data_4M0L
#
_model_server_result.job_id            7kkcVs_UKBRHcy_1XhNl4w 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-15 07:54:51' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          4m0l 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"J","auth_seq_id":502}' 
#
_entry.id    4M0L 
#
_exptl.entry_id    4M0L 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              24.305 
_entity.id                          3 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'MAGNESIUM ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    7 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90.63 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            4M0L 
_cell.length_a            86.05 
_cell.length_b            106.55 
_cell.length_c            156.3 
_cell.Z_PDB               12 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 4M0L 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        4 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1 21 1' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 1 
PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 2 
PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 3 
PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 4 
PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 5 
PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 6 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,G,H,U 1 1 
B,I,J,V 2 1 
C,K,L,M,W 3 1 
D,N,O,X 4 1 
E,P,Q,R,Y 5 1 
F,S,T,Z 6 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 3 H N N 
? 3 J N N 
? 3 L N N 
? 3 M N N 
? 3 O N N 
? 3 Q N N 
? 3 T N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 A SG CYS 59 A CYS 59 1_555 A SG CYS 74 A CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.96 ? 
disulf ? disulf2 A SG CYS 62 A CYS 62 1_555 A SG CYS 77 A CYS 77 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? 
disulf ? disulf3 B SG CYS 59 B CYS 59 1_555 B SG CYS 74 B CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? 
disulf ? disulf4 B SG CYS 62 B CYS 62 1_555 B SG CYS 77 B CYS 77 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? 
disulf ? disulf5 C SG CYS 59 C CYS 59 1_555 C SG CYS 74 C CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? 
disulf ? disulf6 C SG CYS 62 C CYS 62 1_555 C SG CYS 77 C CYS 77 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? 
disulf ? disulf7 D SG CYS 59 D CYS 59 1_555 D SG CYS 74 D CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? 
disulf ? disulf8 D SG CYS 62 D CYS 62 1_555 D SG CYS 77 D CYS 77 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? 
disulf ? disulf9 E SG CYS 59 E CYS 59 1_555 E SG CYS 74 E CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? 
disulf ? disulf10 E SG CYS 62 E CYS 62 1_555 E SG CYS 77 E CYS 77 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? 
disulf ? disulf11 F SG CYS 59 F CYS 59 1_555 F SG CYS 74 F CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? 
disulf ? disulf12 F SG CYS 62 F CYS 62 1_555 F SG CYS 77 F CYS 77 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.019 ? 
metalc ? metalc1 A OG1 THR 23 A THR 23 1_555 H MG MG . A MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.129 ? 
metalc ? metalc2 G O3B GDP . A GDP 501 1_555 H MG MG . A MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.123 ? 
metalc ? metalc3 H MG MG . A MG 502 1_555 U O HOH . A HOH 632 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.129 ? 
metalc ? metalc4 H MG MG . A MG 502 1_555 U O HOH . A HOH 644 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.107 ? 
metalc ? metalc5 H MG MG . A MG 502 1_555 U O HOH . A HOH 645 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.127 ? 
metalc ? metalc6 H MG MG . A MG 502 1_555 U O HOH . A HOH 646 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.119 ? 
metalc ? metalc7 B OG1 THR 23 B THR 23 1_555 J MG MG . B MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.163 ? 
metalc ? metalc8 I O3B GDP . B GDP 501 1_555 J MG MG . B MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.08 ? 
metalc ? metalc9 J MG MG . B MG 502 1_555 V O HOH . B HOH 622 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.215 ? 
metalc ? metalc10 J MG MG . B MG 502 1_555 V O HOH . B HOH 625 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.316 ? 
metalc ? metalc11 J MG MG . B MG 502 1_555 V O HOH . B HOH 645 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.446 ? 
metalc ? metalc12 C OG1 THR 23 C THR 23 1_555 L MG MG . C MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.119 ? 
metalc ? metalc13 C OG1 THR 54 C THR 54 1_555 M MG MG . C MG 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.443 ? 
metalc ? metalc14 C O THR 70 C THR 70 1_555 M MG MG . C MG 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.984 ? 
metalc ? metalc15 C OE2 GLU 71 C GLU 71 1_555 M MG MG . C MG 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.538 ? 
metalc ? metalc16 K O1B GDP . C GDP 501 1_555 L MG MG . C MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.154 ? 
metalc ? metalc17 L MG MG . C MG 502 1_555 W O HOH . C HOH 634 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.132 ? 
metalc ? metalc18 L MG MG . C MG 502 1_555 W O HOH . C HOH 643 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.196 ? 
metalc ? metalc19 L MG MG . C MG 502 1_555 W O HOH . C HOH 655 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.146 ? 
metalc ? metalc20 L MG MG . C MG 502 1_555 W O HOH . C HOH 665 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.095 ? 
metalc ? metalc21 M MG MG . C MG 503 1_555 W O HOH . C HOH 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.937 ? 
metalc ? metalc22 M MG MG . C MG 503 1_555 W O HOH . C HOH 630 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.334 ? 
metalc ? metalc23 D OG1 THR 23 D THR 23 1_555 O MG MG . D MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.196 ? 
metalc ? metalc24 N O1B GDP . D GDP 501 1_555 O MG MG . D MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.147 ? 
metalc ? metalc25 O MG MG . D MG 502 1_555 X O HOH . D HOH 617 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.199 ? 
metalc ? metalc26 O MG MG . D MG 502 1_555 X O HOH . D HOH 631 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.257 ? 
metalc ? metalc27 O MG MG . D MG 502 1_555 X O HOH . D HOH 632 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.15 ? 
metalc ? metalc28 E OG1 THR 23 E THR 23 1_555 Q MG MG . E MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.322 ? 
metalc ? metalc29 P O2B GDP . E GDP 501 1_555 Q MG MG . E MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.504 ? 
metalc ? metalc30 P O2A GDP . E GDP 501 1_555 Q MG MG . E MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.953 ? 
metalc ? metalc31 Q MG MG . E MG 502 1_555 Y O HOH . E HOH 621 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.153 ? 
metalc ? metalc32 Q MG MG . E MG 502 1_555 Y O HOH . E HOH 636 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.383 ? 
metalc ? metalc33 Q MG MG . E MG 502 1_555 Y O HOH . E HOH 637 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.681 ? 
metalc ? metalc34 Q MG MG . E MG 502 1_555 Y O HOH . E HOH 638 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.2 ? 
metalc ? metalc35 F OG1 THR 23 F THR 23 1_555 T MG MG . F MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.172 ? 
metalc ? metalc36 S O1B GDP . F GDP 501 1_555 T MG MG . F MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.199 ? 
metalc ? metalc37 T MG MG . F MG 502 1_555 Z O HOH . F HOH 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.69 ? 
metalc ? metalc38 T MG MG . F MG 502 1_555 Z O HOH . F HOH 615 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.208 ? 
metalc ? metalc39 T MG MG . F MG 502 1_555 Z O HOH . F HOH 619 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.225 ? 
#
_chem_comp.formula           'Mg 2' 
_chem_comp.formula_weight    24.305 
_chem_comp.id                MG 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'MAGNESIUM ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     4M0L 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.011621 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.000128 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.009385 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.006398 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
G 2 GDP A 1 501 1 GDP GDP . 
H 3 MG A 1 502 6 MG MG . 
I 2 GDP B 1 501 2 GDP GDP . 
J 3 MG B 1 502 1 MG MG . 
K 2 GDP C 1 501 3 GDP GDP . 
L 3 MG C 1 502 2 MG MG . 
M 3 MG C 1 503 7 MG MG . 
N 2 GDP D 1 501 4 GDP GDP . 
O 3 MG D 1 502 3 MG MG . 
P 2 GDP E 1 501 5 GDP GDP . 
Q 3 MG E 1 502 4 MG MG . 
R 4 PO4 E 1 503 1 PO4 PO4 . 
S 2 GDP F 1 501 6 GDP GDP . 
T 3 MG F 1 502 5 MG MG . 
U 5 HOH A 1 601 1 HOH HOH . 
U 5 HOH A 2 602 3 HOH HOH . 
U 5 HOH A 3 603 4 HOH HOH . 
U 5 HOH A 4 604 7 HOH HOH . 
U 5 HOH A 5 605 11 HOH HOH . 
U 5 HOH A 6 606 14 HOH HOH . 
U 5 HOH A 7 607 15 HOH HOH . 
U 5 HOH A 8 608 21 HOH HOH . 
U 5 HOH A 9 609 32 HOH HOH . 
U 5 HOH A 10 610 33 HOH HOH . 
U 5 HOH A 11 611 34 HOH HOH . 
U 5 HOH A 12 612 35 HOH HOH . 
U 5 HOH A 13 613 37 HOH HOH . 
U 5 HOH A 14 614 39 HOH HOH . 
U 5 HOH A 15 615 52 HOH HOH . 
U 5 HOH A 16 616 55 HOH HOH . 
U 5 HOH A 17 617 57 HOH HOH . 
U 5 HOH A 18 618 61 HOH HOH . 
U 5 HOH A 19 619 66 HOH HOH . 
U 5 HOH A 20 620 67 HOH HOH . 
U 5 HOH A 21 621 71 HOH HOH . 
U 5 HOH A 22 622 72 HOH HOH . 
U 5 HOH A 23 623 77 HOH HOH . 
U 5 HOH A 24 624 80 HOH HOH . 
U 5 HOH A 25 625 90 HOH HOH . 
U 5 HOH A 26 626 94 HOH HOH . 
U 5 HOH A 27 627 95 HOH HOH . 
U 5 HOH A 28 628 102 HOH HOH . 
U 5 HOH A 29 629 107 HOH HOH . 
U 5 HOH A 30 630 110 HOH HOH . 
U 5 HOH A 31 631 112 HOH HOH . 
U 5 HOH A 32 632 121 HOH HOH . 
U 5 HOH A 33 633 127 HOH HOH . 
U 5 HOH A 34 634 132 HOH HOH . 
U 5 HOH A 35 635 136 HOH HOH . 
U 5 HOH A 36 636 146 HOH HOH . 
U 5 HOH A 37 637 154 HOH HOH . 
U 5 HOH A 38 638 162 HOH HOH . 
U 5 HOH A 39 639 163 HOH HOH . 
U 5 HOH A 40 640 170 HOH HOH . 
U 5 HOH A 41 641 186 HOH HOH . 
U 5 HOH A 42 642 196 HOH HOH . 
U 5 HOH A 43 643 213 HOH HOH . 
U 5 HOH A 44 644 225 HOH HOH . 
U 5 HOH A 45 645 226 HOH HOH . 
U 5 HOH A 46 646 227 HOH HOH . 
U 5 HOH A 47 647 249 HOH HOH . 
U 5 HOH A 48 648 250 HOH HOH . 
U 5 HOH A 49 649 251 HOH HOH . 
U 5 HOH A 50 650 257 HOH HOH . 
U 5 HOH A 51 651 259 HOH HOH . 
U 5 HOH A 52 652 264 HOH HOH . 
U 5 HOH A 53 653 265 HOH HOH . 
U 5 HOH A 54 654 266 HOH HOH . 
U 5 HOH A 55 655 267 HOH HOH . 
U 5 HOH A 56 656 268 HOH HOH . 
U 5 HOH A 57 657 272 HOH HOH . 
U 5 HOH A 58 658 276 HOH HOH . 
U 5 HOH A 59 659 297 HOH HOH . 
U 5 HOH A 60 660 303 HOH HOH . 
U 5 HOH A 61 661 307 HOH HOH . 
U 5 HOH A 62 662 311 HOH HOH . 
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