data_4PI2 # _model_server_result.job_id cThsblMg4N6An-rwOJReqg _model_server_result.datetime_utc '2024-11-07 06:37:14' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 4pi2 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"P","auth_seq_id":301}' # _entry.id 4PI2 # _exptl.entry_id 4PI2 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 65.409 _entity.id 6 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'ZINC ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 5 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 4PI2 _cell.length_a 120.857 _cell.length_b 185.45 _cell.length_c 192.777 _cell.Z_PDB 12 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 4PI2 _symmetry.cell_setting . _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dodecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 12 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 6 P N N ? 6 Q N N ? 6 R N N ? 6 S N N ? 6 T N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale ? covale1 A C UNK 1 D UNK 3 1_555 A N UNK 2 D UNK 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? covale ? covale2 A C UNK 2 D UNK 4 1_555 A N UNK 3 D UNK 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.353 ? covale ? covale3 A C UNK 3 D UNK 5 1_555 A N UNK 4 D UNK 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.351 ? covale ? covale4 A C UNK 4 D UNK 6 1_555 A N UNK 5 D UNK 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? covale ? covale5 A C UNK 5 D UNK 7 1_555 A N UNK 6 D UNK 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.337 ? covale ? covale6 A C UNK 6 D UNK 8 1_555 A N UNK 7 D UNK 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale7 A C UNK 7 D UNK 9 1_555 A N UNK 8 D UNK 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.342 ? covale ? covale8 A C UNK 8 D UNK 10 1_555 A N UNK 9 D UNK 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.351 ? covale ? covale9 A C UNK 9 D UNK 11 1_555 A N UNK 10 D UNK 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale10 A C UNK 10 D UNK 12 1_555 A N UNK 11 D UNK 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.351 ? covale ? covale11 A C UNK 11 D UNK 13 1_555 A N UNK 12 D UNK 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.343 ? covale ? covale12 A C UNK 12 D UNK 14 1_555 A N UNK 13 D UNK 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.341 ? covale ? covale13 A C UNK 13 D UNK 15 1_555 A N UNK 14 D UNK 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.358 ? covale ? covale14 A C UNK 14 D UNK 16 1_555 A N UNK 15 D UNK 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.349 ? covale ? covale15 A C UNK 15 D UNK 17 1_555 A N UNK 16 D UNK 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? covale ? covale16 A C UNK 16 D UNK 18 1_555 A N UNK 17 D UNK 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.347 ? covale ? covale17 A C UNK 17 D UNK 19 1_555 A N UNK 18 D UNK 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale18 A C UNK 18 D UNK 20 1_555 A N UNK 19 D UNK 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.344 ? covale ? covale19 B C UNK 1 H UNK 3 1_555 B N UNK 2 H UNK 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.339 ? covale ? covale20 B C UNK 2 H UNK 4 1_555 B N UNK 3 H UNK 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.353 ? covale ? covale21 B C UNK 3 H UNK 5 1_555 B N UNK 4 H UNK 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.337 ? covale ? covale22 B C UNK 4 H UNK 6 1_555 B N UNK 5 H UNK 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.341 ? covale ? covale23 B C UNK 5 H UNK 7 1_555 B N UNK 6 H UNK 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.351 ? covale ? covale24 B C UNK 6 H UNK 8 1_555 B N UNK 7 H UNK 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale25 B C UNK 7 H UNK 9 1_555 B N UNK 8 H UNK 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.343 ? covale ? covale26 B C UNK 8 H UNK 10 1_555 B N UNK 9 H UNK 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.348 ? covale ? covale27 B C UNK 9 H UNK 11 1_555 B N UNK 10 H UNK 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.337 ? covale ? covale28 B C UNK 10 H UNK 12 1_555 B N UNK 11 H UNK 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.344 ? covale ? covale29 B C UNK 11 H UNK 13 1_555 B N UNK 12 H UNK 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.341 ? covale ? covale30 B C UNK 12 H UNK 14 1_555 B N UNK 13 H UNK 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.359 ? covale ? covale31 B C UNK 13 H UNK 15 1_555 B N UNK 14 H UNK 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.342 ? covale ? covale32 B C UNK 14 H UNK 16 1_555 B N UNK 15 H UNK 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale33 B C UNK 15 H UNK 17 1_555 B N UNK 16 H UNK 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale34 B C UNK 16 H UNK 18 1_555 B N UNK 17 H UNK 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.345 ? covale ? covale35 B C UNK 17 H UNK 19 1_555 B N UNK 18 H UNK 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.344 ? covale ? covale36 B C UNK 18 H UNK 20 1_555 B N UNK 19 H UNK 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.347 ? covale ? covale37 B C UNK 19 H UNK 21 1_555 B N UNK 20 H UNK 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.343 ? covale ? covale38 E C UNK 1 N UNK 1 1_555 E N UNK 2 N UNK 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.339 ? covale ? covale39 E C UNK 2 N UNK 2 1_555 E N UNK 3 N UNK 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.339 ? covale ? covale40 E C UNK 3 N UNK 3 1_555 E N UNK 4 N UNK 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.342 ? covale ? covale41 E C UNK 4 N UNK 4 1_555 E N UNK 5 N UNK 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.345 ? covale ? covale42 E C UNK 5 N UNK 5 1_555 E N UNK 6 N UNK 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.347 ? covale ? covale43 E C UNK 6 N UNK 6 1_555 E N UNK 7 N UNK 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.347 ? covale ? covale44 E C UNK 7 N UNK 7 1_555 E N UNK 8 N UNK 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.34 ? covale ? covale45 E C UNK 8 N UNK 8 1_555 E N UNK 9 N UNK 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.338 ? covale ? covale46 E C UNK 9 N UNK 9 1_555 E N UNK 10 N UNK 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? covale ? covale47 E C UNK 10 N UNK 10 1_555 E N UNK 11 N UNK 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.35 ? covale ? covale48 E C UNK 11 N UNK 11 1_555 E N UNK 12 N UNK 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.354 ? covale ? covale49 E C UNK 12 N UNK 12 1_555 E N UNK 13 N UNK 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale50 E C UNK 13 N UNK 13 1_555 E N UNK 14 N UNK 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.337 ? covale ? covale51 E C UNK 14 N UNK 14 1_555 E N UNK 15 N UNK 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.349 ? covale ? covale52 E C UNK 15 N UNK 15 1_555 E N UNK 16 N UNK 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.346 ? covale ? covale53 E C UNK 16 N UNK 16 1_555 E N UNK 17 N UNK 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.348 ? covale ? covale54 E C UNK 17 N UNK 17 1_555 E N UNK 18 N UNK 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.343 ? covale ? covale55 E C UNK 18 N UNK 18 1_555 E N UNK 19 N UNK 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.349 ? covale ? covale56 E C UNK 19 N UNK 19 1_555 E N UNK 20 N UNK 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.352 ? covale ? covale57 E C UNK 20 N UNK 20 1_555 E N UNK 21 N UNK 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? covale ? covale58 E C UNK 21 N UNK 21 1_555 E N UNK 22 N UNK 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.341 ? covale ? covale59 E C UNK 22 N UNK 22 1_555 E N UNK 23 N UNK 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.353 ? covale ? covale60 E C UNK 23 N UNK 23 1_555 E N UNK 24 N UNK 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.354 ? covale ? covale61 E C UNK 24 N UNK 24 1_555 E N UNK 25 N UNK 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.342 ? metalc ? metalc1 D ND1 HIS 29 E HIS 29 1_555 M CU CU . E CU 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.696 ? metalc ? metalc2 D ND1 HIS 133 E HIS 133 1_555 M CU CU . E CU 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.24 ? metalc ? metalc3 D NE2 HIS 135 E HIS 135 1_555 M CU CU . E CU 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.834 ? metalc ? metalc4 D OD1 ASP 330 E ASP 330 1_555 T ZN ZN . C ZN 302 3_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.136 ? metalc ? metalc5 F ND1 HIS 29 A HIS 29 1_555 N CU CU . A CU 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.586 ? metalc ? metalc6 F ND1 HIS 133 A HIS 133 1_555 N CU CU . A CU 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.337 ? metalc ? metalc7 F NE2 HIS 135 A HIS 135 1_555 N CU CU . A CU 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.17 ? metalc ? metalc8 G ND1 HIS 29 I HIS 29 1_555 O CU CU . I CU 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.65 ? metalc ? metalc9 G ND1 HIS 133 I HIS 133 1_555 O CU CU . I CU 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.326 ? metalc ? metalc10 G NE2 HIS 135 I HIS 135 1_555 O CU CU . I CU 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.84 ? metalc ? metalc11 H OD2 ASP 93 G ASP 93 1_555 Q ZN ZN . G ZN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.452 ? metalc ? metalc12 H OD2 ASP 129 G ASP 129 1_555 P ZN ZN . G ZN 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.903 ? metalc ? metalc13 H NE2 HIS 133 G HIS 133 1_555 P ZN ZN . G ZN 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.193 ? metalc ? metalc14 H NE2 HIS 146 G HIS 146 1_555 P ZN ZN . G ZN 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.066 ? metalc ? metalc15 K OD1 ASP 129 K ASP 129 1_555 R ZN ZN . K ZN 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.621 ? metalc ? metalc16 K OD2 ASP 129 K ASP 129 1_555 R ZN ZN . K ZN 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.842 ? metalc ? metalc17 K NE2 HIS 133 K HIS 133 1_555 R ZN ZN . K ZN 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.177 ? metalc ? metalc18 K NE2 HIS 146 K HIS 146 1_555 R ZN ZN . K ZN 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.886 ? metalc ? metalc19 K OE2 GLU 201 K GLU 201 1_555 R ZN ZN . K ZN 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.247 ? metalc ? metalc20 L OD2 ASP 93 C ASP 93 1_555 T ZN ZN . C ZN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.278 ? metalc ? metalc21 L OD2 ASP 129 C ASP 129 1_555 S ZN ZN . C ZN 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.873 ? metalc ? metalc22 L NE2 HIS 133 C HIS 133 1_555 S ZN ZN . C ZN 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.172 ? metalc ? metalc23 L NE2 HIS 146 C HIS 146 1_555 S ZN ZN . C ZN 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.015 ? metalc ? metalc24 L ND1 HIS 177 C HIS 177 1_555 T ZN ZN . C ZN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.342 ? metalc ? metalc25 L OE2 GLU 201 C GLU 201 1_555 S ZN ZN . C ZN 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.707 ? metalc ? metalc26 T ZN ZN . C ZN 302 1_555 U O2 CAC . C CAC 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.18 ? # _chem_comp.formula 'Zn 2' _chem_comp.formula_weight 65.409 _chem_comp.id ZN _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'ZINC ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 4PI2 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.008274 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.005392 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.005187 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code M 5 CU E 1 501 1 CU CU . N 5 CU A 1 501 2 CU CU . O 5 CU I 1 501 3 CU CU . P 6 ZN G 1 301 2 ZN ZN . Q 6 ZN G 1 302 5 ZN ZN . R 6 ZN K 1 301 1 ZN ZN . S 6 ZN C 1 301 3 ZN ZN . T 6 ZN C 1 302 4 ZN ZN . U 7 CAC C 1 303 1 CAC CAC . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol ZN _atom_site.label_atom_id ZN _atom_site.label_comp_id ZN _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id P _atom_site.label_entity_id 6 _atom_site.Cartn_x 7.732 _atom_site.Cartn_y -2.138 _atom_site.Cartn_z 44.446 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 64.26 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id ZN _atom_site.auth_comp_id ZN _atom_site.auth_seq_id 301 _atom_site.auth_asym_id G _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 16 _model_server_stats.parse_time_ms 16 _model_server_stats.create_model_time_ms 84 _model_server_stats.query_time_ms 571 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 1 #