data_4OKH # _model_server_result.job_id 4BbbEORUBwMJhiEEx_hRiw _model_server_result.datetime_utc '2024-11-22 17:23:09' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 4okh # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"P","auth_seq_id":903}' # _entry.id 4OKH # _exptl.entry_id 4OKH _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 40.078 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CALCIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 11 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 4OKH _cell.length_a 107 _cell.length_b 107 _cell.length_c 96.71 _cell.Z_PDB 24 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 4OKH _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 92 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 41 21 2' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 1 PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,B,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,Q,R 1 1 C,N,O,P,S 2 1,2 # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 2 'crystal symmetry operation' 7_555 y,x,-z 0 1 0 1 0 0 0 0 -1 0 0 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 D N N ? 2 E N N ? 2 F N N ? 2 G N N ? 2 I N N ? 2 J N N ? 2 K N N ? 2 L N N ? 2 N N N ? 2 O N N ? 2 P N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A O ALA 22 A ALA 662 1_555 D CA CA . A CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.267 ? metalc ? metalc2 A OD1 ASP 25 A ASP 665 1_555 D CA CA . A CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.459 ? metalc ? metalc3 A O GLU 27 A GLU 667 1_555 D CA CA . A CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.286 ? metalc ? metalc4 A OE1 GLU 32 A GLU 672 1_555 D CA CA . A CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.399 ? metalc ? metalc5 A OE2 GLU 32 A GLU 672 1_555 D CA CA . A CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.546 ? metalc ? metalc6 A OD1 ASP 65 A ASP 705 1_555 E CA CA . A CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.268 ? metalc ? metalc7 A OD1 ASP 67 A ASP 707 1_555 E CA CA . A CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.439 ? metalc ? metalc8 A OG SER 69 A SER 709 1_555 E CA CA . A CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.289 ? metalc ? metalc9 A O LYS 71 A LYS 711 1_555 E CA CA . A CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.371 ? metalc ? metalc10 A OE2 GLU 76 A GLU 716 1_555 E CA CA . A CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.374 ? metalc ? metalc11 A OE1 GLU 76 A GLU 716 1_555 E CA CA . A CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.609 ? metalc ? metalc12 A OD1 ASP 95 A ASP 735 1_555 F CA CA . A CA 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.731 ? metalc ? metalc13 A OD1 ASP 97 A ASP 737 1_555 F CA CA . A CA 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.386 ? metalc ? metalc14 A OG SER 99 A SER 739 1_555 F CA CA . A CA 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.592 ? metalc ? metalc15 A O THR 101 A THR 741 1_555 F CA CA . A CA 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.482 ? metalc ? metalc16 A OD1 ASP 160 A ASP 800 1_555 G CA CA . A CA 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.275 ? metalc ? metalc17 A OD1 ASP 162 A ASP 802 1_555 G CA CA . A CA 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.431 ? metalc ? metalc18 A OD2 ASP 162 A ASP 802 1_555 G CA CA . A CA 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.595 ? metalc ? metalc19 A OD1 ASP 164 A ASP 804 1_555 G CA CA . A CA 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.313 ? metalc ? metalc20 A O ILE 166 A ILE 806 1_555 G CA CA . A CA 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.212 ? metalc ? metalc21 D CA CA . A CA 901 1_555 Q O HOH . A HOH 1014 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.213 ? metalc ? metalc22 E CA CA . A CA 902 1_555 Q O HOH . A HOH 1011 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.276 ? metalc ? metalc23 F CA CA . A CA 903 1_555 Q O HOH . A HOH 1012 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.694 ? metalc ? metalc24 G CA CA . A CA 904 1_555 Q O HOH . A HOH 1005 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.234 ? metalc ? metalc25 G CA CA . A CA 904 1_555 Q O HOH . A HOH 1008 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.293 ? metalc ? metalc26 B O ALA 22 B ALA 662 1_555 I CA CA . B CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.298 ? metalc ? metalc27 B OD1 ASP 25 B ASP 665 1_555 I CA CA . B CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.546 ? metalc ? metalc28 B OD2 ASP 25 B ASP 665 1_555 I CA CA . B CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.167 ? metalc ? metalc29 B O GLU 27 B GLU 667 1_555 I CA CA . B CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.46 ? metalc ? metalc30 B OE1 GLU 32 B GLU 672 1_555 I CA CA . B CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.59 ? metalc ? metalc31 B OE2 GLU 32 B GLU 672 1_555 I CA CA . B CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.911 ? metalc ? metalc32 B OD1 ASP 65 B ASP 705 1_555 J CA CA . B CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.321 ? metalc ? metalc33 B OD1 ASP 67 B ASP 707 1_555 J CA CA . B CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.407 ? metalc ? metalc34 B OG SER 69 B SER 709 1_555 J CA CA . B CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.685 ? metalc ? metalc35 B O LYS 71 B LYS 711 1_555 J CA CA . B CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.482 ? metalc ? metalc36 B OE1 GLU 76 B GLU 716 1_555 J CA CA . B CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.453 ? metalc ? metalc37 B OE2 GLU 76 B GLU 716 1_555 J CA CA . B CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.48 ? metalc ? metalc38 B OD1 ASP 95 B ASP 735 1_555 K CA CA . B CA 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.644 ? metalc ? metalc39 B OD1 ASP 97 B ASP 737 1_555 K CA CA . B CA 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.312 ? metalc ? metalc40 B OG SER 99 B SER 739 1_555 K CA CA . B CA 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.538 ? metalc ? metalc41 B O THR 101 B THR 741 1_555 K CA CA . B CA 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.637 ? metalc ? metalc42 B OD1 ASP 160 B ASP 800 1_555 L CA CA . B CA 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.264 ? metalc ? metalc43 B OD1 ASP 162 B ASP 802 1_555 L CA CA . B CA 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.168 ? metalc ? metalc44 B OD1 ASP 164 B ASP 804 1_555 L CA CA . B CA 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.28 ? metalc ? metalc45 B O ILE 166 B ILE 806 1_555 L CA CA . B CA 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.185 ? metalc ? metalc46 I CA CA . B CA 901 1_555 R O HOH . B HOH 1010 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.377 ? metalc ? metalc47 I CA CA . B CA 901 1_555 R O HOH . B HOH 1011 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.414 ? metalc ? metalc48 J CA CA . B CA 902 1_555 R O HOH . B HOH 1013 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.214 ? metalc ? metalc49 K CA CA . B CA 903 1_555 R O HOH . B HOH 1012 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.716 ? metalc ? metalc50 L CA CA . B CA 904 1_555 R O HOH . B HOH 1007 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.382 ? metalc ? metalc51 L CA CA . B CA 904 1_555 R O HOH . B HOH 1009 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.322 ? metalc ? metalc52 C OD1 ASP 65 C ASP 705 1_555 N CA CA . C CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.08 ? metalc ? metalc53 C OD1 ASP 67 C ASP 707 1_555 N CA CA . C CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.387 ? metalc ? metalc54 C OG SER 69 C SER 709 1_555 N CA CA . C CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.462 ? metalc ? metalc55 C O LYS 71 C LYS 711 1_555 N CA CA . C CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.293 ? metalc ? metalc56 C OE1 GLU 76 C GLU 716 1_555 N CA CA . C CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.54 ? metalc ? metalc57 C OE2 GLU 76 C GLU 716 1_555 N CA CA . C CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.585 ? metalc ? metalc58 C OD1 ASP 95 C ASP 735 1_555 O CA CA . C CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.41 ? metalc ? metalc59 C OD2 ASP 97 C ASP 737 1_555 O CA CA . C CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.507 ? metalc ? metalc60 C OD1 ASP 97 C ASP 737 1_555 O CA CA . C CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.818 ? metalc ? metalc61 C OG SER 99 C SER 739 1_555 O CA CA . C CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.899 ? metalc ? metalc62 C O THR 101 C THR 741 1_555 O CA CA . C CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.225 ? metalc ? metalc63 C OD1 ASP 160 C ASP 800 1_555 P CA CA . C CA 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.467 ? metalc ? metalc64 C OD1 ASP 162 C ASP 802 1_555 P CA CA . C CA 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.382 ? metalc ? metalc65 C OD2 ASP 162 C ASP 802 1_555 P CA CA . C CA 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.121 ? metalc ? metalc66 C O ILE 166 C ILE 806 1_555 P CA CA . C CA 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.296 ? metalc ? metalc67 N CA CA . C CA 901 1_555 S O HOH . C HOH 1007 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.31 ? metalc ? metalc68 O CA CA . C CA 902 1_555 S O HOH . C HOH 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.517 ? metalc ? metalc69 O CA CA . C CA 902 1_555 S O HOH . C HOH 1004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.981 ? metalc ? metalc70 P CA CA . C CA 903 1_555 S O HOH . C HOH 1006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.387 ? # _chem_comp.formula 'Ca 2' _chem_comp.formula_weight 40.078 _chem_comp.id CA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CALCIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 4OKH _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.009346 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.009346 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.01034 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code D 2 CA A 1 901 901 CA CA . E 2 CA A 1 902 902 CA CA . F 2 CA A 1 903 903 CA CA . G 2 CA A 1 904 905 CA CA . H 3 PEU A 1 905 1020 PEU PEU . I 2 CA B 1 901 901 CA CA . J 2 CA B 1 902 902 CA CA . K 2 CA B 1 903 903 CA CA . L 2 CA B 1 904 905 CA CA . M 3 PEU B 1 905 1020 PEU PEU . N 2 CA C 1 901 902 CA CA . O 2 CA C 1 902 903 CA CA . P 2 CA C 1 903 905 CA CA . Q 4 HOH A 1 1001 1001 HOH HOH . Q 4 HOH A 2 1002 1002 HOH HOH . Q 4 HOH A 3 1003 1004 HOH HOH . Q 4 HOH A 4 1004 1005 HOH HOH . Q 4 HOH A 5 1005 1006 HOH HOH . Q 4 HOH A 6 1006 1007 HOH HOH . Q 4 HOH A 7 1007 1008 HOH HOH . Q 4 HOH A 8 1008 1009 HOH HOH . Q 4 HOH A 9 1009 1010 HOH HOH . Q 4 HOH A 10 1010 1011 HOH HOH . Q 4 HOH A 11 1011 1012 HOH HOH . Q 4 HOH A 12 1012 1013 HOH HOH . Q 4 HOH A 13 1013 1014 HOH HOH . Q 4 HOH A 14 1014 1015 HOH HOH . Q 4 HOH A 15 1015 1016 HOH HOH . Q 4 HOH A 16 1016 1017 HOH HOH . Q 4 HOH A 17 1017 1018 HOH HOH . R 4 HOH B 1 1001 1003 HOH HOH . R 4 HOH B 2 1002 1001 HOH HOH . R 4 HOH B 3 1003 1002 HOH HOH . R 4 HOH B 4 1004 1003 HOH HOH . R 4 HOH B 5 1005 1004 HOH HOH . R 4 HOH B 6 1006 1005 HOH HOH . R 4 HOH B 7 1007 1007 HOH HOH . R 4 HOH B 8 1008 1008 HOH HOH . R 4 HOH B 9 1009 1009 HOH HOH . R 4 HOH B 10 1010 1010 HOH HOH . R 4 HOH B 11 1011 1011 HOH HOH . R 4 HOH B 12 1012 1012 HOH HOH . R 4 HOH B 13 1013 1013 HOH HOH . R 4 HOH B 14 1014 1014 HOH HOH . R 4 HOH B 15 1015 1015 HOH HOH . R 4 HOH B 16 1016 1016 HOH HOH . R 4 HOH B 17 1017 1017 HOH HOH . S 4 HOH C 1 1001 1001 HOH HOH . S 4 HOH C 2 1002 1002 HOH HOH . S 4 HOH C 3 1003 1003 HOH HOH . S 4 HOH C 4 1004 1004 HOH HOH . S 4 HOH C 5 1005 1005 HOH HOH . S 4 HOH C 6 1006 1006 HOH HOH . S 4 HOH C 7 1007 1007 HOH HOH . S 4 HOH C 8 1008 1008 HOH HOH . S 4 HOH C 9 1009 1009 HOH HOH . S 4 HOH C 10 1010 1010 HOH HOH . S 4 HOH C 11 1011 1011 HOH HOH . S 4 HOH C 12 1012 1012 HOH HOH . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CA _atom_site.label_atom_id CA _atom_site.label_comp_id CA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id P _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x -25.61 _atom_site.Cartn_y -35.423 _atom_site.Cartn_z -3.116 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 97.61 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CA _atom_site.auth_comp_id CA _atom_site.auth_seq_id 903 _atom_site.auth_asym_id C _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 14 _model_server_stats.parse_time_ms 8 _model_server_stats.create_model_time_ms 20 _model_server_stats.query_time_ms 279 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 1 #