data_4PV2
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_model_server_result.job_id            0a6mXdBIEas2skuDP2uMAw 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-22 05:10:58' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          4pv2 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"V","auth_seq_id":208}' 
#
_entry.id    4PV2 
#
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_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
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_entity.id                          5 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'NITRATE ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    21 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
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_cell.entry_id            4PV2 
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_cell.length_b            102.632 
_cell.length_c            123.754 
_cell.Z_PDB               8 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
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_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        19 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 21 21 21' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    tetrameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      4 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
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_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 5 I N N 
? 5 J N N 
? 5 K N N 
? 5 L N N 
? 5 M N N 
? 5 N N N 
? 5 S N N 
? 5 T N N 
? 5 U N N 
? 5 V N N 
? 5 W N N 
? 5 X N N 
? 5 Y N N 
? 5 Z N N 
? 5 AA N N 
? 5 BA N N 
? 5 CA N N 
? 5 DA N N 
? 5 EA N N 
? 5 FA N N 
? 5 GA N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A O LEU 60 A LEU 58 1_555 G K K . A K 203 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.689 ? 
metalc ? metalc2 A O GLU 61 A GLU 59 1_555 E NA NA . A NA 201 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.394 ? 
metalc ? metalc3 A O ASP 63 A ASP 61 1_555 E NA NA . A NA 201 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.273 ? 
metalc ? metalc4 A O ASP 63 A ASP 61 1_555 G K K . A K 203 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.857 ? 
metalc ? metalc5 A O PHE 66 A PHE 64 1_555 G K K . A K 203 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.68 ? 
metalc ? metalc6 A O SER 68 A SER 66 1_555 E NA NA . A NA 201 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.294 ? 
metalc ? metalc7 A O SER 68 A SER 66 1_555 G K K . A K 203 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.712 ? 
metalc ? metalc8 A OG SER 68 A SER 66 1_555 G K K . A K 203 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.969 ? 
metalc ? metalc9 A O ARG 70 A ARG 68 1_555 E NA NA . A NA 201 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.202 ? 
metalc ? metalc10 A O VAL 113 A VAL 111 1_555 F NA NA . A NA 202 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.311 ? 
metalc ? metalc11 A O VAL 113 A VAL 111 1_555 H K K . A K 204 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.862 ? 
metalc ? metalc12 A O MET 114 A MET 112 1_555 F NA NA . A NA 202 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.778 ? 
metalc ? metalc13 A O MET 114 A MET 112 1_555 H K K . A K 204 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 3.411 ? 
metalc ? metalc14 A O SER 117 A SER 115 1_555 F NA NA . A NA 202 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.229 ? 
metalc ? metalc15 A O SER 117 A SER 115 1_555 H K K . A K 204 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 3.23 ? 
metalc ? metalc16 A O HIS 119 A HIS 117 1_555 F NA NA . A NA 202 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.815 ? 
metalc ? metalc17 A O HIS 119 A HIS 117 1_555 H K K . A K 204 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.358 ? 
metalc ? metalc18 F NA NA . A NA 202 1_555 HA O HOH . A HOH 420 1_555 ? A ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.916 ? 
metalc ? metalc19 F NA NA . A NA 202 1_555 HA O HOH . A HOH 422 1_555 ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.386 ? 
metalc ? metalc20 G K K . A K 203 1_555 HA O HOH . A HOH 379 1_555 ? B ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.636 ? 
metalc ? metalc21 H K K . A K 204 1_555 HA O HOH . A HOH 422 1_555 ? B ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.765 ? 
metalc ? metalc22 H K K . A K 204 1_555 HA O HOH . A HOH 423 1_555 ? B ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.791 ? 
metalc ? metalc23 C O LEU 60 C LEU 58 1_555 Q K K . C K 203 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.533 ? 
metalc ? metalc24 C O GLU 61 C GLU 59 1_555 O NA NA . C NA 201 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.333 ? 
metalc ? metalc25 C O ASP 63 C ASP 61 1_555 O NA NA . C NA 201 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.331 ? 
metalc ? metalc26 C O ASP 63 C ASP 61 1_555 Q K K . C K 203 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.929 ? 
metalc ? metalc27 C O PHE 66 C PHE 64 1_555 Q K K . C K 203 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.827 ? 
metalc ? metalc28 C O SER 68 C SER 66 1_555 O NA NA . C NA 201 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.237 ? 
metalc ? metalc29 C O SER 68 C SER 66 1_555 Q K K . C K 203 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.762 ? 
metalc ? metalc30 C OG SER 68 C SER 66 1_555 Q K K . C K 203 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 3.097 ? 
metalc ? metalc31 C O ARG 70 C ARG 68 1_555 O NA NA . C NA 201 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.162 ? 
metalc ? metalc32 C O VAL 113 C VAL 111 1_555 P NA NA . C NA 202 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.434 ? 
metalc ? metalc33 C O MET 114 C MET 112 1_555 P NA NA . C NA 202 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 3.013 ? 
metalc ? metalc34 C O SER 117 C SER 115 1_555 P NA NA . C NA 202 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.35 ? 
metalc ? metalc35 C O SER 117 C SER 115 1_555 R K K . C K 204 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.728 ? 
metalc ? metalc36 C O HIS 119 C HIS 117 1_555 P NA NA . C NA 202 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.496 ? 
metalc ? metalc37 P NA NA . C NA 202 1_555 JA O HOH . C HOH 449 1_555 ? A ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.553 ? 
metalc ? metalc38 P NA NA . C NA 202 1_555 JA O HOH . C HOH 450 1_555 ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.632 ? 
metalc ? metalc39 Q K K . C K 203 1_555 JA O HOH . C HOH 304 1_555 ? B ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.59 ? 
metalc ? metalc40 R K K . C K 204 1_555 JA O HOH . C HOH 450 1_555 ? B ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.04 ? 
metalc ? metalc41 R K K . C K 204 1_555 JA O HOH . C HOH 451 1_555 ? B ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.681 ? 
metalc ? metalc42 R K K . C K 204 1_555 JA O HOH . C HOH 452 1_555 ? B ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.216 ? 
#
_chem_comp.formula           'N O3 -1' 
_chem_comp.formula_weight    62.005 
_chem_comp.id                NO3 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'NITRATE ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
N O1 NO3 doub 237 n n 
N O2 NO3 sing 238 n n 
N O3 NO3 sing 239 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     4PV2 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.017579 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.009744 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.008081 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
E 3 NA A 1 201 1 NA NA . 
F 3 NA A 1 202 2 NA NA . 
G 4 K A 1 203 1 K K . 
H 4 K A 1 204 2 K K . 
I 5 NO3 A 1 205 5 NO3 NO3 . 
J 5 NO3 A 1 206 10 NO3 NO3 . 
K 5 NO3 A 1 207 20 NO3 NO3 . 
L 5 NO3 B 1 401 6 NO3 NO3 . 
M 5 NO3 B 1 402 13 NO3 NO3 . 
N 5 NO3 B 1 403 19 NO3 NO3 . 
O 3 NA C 1 201 3 NA NA . 
P 3 NA C 1 202 4 NA NA . 
Q 4 K C 1 203 3 K K . 
R 4 K C 1 204 4 K K . 
S 5 NO3 C 1 205 1 NO3 NO3 . 
T 5 NO3 C 1 206 3 NO3 NO3 . 
U 5 NO3 C 1 207 4 NO3 NO3 . 
V 5 NO3 C 1 208 8 NO3 NO3 . 
W 5 NO3 C 1 209 11 NO3 NO3 . 
X 5 NO3 C 1 210 15 NO3 NO3 . 
Y 5 NO3 C 1 211 17 NO3 NO3 . 
Z 5 NO3 D 1 401 2 NO3 NO3 . 
AA 5 NO3 D 1 402 7 NO3 NO3 . 
BA 5 NO3 D 1 403 9 NO3 NO3 . 
CA 5 NO3 D 1 404 12 NO3 NO3 . 
DA 5 NO3 D 1 405 14 NO3 NO3 . 
EA 5 NO3 D 1 406 16 NO3 NO3 . 
FA 5 NO3 D 1 407 18 NO3 NO3 . 
GA 5 NO3 D 1 408 21 NO3 NO3 . 
HA 6 HOH A 1 301 4 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 2 302 9 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 3 303 10 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 4 304 11 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 5 305 12 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 6 306 14 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 7 307 17 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 8 308 19 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 9 309 20 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 10 310 21 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 11 311 31 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 12 312 32 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 13 313 35 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 14 314 38 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 15 315 42 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 16 316 44 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 17 317 46 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 18 318 47 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 19 319 52 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 20 320 55 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 21 321 60 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 22 322 62 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 23 323 63 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 24 324 64 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 25 325 68 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 26 326 70 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 27 327 73 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 28 328 76 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 29 329 80 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 30 330 82 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 31 331 86 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 32 332 93 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 33 333 96 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 34 334 97 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 35 335 99 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 36 336 100 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 37 337 101 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 38 338 106 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 39 339 109 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 40 340 112 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 41 341 113 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 42 342 115 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 43 343 119 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 44 344 124 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 45 345 127 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 46 346 131 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 47 347 136 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 48 348 140 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 49 349 141 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 50 350 143 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 51 351 144 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 52 352 152 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 53 353 157 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 54 354 158 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 55 355 162 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 56 356 165 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 57 357 167 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 58 358 170 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 59 359 173 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 60 360 175 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 61 361 176 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 62 362 177 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 63 363 190 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 64 364 191 HOH HOH . 
HA 6 HOH A 65 365 192 HOH HOH . 
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HA 6 HOH A 123 423 388 HOH HOH . 
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HA 6 HOH A 125 425 404 HOH HOH . 
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HA 6 HOH A 127 427 411 HOH HOH . 
IA 6 HOH B 1 501 33 HOH HOH . 
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IA 6 HOH B 11 511 126 HOH HOH . 
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JA 6 HOH C 113 413 278 HOH HOH . 
JA 6 HOH C 114 414 281 HOH HOH . 
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JA 6 HOH C 116 416 286 HOH HOH . 
JA 6 HOH C 117 417 290 HOH HOH . 
JA 6 HOH C 118 418 294 HOH HOH . 
JA 6 HOH C 119 419 297 HOH HOH . 
JA 6 HOH C 120 420 300 HOH HOH . 
JA 6 HOH C 121 421 308 HOH HOH . 
JA 6 HOH C 122 422 309 HOH HOH . 
JA 6 HOH C 123 423 321 HOH HOH . 
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JA 6 HOH C 129 429 328 HOH HOH . 
JA 6 HOH C 130 430 329 HOH HOH . 
JA 6 HOH C 131 431 333 HOH HOH . 
JA 6 HOH C 132 432 341 HOH HOH . 
JA 6 HOH C 133 433 342 HOH HOH . 
JA 6 HOH C 134 434 343 HOH HOH . 
JA 6 HOH C 135 435 344 HOH HOH . 
JA 6 HOH C 136 436 352 HOH HOH . 
JA 6 HOH C 137 437 353 HOH HOH . 
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JA 6 HOH C 139 439 361 HOH HOH . 
JA 6 HOH C 140 440 372 HOH HOH . 
JA 6 HOH C 141 441 374 HOH HOH . 
JA 6 HOH C 142 442 376 HOH HOH . 
JA 6 HOH C 143 443 377 HOH HOH . 
JA 6 HOH C 144 444 378 HOH HOH . 
JA 6 HOH C 145 445 380 HOH HOH . 
JA 6 HOH C 146 446 381 HOH HOH . 
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JA 6 HOH C 150 450 390 HOH HOH . 
JA 6 HOH C 151 451 391 HOH HOH . 
JA 6 HOH C 152 452 392 HOH HOH . 
JA 6 HOH C 153 453 393 HOH HOH . 
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JA 6 HOH C 156 456 398 HOH HOH . 
JA 6 HOH C 157 457 400 HOH HOH . 
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JA 6 HOH C 159 459 409 HOH HOH . 
JA 6 HOH C 160 460 410 HOH HOH . 
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JA 6 HOH C 166 466 420 HOH HOH . 
KA 6 HOH D 1 501 1 HOH HOH . 
KA 6 HOH D 2 502 13 HOH HOH . 
KA 6 HOH D 3 503 15 HOH HOH . 
KA 6 HOH D 4 504 22 HOH HOH . 
KA 6 HOH D 5 505 25 HOH HOH . 
KA 6 HOH D 6 506 27 HOH HOH . 
KA 6 HOH D 7 507 34 HOH HOH . 
KA 6 HOH D 8 508 36 HOH HOH . 
KA 6 HOH D 9 509 51 HOH HOH . 
KA 6 HOH D 10 510 56 HOH HOH . 
KA 6 HOH D 11 511 65 HOH HOH . 
KA 6 HOH D 12 512 67 HOH HOH . 
KA 6 HOH D 13 513 71 HOH HOH . 
KA 6 HOH D 14 514 74 HOH HOH . 
KA 6 HOH D 15 515 78 HOH HOH . 
KA 6 HOH D 16 516 81 HOH HOH . 
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KA 6 HOH D 18 518 84 HOH HOH . 
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KA 6 HOH D 20 520 94 HOH HOH . 
KA 6 HOH D 21 521 103 HOH HOH . 
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