data_4NQA # _model_server_result.job_id 6tFMQGsDjRngYG0cO6fwvA _model_server_result.datetime_utc '2024-11-23 04:23:09' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 4nqa # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"S","auth_seq_id":501}' # _entry.id 4NQA # _exptl.entry_id 4NQA _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 300.435 _entity.id 6 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description '(9cis)-retinoic acid' _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 4NQA _cell.length_a 85.783 _cell.length_b 85.783 _cell.length_c 238.577 _cell.Z_PDB 16 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 4NQA _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 78 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 43' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id PISA hexameric 6 author_and_software_defined_assembly 1 PISA hexameric 6 author_and_software_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,B,C,D,E,F,M,N,O,P,Q,R 1 1 G,H,I,J,K,L,S,T,U,V,W,X 2 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 6 M N N ? 6 S N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A SG CYS 38 A CYS 135 1_555 N ZN ZN . A ZN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.308 ? metalc ? metalc2 A SG CYS 41 A CYS 138 1_555 N ZN ZN . A ZN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.288 ? metalc ? metalc3 A SG CYS 55 A CYS 152 1_555 N ZN ZN . A ZN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.3 ? metalc ? metalc4 A SG CYS 58 A CYS 155 1_555 N ZN ZN . A ZN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.291 ? metalc ? metalc5 A SG CYS 74 A CYS 171 1_555 O ZN ZN . A ZN 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.313 ? metalc ? metalc6 A SG CYS 80 A CYS 177 1_555 O ZN ZN . A ZN 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.305 ? metalc ? metalc7 A SG CYS 90 A CYS 187 1_555 O ZN ZN . A ZN 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.309 ? metalc ? metalc8 A SG CYS 93 A CYS 190 1_555 O ZN ZN . A ZN 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.305 ? metalc ? metalc9 B SG CYS 17 B CYS 87 1_555 Q ZN ZN . B ZN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.377 ? metalc ? metalc10 B SG CYS 20 B CYS 90 1_555 Q ZN ZN . B ZN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.194 ? metalc ? metalc11 B SG CYS 34 B CYS 104 1_555 Q ZN ZN . B ZN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.303 ? metalc ? metalc12 B SG CYS 37 B CYS 107 1_555 Q ZN ZN . B ZN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.329 ? metalc ? metalc13 B SG CYS 55 B CYS 125 1_555 R ZN ZN . B ZN 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.273 ? metalc ? metalc14 B SG CYS 61 B CYS 131 1_555 R ZN ZN . B ZN 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.379 ? metalc ? metalc15 B SG CYS 71 B CYS 141 1_555 R ZN ZN . B ZN 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.361 ? metalc ? metalc16 B SG CYS 74 B CYS 144 1_555 R ZN ZN . B ZN 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.296 ? metalc ? metalc17 G SG CYS 38 H CYS 135 1_555 T ZN ZN . H ZN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.346 ? metalc ? metalc18 G SG CYS 41 H CYS 138 1_555 T ZN ZN . H ZN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.225 ? metalc ? metalc19 G SG CYS 55 H CYS 152 1_555 T ZN ZN . H ZN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.302 ? metalc ? metalc20 G SG CYS 58 H CYS 155 1_555 T ZN ZN . H ZN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.285 ? metalc ? metalc21 G SG CYS 74 H CYS 171 1_555 U ZN ZN . H ZN 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.364 ? metalc ? metalc22 G SG CYS 80 H CYS 177 1_555 U ZN ZN . H ZN 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.339 ? metalc ? metalc23 G SG CYS 90 H CYS 187 1_555 U ZN ZN . H ZN 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.24 ? metalc ? metalc24 G SG CYS 93 H CYS 190 1_555 U ZN ZN . H ZN 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.266 ? metalc ? metalc25 H SG CYS 17 I CYS 87 1_555 W ZN ZN . I ZN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.384 ? metalc ? metalc26 H SG CYS 20 I CYS 90 1_555 W ZN ZN . I ZN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.318 ? metalc ? metalc27 H SG CYS 34 I CYS 104 1_555 W ZN ZN . I ZN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.287 ? metalc ? metalc28 H SG CYS 37 I CYS 107 1_555 W ZN ZN . I ZN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.318 ? metalc ? metalc29 H SG CYS 55 I CYS 125 1_555 X ZN ZN . I ZN 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.304 ? metalc ? metalc30 H SG CYS 61 I CYS 131 1_555 X ZN ZN . I ZN 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.318 ? metalc ? metalc31 H SG CYS 71 I CYS 141 1_555 X ZN ZN . I ZN 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.284 ? metalc ? metalc32 H SG CYS 74 I CYS 144 1_555 X ZN ZN . I ZN 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.27 ? hydrog 'DA-DT PAIR' hydrog1 E N6 DA 2 E DA 502 1_555 F O4 DT 18 F DT 518 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DA-DT PAIR' hydrog2 E N1 DA 3 E DA 503 1_555 F N3 DT 18 F DT 518 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 E N1 DG 4 E DG 504 1_555 F N3 DC 17 F DC 517 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 E N2 DG 4 E DG 504 1_555 F O2 DC 17 F DC 517 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 E O6 DG 4 E DG 504 1_555 F N4 DC 17 F DC 517 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 E N1 DG 5 E DG 505 1_555 F N3 DC 16 F DC 516 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 E N2 DG 5 E DG 505 1_555 F O2 DC 16 F DC 516 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 E O6 DG 5 E DG 505 1_555 F N4 DC 16 F DC 516 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 E N3 DT 6 E DT 506 1_555 F N1 DA 15 F DA 515 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 E O4 DT 6 E DT 506 1_555 F N6 DA 15 F DA 515 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 E N3 DC 7 E DC 507 1_555 F N1 DG 14 F DG 514 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 E N4 DC 7 E DC 507 1_555 F O6 DG 14 F DG 514 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog13 E O2 DC 7 E DC 507 1_555 F N2 DG 14 F DG 514 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog14 E N1 DA 8 E DA 508 1_555 F N3 DT 13 F DT 513 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 E N6 DA 8 E DA 508 1_555 F O4 DT 13 F DT 513 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DC-DG PAIR' hydrog16 E O2 DC 9 E DC 509 1_555 F N1 DG 12 F DG 512 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 E N3 DT 10 E DT 510 1_555 F N1 DA 11 F DA 511 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 E O4 DT 10 E DT 510 1_555 F N6 DA 11 F DA 511 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog19 E N3 DT 11 E DT 511 1_555 F N1 DA 10 F DA 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog20 E O4 DT 11 E DT 511 1_555 F N6 DA 10 F DA 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog21 E N3 DC 12 E DC 512 1_555 F N1 DG 9 F DG 509 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog22 E N4 DC 12 E DC 512 1_555 F O6 DG 9 F DG 509 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog23 E O2 DC 12 E DC 512 1_555 F N2 DG 9 F DG 509 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 E N1 DA 13 E DA 513 1_555 F N3 DT 8 F DT 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog25 E N6 DA 13 E DA 513 1_555 F O4 DT 8 F DT 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog26 E N1 DG 14 E DG 514 1_555 F N3 DC 7 F DC 507 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog27 E N2 DG 14 E DG 514 1_555 F O2 DC 7 F DC 507 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog28 E O6 DG 14 E DG 514 1_555 F N4 DC 7 F DC 507 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog29 E N1 DG 15 E DG 515 1_555 F N3 DC 6 F DC 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog30 E N2 DG 15 E DG 515 1_555 F O2 DC 6 F DC 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog31 E O6 DG 15 E DG 515 1_555 F N4 DC 6 F DC 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog32 E N3 DT 16 E DT 516 1_555 F N1 DA 5 F DA 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog33 E O4 DT 16 E DT 516 1_555 F N6 DA 5 F DA 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog34 E N3 DC 17 E DC 517 1_555 F N1 DG 4 F DG 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog35 E N4 DC 17 E DC 517 1_555 F O6 DG 4 F DG 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog36 E O2 DC 17 E DC 517 1_555 F N2 DG 4 F DG 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog37 E N1 DA 18 E DA 518 1_555 F N3 DT 3 F DT 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog38 E N6 DA 18 E DA 518 1_555 F O4 DT 3 F DT 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog39 K N1 DA 3 L DA 503 1_555 L N3 DT 18 M DT 518 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog40 K N6 DA 3 L DA 503 1_555 L O4 DT 18 M DT 518 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DG-DC PAIR' hydrog41 K N1 DG 4 L DG 504 1_555 L N3 DC 17 M DC 517 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog42 K N1 DG 5 L DG 505 1_555 L N3 DC 16 M DC 516 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog43 K N2 DG 5 L DG 505 1_555 L O2 DC 16 M DC 516 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog44 K O6 DG 5 L DG 505 1_555 L N4 DC 16 M DC 516 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog45 K N3 DT 6 L DT 506 1_555 L N1 DA 15 M DA 515 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog46 K O4 DT 6 L DT 506 1_555 L N6 DA 15 M DA 515 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog47 K N3 DC 7 L DC 507 1_555 L N1 DG 14 M DG 514 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog48 K N4 DC 7 L DC 507 1_555 L O6 DG 14 M DG 514 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog49 K O2 DC 7 L DC 507 1_555 L N2 DG 14 M DG 514 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog50 K N1 DA 8 L DA 508 1_555 L N3 DT 13 M DT 513 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog51 K N6 DA 8 L DA 508 1_555 L O4 DT 13 M DT 513 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog52 K N3 DT 10 L DT 510 1_555 L N1 DA 11 M DA 511 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog53 K O4 DT 10 L DT 510 1_555 L N6 DA 11 M DA 511 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog54 K N3 DT 11 L DT 511 1_555 L N1 DA 10 M DA 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog55 K O4 DT 11 L DT 511 1_555 L N6 DA 10 M DA 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog56 K N3 DC 12 L DC 512 1_555 L N1 DG 9 M DG 509 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog57 K N4 DC 12 L DC 512 1_555 L O6 DG 9 M DG 509 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog58 K O2 DC 12 L DC 512 1_555 L N2 DG 9 M DG 509 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog59 K N1 DA 13 L DA 513 1_555 L N3 DT 8 M DT 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog60 K N6 DA 13 L DA 513 1_555 L O4 DT 8 M DT 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog61 K N1 DG 14 L DG 514 1_555 L N3 DC 7 M DC 507 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog62 K N2 DG 14 L DG 514 1_555 L O2 DC 7 M DC 507 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog63 K O6 DG 14 L DG 514 1_555 L N4 DC 7 M DC 507 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog64 K N1 DG 15 L DG 515 1_555 L N3 DC 6 M DC 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog65 K N2 DG 15 L DG 515 1_555 L O2 DC 6 M DC 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog66 K O6 DG 15 L DG 515 1_555 L N4 DC 6 M DC 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog67 K N3 DT 16 L DT 516 1_555 L N1 DA 5 M DA 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog68 K O4 DT 16 L DT 516 1_555 L N6 DA 5 M DA 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DC-DT MISPAIR' hydrog69 K N4 DC 17 L DC 517 1_555 L O4 DT 3 M DT 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog70 K N3 DC 17 L DC 517 1_555 L N1 DG 4 M DG 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog71 K N4 DC 17 L DC 517 1_555 L O6 DG 4 M DG 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog72 K O2 DC 17 L DC 517 1_555 L N2 DG 4 M DG 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog73 K N1 DA 18 L DA 518 1_555 L N3 DT 3 M DT 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog74 K N6 DA 18 L DA 518 1_555 L O4 DT 3 M DT 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'C20 H28 O2' _chem_comp.formula_weight 300.435 _chem_comp.id 9CR _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name '(9cis)-retinoic acid' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag O1 C15 9CR doub 76 n n C15 C14 9CR sing 77 n n C15 O2 9CR sing 78 n n C14 C13 9CR doub 79 e n C13 C12 9CR sing 80 n n C13 C20 9CR sing 81 n n C12 C11 9CR doub 82 e n C11 C10 9CR sing 83 n n C18 C5 9CR sing 84 n n C10 C9 9CR doub 85 z n C9 C19 9CR sing 86 n n C9 C8 9CR sing 87 n n C8 C7 9CR doub 88 e n C5 C4 9CR sing 89 n n C5 C6 9CR doub 90 n n C4 C3 9CR sing 91 n n C7 C6 9CR sing 92 n n C6 C1 9CR sing 93 n n C3 C2 9CR sing 94 n n C1 C17 9CR sing 95 n n C1 C2 9CR sing 96 n n C1 C16 9CR sing 97 n n C2 H1 9CR sing 98 n n C2 H2 9CR sing 99 n n C3 H3 9CR sing 100 n n C3 H4 9CR sing 101 n n C4 H5 9CR sing 102 n n C4 H6 9CR sing 103 n n C7 H7 9CR sing 104 n n C8 H8 9CR sing 105 n n C10 H9 9CR sing 106 n n C11 H10 9CR sing 107 n n C12 H11 9CR sing 108 n n C14 H12 9CR sing 109 n n C16 H13 9CR sing 110 n n C16 H14 9CR sing 111 n n C16 H15 9CR sing 112 n n C17 H16 9CR sing 113 n n C17 H17 9CR sing 114 n n C17 H18 9CR sing 115 n n C18 H19 9CR sing 116 n n C18 H20 9CR sing 117 n n C18 H21 9CR sing 118 n n C19 H22 9CR sing 119 n n C19 H23 9CR sing 120 n n C19 H24 9CR sing 121 n n C20 H25 9CR sing 122 n n C20 H26 9CR sing 123 n n C20 H27 9CR sing 124 n n O2 H28 9CR sing 125 n n # _atom_sites.entry_id 4NQA _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.011657 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.011657 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.004192 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code M 6 9CR A 1 501 500 9CR 9CR . N 7 ZN A 1 502 750 ZN ZN . O 7 ZN A 1 503 751 ZN ZN . P 8 965 B 1 501 500 965 965 . Q 7 ZN B 1 502 750 ZN ZN . R 7 ZN B 1 503 751 ZN ZN . S 6 9CR H 1 501 500 9CR 9CR . T 7 ZN H 1 502 750 ZN ZN . U 7 ZN H 1 503 751 ZN ZN . V 8 965 I 1 501 500 965 965 . W 7 ZN I 1 502 750 ZN ZN . X 7 ZN I 1 503 751 ZN ZN . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 9CR . . . S 6 -5.254 48.635 -58.073 1 88.58 ? C1 9CR 501 H 1 HETATM 2 C C2 9CR . . . S 6 -6.115 49.815 -57.637 1 88.58 ? C2 9CR 501 H 1 HETATM 3 C C3 9CR . . . S 6 -5.413 50.831 -56.74 1 88.58 ? C3 9CR 501 H 1 HETATM 4 C C4 9CR . . . S 6 -4.088 51.202 -57.373 1 88.58 ? C4 9CR 501 H 1 HETATM 5 C C5 9CR . . . S 6 -3.29 49.948 -57.283 1 88.58 ? C5 9CR 501 H 1 HETATM 6 C C6 9CR . . . S 6 -3.763 48.822 -57.858 1 88.58 ? C6 9CR 501 H 1 HETATM 7 C C7 9CR . . . S 6 -2.879 47.761 -58.409 1 88.58 ? C7 9CR 501 H 1 HETATM 8 C C8 9CR . . . S 6 -1.627 48.021 -58.818 1 88.58 ? C8 9CR 501 H 1 HETATM 9 C C9 9CR . . . S 6 -0.828 46.974 -59.51 1 88.58 ? C9 9CR 501 H 1 HETATM 10 C C10 9CR . . . S 6 0.272 47.207 -60.271 1 88.58 ? C10 9CR 501 H 1 HETATM 11 C C11 9CR . . . S 6 0.859 48.523 -60.509 1 88.58 ? C11 9CR 501 H 1 HETATM 12 C C12 9CR . . . S 6 1.85 48.619 -61.386 1 88.58 ? C12 9CR 501 H 1 HETATM 13 C C13 9CR . . . S 6 2.488 49.909 -61.709 1 88.58 ? C13 9CR 501 H 1 HETATM 14 C C14 9CR . . . S 6 3.544 49.842 -62.559 1 88.58 ? C14 9CR 501 H 1 HETATM 15 C C15 9CR . . . S 6 4.393 50.966 -63.013 1 88.58 ? C15 9CR 501 H 1 HETATM 16 C C16 9CR . . . S 6 -5.727 47.372 -57.383 1 88.58 ? C16 9CR 501 H 1 HETATM 17 C C17 9CR . . . S 6 -5.51 48.501 -59.567 1 88.58 ? C17 9CR 501 H 1 HETATM 18 C C18 9CR . . . S 6 -2.053 50.035 -56.436 1 88.58 ? C18 9CR 501 H 1 HETATM 19 C C19 9CR . . . S 6 -1.293 45.552 -59.434 1 88.58 ? C19 9CR 501 H 1 HETATM 20 C C20 9CR . . . S 6 1.917 51.18 -61.121 1 88.58 ? C20 9CR 501 H 1 HETATM 21 O O1 9CR . . . S 6 4.165 52.171 -62.817 1 88.58 ? O1 9CR 501 H 1 HETATM 22 O O2 9CR . . . S 6 5.411 50.664 -63.622 1 88.58 ? O2 9CR 501 H 1 # _model_server_stats.io_time_ms 11 _model_server_stats.parse_time_ms 9 _model_server_stats.create_model_time_ms 14 _model_server_stats.query_time_ms 322 _model_server_stats.encode_time_ms 5 _model_server_stats.element_count 22 #