data_4RUF # _model_server_result.job_id 3E-kXYrrmS8hvPrq5-px9w _model_server_result.datetime_utc '2024-11-30 21:11:42' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 4ruf # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"G","auth_seq_id":402}' # _entry.id 4RUF # _exptl.entry_id 4RUF _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 39.098 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'POTASSIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 6 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 4RUF _cell.length_a 88.053 _cell.length_b 127.982 _cell.length_c 130.406 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 4RUF _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 C N N ? 2 D N N ? 2 E N N ? 2 F N N ? 2 G N N ? 2 H N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 78 A CYS 78 1_555 B SG CYS 78 B CYS 78 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? metalc ? metalc1 A O THR 129 A THR 129 1_555 C K K . A K 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.734 ? metalc ? metalc2 A OG1 THR 129 A THR 129 1_555 D K K . A K 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.867 ? metalc ? metalc3 A O THR 129 A THR 129 1_555 D K K . A K 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.888 ? metalc ? metalc4 A O ILE 130 A ILE 130 1_555 C K K . A K 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.791 ? metalc ? metalc5 A O ILE 130 A ILE 130 1_555 F K K . B K 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.75 ? metalc ? metalc6 A O GLY 131 A GLY 131 1_555 E K K . A K 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.999 ? metalc ? metalc7 A O GLY 131 A GLY 131 1_555 F K K . B K 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.78 ? metalc ? metalc8 A O TYR 132 A TYR 132 1_555 E K K . A K 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.778 ? metalc ? metalc9 A O THR 238 A THR 238 1_555 C K K . A K 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.764 ? metalc ? metalc10 A OG1 THR 238 A THR 238 1_555 D K K . A K 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.83 ? metalc ? metalc11 A O THR 238 A THR 238 1_555 D K K . A K 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.866 ? metalc ? metalc12 A O VAL 239 A VAL 239 1_555 C K K . A K 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.759 ? metalc ? metalc13 A O VAL 239 A VAL 239 1_555 F K K . B K 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.769 ? metalc ? metalc14 A O GLY 240 A GLY 240 1_555 E K K . A K 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.956 ? metalc ? metalc15 A O GLY 240 A GLY 240 1_555 F K K . B K 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.707 ? metalc ? metalc16 A O PHE 241 A PHE 241 1_555 E K K . A K 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.946 ? metalc ? metalc17 C K K . A K 401 1_555 B O THR 129 B THR 129 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.78 ? metalc ? metalc18 C K K . A K 401 1_555 B O ILE 130 B ILE 130 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.794 ? metalc ? metalc19 C K K . A K 401 1_555 B O THR 238 B THR 238 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.689 ? metalc ? metalc20 C K K . A K 401 1_555 B O VAL 239 B VAL 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.013 ? metalc ? metalc21 D K K . A K 402 1_555 B OG1 THR 129 B THR 129 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.784 ? metalc ? metalc22 D K K . A K 402 1_555 B O THR 129 B THR 129 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.844 ? metalc ? metalc23 D K K . A K 402 1_555 B OG1 THR 238 B THR 238 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.684 ? metalc ? metalc24 D K K . A K 402 1_555 B O THR 238 B THR 238 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.836 ? metalc ? metalc25 E K K . A K 403 1_555 B O GLY 131 B GLY 131 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.023 ? metalc ? metalc26 E K K . A K 403 1_555 B O TYR 132 B TYR 132 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.781 ? metalc ? metalc27 E K K . A K 403 1_555 B O GLY 240 B GLY 240 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.828 ? metalc ? metalc28 E K K . A K 403 1_555 B O PHE 241 B PHE 241 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.282 ? metalc ? metalc29 B O ILE 130 B ILE 130 1_555 F K K . B K 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.737 ? metalc ? metalc30 B O GLY 131 B GLY 131 1_555 F K K . B K 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.717 ? metalc ? metalc31 B O VAL 239 B VAL 239 1_555 F K K . B K 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.71 ? metalc ? metalc32 B O GLY 240 B GLY 240 1_555 F K K . B K 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.768 ? # _chem_comp.formula 'K 1' _chem_comp.formula_weight 39.098 _chem_comp.id K _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'POTASSIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 4RUF _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.011357 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.007814 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.007668 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 2 K A 1 401 1 K K . D 2 K A 1 402 3 K K . E 2 K A 1 403 5 K K . F 2 K B 1 401 2 K K . G 2 K B 1 402 4 K K . H 2 K B 1 403 6 K K . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol K _atom_site.label_atom_id K _atom_site.label_comp_id K _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id G _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x -22.933 _atom_site.Cartn_y -4.754 _atom_site.Cartn_z 14.558 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 109.86 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id K _atom_site.auth_comp_id K _atom_site.auth_seq_id 402 _atom_site.auth_asym_id B _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 8 _model_server_stats.parse_time_ms 9 _model_server_stats.create_model_time_ms 4 _model_server_stats.query_time_ms 270 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 1 #