data_4PL5 # _model_server_result.job_id wEeRN-3kbW9sDE04qx9GBQ _model_server_result.datetime_utc '2024-11-16 14:25:55' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 4pl5 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"J","auth_seq_id":1004}' # _entry.id 4PL5 # _exptl.entry_id 4PL5 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 1221.461 _entity.id 5 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68,71,74,77,80-HEPTACOSAOXADOOCTACONTAN-82-OL _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 99.49 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 4PL5 _cell.length_a 319.22 _cell.length_b 63.03 _cell.length_c 140.78 _cell.Z_PDB 16 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 4PL5 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 5 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'C 1 2 1' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id ? dimeric 2 author_defined_assembly 1 ? dimeric 2 author_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,B,E,F,G,H,I,J 1 1 C,D,K,L,M,N 2 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 5 _struct_asym.id J _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale ? covale1 B NZ LYS 365 A LYS 907 1_555 G C01 31L . A 31L 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.243 ? metalc ? metalc1 A OD1 ASN 151 B ASN 693 1_555 F MG MG . B MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.999 ? metalc ? metalc2 A OD2 ASP 169 B ASP 711 1_555 F MG MG . B MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.862 ? metalc ? metalc3 E O2A ADP . B ADP 1001 1_555 F MG MG . B MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.535 ? metalc ? metalc4 E O3A ADP . B ADP 1001 1_555 F MG MG . B MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.125 ? metalc ? metalc5 B OD1 ASN 151 A ASN 693 1_555 I MG MG . A MG 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.871 ? metalc ? metalc6 B OD2 ASP 169 A ASP 711 1_555 I MG MG . A MG 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.679 ? metalc ? metalc7 H O2B ADP . A ADP 1002 1_555 I MG MG . A MG 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.193 ? metalc ? metalc8 H O2A ADP . A ADP 1002 1_555 I MG MG . A MG 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.12 ? metalc ? metalc9 C OD1 ASN 151 C ASN 693 1_555 L MG MG . C MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.328 ? metalc ? metalc10 K O3A ADP . C ADP 1001 1_555 L MG MG . C MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.95 ? metalc ? metalc11 D OD1 ASN 151 D ASN 693 1_555 N MG MG . D MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.811 ? metalc ? metalc12 M O1B ADP . D ADP 1001 1_555 N MG MG . D MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.131 ? metalc ? metalc13 M O1A ADP . D ADP 1001 1_555 N MG MG . D MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.865 ? metalc ? metalc14 M O3A ADP . D ADP 1001 1_555 N MG MG . D MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.876 ? # _chem_comp.formula 'C55 H112 O28' _chem_comp.formula_weight 1221.461 _chem_comp.id PEU _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68,71,74,77,80-HEPTACOSAOXADOOCTACONTAN-82-OL _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms 'PEG 8000' # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag CAA OAB PEU sing 324 n n CAA HAA1 PEU sing 325 n n CAA HAA2 PEU sing 326 n n CAA HAA3 PEU sing 327 n n OAB CAC PEU sing 328 n n CAC CAD PEU sing 329 n n CAC HAC1 PEU sing 330 n n CAC HAC2 PEU sing 331 n n CAD OAE PEU sing 332 n n CAD HAD1 PEU sing 333 n n CAD HAD2 PEU sing 334 n n OAE CAF PEU sing 335 n n CAF CAG PEU sing 336 n n CAF HAF1 PEU sing 337 n n CAF HAF2 PEU sing 338 n n CAG OAH PEU sing 339 n n CAG HAG1 PEU sing 340 n n CAG HAG2 PEU sing 341 n n OAH CAI PEU sing 342 n n CAI CAJ PEU sing 343 n n CAI HAI1 PEU sing 344 n n CAI HAI2 PEU sing 345 n n CAJ OAK PEU sing 346 n n CAJ HAJ1 PEU sing 347 n n CAJ HAJ2 PEU sing 348 n n OAK CAL PEU sing 349 n n CAL CAM PEU sing 350 n n CAL HAL1 PEU sing 351 n n CAL HAL2 PEU sing 352 n n CAM OAN PEU sing 353 n n CAM HAM1 PEU sing 354 n n CAM HAM2 PEU sing 355 n n OAN CAO PEU sing 356 n n CAO CAP PEU sing 357 n n CAO HAO1 PEU sing 358 n n CAO HAO2 PEU sing 359 n n CAP OAQ PEU sing 360 n n CAP HAP1 PEU sing 361 n n CAP HAP2 PEU sing 362 n n OAQ CAR PEU sing 363 n n CAR CAS PEU sing 364 n n CAR HAR1 PEU sing 365 n n CAR HAR2 PEU sing 366 n n CAS OAT PEU sing 367 n n CAS HAS1 PEU sing 368 n n CAS HAS2 PEU sing 369 n n OAT CAU PEU sing 370 n n CAU CAV PEU sing 371 n n CAU HAU1 PEU sing 372 n n CAU HAU2 PEU sing 373 n n CAV OAW PEU sing 374 n n CAV HAV1 PEU sing 375 n n CAV HAV2 PEU sing 376 n n OAW CAX PEU sing 377 n n CAX CAY PEU sing 378 n n CAX HAX1 PEU sing 379 n n CAX HAX2 PEU sing 380 n n CAY OAZ PEU sing 381 n n CAY HAY1 PEU sing 382 n n CAY HAY2 PEU sing 383 n n OAZ CBA PEU sing 384 n n CBA CBB PEU sing 385 n n CBA HBA1 PEU sing 386 n n CBA HBA2 PEU sing 387 n n CBB OBC PEU sing 388 n n CBB HBB1 PEU sing 389 n n CBB HBB2 PEU sing 390 n n OBC CCG PEU sing 391 n n CCG CCF PEU sing 392 n n CCG HCG1 PEU sing 393 n n CCG HCG2 PEU sing 394 n n CCF OCE PEU sing 395 n n CCF HCF1 PEU sing 396 n n CCF HCF2 PEU sing 397 n n OCE CCD PEU sing 398 n n CCD CCC PEU sing 399 n n CCD HCD1 PEU sing 400 n n CCD HCD2 PEU sing 401 n n CCC OCB PEU sing 402 n n CCC HCC1 PEU sing 403 n n CCC HCC2 PEU sing 404 n n OCB CCA PEU sing 405 n n CCA CBZ PEU sing 406 n n CCA HCA1 PEU sing 407 n n CCA HCA2 PEU sing 408 n n CBZ OBY PEU sing 409 n n CBZ HBZ1 PEU sing 410 n n CBZ HBZ2 PEU sing 411 n n OBY CBX PEU sing 412 n n CBX CBW PEU sing 413 n n CBX HBX1 PEU sing 414 n n CBX HBX2 PEU sing 415 n n CBW OBV PEU sing 416 n n CBW HBW1 PEU sing 417 n n CBW HBW2 PEU sing 418 n n OBV CBU PEU sing 419 n n CBU CBT PEU sing 420 n n CBU HBU1 PEU sing 421 n n CBU HBU2 PEU sing 422 n n CBT OBS PEU sing 423 n n CBT HBT1 PEU sing 424 n n CBT HBT2 PEU sing 425 n n OBS CBR PEU sing 426 n n CBR CBQ PEU sing 427 n n CBR HBR1 PEU sing 428 n n CBR HBR2 PEU sing 429 n n CBQ OBP PEU sing 430 n n CBQ HBQ1 PEU sing 431 n n CBQ HBQ2 PEU sing 432 n n OBP CBO PEU sing 433 n n CBO CBN PEU sing 434 n n CBO HBO1 PEU sing 435 n n CBO HBO2 PEU sing 436 n n CBN OBM PEU sing 437 n n CBN HBN1 PEU sing 438 n n CBN HBN2 PEU sing 439 n n OBM CBL PEU sing 440 n n CBL CBK PEU sing 441 n n CBL HBL1 PEU sing 442 n n CBL HBL2 PEU sing 443 n n CBK OBJ PEU sing 444 n n CBK HBK1 PEU sing 445 n n CBK HBK2 PEU sing 446 n n OBJ CBI PEU sing 447 n n CBI CBH PEU sing 448 n n CBI HBI1 PEU sing 449 n n CBI HBI2 PEU sing 450 n n CBH OBG PEU sing 451 n n CBH HBH1 PEU sing 452 n n CBH HBH2 PEU sing 453 n n OBG CBF PEU sing 454 n n CBF CBE PEU sing 455 n n CBF HBF1 PEU sing 456 n n CBF HBF2 PEU sing 457 n n CBE OBD PEU sing 458 n n CBE HBE1 PEU sing 459 n n CBE HBE2 PEU sing 460 n n OBD CCH PEU sing 461 n n CCH CCI PEU sing 462 n n CCH HCH1 PEU sing 463 n n CCH HCH2 PEU sing 464 n n CCI OCJ PEU sing 465 n n CCI HCI1 PEU sing 466 n n CCI HCI2 PEU sing 467 n n OCJ CCK PEU sing 468 n n CCK CCL PEU sing 469 n n CCK HCK1 PEU sing 470 n n CCK HCK2 PEU sing 471 n n CCL OCM PEU sing 472 n n CCL HCL1 PEU sing 473 n n CCL HCL2 PEU sing 474 n n OCM CCN PEU sing 475 n n CCN CCO PEU sing 476 n n CCN HCN1 PEU sing 477 n n CCN HCN2 PEU sing 478 n n CCO OCP PEU sing 479 n n CCO HCO1 PEU sing 480 n n CCO HCO2 PEU sing 481 n n OCP CCQ PEU sing 482 n n CCQ CCR PEU sing 483 n n CCQ HCQ1 PEU sing 484 n n CCQ HCQ2 PEU sing 485 n n CCR OCS PEU sing 486 n n CCR HCR1 PEU sing 487 n n CCR HCR2 PEU sing 488 n n OCS CCT PEU sing 489 n n CCT CCU PEU sing 490 n n CCT HCT1 PEU sing 491 n n CCT HCT2 PEU sing 492 n n CCU OCV PEU sing 493 n n CCU HCU1 PEU sing 494 n n CCU HCU2 PEU sing 495 n n OCV CCW PEU sing 496 n n CCW CCX PEU sing 497 n n CCW HCW1 PEU sing 498 n n CCW HCW2 PEU sing 499 n n CCX OCY PEU sing 500 n n CCX HCX1 PEU sing 501 n n CCX HCX2 PEU sing 502 n n OCY CCZ PEU sing 503 n n CCZ CDA PEU sing 504 n n CCZ HCZ1 PEU sing 505 n n CCZ HCZ2 PEU sing 506 n n CDA ODB PEU sing 507 n n CDA HDA1 PEU sing 508 n n CDA HDA2 PEU sing 509 n n ODB CDC PEU sing 510 n n CDC CDD PEU sing 511 n n CDC HDC1 PEU sing 512 n n CDC HDC2 PEU sing 513 n n CDD ODE PEU sing 514 n n CDD HDD1 PEU sing 515 n n CDD HDD2 PEU sing 516 n n ODE HDE PEU sing 517 n n # _atom_sites.entry_id 4PL5 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.003133 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000524 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.015865 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.007202 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code E 2 ADP B 1 1001 1 ADP ADP . F 3 MG B 1 1002 1 MG MG . G 4 31L A 1 1001 401 31L 573 . H 2 ADP A 1 1002 1 ADP ADP . I 3 MG A 1 1003 1 MG MG . J 5 PEU A 1 1004 1 PEU PEU . K 2 ADP C 1 1001 1 ADP ADP . L 3 MG C 1 1002 1 MG MG . M 2 ADP D 1 1001 1 ADP ADP . N 3 MG D 1 1002 1 MG MG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 O OAB PEU . . . J 5 89.802 -7.878 59.835 1 54.14 ? OAB PEU 1004 A 1 HETATM 2 C CAC PEU . . . J 5 89.892 -7.917 61.264 1 51.28 ? CAC PEU 1004 A 1 HETATM 3 C CAD PEU . . . J 5 90.538 -9.233 61.653 1 43.16 ? CAD PEU 1004 A 1 HETATM 4 O OAE PEU . . . J 5 91.42 -9.08 62.753 1 36.09 ? OAE PEU 1004 A 1 HETATM 5 C CAF PEU . . . J 5 92.142 -10.31 62.858 1 48.07 ? CAF PEU 1004 A 1 HETATM 6 C CAG PEU . . . J 5 93.489 -10.05 63.521 1 63.63 ? CAG PEU 1004 A 1 HETATM 7 O OAH PEU . . . J 5 94.217 -11.268 63.684 1 75.73 ? OAH PEU 1004 A 1 HETATM 8 C CAI PEU . . . J 5 95.59 -10.986 63.946 1 86.26 ? CAI PEU 1004 A 1 HETATM 9 C CAJ PEU . . . J 5 96.187 -12.084 64.805 1 91.47 ? CAJ PEU 1004 A 1 HETATM 10 O OAK PEU . . . J 5 95.471 -13.273 64.48 1 98.03 ? OAK PEU 1004 A 1 HETATM 11 C CAL PEU . . . J 5 96.371 -14.343 64.168 1 97.13 ? CAL PEU 1004 A 1 HETATM 12 C CAM PEU . . . J 5 95.572 -15.625 63.944 1 87.79 ? CAM PEU 1004 A 1 HETATM 13 O OAN PEU . . . J 5 96.184 -16.36 62.89 1 78.01 ? OAN PEU 1004 A 1 HETATM 14 C CAO PEU . . . J 5 95.221 -17.095 62.156 1 73.7 ? CAO PEU 1004 A 1 HETATM 15 C CAP PEU . . . J 5 95.398 -16.727 60.676 1 74.3 ? CAP PEU 1004 A 1 HETATM 16 O OAQ PEU . . . J 5 96.69 -17.071 60.173 1 74.17 ? OAQ PEU 1004 A 1 HETATM 17 C CAR PEU . . . J 5 96.878 -16.718 58.808 1 73.56 ? CAR PEU 1004 A 1 HETATM 18 C CAS PEU . . . J 5 96.065 -17.715 58.012 1 80.14 ? CAS PEU 1004 A 1 HETATM 19 O OAT PEU . . . J 5 96.214 -19.034 58.539 1 88.21 ? OAT PEU 1004 A 1 HETATM 20 C CAU PEU . . . J 5 94.937 -19.638 58.775 1 81.79 ? CAU PEU 1004 A 1 HETATM 21 C CAV PEU . . . J 5 94.992 -21.146 58.564 1 74.45 ? CAV PEU 1004 A 1 HETATM 22 O OAW PEU . . . J 5 95.4 -21.404 57.22 1 72.2 ? OAW PEU 1004 A 1 HETATM 23 C CAX PEU . . . J 5 94.303 -21.223 56.324 1 73.05 ? CAX PEU 1004 A 1 HETATM 24 C CAY PEU . . . J 5 94.813 -21.219 54.892 1 76.38 ? CAY PEU 1004 A 1 HETATM 25 O OAZ PEU . . . J 5 95.665 -22.349 54.766 1 86.85 ? OAZ PEU 1004 A 1 HETATM 26 C CBA PEU . . . J 5 95.293 -23.139 53.642 1 91.47 ? CBA PEU 1004 A 1 HETATM 27 C CBB PEU . . . J 5 95.233 -24.598 54.083 1 91.01 ? CBB PEU 1004 A 1 HETATM 28 O OBC PEU . . . J 5 94.412 -25.298 53.156 1 87.14 ? OBC PEU 1004 A 1 HETATM 29 C CCG PEU . . . J 5 93.409 -26.081 53.798 1 81.96 ? CCG PEU 1004 A 1 HETATM 30 C CCF PEU . . . J 5 92.176 -26.094 52.899 1 79.07 ? CCF PEU 1004 A 1 HETATM 31 O OCE PEU . . . J 5 91.164 -26.912 53.48 1 76.99 ? OCE PEU 1004 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 38 _model_server_stats.parse_time_ms 25 _model_server_stats.create_model_time_ms 52 _model_server_stats.query_time_ms 333 _model_server_stats.encode_time_ms 6 _model_server_stats.element_count 31 #