data_4PBU # _model_server_result.job_id 0CEC4o8_AzUdS0AStaZq0w _model_server_result.datetime_utc '2024-12-27 00:08:29' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 4pbu # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"AG","auth_seq_id":101}' # _entry.id 4PBU # _exptl.entry_id 4PBU _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 949.299 _entity.id 31 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG)' _entity.pdbx_number_of_molecules 10 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 4PBU _cell.length_a 133.25 _cell.length_b 226.26 _cell.length_c 307.09 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 4PBU _symmetry.cell_setting . _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 38-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 38 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,AC,BC,CC,DC,EC,FC,GC,HC,IC,JC,KC,LC,MC,NC,OC,PC,QC,RC,SC,TC,UC,VC,WC,XC,YC,ZC,AD,BD,CD,DD,ED,FD,GD,HD,ID,JD,KD,LD,MD,ND,OD,PD,QD,RD,SD,TD,UD,VD,WD,XD,YD,ZD,AE,BE,CE,DE,EE,FE,GE,HE,IE,JE,KE,LE,ME,NE,OE,PE,QE,RE,SE,TE,UE,VE,WE,XE,YE,ZE,AF,BF,CF,DF,EF,FF,GF,HF,IF,JF,KF,LF,MF,NF,OF,PF,QF,RF,SF,TF,UF,VF,WF,XF,YF,ZF,AG,BG,CG,DG,EG,FG,GG,HG _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 31 MC N N ? 31 NC N N ? 31 OC N N ? 31 UC N N ? 31 CD N N ? 31 IF N N ? 31 JF N N ? 31 QF N N ? 31 ZF N N ? 31 AG N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 M SG CYS 16 O CYS 19 1_555 M SG CYS 41 O CYS 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? disulf ? disulf2 FA SG CYS 16 o CYS 19 1_555 FA SG CYS 41 o CYS 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? covale ? covale1 M CD GLN 33 O GLN 36 1_555 V N SER 2 c SER 20 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale2 M NE2 GLN 33 O GLN 36 1_555 V N SER 2 c SER 20 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.514 ? covale ? covale3 M CA THR 34 O THR 37 1_555 V OD1 ASN 1 c ASN 19 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale4 M C THR 34 O THR 37 1_555 V CG ASN 1 c ASN 19 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.288 ? covale ? covale5 M C THR 34 O THR 37 1_555 V ND2 ASN 1 c ASN 19 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.546 ? metalc ? metalc1 A OD1 ASP 160 A ASP 170 1_555 MA MN4 OEX . A OEX 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.076 ? metalc ? metalc2 A OD2 ASP 160 A ASP 170 1_555 MA CA1 OEX . A OEX 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.443 ? metalc ? metalc3 A OE2 GLU 179 A GLU 189 1_555 MA MN1 OEX . A OEX 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.9 ? metalc ? metalc4 A NE2 HIS 205 A HIS 215 1_555 NA FE FE2 . A FE2 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.163 ? metalc ? metalc5 A NE2 HIS 262 A HIS 272 1_555 NA FE FE2 . A FE2 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.249 ? metalc ? metalc6 A NE2 HIS 322 A HIS 332 1_555 MA MN1 OEX . A OEX 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.135 ? metalc ? metalc7 A OE1 GLU 323 A GLU 333 1_555 MA MN3 OEX . A OEX 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.07 ? metalc ? metalc8 A OE2 GLU 323 A GLU 333 1_555 MA MN4 OEX . A OEX 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.173 ? metalc ? metalc9 A OD1 ASP 332 A ASP 342 1_555 MA MN2 OEX . A OEX 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.148 ? metalc ? metalc10 A OD2 ASP 332 A ASP 342 1_555 MA MN1 OEX . A OEX 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.256 ? metalc ? metalc11 A O ALA 334 A ALA 344 1_555 MA CA1 OEX . A OEX 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.541 ? metalc ? metalc12 A OXT ALA 334 A ALA 344 1_555 MA MN2 OEX . A OEX 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.989 ? metalc ? metalc13 MA MN2 OEX . A OEX 601 1_555 C OE1 GLU 336 C GLU 354 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.854 ? metalc ? metalc14 MA MN3 OEX . A OEX 601 1_555 C OE2 GLU 336 C GLU 354 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.993 ? metalc ? metalc15 NA FE FE2 . A FE2 602 1_555 QA O3 BCT . A BCT 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.255 ? metalc ? metalc16 NA FE FE2 . A FE2 602 1_555 QA O2 BCT . A BCT 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.288 ? metalc ? metalc17 NA FE FE2 . A FE2 602 1_555 D NE2 HIS 204 D HIS 214 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.257 ? metalc ? metalc18 NA FE FE2 . A FE2 602 1_555 D NE2 HIS 258 D HIS 268 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.285 ? metalc ? metalc19 B OD1 ASN 437 B ASN 438 1_555 BB CA CA . B CA 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.653 ? metalc ? metalc20 C OD1 ASN 21 C ASN 39 1_555 HC MG CLA . C CLA 511 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.109 ? metalc ? metalc21 E NE2 HIS 20 E HIS 23 1_555 YC FE HEM . E HEM 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.101 ? metalc ? metalc22 YC FE HEM . E HEM 101 1_555 F NE2 HIS 13 F HIS 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.095 ? metalc ? metalc23 F O ARG 34 F ARG 45 1_555 AD CA CA . F CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.971 ? metalc ? metalc24 F OXT ARG 34 F ARG 45 1_555 AD CA CA . F CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.582 ? metalc ? metalc25 M O THR 135 O THR 138 1_555 FD CA CA . O CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.483 ? metalc ? metalc26 M OD1 ASN 197 O ASN 200 1_555 FD CA CA . O CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.517 ? metalc ? metalc27 M O VAL 198 O VAL 201 1_555 FD CA CA . O CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.51 ? metalc ? metalc28 P NE2 HIS 41 V HIS 41 1_555 JD FE HEM . V HEM 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? metalc ? metalc29 P NE2 HIS 92 V HIS 92 1_555 JD FE HEM . V HEM 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.129 ? metalc ? metalc30 T OD1 ASP 160 a ASP 170 1_555 LD MN4 OEX . a OEX 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? metalc ? metalc31 T OD2 ASP 160 a ASP 170 1_555 LD CA1 OEX . a OEX 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.366 ? metalc ? metalc32 T OE2 GLU 179 a GLU 189 1_555 LD MN1 OEX . a OEX 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.79 ? metalc ? metalc33 T NE2 HIS 205 a HIS 215 1_555 ND FE FE2 . a FE2 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.114 ? metalc ? metalc34 T NE2 HIS 262 a HIS 272 1_555 ND FE FE2 . a FE2 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.316 ? metalc ? metalc35 T NE2 HIS 322 a HIS 332 1_555 LD MN1 OEX . a OEX 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.194 ? metalc ? metalc36 T OE1 GLU 323 a GLU 333 1_555 LD MN3 OEX . a OEX 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.976 ? metalc ? metalc37 T OE2 GLU 323 a GLU 333 1_555 LD MN4 OEX . a OEX 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.132 ? metalc ? metalc38 T OD1 ASP 332 a ASP 342 1_555 LD MN2 OEX . a OEX 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.13 ? metalc ? metalc39 T OD2 ASP 332 a ASP 342 1_555 LD MN1 OEX . a OEX 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.263 ? metalc ? metalc40 T O ALA 334 a ALA 344 1_555 LD CA1 OEX . a OEX 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.455 ? metalc ? metalc41 T OXT ALA 334 a ALA 344 1_555 LD MN2 OEX . a OEX 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.885 ? metalc ? metalc42 LD MN2 OEX . a OEX 401 1_555 V OE1 GLU 336 c GLU 354 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.851 ? metalc ? metalc43 LD MN3 OEX . a OEX 401 1_555 V OE2 GLU 336 c GLU 354 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.889 ? metalc ? metalc44 ND FE FE2 . a FE2 403 1_555 YD O2 BCT . a BCT 414 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.18 ? metalc ? metalc45 ND FE FE2 . a FE2 403 1_555 YD O3 BCT . a BCT 414 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.238 ? metalc ? metalc46 ND FE FE2 . a FE2 403 1_555 W NE2 HIS 204 d HIS 214 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.408 ? metalc ? metalc47 ND FE FE2 . a FE2 403 1_555 W NE2 HIS 258 d HIS 268 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.216 ? metalc ? metalc48 U OD1 ASN 437 b ASN 438 1_555 ZD CA CA . b CA 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.577 ? metalc ? metalc49 V O PHE 4 c PHE 22 1_555 TE CA CA . c CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.415 ? metalc ? metalc50 V O THR 6 c THR 24 1_555 TE CA CA . c CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.392 ? metalc ? metalc51 V OD1 ASP 9 c ASP 27 1_555 TE CA CA . c CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.643 ? metalc ? metalc52 V OD2 ASP 9 c ASP 27 1_555 TE CA CA . c CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.459 ? metalc ? metalc53 V OE1 GLU 11 c GLU 29 1_555 TE CA CA . c CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.407 ? metalc ? metalc54 V OG SER 12 c SER 30 1_555 TE CA CA . c CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.411 ? metalc ? metalc55 V OD1 ASN 21 c ASN 39 1_555 EF MG CLA . c CLA 912 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.961 ? metalc ? metalc56 X NE2 HIS 20 e HIS 23 1_555 VF FE HEM . e HEM 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.133 ? metalc ? metalc57 VF FE HEM . e HEM 101 1_555 Y NE2 HIS 13 f HIS 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.149 ? metalc ? metalc58 Y O ARG 34 f ARG 45 1_555 XF CA CA . f CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.009 ? metalc ? metalc59 Y OXT ARG 34 f ARG 45 1_555 XF CA CA . f CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.514 ? metalc ? metalc60 BA O GLY 31 j GLY 31 1_555 BG MG MG . j MG 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.254 ? metalc ? metalc61 BA O ALA 34 j ALA 34 1_555 BG MG MG . j MG 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.334 ? metalc ? metalc62 BA O LEU 36 j LEU 36 1_555 BG MG MG . j MG 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.283 ? metalc ? metalc63 FA O THR 135 o THR 138 1_555 FG CA CA . o CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.28 ? metalc ? metalc64 FA OD1 ASN 197 o ASN 200 1_555 FG CA CA . o CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.587 ? metalc ? metalc65 FA O VAL 198 o VAL 201 1_555 FG CA CA . o CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.508 ? metalc ? metalc66 IA NE2 HIS 41 v HIS 41 1_555 HG FE HEM . v HEM 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.051 ? metalc ? metalc67 IA NE2 HIS 92 v HIS 92 1_555 HG FE HEM . v HEM 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.085 ? # _chem_comp.formula 'C51 H96 O15' _chem_comp.formula_weight 949.299 _chem_comp.id DGD _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG)' _chem_comp.type saccharide _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1A C2A DGD sing 329 n n C1A O1A DGD doub 330 n n C1A O1G DGD sing 331 n n C2A C3A DGD sing 332 n n C2A HA21 DGD sing 333 n n C2A HA22 DGD sing 334 n n C3A C4A DGD sing 335 n n C3A HA31 DGD sing 336 n n C3A HA32 DGD sing 337 n n C4A C5A DGD sing 338 n n C4A HA41 DGD sing 339 n n C4A HA42 DGD sing 340 n n C5A C6A DGD sing 341 n n C5A HA51 DGD sing 342 n n C5A HA52 DGD sing 343 n n C6A C7A DGD sing 344 n n C6A HA61 DGD sing 345 n n C6A HA62 DGD sing 346 n n C7A C8A DGD sing 347 n n C7A HA71 DGD sing 348 n n C7A HA72 DGD sing 349 n n C8A C9A DGD sing 350 n n C8A HA81 DGD sing 351 n n C8A HA82 DGD sing 352 n n C9A CAA DGD sing 353 n n C9A HA91 DGD sing 354 n n C9A HA92 DGD sing 355 n n CAA CBA DGD sing 356 n n CAA HAT1 DGD sing 357 n n CAA HAT2 DGD sing 358 n n CBA CCA DGD sing 359 n n CBA HAE1 DGD sing 360 n n CBA HAE2 DGD sing 361 n n CCA CDA DGD sing 362 n n CCA HAW1 DGD sing 363 n n CCA HAW2 DGD sing 364 n n CDA CEA DGD sing 365 n n CDA HAH1 DGD sing 366 n n CDA HAH2 DGD sing 367 n n CEA CFA DGD sing 368 n n CEA HAF1 DGD sing 369 n n CEA HAF2 DGD sing 370 n n CFA CGA DGD sing 371 n n CFA HAN1 DGD sing 372 n n CFA HAN2 DGD sing 373 n n CGA CHA DGD sing 374 n n CGA HAS1 DGD sing 375 n n CGA HAS2 DGD sing 376 n n CHA CIA DGD sing 377 n n CHA HAV1 DGD sing 378 n n CHA HAV2 DGD sing 379 n n CIA HAG1 DGD sing 380 n n CIA HAG2 DGD sing 381 n n CIA HAG3 DGD sing 382 n n C1B C2B DGD sing 383 n n C1B O1B DGD doub 384 n n C1B O2G DGD sing 385 n n C2B C3B DGD sing 386 n n C2B HB21 DGD sing 387 n n C2B HB22 DGD sing 388 n n C3B C4B DGD sing 389 n n C3B HB31 DGD sing 390 n n C3B HB32 DGD sing 391 n n C4B C5B DGD sing 392 n n C4B HB41 DGD sing 393 n n C4B HB42 DGD sing 394 n n C5B C6B DGD sing 395 n n C5B HB51 DGD sing 396 n n C5B HB52 DGD sing 397 n n C6B C7B DGD sing 398 n n C6B HB61 DGD sing 399 n n C6B HB62 DGD sing 400 n n C7B C8B DGD sing 401 n n C7B HB71 DGD sing 402 n n C7B HB72 DGD sing 403 n n C8B C9B DGD sing 404 n n C8B HB81 DGD sing 405 n n C8B HB82 DGD sing 406 n n C9B CAB DGD sing 407 n n C9B HB91 DGD sing 408 n n C9B HB92 DGD sing 409 n n CAB CBB DGD sing 410 n n CAB HBT1 DGD sing 411 n n CAB HBT2 DGD sing 412 n n CBB CCB DGD sing 413 n n CBB HBE1 DGD sing 414 n n CBB HBE2 DGD sing 415 n n CCB CDB DGD sing 416 n n CCB HBW1 DGD sing 417 n n CCB HBW2 DGD sing 418 n n CDB CEB DGD sing 419 n n CDB HBH1 DGD sing 420 n n CDB HBH2 DGD sing 421 n n CEB CFB DGD sing 422 n n CEB HBF1 DGD sing 423 n n CEB HBF2 DGD sing 424 n n CFB CGB DGD sing 425 n n CFB HBN1 DGD sing 426 n n CFB HBN2 DGD sing 427 n n CGB CHB DGD sing 428 n n CGB HBS1 DGD sing 429 n n CGB HBS2 DGD sing 430 n n CHB CIB DGD sing 431 n n CHB HBV1 DGD sing 432 n n CHB HBV2 DGD sing 433 n n CIB HBG1 DGD sing 434 n n CIB HBG2 DGD sing 435 n n CIB HBG3 DGD sing 436 n n O1G C1G DGD sing 437 n n C1G C2G DGD sing 438 n n C1G HG11 DGD sing 439 n n C1G HG12 DGD sing 440 n n C2G O2G DGD sing 441 n n C2G C3G DGD sing 442 n n C2G HG2 DGD sing 443 n n C3G O3G DGD sing 444 n n C3G HG31 DGD sing 445 n n C3G HG32 DGD sing 446 n n O3G C1D DGD sing 447 n n C1D C2D DGD sing 448 n n C1D O6D DGD sing 449 n n C1D HD1 DGD sing 450 n n C2D O2D DGD sing 451 n n C2D C3D DGD sing 452 n n C2D HD2 DGD sing 453 n n O2D HO2D DGD sing 454 n n C3D O3D DGD sing 455 n n C3D C4D DGD sing 456 n n C3D HD3 DGD sing 457 n n O3D HO3D DGD sing 458 n n C4D O4D DGD sing 459 n n C4D C5D DGD sing 460 n n C4D HD4 DGD sing 461 n n O4D HO4D DGD sing 462 n n C5D C6D DGD sing 463 n n C5D O6D DGD sing 464 n n C5D HD5 DGD sing 465 n n O5D C6D DGD sing 466 n n O5D C1E DGD sing 467 n n C6D HD61 DGD sing 468 n n C6D HD62 DGD sing 469 n n C1E C2E DGD sing 470 n n C1E O6E DGD sing 471 n n C1E HE1 DGD sing 472 n n C2E O2E DGD sing 473 n n C2E C3E DGD sing 474 n n C2E HE2 DGD sing 475 n n O2E HO2E DGD sing 476 n n C3E O3E DGD sing 477 n n C3E C4E DGD sing 478 n n C3E HE3 DGD sing 479 n n O3E HO3E DGD sing 480 n n C4E O4E DGD sing 481 n n C4E C5E DGD sing 482 n n C4E HE4 DGD sing 483 n n O4E HO4E DGD sing 484 n n C5E O6E DGD sing 485 n n C5E C6E DGD sing 486 n n C5E HE5 DGD sing 487 n n C6E O5E DGD sing 488 n n C6E HE61 DGD sing 489 n n C6E HE62 DGD sing 490 n n O5E HO5E DGD sing 491 n n # _atom_sites.entry_id 4PBU _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.007505 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.00442 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.003256 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code MA 20 OEX A 1 601 601 OEX OEX . NA 21 FE2 A 1 602 603 FE2 FE2 . OA 22 CL A 1 603 679 CL CL . PA 22 CL A 1 604 680 CL CL . QA 23 BCT A 1 605 681 BCT BCT . RA 24 CLA A 1 606 604 CLA CLA . SA 24 CLA A 1 607 607 CLA CLA . TA 25 PHO A 1 608 608 PHO PHO . UA 24 CLA A 1 609 610 CLA CLA . VA 26 BCR A 1 610 645 BCR BCR . WA 27 PL9 A 1 611 713 PL9 PL9 . XA 28 SQD A 1 612 659 SQD SQD . YA 28 SQD A 1 613 667 SQD SQD . ZA 24 CLA A 1 614 606 CLA CLA . AB 29 LHG A 1 615 772 LHG LHG . BB 30 CA B 1 601 803 CA CA . CB 24 CLA B 1 602 612 CLA CLA . DB 24 CLA B 1 603 613 CLA CLA . EB 24 CLA B 1 604 614 CLA CLA . FB 24 CLA B 1 605 615 CLA CLA . GB 24 CLA B 1 606 616 CLA CLA . HB 24 CLA B 1 607 617 CLA CLA . IB 24 CLA B 1 608 618 CLA CLA . JB 24 CLA B 1 609 619 CLA CLA . KB 24 CLA B 1 610 620 CLA CLA . LB 24 CLA B 1 611 621 CLA CLA . MB 24 CLA B 1 612 622 CLA CLA . NB 24 CLA B 1 613 623 CLA CLA . OB 24 CLA B 1 614 624 CLA CLA . PB 24 CLA B 1 615 625 CLA CLA . QB 24 CLA B 1 616 626 CLA CLA . RB 24 CLA B 1 617 627 CLA CLA . SB 26 BCR B 1 618 646 BCR BCR . TB 26 BCR B 1 619 648 BCR BCR . UB 26 BCR B 1 620 649 BCR BCR . VB 29 LHG B 1 621 694 LHG LHG . WB 26 BCR B 1 622 647 BCR BCR . XB 24 CLA C 1 501 628 CLA CLA . YB 24 CLA C 1 502 629 CLA CLA . ZB 24 CLA C 1 503 630 CLA CLA . AC 24 CLA C 1 504 631 CLA CLA . BC 24 CLA C 1 505 632 CLA CLA . CC 24 CLA C 1 506 633 CLA CLA . DC 24 CLA C 1 507 634 CLA CLA . EC 24 CLA C 1 508 635 CLA CLA . FC 24 CLA C 1 509 636 CLA CLA . GC 24 CLA C 1 510 637 CLA CLA . HC 24 CLA C 1 511 638 CLA CLA . IC 24 CLA C 1 512 639 CLA CLA . JC 24 CLA C 1 513 640 CLA CLA . KC 26 BCR C 1 514 654 BCR BCR . LC 26 BCR C 1 515 655 BCR BCR . MC 31 DGD C 1 516 657 DGD DGD . NC 31 DGD C 1 517 660 DGD DGD . OC 31 DGD C 1 518 661 DGD DGD . PC 25 PHO D 1 401 609 PHO PHO . QC 24 CLA D 1 402 605 CLA CLA . RC 24 CLA D 1 403 611 CLA CLA . SC 26 BCR D 1 404 651 BCR BCR . TC 27 PL9 D 1 405 712 PL9 PL9 . UC 31 DGD D 1 406 755 DGD DGD . VC 29 LHG D 1 407 664 LHG LHG . WC 29 LHG D 1 408 702 LHG LHG . XC 29 LHG D 1 409 714 LHG LHG . YC 32 HEM E 1 101 641 HEM HEM . ZC 28 SQD F 1 101 768 SQD SQD . AD 30 CA F 1 102 796 CA CA . BD 26 BCR H 1 101 650 BCR BCR . CD 31 DGD H 1 102 663 DGD DGD . DD 26 BCR K 1 101 653 BCR BCR . ED 28 SQD L 1 101 668 SQD SQD . FD 30 CA O 1 301 767 CA CA . GD 26 BCR T 1 101 647 BCR BCR . HD 26 BCR T 1 102 646 BCR BCR . ID 22 CL V 1 201 808 CL CL . JD 32 HEM V 1 202 642 HEM HEM . KD 26 BCR Y 1 101 652 BCR BCR . LD 20 OEX a 1 401 601 OEX OEX . MD 28 SQD a 1 402 667 SQD SQD . ND 21 FE2 a 1 403 603 FE2 FE2 . OD 22 CL a 1 404 679 CL CL . PD 22 CL a 1 405 680 CL CL . QD 24 CLA a 1 406 604 CLA CLA . RD 24 CLA a 1 407 607 CLA CLA . SD 24 CLA a 1 408 610 CLA CLA . TD 26 BCR a 1 409 645 BCR BCR . UD 27 PL9 a 1 410 713 PL9 PL9 . VD 28 SQD a 1 411 659 SQD SQD . WD 25 PHO a 1 412 609 PHO PHO . XD 29 LHG a 1 413 772 LHG LHG . YD 23 BCT a 1 414 681 BCT BCT . ZD 30 CA b 1 601 803 CA CA . AE 24 CLA b 1 602 612 CLA CLA . BE 24 CLA b 1 603 613 CLA CLA . CE 24 CLA b 1 604 614 CLA CLA . DE 24 CLA b 1 605 615 CLA CLA . EE 24 CLA b 1 606 616 CLA CLA . FE 24 CLA b 1 607 617 CLA CLA . GE 24 CLA b 1 608 618 CLA CLA . HE 24 CLA b 1 609 619 CLA CLA . IE 24 CLA b 1 610 620 CLA CLA . JE 24 CLA b 1 611 621 CLA CLA . KE 24 CLA b 1 612 622 CLA CLA . LE 24 CLA b 1 613 623 CLA CLA . ME 24 CLA b 1 614 624 CLA CLA . NE 24 CLA b 1 615 625 CLA CLA . OE 24 CLA b 1 616 626 CLA CLA . PE 24 CLA b 1 617 627 CLA CLA . QE 26 BCR b 1 618 648 BCR BCR . RE 26 BCR b 1 619 649 BCR BCR . SE 29 LHG b 1 620 694 LHG LHG . TE 30 CA c 1 901 901 CA CA . UE 24 CLA c 1 902 628 CLA CLA . VE 24 CLA c 1 903 629 CLA CLA . WE 24 CLA c 1 904 630 CLA CLA . XE 24 CLA c 1 905 631 CLA CLA . YE 24 CLA c 1 906 632 CLA CLA . ZE 24 CLA c 1 907 633 CLA CLA . AF 24 CLA c 1 908 634 CLA CLA . BF 24 CLA c 1 909 635 CLA CLA . CF 24 CLA c 1 910 636 CLA CLA . DF 24 CLA c 1 911 637 CLA CLA . EF 24 CLA c 1 912 638 CLA CLA . FF 24 CLA c 1 913 639 CLA CLA . GF 24 CLA c 1 914 640 CLA CLA . HF 26 BCR c 1 915 655 BCR BCR . IF 31 DGD c 1 916 657 DGD DGD . JF 31 DGD c 1 917 660 DGD DGD . KF 26 BCR c 1 918 654 BCR BCR . LF 24 CLA d 1 401 606 CLA CLA . MF 25 PHO d 1 402 608 PHO PHO . NF 24 CLA d 1 403 605 CLA CLA . OF 24 CLA d 1 404 611 CLA CLA . PF 27 PL9 d 1 405 712 PL9 PL9 . QF 31 DGD d 1 406 755 DGD DGD . RF 28 SQD d 1 407 768 SQD SQD . SF 29 LHG d 1 408 664 LHG LHG . TF 29 LHG d 1 409 702 LHG LHG . UF 29 LHG d 1 410 714 LHG LHG . VF 32 HEM e 1 101 641 HEM HEM . WF 26 BCR f 1 101 651 BCR BCR . XF 30 CA f 1 102 796 CA CA . YF 26 BCR h 1 101 650 BCR BCR . ZF 31 DGD h 1 102 663 DGD DGD . AG 31 DGD j 1 101 661 DGD DGD . BG 33 MG j 1 102 771 MG MG . CG 26 BCR k 1 101 652 BCR BCR . DG 26 BCR k 1 102 653 BCR BCR . EG 28 SQD l 1 101 668 SQD SQD . FG 30 CA o 1 301 767 CA CA . GG 22 CL v 1 201 808 CL CL . HG 32 HEM v 1 202 642 HEM HEM . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1A DGD . . . AG 31 -15.928 28.693 -1.28 1 37.35 ? C1A DGD 101 j 1 HETATM 2 C C2A DGD . . . AG 31 -16.34 27.298 -0.86 1 39.03 ? C2A DGD 101 j 1 HETATM 3 C C3A DGD . . . AG 31 -16.829 26.503 -2.065 1 41.73 ? C3A DGD 101 j 1 HETATM 4 C C4A DGD . . . AG 31 -15.986 25.245 -2.253 1 44.15 ? C4A DGD 101 j 1 HETATM 5 C C5A DGD . . . AG 31 -16.866 24.006 -2.299 1 46.14 ? C5A DGD 101 j 1 HETATM 6 C C6A DGD . . . AG 31 -16.073 22.8 -2.783 1 46.97 ? C6A DGD 101 j 1 HETATM 7 C C7A DGD . . . AG 31 -16.943 21.555 -2.858 1 48.37 ? C7A DGD 101 j 1 HETATM 8 C C8A DGD . . . AG 31 -16.079 20.328 -2.596 1 49.52 ? C8A DGD 101 j 1 HETATM 9 C C9A DGD . . . AG 31 -15.964 19.425 -3.819 1 49.52 ? C9A DGD 101 j 1 HETATM 10 C CAA DGD . . . AG 31 -16.299 17.991 -3.42 1 50.2 ? CAA DGD 101 j 1 HETATM 11 C CBA DGD . . . AG 31 -17.808 17.766 -3.368 1 50.44 ? CBA DGD 101 j 1 HETATM 12 C CCA DGD . . . AG 31 -18.169 16.323 -3.053 1 50.21 ? CCA DGD 101 j 1 HETATM 13 C CDA DGD . . . AG 31 -19.648 16.108 -3.336 1 51.18 ? CDA DGD 101 j 1 HETATM 14 C CEA DGD . . . AG 31 -19.881 15.324 -4.626 1 51.16 ? CEA DGD 101 j 1 HETATM 15 C CFA DGD . . . AG 31 -21.38 15.211 -4.905 1 51.27 ? CFA DGD 101 j 1 HETATM 16 C CGA DGD . . . AG 31 -21.727 13.925 -5.653 1 51.04 ? CGA DGD 101 j 1 HETATM 17 O O1A DGD . . . AG 31 -16.743 29.532 -1.618 1 37.32 ? O1A DGD 101 j 1 HETATM 18 C C1B DGD . . . AG 31 -11.049 29.768 -2.6 1 31.09 ? C1B DGD 101 j 1 HETATM 19 C C2B DGD . . . AG 31 -10.68 29.6 -4.054 1 33.51 ? C2B DGD 101 j 1 HETATM 20 C C3B DGD . . . AG 31 -9.519 28.643 -4.291 1 36.49 ? C3B DGD 101 j 1 HETATM 21 C C4B DGD . . . AG 31 -9.786 27.224 -3.812 1 38.89 ? C4B DGD 101 j 1 HETATM 22 C C5B DGD . . . AG 31 -11.08 26.634 -4.345 1 39.51 ? C5B DGD 101 j 1 HETATM 23 C C6B DGD . . . AG 31 -10.739 25.242 -4.844 1 41.5 ? C6B DGD 101 j 1 HETATM 24 C C7B DGD . . . AG 31 -11.956 24.34 -4.949 1 43.47 ? C7B DGD 101 j 1 HETATM 25 C C8B DGD . . . AG 31 -11.459 22.898 -4.931 1 45.59 ? C8B DGD 101 j 1 HETATM 26 C C9B DGD . . . AG 31 -12.311 22.003 -5.819 1 47.82 ? C9B DGD 101 j 1 HETATM 27 C CAB DGD . . . AG 31 -11.696 20.612 -5.917 1 49.23 ? CAB DGD 101 j 1 HETATM 28 C CBB DGD . . . AG 31 -12.213 19.872 -7.146 1 50.91 ? CBB DGD 101 j 1 HETATM 29 C CCB DGD . . . AG 31 -11.092 19.049 -7.765 1 52.45 ? CCB DGD 101 j 1 HETATM 30 C CDB DGD . . . AG 31 -11.552 18.34 -9.031 1 53.84 ? CDB DGD 101 j 1 HETATM 31 C CEB DGD . . . AG 31 -10.706 18.776 -10.225 1 54.78 ? CEB DGD 101 j 1 HETATM 32 C CFB DGD . . . AG 31 -10.867 17.826 -11.409 1 55.32 ? CFB DGD 101 j 1 HETATM 33 C CGB DGD . . . AG 31 -11.834 18.391 -12.443 1 55.59 ? CGB DGD 101 j 1 HETATM 34 O O1B DGD . . . AG 31 -10.318 29.445 -1.682 1 31.08 ? O1B DGD 101 j 1 HETATM 35 O O1G DGD . . . AG 31 -14.533 29.072 -1.277 1 34.7 ? O1G DGD 101 j 1 HETATM 36 C C1G DGD . . . AG 31 -14.181 30.402 -0.914 1 31.95 ? C1G DGD 101 j 1 HETATM 37 C C2G DGD . . . AG 31 -12.668 30.458 -0.966 1 30.07 ? C2G DGD 101 j 1 HETATM 38 O O2G DGD . . . AG 31 -12.343 30.34 -2.329 1 29.97 ? O2G DGD 101 j 1 HETATM 39 C C3G DGD . . . AG 31 -12.175 31.795 -0.432 1 30.35 ? C3G DGD 101 j 1 HETATM 40 O O3G DGD . . . AG 31 -12.828 32.004 0.811 1 29.93 ? O3G DGD 101 j 1 HETATM 41 C C1D DGD . . . AG 31 -12.501 33.25 1.389 1 27.78 ? C1D DGD 101 j 1 HETATM 42 C C2D DGD . . . AG 31 -13.451 33.436 2.548 1 26.6 ? C2D DGD 101 j 1 HETATM 43 O O2D DGD . . . AG 31 -14.79 33.611 2.036 1 27.04 ? O2D DGD 101 j 1 HETATM 44 C C3D DGD . . . AG 31 -13.002 34.646 3.364 1 27.05 ? C3D DGD 101 j 1 HETATM 45 O O3D DGD . . . AG 31 -13.845 34.837 4.498 1 25.9 ? O3D DGD 101 j 1 HETATM 46 C C4D DGD . . . AG 31 -11.535 34.52 3.775 1 27.01 ? C4D DGD 101 j 1 HETATM 47 O O4D DGD . . . AG 31 -11.326 33.387 4.652 1 27.76 ? O4D DGD 101 j 1 HETATM 48 C C5D DGD . . . AG 31 -10.677 34.328 2.527 1 27.38 ? C5D DGD 101 j 1 HETATM 49 O O5D DGD . . . AG 31 -8.868 35.034 3.921 1 29.87 ? O5D DGD 101 j 1 HETATM 50 C C6D DGD . . . AG 31 -9.202 34.119 2.874 1 27.92 ? C6D DGD 101 j 1 HETATM 51 O O6D DGD . . . AG 31 -11.127 33.179 1.812 1 27.59 ? O6D DGD 101 j 1 HETATM 52 C C1E DGD . . . AG 31 -7.506 35.459 3.92 1 27.86 ? C1E DGD 101 j 1 HETATM 53 C C2E DGD . . . AG 31 -7.228 36.258 5.2 1 28.61 ? C2E DGD 101 j 1 HETATM 54 O O2E DGD . . . AG 31 -7.575 35.504 6.376 1 27.65 ? O2E DGD 101 j 1 HETATM 55 C C3E DGD . . . AG 31 -7.98 37.596 5.192 1 28.69 ? C3E DGD 101 j 1 HETATM 56 O O3E DGD . . . AG 31 -7.506 38.398 6.264 1 29.74 ? O3E DGD 101 j 1 HETATM 57 C C4E DGD . . . AG 31 -7.781 38.387 3.89 1 29.04 ? C4E DGD 101 j 1 HETATM 58 O O4E DGD . . . AG 31 -6.433 38.856 3.821 1 29.72 ? O4E DGD 101 j 1 HETATM 59 C C5E DGD . . . AG 31 -8.069 37.482 2.69 1 29.23 ? C5E DGD 101 j 1 HETATM 60 O O6E DGD . . . AG 31 -7.258 36.295 2.774 1 28.78 ? O6E DGD 101 j 1 HETATM 61 C C6E DGD . . . AG 31 -7.849 38.204 1.356 1 30.89 ? C6E DGD 101 j 1 HETATM 62 O O5E DGD . . . AG 31 -8.09 37.299 0.265 1 34.4 ? O5E DGD 101 j 1 # _model_server_stats.io_time_ms 30 _model_server_stats.parse_time_ms 22 _model_server_stats.create_model_time_ms 111 _model_server_stats.query_time_ms 522 _model_server_stats.encode_time_ms 8 _model_server_stats.element_count 62 #