data_4PKO # _model_server_result.job_id 7j00nqpzKDIbeOc99aKWjg _model_server_result.datetime_utc '2024-12-27 04:13:54' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 4pko # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"MA","auth_seq_id":603}' # _entry.id 4PKO # _exptl.entry_id 4PKO _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 24.305 _entity.id 5 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MAGNESIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 14 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 4PKO _cell.length_a 169.79 _cell.length_b 174.49 _cell.length_c 410.16 _cell.Z_PDB 56 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 4PKO _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 28-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 28 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,AC,BC,CC,DC,EC,FC _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 5 EA N N ? 5 IA N N ? 5 MA N N ? 5 QA N N ? 5 UA N N ? 5 YA N N ? 5 CB N N ? 5 GB N N ? 5 KB N N ? 5 OB N N ? 5 SB N N ? 5 WB N N ? 5 AC N N ? 5 EC N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale ? covale1 G C GLY 471 G GLY 471 1_555 P ND2 ASN 2 P ASN 2 3_554 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.527 ? covale ? covale2 P CE MET 1 P MET 1 1_555 P CG2 ILE 78 P ILE 78 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.627 ? metalc ? metalc1 A O THR 30 A THR 30 1_555 FA K K . A K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.913 ? metalc ? metalc2 A OG1 THR 30 A THR 30 1_555 FA K K . A K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.699 ? metalc ? metalc3 A O LYS 51 A LYS 51 1_555 FA K K . A K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.669 ? metalc ? metalc4 A OD1 ASP 87 A ASP 87 1_555 EA MG MG . A MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.333 ? metalc ? metalc5 A OD2 ASP 87 A ASP 87 1_555 EA MG MG . A MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.537 ? metalc ? metalc6 A OG1 THR 90 A THR 90 1_555 FA K K . A K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.882 ? metalc ? metalc7 CA O3B ADP . A ADP 601 1_555 DA BE BEF . A BEF 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.198 ? metalc ? metalc8 CA O1B ADP . A ADP 601 1_555 EA MG MG . A MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.047 ? metalc ? metalc9 CA O3B ADP . A ADP 601 1_555 EA MG MG . A MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.354 ? metalc ? metalc10 CA O1A ADP . A ADP 601 1_555 EA MG MG . A MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.123 ? metalc ? metalc11 CA O3B ADP . A ADP 601 1_555 FA K K . A K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.329 ? metalc ? metalc12 CA O2A ADP . A ADP 601 1_555 FA K K . A K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.214 ? metalc ? metalc13 B OG1 THR 30 B THR 30 1_555 JA K K . B K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.249 ? metalc ? metalc14 B O LYS 51 B LYS 51 1_555 JA K K . B K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.765 ? metalc ? metalc15 B OD1 ASP 87 B ASP 87 1_555 IA MG MG . B MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.943 ? metalc ? metalc16 B OG1 THR 90 B THR 90 1_555 JA K K . B K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.721 ? metalc ? metalc17 GA O1A ADP . B ADP 601 1_555 IA MG MG . B MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.558 ? metalc ? metalc18 GA O3A ADP . B ADP 601 1_555 IA MG MG . B MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.726 ? metalc ? metalc19 GA O3B ADP . B ADP 601 1_555 JA K K . B K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.986 ? metalc ? metalc20 GA O2A ADP . B ADP 601 1_555 JA K K . B K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.875 ? metalc ? metalc21 C O THR 30 C THR 30 1_555 NA K K . C K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.319 ? metalc ? metalc22 C OG1 THR 30 C THR 30 1_555 NA K K . C K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.677 ? metalc ? metalc23 C O LYS 51 C LYS 51 1_555 NA K K . C K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.616 ? metalc ? metalc24 C OD1 ASP 87 C ASP 87 1_555 MA MG MG . C MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.443 ? metalc ? metalc25 C OD2 ASP 87 C ASP 87 1_555 MA MG MG . C MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.531 ? metalc ? metalc26 C OG1 THR 90 C THR 90 1_555 NA K K . C K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.766 ? metalc ? metalc27 KA O2B ADP . C ADP 601 1_555 MA MG MG . C MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.825 ? metalc ? metalc28 KA O1B ADP . C ADP 601 1_555 NA K K . C K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.057 ? metalc ? metalc29 KA O3B ADP . C ADP 601 1_555 NA K K . C K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.824 ? metalc ? metalc30 KA O3A ADP . C ADP 601 1_555 NA K K . C K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.964 ? metalc ? metalc31 D O THR 30 D THR 30 1_555 RA K K . D K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.313 ? metalc ? metalc32 D OG1 THR 30 D THR 30 1_555 RA K K . D K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.062 ? metalc ? metalc33 D O LYS 51 D LYS 51 1_555 RA K K . D K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.634 ? metalc ? metalc34 D OD1 ASP 87 D ASP 87 1_555 QA MG MG . D MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.979 ? metalc ? metalc35 D OD2 ASP 87 D ASP 87 1_555 QA MG MG . D MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.761 ? metalc ? metalc36 D OG1 THR 90 D THR 90 1_555 RA K K . D K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.979 ? metalc ? metalc37 OA O1A ADP . D ADP 601 1_555 QA MG MG . D MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.406 ? metalc ? metalc38 OA O3A ADP . D ADP 601 1_555 QA MG MG . D MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.287 ? metalc ? metalc39 OA O2A ADP . D ADP 601 1_555 RA K K . D K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.988 ? metalc ? metalc40 OA O3A ADP . D ADP 601 1_555 RA K K . D K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.44 ? metalc ? metalc41 E O THR 30 E THR 30 1_555 VA K K . E K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.275 ? metalc ? metalc42 E OG1 THR 30 E THR 30 1_555 VA K K . E K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.286 ? metalc ? metalc43 E O LYS 51 E LYS 51 1_555 VA K K . E K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.712 ? metalc ? metalc44 E OD1 ASP 87 E ASP 87 1_555 UA MG MG . E MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.654 ? metalc ? metalc45 E OG1 THR 90 E THR 90 1_555 VA K K . E K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.162 ? metalc ? metalc46 SA O1A ADP . E ADP 601 1_555 UA MG MG . E MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.822 ? metalc ? metalc47 SA O3A ADP . E ADP 601 1_555 UA MG MG . E MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.607 ? metalc ? metalc48 SA O2A ADP . E ADP 601 1_555 VA K K . E K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.25 ? metalc ? metalc49 SA O3A ADP . E ADP 601 1_555 VA K K . E K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.15 ? metalc ? metalc50 F O THR 30 F THR 30 1_555 ZA K K . F K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.833 ? metalc ? metalc51 F OD1 ASP 87 F ASP 87 1_555 YA MG MG . F MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.085 ? metalc ? metalc52 WA O1B ADP . F ADP 601 1_555 YA MG MG . F MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.384 ? metalc ? metalc53 WA O1A ADP . F ADP 601 1_555 YA MG MG . F MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.853 ? metalc ? metalc54 WA O2A ADP . F ADP 601 1_555 YA MG MG . F MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.993 ? metalc ? metalc55 WA O2A ADP . F ADP 601 1_555 ZA K K . F K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.691 ? metalc ? metalc56 WA O3A ADP . F ADP 601 1_555 ZA K K . F K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.069 ? metalc ? metalc57 WA O5' ADP . F ADP 601 1_555 ZA K K . F K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.739 ? metalc ? metalc58 G O THR 30 G THR 30 1_555 DB K K . G K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.921 ? metalc ? metalc59 G OG1 THR 30 G THR 30 1_555 DB K K . G K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.724 ? metalc ? metalc60 G O LYS 51 G LYS 51 1_555 DB K K . G K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.557 ? metalc ? metalc61 G OD1 ASP 87 G ASP 87 1_555 CB MG MG . G MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.373 ? metalc ? metalc62 G OG1 THR 90 G THR 90 1_555 DB K K . G K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.079 ? metalc ? metalc63 AB O1A ADP . G ADP 601 1_555 CB MG MG . G MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.848 ? metalc ? metalc64 AB O3A ADP . G ADP 601 1_555 CB MG MG . G MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.579 ? metalc ? metalc65 AB O3B ADP . G ADP 601 1_555 DB K K . G K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.151 ? metalc ? metalc66 AB O2A ADP . G ADP 601 1_555 DB K K . G K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.085 ? metalc ? metalc67 H O THR 30 H THR 30 1_555 HB K K . H K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.111 ? metalc ? metalc68 H OG1 THR 30 H THR 30 1_555 HB K K . H K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.735 ? metalc ? metalc69 H O LYS 51 H LYS 51 1_555 HB K K . H K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.664 ? metalc ? metalc70 H OD1 ASP 87 H ASP 87 1_555 GB MG MG . H MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.288 ? metalc ? metalc71 H OD2 ASP 87 H ASP 87 1_555 GB MG MG . H MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.556 ? metalc ? metalc72 H OG1 THR 90 H THR 90 1_555 HB K K . H K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.038 ? metalc ? metalc73 EB O1A ADP . H ADP 601 1_555 GB MG MG . H MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.22 ? metalc ? metalc74 EB O3A ADP . H ADP 601 1_555 GB MG MG . H MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.996 ? metalc ? metalc75 EB O2B ADP . H ADP 601 1_555 HB K K . H K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.672 ? metalc ? metalc76 EB O2A ADP . H ADP 601 1_555 HB K K . H K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.359 ? metalc ? metalc77 I OG1 THR 30 I THR 30 1_555 LB K K . I K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.303 ? metalc ? metalc78 I O LYS 51 I LYS 51 1_555 LB K K . I K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.944 ? metalc ? metalc79 I OD1 ASP 87 I ASP 87 1_555 KB MG MG . I MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.627 ? metalc ? metalc80 I OG1 THR 90 I THR 90 1_555 LB K K . I K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.01 ? metalc ? metalc81 IB O3B ADP . I ADP 601 1_555 KB MG MG . I MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.822 ? metalc ? metalc82 IB O3A ADP . I ADP 601 1_555 KB MG MG . I MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.976 ? metalc ? metalc83 IB O2B ADP . I ADP 601 1_555 LB K K . I K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.41 ? metalc ? metalc84 IB O1A ADP . I ADP 601 1_555 LB K K . I K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.669 ? metalc ? metalc85 IB O3A ADP . I ADP 601 1_555 LB K K . I K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.181 ? metalc ? metalc86 J O THR 30 J THR 30 1_555 PB K K . J K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.375 ? metalc ? metalc87 J OG1 THR 30 J THR 30 1_555 PB K K . J K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.315 ? metalc ? metalc88 J O LYS 51 J LYS 51 1_555 PB K K . J K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.719 ? metalc ? metalc89 J OD1 ASP 87 J ASP 87 1_555 OB MG MG . J MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.982 ? metalc ? metalc90 J OD2 ASP 87 J ASP 87 1_555 OB MG MG . J MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.99 ? metalc ? metalc91 MB O1A ADP . J ADP 601 1_555 OB MG MG . J MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.047 ? metalc ? metalc92 MB O2B ADP . J ADP 601 1_555 PB K K . J K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.683 ? metalc ? metalc93 MB O2A ADP . J ADP 601 1_555 PB K K . J K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.36 ? metalc ? metalc94 K O THR 30 K THR 30 1_555 TB K K . K K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.078 ? metalc ? metalc95 K OG1 THR 30 K THR 30 1_555 TB K K . K K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.991 ? metalc ? metalc96 K O LYS 51 K LYS 51 1_555 TB K K . K K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.718 ? metalc ? metalc97 K OD1 ASP 87 K ASP 87 1_555 SB MG MG . K MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.988 ? metalc ? metalc98 QB O1B ADP . K ADP 601 1_555 SB MG MG . K MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.835 ? metalc ? metalc99 QB O3B ADP . K ADP 601 1_555 SB MG MG . K MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.343 ? metalc ? metalc100 QB O1A ADP . K ADP 601 1_555 SB MG MG . K MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.338 ? metalc ? metalc101 QB O2A ADP . K ADP 601 1_555 TB K K . K K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.285 ? metalc ? metalc102 QB O3A ADP . K ADP 601 1_555 TB K K . K K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.939 ? metalc ? metalc103 L O THR 30 L THR 30 1_555 XB K K . L K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.393 ? metalc ? metalc104 L OG1 THR 30 L THR 30 1_555 XB K K . L K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.111 ? metalc ? metalc105 L O LYS 51 L LYS 51 1_555 XB K K . L K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.835 ? metalc ? metalc106 L OD1 ASP 87 L ASP 87 1_555 WB MG MG . L MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.313 ? metalc ? metalc107 L OG1 THR 90 L THR 90 1_555 XB K K . L K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.973 ? metalc ? metalc108 UB O3B ADP . L ADP 601 1_555 WB MG MG . L MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.44 ? metalc ? metalc109 UB O2A ADP . L ADP 601 1_555 WB MG MG . L MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.455 ? metalc ? metalc110 UB O3A ADP . L ADP 601 1_555 WB MG MG . L MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.671 ? metalc ? metalc111 UB O3B ADP . L ADP 601 1_555 XB K K . L K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.872 ? metalc ? metalc112 UB O1A ADP . L ADP 601 1_555 XB K K . L K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.847 ? metalc ? metalc113 M O THR 30 M THR 30 1_555 BC K K . M K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.284 ? metalc ? metalc114 M OG1 THR 30 M THR 30 1_555 BC K K . M K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.809 ? metalc ? metalc115 M O LYS 51 M LYS 51 1_555 BC K K . M K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.62 ? metalc ? metalc116 M OD1 ASP 87 M ASP 87 1_555 AC MG MG . M MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.556 ? metalc ? metalc117 M OG1 THR 90 M THR 90 1_555 BC K K . M K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.637 ? metalc ? metalc118 YB O2B ADP . M ADP 601 1_555 AC MG MG . M MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.189 ? metalc ? metalc119 YB O1A ADP . M ADP 601 1_555 AC MG MG . M MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.152 ? metalc ? metalc120 YB O3A ADP . M ADP 601 1_555 BC K K . M K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.35 ? metalc ? metalc121 N O THR 30 N THR 30 1_555 FC K K . N K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.1 ? metalc ? metalc122 N OG1 THR 30 N THR 30 1_555 FC K K . N K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.177 ? metalc ? metalc123 N O LYS 51 N LYS 51 1_555 FC K K . N K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.694 ? metalc ? metalc124 N OD1 ASP 87 N ASP 87 1_555 EC MG MG . N MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? metalc ? metalc125 N OD2 ASP 87 N ASP 87 1_555 EC MG MG . N MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.25 ? metalc ? metalc126 N OG1 THR 90 N THR 90 1_555 FC K K . N K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.999 ? metalc ? metalc127 CC O1B ADP . N ADP 601 1_555 EC MG MG . N MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.582 ? metalc ? metalc128 CC O3B ADP . N ADP 601 1_555 EC MG MG . N MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.651 ? metalc ? metalc129 CC O1A ADP . N ADP 601 1_555 EC MG MG . N MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.064 ? metalc ? metalc130 CC O2A ADP . N ADP 601 1_555 FC K K . N K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.82 ? metalc ? metalc131 CC O3A ADP . N ADP 601 1_555 FC K K . N K 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.94 ? # _chem_comp.formula 'Mg 2' _chem_comp.formula_weight 24.305 _chem_comp.id MG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MAGNESIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 4PKO _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.00589 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.005731 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.002438 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code CA 3 ADP A 1 601 601 ADP ADP . DA 4 BEF A 1 602 602 BEF BEF . EA 5 MG A 1 603 603 MG MG . FA 6 K A 1 604 604 K K . GA 3 ADP B 1 601 601 ADP ADP . HA 4 BEF B 1 602 602 BEF BEF . IA 5 MG B 1 603 603 MG MG . JA 6 K B 1 604 604 K K . KA 3 ADP C 1 601 601 ADP ADP . LA 4 BEF C 1 602 602 BEF BEF . MA 5 MG C 1 603 603 MG MG . NA 6 K C 1 604 604 K K . OA 3 ADP D 1 601 601 ADP ADP . PA 4 BEF D 1 602 602 BEF BEF . QA 5 MG D 1 603 603 MG MG . RA 6 K D 1 604 604 K K . SA 3 ADP E 1 601 601 ADP ADP . TA 4 BEF E 1 602 602 BEF BEF . UA 5 MG E 1 603 603 MG MG . VA 6 K E 1 604 604 K K . WA 3 ADP F 1 601 601 ADP ADP . XA 4 BEF F 1 602 602 BEF BEF . YA 5 MG F 1 603 603 MG MG . ZA 6 K F 1 604 604 K K . AB 3 ADP G 1 601 601 ADP ADP . BB 4 BEF G 1 602 602 BEF BEF . CB 5 MG G 1 603 603 MG MG . DB 6 K G 1 604 604 K K . EB 3 ADP H 1 601 601 ADP ADP . FB 4 BEF H 1 602 602 BEF BEF . GB 5 MG H 1 603 603 MG MG . HB 6 K H 1 604 604 K K . IB 3 ADP I 1 601 601 ADP ADP . JB 4 BEF I 1 602 602 BEF BEF . KB 5 MG I 1 603 603 MG MG . LB 6 K I 1 604 604 K K . MB 3 ADP J 1 601 601 ADP ADP . NB 4 BEF J 1 602 602 BEF BEF . OB 5 MG J 1 603 603 MG MG . PB 6 K J 1 604 604 K K . QB 3 ADP K 1 601 601 ADP ADP . RB 4 BEF K 1 602 602 BEF BEF . SB 5 MG K 1 603 603 MG MG . TB 6 K K 1 604 604 K K . UB 3 ADP L 1 601 601 ADP ADP . VB 4 BEF L 1 602 602 BEF BEF . WB 5 MG L 1 603 603 MG MG . XB 6 K L 1 604 604 K K . YB 3 ADP M 1 601 601 ADP ADP . ZB 4 BEF M 1 602 602 BEF BEF . AC 5 MG M 1 603 603 MG MG . BC 6 K M 1 604 604 K K . CC 3 ADP N 1 601 601 ADP ADP . DC 4 BEF N 1 602 602 BEF BEF . EC 5 MG N 1 603 603 MG MG . FC 6 K N 1 604 604 K K . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MG _atom_site.label_atom_id MG _atom_site.label_comp_id MG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id MA _atom_site.label_entity_id 5 _atom_site.Cartn_x -48.155 _atom_site.Cartn_y 46.895 _atom_site.Cartn_z -15.831 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 57.66 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MG _atom_site.auth_comp_id MG _atom_site.auth_seq_id 603 _atom_site.auth_asym_id C _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 105 _model_server_stats.parse_time_ms 24 _model_server_stats.create_model_time_ms 329 _model_server_stats.query_time_ms 222 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 1 #