data_4PXM
#
_model_server_result.job_id            iUBNVjb6XIrGLpBVDUxs2A 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-26 16:27:52' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          4pxm 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"F","auth_seq_id":2000}' 
#
_entry.id    4PXM 
#
_exptl.entry_id    4PXM 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              272.382 
_entity.id                          3 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            ESTRADIOL 
_entity.pdbx_number_of_molecules    2 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          108.83 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            4PXM 
_cell.length_a            56.084 
_cell.length_b            84.182 
_cell.length_c            58.372 
_cell.Z_PDB               4 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 4PXM 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        4 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1 21 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    tetrameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      4 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 3 E N N 
? 3 F N N 
#
_chem_comp.formula           'C18 H24 O2' 
_chem_comp.formula_weight    272.382 
_chem_comp.id                EST 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              ESTRADIOL 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
C1 C2 EST doub 83 n y 
C1 C10 EST sing 84 n y 
C1 H1 EST sing 85 n n 
C2 C3 EST sing 86 n y 
C2 H2 EST sing 87 n n 
C3 O3 EST sing 88 n n 
C3 C4 EST doub 89 n y 
O3 HO3 EST sing 90 n n 
C4 C5 EST sing 91 n y 
C4 H4 EST sing 92 n n 
C5 C6 EST sing 93 n n 
C5 C10 EST doub 94 n y 
C6 C7 EST sing 95 n n 
C6 H61 EST sing 96 n n 
C6 H62 EST sing 97 n n 
C7 C8 EST sing 98 n n 
C7 H71 EST sing 99 n n 
C7 H72 EST sing 100 n n 
C8 C9 EST sing 101 n n 
C8 C14 EST sing 102 n n 
C8 H8 EST sing 103 n n 
C9 C10 EST sing 104 n n 
C9 C11 EST sing 105 n n 
C9 H9 EST sing 106 n n 
C11 C12 EST sing 107 n n 
C11 H111 EST sing 108 n n 
C11 H112 EST sing 109 n n 
C12 C13 EST sing 110 n n 
C12 H121 EST sing 111 n n 
C12 H122 EST sing 112 n n 
C13 C14 EST sing 113 n n 
C13 C17 EST sing 114 n n 
C13 C18 EST sing 115 n n 
C14 C15 EST sing 116 n n 
C14 H14 EST sing 117 n n 
C15 C16 EST sing 118 n n 
C15 H151 EST sing 119 n n 
C15 H152 EST sing 120 n n 
C16 C17 EST sing 121 n n 
C16 H161 EST sing 122 n n 
C16 H162 EST sing 123 n n 
C17 O17 EST sing 124 n n 
C17 H17 EST sing 125 n n 
O17 HO7 EST sing 126 n n 
C18 H181 EST sing 127 n n 
C18 H182 EST sing 128 n n 
C18 H183 EST sing 129 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     4PXM 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.01783 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.006079 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.011879 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.0181 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
E 3 EST A 1 2000 2000 EST EST . 
F 3 EST B 1 2000 2000 EST EST . 
G 4 HOH A 1 2101 1000 HOH HOH . 
G 4 HOH A 2 2102 1001 HOH HOH . 
G 4 HOH A 3 2103 1002 HOH HOH . 
G 4 HOH A 4 2104 1003 HOH HOH . 
G 4 HOH A 5 2105 1004 HOH HOH . 
G 4 HOH A 6 2106 1005 HOH HOH . 
G 4 HOH A 7 2107 1006 HOH HOH . 
G 4 HOH A 8 2108 1007 HOH HOH . 
G 4 HOH A 9 2109 1008 HOH HOH . 
G 4 HOH A 10 2110 1010 HOH HOH . 
G 4 HOH A 11 2111 1011 HOH HOH . 
G 4 HOH A 12 2112 1012 HOH HOH . 
G 4 HOH A 13 2113 1013 HOH HOH . 
G 4 HOH A 14 2114 1014 HOH HOH . 
G 4 HOH A 15 2115 1015 HOH HOH . 
G 4 HOH A 16 2116 1016 HOH HOH . 
G 4 HOH A 17 2117 1017 HOH HOH . 
G 4 HOH A 18 2118 1018 HOH HOH . 
G 4 HOH A 19 2119 1019 HOH HOH . 
G 4 HOH A 20 2120 1020 HOH HOH . 
G 4 HOH A 21 2121 1021 HOH HOH . 
G 4 HOH A 22 2122 1022 HOH HOH . 
G 4 HOH A 23 2123 1023 HOH HOH . 
G 4 HOH A 24 2124 1024 HOH HOH . 
G 4 HOH A 25 2125 1025 HOH HOH . 
G 4 HOH A 26 2126 1026 HOH HOH . 
G 4 HOH A 27 2127 1027 HOH HOH . 
G 4 HOH A 28 2128 1028 HOH HOH . 
G 4 HOH A 29 2129 1029 HOH HOH . 
G 4 HOH A 30 2130 1030 HOH HOH . 
G 4 HOH A 31 2131 1031 HOH HOH . 
G 4 HOH A 32 2132 1032 HOH HOH . 
G 4 HOH A 33 2133 1033 HOH HOH . 
G 4 HOH A 34 2134 1034 HOH HOH . 
G 4 HOH A 35 2135 1035 HOH HOH . 
G 4 HOH A 36 2136 1036 HOH HOH . 
G 4 HOH A 37 2137 1037 HOH HOH . 
G 4 HOH A 38 2138 1039 HOH HOH . 
H 4 HOH B 1 2101 1000 HOH HOH . 
H 4 HOH B 2 2102 1001 HOH HOH . 
H 4 HOH B 3 2103 1002 HOH HOH . 
H 4 HOH B 4 2104 1006 HOH HOH . 
H 4 HOH B 5 2105 1007 HOH HOH . 
H 4 HOH B 6 2106 1009 HOH HOH . 
H 4 HOH B 7 2107 1010 HOH HOH . 
H 4 HOH B 8 2108 1011 HOH HOH . 
H 4 HOH B 9 2109 1012 HOH HOH . 
H 4 HOH B 10 2110 1016 HOH HOH . 
H 4 HOH B 11 2111 1017 HOH HOH . 
H 4 HOH B 12 2112 1019 HOH HOH . 
H 4 HOH B 13 2113 1020 HOH HOH . 
H 4 HOH B 14 2114 1022 HOH HOH . 
H 4 HOH B 15 2115 1023 HOH HOH . 
H 4 HOH B 16 2116 1028 HOH HOH . 
H 4 HOH B 17 2117 1029 HOH HOH . 
H 4 HOH B 18 2118 1030 HOH HOH . 
H 4 HOH B 19 2119 1033 HOH HOH . 
H 4 HOH B 20 2120 1035 HOH HOH . 
H 4 HOH B 21 2121 1036 HOH HOH . 
H 4 HOH B 22 2122 1037 HOH HOH . 
H 4 HOH B 23 2123 1031 HOH HOH . 
H 4 HOH B 24 2124 1044 HOH HOH . 
H 4 HOH B 25 2125 1045 HOH HOH . 
H 4 HOH B 26 2126 1046 HOH HOH . 
H 4 HOH B 27 2127 1048 HOH HOH . 
H 4 HOH B 28 2128 1049 HOH HOH . 
H 4 HOH B 29 2129 1050 HOH HOH . 
H 4 HOH B 30 2130 1053 HOH HOH . 
H 4 HOH B 31 2131 1056 HOH HOH . 
H 4 HOH B 32 2132 1057 HOH HOH . 
H 4 HOH B 33 2133 1058 HOH HOH . 
H 4 HOH B 34 2134 1059 HOH HOH . 
H 4 HOH B 35 2135 1061 HOH HOH . 
H 4 HOH B 36 2136 1062 HOH HOH . 
H 4 HOH B 37 2137 1063 HOH HOH . 
H 4 HOH B 38 2138 1064 HOH HOH . 
H 4 HOH B 39 2139 1067 HOH HOH . 
H 4 HOH B 40 2140 1068 HOH HOH . 
H 4 HOH B 41 2141 1071 HOH HOH . 
H 4 HOH B 42 2142 1072 HOH HOH . 
H 4 HOH B 43 2143 1075 HOH HOH . 
H 4 HOH B 44 2144 1078 HOH HOH . 
H 4 HOH B 45 2145 1079 HOH HOH . 
H 4 HOH B 46 2146 1081 HOH HOH . 
H 4 HOH B 47 2147 1084 HOH HOH . 
H 4 HOH B 48 2148 1086 HOH HOH . 
H 4 HOH B 49 2149 1090 HOH HOH . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 C C1 EST . . . F 3 13.005 5.654 36.359 1 24.43 ? C1 EST 2000 B 1 
HETATM 2 C C2 EST . . . F 3 11.651 5.526 36.924 1 27.35 ? C2 EST 2000 B 1 
HETATM 3 C C3 EST . . . F 3 10.556 5.565 35.77 1 28.98 ? C3 EST 2000 B 1 
HETATM 4 O O3 EST . . . F 3 9.207 5.391 36.205 1 29.74 ? O3 EST 2000 B 1 
HETATM 5 C C4 EST . . . F 3 10.885 5.892 34.467 1 27.73 ? C4 EST 2000 B 1 
HETATM 6 C C5 EST . . . F 3 12.198 6.011 34.063 1 23.7 ? C5 EST 2000 B 1 
HETATM 7 C C6 EST . . . F 3 12.451 6.272 32.592 1 25.98 ? C6 EST 2000 B 1 
HETATM 8 C C7 EST . . . F 3 13.873 6.809 32.378 1 26.97 ? C7 EST 2000 B 1 
HETATM 9 C C8 EST . . . F 3 14.917 5.959 33.077 1 26.78 ? C8 EST 2000 B 1 
HETATM 10 C C9 EST . . . F 3 14.734 6.109 34.601 1 26.6 ? C9 EST 2000 B 1 
HETATM 11 C C10 EST . . . F 3 13.316 5.897 35.023 1 25.28 ? C10 EST 2000 B 1 
HETATM 12 C C11 EST . . . F 3 15.69 5.188 35.322 1 27.26 ? C11 EST 2000 B 1 
HETATM 13 C C12 EST . . . F 3 17.141 5.522 34.986 1 28.41 ? C12 EST 2000 B 1 
HETATM 14 C C13 EST . . . F 3 17.383 5.479 33.46 1 28.51 ? C13 EST 2000 B 1 
HETATM 15 C C14 EST . . . F 3 16.344 6.373 32.798 1 25.7 ? C14 EST 2000 B 1 
HETATM 16 C C15 EST . . . F 3 16.788 6.546 31.351 1 30.42 ? C15 EST 2000 B 1 
HETATM 17 C C16 EST . . . F 3 18.334 6.512 31.482 1 30.31 ? C16 EST 2000 B 1 
HETATM 18 C C17 EST . . . F 3 18.641 6.198 32.969 1 30.93 ? C17 EST 2000 B 1 
HETATM 19 O O17 EST . . . F 3 19.859 5.428 33.105 1 31.03 ? O17 EST 2000 B 1 
HETATM 20 C C18 EST . . . F 3 17.376 4.017 32.991 1 30.48 ? C18 EST 2000 B 1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              12 
_model_server_stats.parse_time_ms           12 
_model_server_stats.create_model_time_ms    21 
_model_server_stats.query_time_ms           258 
_model_server_stats.encode_time_ms          4 
_model_server_stats.element_count           20 
#