data_4RQ8 # _model_server_result.job_id EhzR9e05XghcBzeJ7ZI_YQ _model_server_result.datetime_utc '2024-11-23 18:07:44' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 4rq8 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"M","auth_seq_id":409}' # _entry.id 4RQ8 # _exptl.entry_id 4RQ8 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 22.99 _entity.id 7 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'SODIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 9 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 110.89 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 4RQ8 _cell.length_a 50.22 _cell.length_b 82.54 _cell.length_c 54.74 _cell.Z_PDB 2 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 4RQ8 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 4 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1 21 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tetrameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 4 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 7 K N N ? 7 L N N ? 7 M N N ? 7 N N N ? 7 O N N ? 7 P N N ? 7 Q N N ? 7 DA N N ? 7 EA N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale ? covale1 D O3' DC 5 T DC 5 1_555 D P 8OG 6 T 8OG 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.594 ? covale ? covale2 D O3' 8OG 6 T 8OG 6 1_555 D P DG 7 T DG 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.595 ? metalc ? metalc1 A O LYS 50 A LYS 48 1_555 J MN MN . A MN 406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.137 ? metalc ? metalc2 A O LYS 62 A LYS 60 1_555 L NA NA . A NA 408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.64 ? metalc ? metalc3 A O LEU 64 A LEU 62 1_555 L NA NA . A NA 408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.599 ? metalc ? metalc4 A O VAL 67 A VAL 65 1_555 L NA NA . A NA 408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.483 ? metalc ? metalc5 A O THR 103 A THR 101 1_555 M NA NA . A NA 409 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.205 ? metalc ? metalc6 A O VAL 105 A VAL 103 1_555 M NA NA . A NA 409 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.461 ? metalc ? metalc7 A O ILE 108 A ILE 106 1_555 M NA NA . A NA 409 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.43 ? metalc ? metalc8 A OD2 ASP 147 A ASP 145 1_555 P NA NA . A NA 412 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.091 ? metalc ? metalc9 A OD1 ASP 162 A ASP 160 1_555 Q NA NA . A NA 413 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.919 ? metalc ? metalc10 A OD2 ASP 192 A ASP 190 1_555 F MN MN . A MN 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.92 ? metalc ? metalc11 A OD1 ASP 192 A ASP 190 1_555 H MN MN . A MN 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.128 ? metalc ? metalc12 A OD1 ASP 194 A ASP 192 1_555 F MN MN . A MN 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.067 ? metalc ? metalc13 A OD2 ASP 194 A ASP 192 1_555 H MN MN . A MN 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.076 ? metalc ? metalc14 A OD2 ASP 258 A ASP 256 1_555 F MN MN . A MN 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 ? metalc ? metalc15 A OE2 GLU 290 A GLU 288 1_555 N NA NA . A NA 410 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.064 ? metalc ? metalc16 A OD2 ASP 323 A ASP 321 1_555 I MN MN . A MN 405 1_555 ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.475 ? metalc ? metalc17 A NE2 HIS 338 A HIS 336 1_555 J MN MN . A MN 406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.297 ? metalc ? metalc18 A NE2 HIS 339 A HIS 337 1_555 G MN MN . A MN 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.204 ? metalc ? metalc19 A NE2 HIS 340 A HIS 338 1_555 J MN MN . A MN 406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.216 ? metalc ? metalc20 A NE2 HIS 341 A HIS 339 1_555 G MN MN . A MN 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.295 ? metalc ? metalc21 E O21 PPV . A PPV 401 1_555 H MN MN . A MN 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.112 ? metalc ? metalc22 E O12 PPV . A PPV 401 1_555 H MN MN . A MN 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.2 ? metalc ? metalc23 E O11 PPV . A PPV 401 1_555 CA MN MN . P MN 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.461 ? metalc ? metalc24 F MN MN . A MN 402 1_555 GA O HOH . A HOH 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.312 ? metalc ? metalc25 F MN MN . A MN 402 1_555 C O3' DC 10 P DC 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.552 ? metalc ? metalc26 F MN MN . A MN 402 1_555 C OP1 DA 11 P DA 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.238 ? metalc ? metalc27 G MN MN . A MN 403 1_555 GA O HOH . A HOH 519 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.205 ? metalc ? metalc28 G MN MN . A MN 403 1_555 GA O HOH . A HOH 520 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.371 ? metalc ? metalc29 G MN MN . A MN 403 1_555 GA O HOH . A HOH 521 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.392 ? metalc ? metalc30 G MN MN . A MN 403 1_555 GA O HOH . A HOH 522 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.897 ? metalc ? metalc31 H MN MN . A MN 404 1_555 GA O HOH . A HOH 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.2 ? metalc ? metalc32 H MN MN . A MN 404 1_555 C OP1 DA 11 P DA 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.114 ? metalc ? metalc33 I MN MN . A MN 405 1_555 GA O HOH . A HOH 639 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.414 ? metalc ? metalc34 I MN MN . A MN 405 1_555 GA O HOH . A HOH 660 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.274 ? metalc ? metalc35 I MN MN . A MN 405 1_555 GA O HOH . A HOH 669 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.121 ? metalc ? metalc36 J MN MN . A MN 406 1_555 GA O HOH . A HOH 659 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.939 ? metalc ? metalc37 K NA NA . A NA 407 1_555 GA O HOH . A HOH 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.054 ? metalc ? metalc38 K NA NA . A NA 407 1_555 GA O HOH . A HOH 526 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.263 ? metalc ? metalc39 K NA NA . A NA 407 1_555 GA O HOH . A HOH 666 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.165 ? metalc ? metalc40 L NA NA . A NA 408 1_555 GA O HOH . A HOH 547 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.432 ? metalc ? metalc41 L NA NA . A NA 408 1_555 GA O HOH . A HOH 548 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.193 ? metalc ? metalc42 L NA NA . A NA 408 1_555 B OP1 DC 3 D DC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.356 ? metalc ? metalc43 M NA NA . A NA 409 1_555 GA O HOH . A HOH 553 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.138 ? metalc ? metalc44 M NA NA . A NA 409 1_555 C OP1 DG 9 P DG 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.455 ? metalc ? metalc45 M NA NA . A NA 409 1_555 IA O HOH . P HOH 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.446 ? metalc ? metalc46 N NA NA . A NA 410 1_555 GA O HOH . A HOH 670 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.945 ? metalc ? metalc47 O NA NA . A NA 411 1_555 GA O HOH . A HOH 656 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.124 ? metalc ? metalc48 O NA NA . A NA 411 1_555 GA O HOH . A HOH 657 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 ? metalc ? metalc49 P NA NA . A NA 412 1_555 GA O HOH . A HOH 585 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.215 ? metalc ? metalc50 P NA NA . A NA 412 1_555 GA O HOH . A HOH 586 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.077 ? metalc ? metalc51 P NA NA . A NA 412 1_555 GA O HOH . A HOH 596 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.377 ? metalc ? metalc52 Q NA NA . A NA 413 1_555 GA O HOH . A HOH 595 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.456 ? metalc ? metalc53 GA O HOH . A HOH 575 1_555 CA MN MN . P MN 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.199 ? metalc ? metalc54 C OP2 DA 11 P DA 11 1_555 CA MN MN . P MN 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.199 ? metalc ? metalc55 CA MN MN . P MN 101 1_555 IA O HOH . P HOH 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.494 ? metalc ? metalc56 CA MN MN . P MN 101 1_555 IA O HOH . P HOH 509 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.798 ? metalc ? metalc57 D OP1 DA 11 T DA 11 1_555 EA NA NA . T NA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.242 ? metalc ? metalc58 DA NA NA . T NA 101 1_555 JA O HOH . T HOH 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.002 ? metalc ? metalc59 DA NA NA . T NA 101 1_555 JA O HOH . T HOH 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.257 ? metalc ? metalc60 DA NA NA . T NA 101 1_555 JA O HOH . T HOH 227 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.367 ? metalc ? metalc61 EA NA NA . T NA 102 1_555 JA O HOH . T HOH 218 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.318 ? metalc ? metalc62 EA NA NA . T NA 102 1_555 JA O HOH . T HOH 219 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.353 ? metalc ? metalc63 EA NA NA . T NA 102 1_555 JA O HOH . T HOH 220 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.965 ? hydrog WATSON-CRICK hydrog1 B N1 DG 1 D DG 1 1_555 D N3 DC 5 T DC 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog2 B N2 DG 1 D DG 1 1_555 D O2 DC 5 T DC 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 B O6 DG 1 D DG 1 1_555 D N4 DC 5 T DC 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 B N3 DT 2 D DT 2 1_555 D N1 DA 4 T DA 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 B O4 DT 2 D DT 2 1_555 D N6 DA 4 T DA 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 B N3 DC 3 D DC 3 1_555 D N1 DG 3 T DG 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 B N4 DC 3 D DC 3 1_555 D O6 DG 3 T DG 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 B O2 DC 3 D DC 3 1_555 D N2 DG 3 T DG 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 B N1 DG 4 D DG 4 1_555 D N3 DC 2 T DC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 B N2 DG 4 D DG 4 1_555 D O2 DC 2 T DC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 B O6 DG 4 D DG 4 1_555 D N4 DC 2 T DC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 C N1 DG 1 P DG 1 1_555 D N3 DC 16 T DC 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog13 C N2 DG 1 P DG 1 1_555 D O2 DC 16 T DC 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog14 C O6 DG 1 P DG 1 1_555 D N4 DC 16 T DC 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 C N3 DC 2 P DC 2 1_555 D N1 DG 15 T DG 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 C N4 DC 2 P DC 2 1_555 D O6 DG 15 T DG 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 C O2 DC 2 P DC 2 1_555 D N2 DG 15 T DG 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 C N3 DT 3 P DT 3 1_555 D N1 DA 14 T DA 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog19 C O4 DT 3 P DT 3 1_555 D N6 DA 14 T DA 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog20 C N1 DG 4 P DG 4 1_555 D N3 DC 13 T DC 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog21 C N2 DG 4 P DG 4 1_555 D O2 DC 13 T DC 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog22 C O6 DG 4 P DG 4 1_555 D N4 DC 13 T DC 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog23 C N1 DA 5 P DA 5 1_555 D N3 DT 12 T DT 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 C N6 DA 5 P DA 5 1_555 D O4 DT 12 T DT 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog25 C N3 DT 6 P DT 6 1_555 D N1 DA 11 T DA 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog26 C O4 DT 6 P DT 6 1_555 D N6 DA 11 T DA 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog27 C N1 DG 7 P DG 7 1_555 D N3 DC 10 T DC 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog28 C N2 DG 7 P DG 7 1_555 D O2 DC 10 T DC 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog29 C O6 DG 7 P DG 7 1_555 D N4 DC 10 T DC 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog30 C N3 DC 8 P DC 8 1_555 D N1 DG 9 T DG 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog31 C N4 DC 8 P DC 8 1_555 D O6 DG 9 T DG 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog32 C O2 DC 8 P DC 8 1_555 D N2 DG 9 T DG 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog33 C N1 DG 9 P DG 9 1_555 D N3 DC 8 T DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog34 C N2 DG 9 P DG 9 1_555 D O2 DC 8 T DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog35 C O6 DG 9 P DG 9 1_555 D N4 DC 8 T DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog36 C N3 DC 10 P DC 10 1_555 D N1 DG 7 T DG 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog37 C N4 DC 10 P DC 10 1_555 D O6 DG 7 T DG 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog38 C O2 DC 10 P DC 10 1_555 D N2 DG 7 T DG 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DA-8OG MISPAIR' hydrog39 C N6 DA 11 P DA 11 1_555 D O6 8OG 6 T 8OG 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'Na 1' _chem_comp.formula_weight 22.99 _chem_comp.id NA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'SODIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 4RQ8 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.019912 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.0076 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.012115 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.019553 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code E 5 PPV A 1 401 1 PPV PPV . F 6 MN A 1 402 2 MN MN . G 6 MN A 1 403 3 MN MN . H 6 MN A 1 404 4 MN MN . I 6 MN A 1 405 6 MN MN . J 6 MN A 1 406 7 MN MN . K 7 NA A 1 407 8 NA NA . L 7 NA A 1 408 9 NA NA . M 7 NA A 1 409 10 NA NA . N 7 NA A 1 410 13 NA NA . O 7 NA A 1 411 14 NA NA . P 7 NA A 1 412 15 NA NA . Q 7 NA A 1 413 16 NA NA . R 8 CL A 1 414 17 CL CL . S 8 CL A 1 415 18 CL CL . T 8 CL A 1 416 19 CL CL . U 8 CL A 1 417 20 CL CL . V 8 CL A 1 418 21 CL CL . W 8 CL A 1 419 22 CL CL . X 9 ACT A 1 420 24 ACT ACT . Y 9 ACT A 1 421 25 ACT ACT . Z 9 ACT A 1 422 26 ACT ACT . AA 9 ACT A 1 423 27 ACT ACT . BA 9 ACT A 1 424 28 ACT ACT . CA 6 MN P 1 101 5 MN MN . DA 7 NA T 1 101 11 NA NA . EA 7 NA T 1 102 12 NA NA . FA 9 ACT T 1 103 23 ACT ACT . GA 10 HOH A 1 501 2 HOH HOH . GA 10 HOH A 2 502 3 HOH HOH . GA 10 HOH A 3 503 4 HOH HOH . GA 10 HOH A 4 504 5 HOH HOH . GA 10 HOH A 5 505 7 HOH HOH . GA 10 HOH A 6 506 8 HOH HOH . GA 10 HOH A 7 507 9 HOH HOH . GA 10 HOH A 8 508 10 HOH HOH . GA 10 HOH A 9 509 11 HOH HOH . GA 10 HOH A 10 510 12 HOH HOH . GA 10 HOH A 11 511 13 HOH HOH . GA 10 HOH A 12 512 14 HOH HOH . GA 10 HOH A 13 513 15 HOH HOH . GA 10 HOH A 14 514 16 HOH HOH . GA 10 HOH A 15 515 17 HOH HOH . GA 10 HOH A 16 516 18 HOH HOH . GA 10 HOH A 17 517 19 HOH HOH . GA 10 HOH A 18 518 20 HOH HOH . GA 10 HOH A 19 519 21 HOH HOH . GA 10 HOH A 20 520 22 HOH HOH . GA 10 HOH A 21 521 23 HOH HOH . GA 10 HOH A 22 522 24 HOH HOH . GA 10 HOH A 23 523 25 HOH HOH . GA 10 HOH A 24 524 26 HOH HOH . GA 10 HOH A 25 525 27 HOH HOH . GA 10 HOH A 26 526 28 HOH HOH . GA 10 HOH A 27 527 29 HOH HOH . GA 10 HOH A 28 528 30 HOH HOH . GA 10 HOH A 29 529 31 HOH HOH . GA 10 HOH A 30 530 32 HOH HOH . GA 10 HOH A 31 531 33 HOH HOH . GA 10 HOH A 32 532 34 HOH HOH . GA 10 HOH A 33 533 38 HOH HOH . GA 10 HOH A 34 534 42 HOH HOH . GA 10 HOH A 35 535 43 HOH HOH . GA 10 HOH A 36 536 44 HOH HOH . GA 10 HOH A 37 537 45 HOH HOH . GA 10 HOH A 38 538 46 HOH HOH . GA 10 HOH A 39 539 47 HOH HOH . GA 10 HOH A 40 540 48 HOH HOH . GA 10 HOH A 41 541 49 HOH HOH . GA 10 HOH A 42 542 50 HOH HOH . GA 10 HOH A 43 543 51 HOH HOH . GA 10 HOH A 44 544 53 HOH HOH . GA 10 HOH A 45 545 55 HOH HOH . GA 10 HOH A 46 546 56 HOH HOH . GA 10 HOH A 47 547 57 HOH HOH . GA 10 HOH A 48 548 58 HOH HOH . GA 10 HOH A 49 549 59 HOH HOH . GA 10 HOH A 50 550 60 HOH HOH . GA 10 HOH A 51 551 61 HOH HOH . GA 10 HOH A 52 552 62 HOH HOH . GA 10 HOH A 53 553 63 HOH HOH . GA 10 HOH A 54 554 64 HOH HOH . GA 10 HOH A 55 555 65 HOH HOH . GA 10 HOH A 56 556 67 HOH HOH . GA 10 HOH A 57 557 68 HOH HOH . GA 10 HOH A 58 558 69 HOH HOH . GA 10 HOH A 59 559 70 HOH HOH . GA 10 HOH A 60 560 71 HOH HOH . GA 10 HOH A 61 561 72 HOH HOH . GA 10 HOH A 62 562 73 HOH HOH . GA 10 HOH A 63 563 74 HOH HOH . GA 10 HOH A 64 564 75 HOH HOH . GA 10 HOH A 65 565 76 HOH HOH . GA 10 HOH A 66 566 83 HOH HOH . GA 10 HOH A 67 567 84 HOH HOH . GA 10 HOH A 68 568 85 HOH HOH . GA 10 HOH A 69 569 86 HOH HOH . GA 10 HOH A 70 570 87 HOH HOH . GA 10 HOH A 71 571 90 HOH HOH . GA 10 HOH A 72 572 91 HOH HOH . GA 10 HOH A 73 573 94 HOH HOH . GA 10 HOH A 74 574 95 HOH HOH . GA 10 HOH A 75 575 97 HOH HOH . GA 10 HOH A 76 576 98 HOH HOH . GA 10 HOH A 77 577 99 HOH HOH . GA 10 HOH A 78 578 100 HOH HOH . GA 10 HOH A 79 579 101 HOH HOH . GA 10 HOH A 80 580 102 HOH HOH . GA 10 HOH A 81 581 103 HOH HOH . GA 10 HOH A 82 582 104 HOH HOH . GA 10 HOH A 83 583 105 HOH HOH . GA 10 HOH A 84 584 106 HOH HOH . GA 10 HOH A 85 585 107 HOH HOH . GA 10 HOH A 86 586 108 HOH HOH . GA 10 HOH A 87 587 109 HOH HOH . GA 10 HOH A 88 588 110 HOH HOH . GA 10 HOH A 89 589 111 HOH HOH . GA 10 HOH A 90 590 112 HOH HOH . GA 10 HOH A 91 591 113 HOH HOH . GA 10 HOH A 92 592 114 HOH HOH . GA 10 HOH A 93 593 115 HOH HOH . GA 10 HOH A 94 594 116 HOH HOH . GA 10 HOH A 95 595 117 HOH HOH . GA 10 HOH A 96 596 118 HOH HOH . GA 10 HOH A 97 597 119 HOH HOH . GA 10 HOH A 98 598 120 HOH HOH . GA 10 HOH A 99 599 121 HOH HOH . GA 10 HOH A 100 600 122 HOH HOH . GA 10 HOH A 101 601 123 HOH HOH . GA 10 HOH A 102 602 124 HOH HOH . GA 10 HOH A 103 603 125 HOH HOH . GA 10 HOH A 104 604 126 HOH HOH . GA 10 HOH A 105 605 127 HOH HOH . GA 10 HOH A 106 606 128 HOH HOH . GA 10 HOH A 107 607 129 HOH HOH . GA 10 HOH A 108 608 130 HOH HOH . GA 10 HOH A 109 609 137 HOH HOH . GA 10 HOH A 110 610 138 HOH HOH . GA 10 HOH A 111 611 139 HOH HOH . GA 10 HOH A 112 612 140 HOH HOH . GA 10 HOH A 113 613 141 HOH HOH . GA 10 HOH A 114 614 142 HOH HOH . GA 10 HOH A 115 615 143 HOH HOH . GA 10 HOH A 116 616 144 HOH HOH . GA 10 HOH A 117 617 145 HOH HOH . GA 10 HOH A 118 618 146 HOH HOH . GA 10 HOH A 119 619 147 HOH HOH . GA 10 HOH A 120 620 155 HOH HOH . GA 10 HOH A 121 621 157 HOH HOH . GA 10 HOH A 122 622 158 HOH HOH . GA 10 HOH A 123 623 159 HOH HOH . GA 10 HOH A 124 624 160 HOH HOH . GA 10 HOH A 125 625 161 HOH HOH . GA 10 HOH A 126 626 162 HOH HOH . GA 10 HOH A 127 627 163 HOH HOH . GA 10 HOH A 128 628 164 HOH HOH . GA 10 HOH A 129 629 165 HOH HOH . GA 10 HOH A 130 630 166 HOH HOH . GA 10 HOH A 131 631 167 HOH HOH . GA 10 HOH A 132 632 168 HOH HOH . GA 10 HOH A 133 633 169 HOH HOH . GA 10 HOH A 134 634 171 HOH HOH . GA 10 HOH A 135 635 172 HOH HOH . GA 10 HOH A 136 636 173 HOH HOH . GA 10 HOH A 137 637 174 HOH HOH . GA 10 HOH A 138 638 175 HOH HOH . GA 10 HOH A 139 639 176 HOH HOH . GA 10 HOH A 140 640 177 HOH HOH . GA 10 HOH A 141 641 178 HOH HOH . GA 10 HOH A 142 642 179 HOH HOH . GA 10 HOH A 143 643 180 HOH HOH . GA 10 HOH A 144 644 181 HOH HOH . GA 10 HOH A 145 645 182 HOH HOH . GA 10 HOH A 146 646 188 HOH HOH . GA 10 HOH A 147 647 190 HOH HOH . GA 10 HOH A 148 648 197 HOH HOH . GA 10 HOH A 149 649 198 HOH HOH . GA 10 HOH A 150 650 199 HOH HOH . GA 10 HOH A 151 651 200 HOH HOH . GA 10 HOH A 152 652 201 HOH HOH . GA 10 HOH A 153 653 202 HOH HOH . GA 10 HOH A 154 654 203 HOH HOH . GA 10 HOH A 155 655 204 HOH HOH . GA 10 HOH A 156 656 205 HOH HOH . GA 10 HOH A 157 657 206 HOH HOH . GA 10 HOH A 158 658 207 HOH HOH . GA 10 HOH A 159 659 208 HOH HOH . GA 10 HOH A 160 660 209 HOH HOH . GA 10 HOH A 161 661 210 HOH HOH . GA 10 HOH A 162 662 211 HOH HOH . GA 10 HOH A 163 663 212 HOH HOH . GA 10 HOH A 164 664 213 HOH HOH . GA 10 HOH A 165 665 215 HOH HOH . GA 10 HOH A 166 666 218 HOH HOH . GA 10 HOH A 167 667 219 HOH HOH . GA 10 HOH A 168 668 222 HOH HOH . GA 10 HOH A 169 669 224 HOH HOH . GA 10 HOH A 170 670 225 HOH HOH . GA 10 HOH A 171 671 227 HOH HOH . GA 10 HOH A 172 672 228 HOH HOH . GA 10 HOH A 173 673 229 HOH HOH . GA 10 HOH A 174 674 230 HOH HOH . GA 10 HOH A 175 675 231 HOH HOH . HA 10 HOH D 1 101 36 HOH HOH . HA 10 HOH D 2 102 37 HOH HOH . HA 10 HOH D 3 103 66 HOH HOH . HA 10 HOH D 4 104 193 HOH HOH . HA 10 HOH D 5 105 194 HOH HOH . HA 10 HOH D 6 106 195 HOH HOH . HA 10 HOH D 7 107 196 HOH HOH . IA 10 HOH P 1 501 1 HOH HOH . IA 10 HOH P 2 502 189 HOH HOH . IA 10 HOH P 3 503 52 HOH HOH . IA 10 HOH P 4 504 54 HOH HOH . IA 10 HOH P 5 505 77 HOH HOH . IA 10 HOH P 6 506 78 HOH HOH . IA 10 HOH P 7 507 79 HOH HOH . IA 10 HOH P 8 508 88 HOH HOH . IA 10 HOH P 9 509 96 HOH HOH . IA 10 HOH P 10 510 153 HOH HOH . IA 10 HOH P 11 511 154 HOH HOH . IA 10 HOH P 12 512 183 HOH HOH . IA 10 HOH P 13 513 184 HOH HOH . IA 10 HOH P 14 514 220 HOH HOH . IA 10 HOH P 15 515 223 HOH HOH . IA 10 HOH P 16 516 226 HOH HOH . JA 10 HOH T 1 201 6 HOH HOH . JA 10 HOH T 2 202 35 HOH HOH . JA 10 HOH T 3 203 39 HOH HOH . JA 10 HOH T 4 204 40 HOH HOH . JA 10 HOH T 5 205 41 HOH HOH . JA 10 HOH T 6 206 80 HOH HOH . JA 10 HOH T 7 207 81 HOH HOH . JA 10 HOH T 8 208 82 HOH HOH . JA 10 HOH T 9 209 89 HOH HOH . JA 10 HOH T 10 210 92 HOH HOH . JA 10 HOH T 11 211 93 HOH HOH . JA 10 HOH T 12 212 131 HOH HOH . JA 10 HOH T 13 213 132 HOH HOH . JA 10 HOH T 14 214 133 HOH HOH . JA 10 HOH T 15 215 134 HOH HOH . JA 10 HOH T 16 216 135 HOH HOH . JA 10 HOH T 17 217 136 HOH HOH . JA 10 HOH T 18 218 148 HOH HOH . JA 10 HOH T 19 219 149 HOH HOH . JA 10 HOH T 20 220 150 HOH HOH . JA 10 HOH T 21 221 151 HOH HOH . JA 10 HOH T 22 222 152 HOH HOH . JA 10 HOH T 23 223 156 HOH HOH . JA 10 HOH T 24 224 170 HOH HOH . JA 10 HOH T 25 225 185 HOH HOH . JA 10 HOH T 26 226 186 HOH HOH . JA 10 HOH T 27 227 187 HOH HOH . JA 10 HOH T 28 228 191 HOH HOH . JA 10 HOH T 29 229 192 HOH HOH . JA 10 HOH T 30 230 214 HOH HOH . JA 10 HOH T 31 231 216 HOH HOH . JA 10 HOH T 32 232 217 HOH HOH . JA 10 HOH T 33 233 221 HOH HOH . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol NA _atom_site.label_atom_id NA _atom_site.label_comp_id NA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id M _atom_site.label_entity_id 7 _atom_site.Cartn_x 13.152 _atom_site.Cartn_y 7.049 _atom_site.Cartn_z 24.687 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 15.51 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id NA _atom_site.auth_comp_id NA _atom_site.auth_seq_id 409 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 8 _model_server_stats.parse_time_ms 8 _model_server_stats.create_model_time_ms 23 _model_server_stats.query_time_ms 302 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 1 #