data_4RVY # _model_server_result.job_id mxBPHtaNOL_sjtBW97vXQg _model_server_result.datetime_utc '2024-11-23 13:28:18' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 4rvy # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"VD","auth_seq_id":516}' # _entry.id 4RVY # _exptl.entry_id 4RVY _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 949.299 _entity.id 31 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG)' _entity.pdbx_number_of_molecules 10 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 4RVY _cell.length_a 136.61 _cell.length_b 228.09 _cell.length_c 308.68 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 4RVY _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 38-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 38 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,AC,BC,CC,DC,EC,FC,GC,HC,IC,JC,KC,LC,MC,NC,OC,PC,QC,RC,SC,TC,UC,VC,WC,XC,YC,ZC,AD,BD,CD,DD,ED,FD,GD,HD,ID,JD,KD,LD,MD,ND,OD,PD,QD,RD,SD,TD,UD,VD,WD,XD,YD,ZD,AE,BE,CE,DE,EE,FE,GE,HE,IE,JE,KE,LE,ME,NE,OE,PE,QE,RE,SE,TE,UE,VE,WE,XE,YE,ZE,AF,BF,CF,DF,EF,FF,GF,HF,IF,JF,KF,LF,MF,NF,OF,PF,QF,RF,SF,TF,UF,VF,WF,XF,YF,ZF,AG,BG,CG,DG,EG,FG,GG,HG,IG,JG,KG,LG,MG,NG,OG,PG,QG,RG,SG,TG,UG,VG _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 31 VD N N ? 31 WD N N ? 31 XD N N ? 31 PE N N ? 31 QE N N ? 31 RE N N ? 31 DF N N ? 31 OF N N ? 31 XF N N ? 31 ZF N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 Y SG CYS 16 O CYS 19 1_555 Y SG CYS 41 O CYS 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? disulf ? disulf2 Z SG CYS 16 o CYS 19 1_555 Z SG CYS 41 o CYS 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.047 ? metalc ? metalc1 A OD2 ASP 160 A ASP 170 1_555 MA MN4 OEX . A OEX 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.077 ? metalc ? metalc2 A OD1 ASP 160 A ASP 170 1_555 MA CA1 OEX . A OEX 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.441 ? metalc ? metalc3 A OE2 GLU 179 A GLU 189 1_555 MA MN1 OEX . A OEX 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.899 ? metalc ? metalc4 A NE2 HIS 205 A HIS 215 1_555 NA FE FE2 . A FE2 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.163 ? metalc ? metalc5 A NE2 HIS 262 A HIS 272 1_555 NA FE FE2 . A FE2 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.248 ? metalc ? metalc6 A NE2 HIS 322 A HIS 332 1_555 MA MN1 OEX . A OEX 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.135 ? metalc ? metalc7 A OE1 GLU 323 A GLU 333 1_555 MA MN3 OEX . A OEX 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.072 ? metalc ? metalc8 A OE2 GLU 323 A GLU 333 1_555 MA MN4 OEX . A OEX 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.173 ? metalc ? metalc9 A OD1 ASP 332 A ASP 342 1_555 MA MN2 OEX . A OEX 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.147 ? metalc ? metalc10 A OD2 ASP 332 A ASP 342 1_555 MA MN1 OEX . A OEX 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.257 ? metalc ? metalc11 A OXT ALA 334 A ALA 344 1_555 MA MN2 OEX . A OEX 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.989 ? metalc ? metalc12 A O ALA 334 A ALA 344 1_555 MA CA1 OEX . A OEX 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.539 ? metalc ? metalc13 MA MN2 OEX . A OEX 601 1_555 E OE1 GLU 342 C GLU 354 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.076 ? metalc ? metalc14 MA MN3 OEX . A OEX 601 1_555 E OE2 GLU 342 C GLU 354 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.233 ? metalc ? metalc15 NA FE FE2 . A FE2 602 1_555 XA O2 BCT . A BCT 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.255 ? metalc ? metalc16 NA FE FE2 . A FE2 602 1_555 XA O1 BCT . A BCT 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.288 ? metalc ? metalc17 NA FE FE2 . A FE2 602 1_555 G NE2 HIS 204 D HIS 214 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.114 ? metalc ? metalc18 NA FE FE2 . A FE2 602 1_555 G NE2 HIS 258 D HIS 268 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.334 ? metalc ? metalc19 B OD2 ASP 160 a ASP 170 1_555 AB MN4 OEX . a OEX 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.076 ? metalc ? metalc20 B OD1 ASP 160 a ASP 170 1_555 AB CA1 OEX . a OEX 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.441 ? metalc ? metalc21 B OE2 GLU 179 a GLU 189 1_555 AB MN1 OEX . a OEX 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.899 ? metalc ? metalc22 B NE2 HIS 205 a HIS 215 1_555 BB FE FE2 . a FE2 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.164 ? metalc ? metalc23 B NE2 HIS 262 a HIS 272 1_555 BB FE FE2 . a FE2 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.249 ? metalc ? metalc24 B NE2 HIS 322 a HIS 332 1_555 AB MN1 OEX . a OEX 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.135 ? metalc ? metalc25 B OE1 GLU 323 a GLU 333 1_555 AB MN3 OEX . a OEX 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.071 ? metalc ? metalc26 B OE2 GLU 323 a GLU 333 1_555 AB MN4 OEX . a OEX 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.173 ? metalc ? metalc27 B OD1 ASP 332 a ASP 342 1_555 AB MN2 OEX . a OEX 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.148 ? metalc ? metalc28 B OD2 ASP 332 a ASP 342 1_555 AB MN1 OEX . a OEX 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.256 ? metalc ? metalc29 B OXT ALA 334 a ALA 344 1_555 AB MN2 OEX . a OEX 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.989 ? metalc ? metalc30 B O ALA 334 a ALA 344 1_555 AB CA1 OEX . a OEX 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.54 ? metalc ? metalc31 AB MN2 OEX . a OEX 601 1_555 F OE1 GLU 342 c GLU 354 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.075 ? metalc ? metalc32 AB MN3 OEX . a OEX 601 1_555 F OE2 GLU 342 c GLU 354 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.233 ? metalc ? metalc33 BB FE FE2 . a FE2 602 1_555 LB O1 BCT . a BCT 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.255 ? metalc ? metalc34 BB FE FE2 . a FE2 602 1_555 LB O2 BCT . a BCT 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.288 ? metalc ? metalc35 BB FE FE2 . a FE2 602 1_555 H NE2 HIS 204 d HIS 214 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.114 ? metalc ? metalc36 BB FE FE2 . a FE2 602 1_555 H NE2 HIS 258 d HIS 268 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.335 ? metalc ? metalc37 C OD1 ASN 437 B ASN 438 1_555 IC CA CA . B CA 621 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.654 ? metalc ? metalc38 D OD1 ASN 437 b ASN 438 1_555 DD CA CA . b CA 620 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.654 ? metalc ? metalc39 E OD1 ASN 27 C ASN 39 1_555 QD MG CLA . C CLA 511 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.109 ? metalc ? metalc40 F OD1 ASN 27 c ASN 39 1_555 KE MG CLA . c CLA 511 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.109 ? metalc ? metalc41 ZE O4 LMG . D LMG 406 1_555 AG MG MG . J MG 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.392 ? metalc ? metalc42 KF O4 LMG . d LMG 406 1_555 BG MG MG . j MG 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.393 ? metalc ? metalc43 I NE2 HIS 20 E HIS 23 1_555 SF FE HEM . F HEM 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.062 ? metalc ? metalc44 J NE2 HIS 20 e HIS 23 1_555 UF FE HEM . f HEM 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.061 ? metalc ? metalc45 K NE2 HIS 13 F HIS 24 1_555 SF FE HEM . F HEM 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.095 ? metalc ? metalc46 K OXT ARG 34 F ARG 45 1_555 TF CA CA . F CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.583 ? metalc ? metalc47 K O ARG 34 F ARG 45 1_555 TF CA CA . F CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.971 ? metalc ? metalc48 L NE2 HIS 13 f HIS 24 1_555 UF FE HEM . f HEM 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.095 ? metalc ? metalc49 L OXT ARG 34 f ARG 45 1_555 VF CA CA . f CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.583 ? metalc ? metalc50 L O ARG 34 f ARG 45 1_555 VF CA CA . f CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.971 ? metalc ? metalc51 Q O GLY 31 J GLY 31 1_555 AG MG MG . J MG 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.204 ? metalc ? metalc52 Q O ALA 34 J ALA 34 1_555 AG MG MG . J MG 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.255 ? metalc ? metalc53 Q O LEU 36 J LEU 36 1_555 AG MG MG . J MG 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.384 ? metalc ? metalc54 R O GLY 31 j GLY 31 1_555 BG MG MG . j MG 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.204 ? metalc ? metalc55 R O ALA 34 j ALA 34 1_555 BG MG MG . j MG 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.256 ? metalc ? metalc56 R O LEU 36 j LEU 36 1_555 BG MG MG . j MG 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.384 ? metalc ? metalc57 Y O THR 135 O THR 138 1_555 LG CA CA . O CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.545 ? metalc ? metalc58 Y OD1 ASN 197 O ASN 200 1_555 LG CA CA . O CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.423 ? metalc ? metalc59 Y O VAL 198 O VAL 201 1_555 LG CA CA . O CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.29 ? metalc ? metalc60 Z O THR 135 o THR 138 1_555 MG CA CA . o CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.545 ? metalc ? metalc61 Z OD1 ASN 197 o ASN 200 1_555 MG CA CA . o CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.422 ? metalc ? metalc62 Z O VAL 198 o VAL 201 1_555 MG CA CA . o CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.29 ? metalc ? metalc63 EA NE2 HIS 41 V HIS 41 1_555 SG FE HEM . V HEM 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? metalc ? metalc64 EA NE2 HIS 92 V HIS 92 1_555 SG FE HEM . V HEM 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.129 ? metalc ? metalc65 FA NE2 HIS 41 v HIS 41 1_555 TG FE HEM . v HEM 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.045 ? metalc ? metalc66 FA NE2 HIS 92 v HIS 92 1_555 TG FE HEM . v HEM 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.129 ? # _chem_comp.formula 'C51 H96 O15' _chem_comp.formula_weight 949.299 _chem_comp.id DGD _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG)' _chem_comp.type saccharide _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1A C2A DGD sing 329 n n C1A O1A DGD doub 330 n n C1A O1G DGD sing 331 n n C2A C3A DGD sing 332 n n C2A HA21 DGD sing 333 n n C2A HA22 DGD sing 334 n n C3A C4A DGD sing 335 n n C3A HA31 DGD sing 336 n n C3A HA32 DGD sing 337 n n C4A C5A DGD sing 338 n n C4A HA41 DGD sing 339 n n C4A HA42 DGD sing 340 n n C5A C6A DGD sing 341 n n C5A HA51 DGD sing 342 n n C5A HA52 DGD sing 343 n n C6A C7A DGD sing 344 n n C6A HA61 DGD sing 345 n n C6A HA62 DGD sing 346 n n C7A C8A DGD sing 347 n n C7A HA71 DGD sing 348 n n C7A HA72 DGD sing 349 n n C8A C9A DGD sing 350 n n C8A HA81 DGD sing 351 n n C8A HA82 DGD sing 352 n n C9A CAA DGD sing 353 n n C9A HA91 DGD sing 354 n n C9A HA92 DGD sing 355 n n CAA CBA DGD sing 356 n n CAA HAT1 DGD sing 357 n n CAA HAT2 DGD sing 358 n n CBA CCA DGD sing 359 n n CBA HAE1 DGD sing 360 n n CBA HAE2 DGD sing 361 n n CCA CDA DGD sing 362 n n CCA HAW1 DGD sing 363 n n CCA HAW2 DGD sing 364 n n CDA CEA DGD sing 365 n n CDA HAH1 DGD sing 366 n n CDA HAH2 DGD sing 367 n n CEA CFA DGD sing 368 n n CEA HAF1 DGD sing 369 n n CEA HAF2 DGD sing 370 n n CFA CGA DGD sing 371 n n CFA HAN1 DGD sing 372 n n CFA HAN2 DGD sing 373 n n CGA CHA DGD sing 374 n n CGA HAS1 DGD sing 375 n n CGA HAS2 DGD sing 376 n n CHA CIA DGD sing 377 n n CHA HAV1 DGD sing 378 n n CHA HAV2 DGD sing 379 n n CIA HAG1 DGD sing 380 n n CIA HAG2 DGD sing 381 n n CIA HAG3 DGD sing 382 n n C1B C2B DGD sing 383 n n C1B O1B DGD doub 384 n n C1B O2G DGD sing 385 n n C2B C3B DGD sing 386 n n C2B HB21 DGD sing 387 n n C2B HB22 DGD sing 388 n n C3B C4B DGD sing 389 n n C3B HB31 DGD sing 390 n n C3B HB32 DGD sing 391 n n C4B C5B DGD sing 392 n n C4B HB41 DGD sing 393 n n C4B HB42 DGD sing 394 n n C5B C6B DGD sing 395 n n C5B HB51 DGD sing 396 n n C5B HB52 DGD sing 397 n n C6B C7B DGD sing 398 n n C6B HB61 DGD sing 399 n n C6B HB62 DGD sing 400 n n C7B C8B DGD sing 401 n n C7B HB71 DGD sing 402 n n C7B HB72 DGD sing 403 n n C8B C9B DGD sing 404 n n C8B HB81 DGD sing 405 n n C8B HB82 DGD sing 406 n n C9B CAB DGD sing 407 n n C9B HB91 DGD sing 408 n n C9B HB92 DGD sing 409 n n CAB CBB DGD sing 410 n n CAB HBT1 DGD sing 411 n n CAB HBT2 DGD sing 412 n n CBB CCB DGD sing 413 n n CBB HBE1 DGD sing 414 n n CBB HBE2 DGD sing 415 n n CCB CDB DGD sing 416 n n CCB HBW1 DGD sing 417 n n CCB HBW2 DGD sing 418 n n CDB CEB DGD sing 419 n n CDB HBH1 DGD sing 420 n n CDB HBH2 DGD sing 421 n n CEB CFB DGD sing 422 n n CEB HBF1 DGD sing 423 n n CEB HBF2 DGD sing 424 n n CFB CGB DGD sing 425 n n CFB HBN1 DGD sing 426 n n CFB HBN2 DGD sing 427 n n CGB CHB DGD sing 428 n n CGB HBS1 DGD sing 429 n n CGB HBS2 DGD sing 430 n n CHB CIB DGD sing 431 n n CHB HBV1 DGD sing 432 n n CHB HBV2 DGD sing 433 n n CIB HBG1 DGD sing 434 n n CIB HBG2 DGD sing 435 n n CIB HBG3 DGD sing 436 n n O1G C1G DGD sing 437 n n C1G C2G DGD sing 438 n n C1G HG11 DGD sing 439 n n C1G HG12 DGD sing 440 n n C2G O2G DGD sing 441 n n C2G C3G DGD sing 442 n n C2G HG2 DGD sing 443 n n C3G O3G DGD sing 444 n n C3G HG31 DGD sing 445 n n C3G HG32 DGD sing 446 n n O3G C1D DGD sing 447 n n C1D C2D DGD sing 448 n n C1D O6D DGD sing 449 n n C1D HD1 DGD sing 450 n n C2D O2D DGD sing 451 n n C2D C3D DGD sing 452 n n C2D HD2 DGD sing 453 n n O2D HO2D DGD sing 454 n n C3D O3D DGD sing 455 n n C3D C4D DGD sing 456 n n C3D HD3 DGD sing 457 n n O3D HO3D DGD sing 458 n n C4D O4D DGD sing 459 n n C4D C5D DGD sing 460 n n C4D HD4 DGD sing 461 n n O4D HO4D DGD sing 462 n n C5D C6D DGD sing 463 n n C5D O6D DGD sing 464 n n C5D HD5 DGD sing 465 n n O5D C6D DGD sing 466 n n O5D C1E DGD sing 467 n n C6D HD61 DGD sing 468 n n C6D HD62 DGD sing 469 n n C1E C2E DGD sing 470 n n C1E O6E DGD sing 471 n n C1E HE1 DGD sing 472 n n C2E O2E DGD sing 473 n n C2E C3E DGD sing 474 n n C2E HE2 DGD sing 475 n n O2E HO2E DGD sing 476 n n C3E O3E DGD sing 477 n n C3E C4E DGD sing 478 n n C3E HE3 DGD sing 479 n n O3E HO3E DGD sing 480 n n C4E O4E DGD sing 481 n n C4E C5E DGD sing 482 n n C4E HE4 DGD sing 483 n n O4E HO4E DGD sing 484 n n C5E O6E DGD sing 485 n n C5E C6E DGD sing 486 n n C5E HE5 DGD sing 487 n n C6E O5E DGD sing 488 n n C6E HE61 DGD sing 489 n n C6E HE62 DGD sing 490 n n O5E HO5E DGD sing 491 n n # _atom_sites.entry_id 4RVY _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.00732 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.004384 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.00324 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code MA 20 OEX A 1 601 601 OEX OEX . NA 21 FE2 A 1 602 603 FE2 FE2 . OA 22 CLA A 1 603 604 CLA CLA . PA 22 CLA A 1 604 607 CLA CLA . QA 23 PHO A 1 605 608 PHO PHO . RA 23 PHO A 1 606 609 PHO PHO . SA 22 CLA A 1 607 610 CLA CLA . TA 24 BCR A 1 608 645 BCR BCR . UA 25 SQD A 1 609 659 SQD SQD . VA 26 CL A 1 610 679 CL CL . WA 26 CL A 1 611 680 CL CL . XA 27 BCT A 1 612 681 BCT BCT . YA 28 PL9 A 1 613 713 PL9 PL9 . ZA 29 LMG A 1 614 751 LMG LMG . AB 20 OEX a 1 601 601 OEX OEX . BB 21 FE2 a 1 602 603 FE2 FE2 . CB 22 CLA a 1 603 604 CLA CLA . DB 22 CLA a 1 604 607 CLA CLA . EB 23 PHO a 1 605 608 PHO PHO . FB 23 PHO a 1 606 609 PHO PHO . GB 22 CLA a 1 607 610 CLA CLA . HB 24 BCR a 1 608 645 BCR BCR . IB 25 SQD a 1 609 659 SQD SQD . JB 26 CL a 1 610 679 CL CL . KB 26 CL a 1 611 680 CL CL . LB 27 BCT a 1 612 681 BCT BCT . MB 28 PL9 a 1 613 713 PL9 PL9 . NB 29 LMG a 1 614 751 LMG LMG . OB 25 SQD B 1 601 667 SQD SQD . PB 22 CLA B 1 602 612 CLA CLA . QB 22 CLA B 1 603 613 CLA CLA . RB 22 CLA B 1 604 614 CLA CLA . SB 22 CLA B 1 605 615 CLA CLA . TB 22 CLA B 1 606 616 CLA CLA . UB 22 CLA B 1 607 617 CLA CLA . VB 22 CLA B 1 608 618 CLA CLA . WB 22 CLA B 1 609 619 CLA CLA . XB 22 CLA B 1 610 620 CLA CLA . YB 22 CLA B 1 611 621 CLA CLA . ZB 22 CLA B 1 612 622 CLA CLA . AC 22 CLA B 1 613 623 CLA CLA . BC 22 CLA B 1 614 624 CLA CLA . CC 22 CLA B 1 615 625 CLA CLA . DC 22 CLA B 1 616 626 CLA CLA . EC 22 CLA B 1 617 627 CLA CLA . FC 24 BCR B 1 618 646 BCR BCR . GC 24 BCR B 1 619 648 BCR BCR . HC 29 LMG B 1 620 669 LMG LMG . IC 30 CA B 1 621 803 CA CA . JC 24 BCR B 1 622 647 BCR BCR . KC 25 SQD b 1 601 667 SQD SQD . LC 22 CLA b 1 602 612 CLA CLA . MC 22 CLA b 1 603 613 CLA CLA . NC 22 CLA b 1 604 614 CLA CLA . OC 22 CLA b 1 605 615 CLA CLA . PC 22 CLA b 1 606 616 CLA CLA . QC 22 CLA b 1 607 617 CLA CLA . RC 22 CLA b 1 608 618 CLA CLA . SC 22 CLA b 1 609 619 CLA CLA . TC 22 CLA b 1 610 620 CLA CLA . UC 22 CLA b 1 611 621 CLA CLA . VC 22 CLA b 1 612 622 CLA CLA . WC 22 CLA b 1 613 623 CLA CLA . XC 22 CLA b 1 614 624 CLA CLA . YC 22 CLA b 1 615 625 CLA CLA . ZC 22 CLA b 1 616 626 CLA CLA . AD 22 CLA b 1 617 627 CLA CLA . BD 24 BCR b 1 618 648 BCR BCR . CD 29 LMG b 1 619 669 LMG LMG . DD 30 CA b 1 620 803 CA CA . ED 25 SQD b 1 621 668 SQD SQD . FD 24 BCR b 1 622 647 BCR BCR . GD 22 CLA C 1 501 628 CLA CLA . HD 22 CLA C 1 502 629 CLA CLA . ID 22 CLA C 1 503 630 CLA CLA . JD 22 CLA C 1 504 631 CLA CLA . KD 22 CLA C 1 505 632 CLA CLA . LD 22 CLA C 1 506 633 CLA CLA . MD 22 CLA C 1 507 634 CLA CLA . ND 22 CLA C 1 508 635 CLA CLA . OD 22 CLA C 1 509 636 CLA CLA . PD 22 CLA C 1 510 637 CLA CLA . QD 22 CLA C 1 511 638 CLA CLA . RD 22 CLA C 1 512 639 CLA CLA . SD 22 CLA C 1 513 640 CLA CLA . TD 24 BCR C 1 514 654 BCR BCR . UD 24 BCR C 1 515 655 BCR BCR . VD 31 DGD C 1 516 657 DGD DGD . WD 31 DGD C 1 517 660 DGD DGD . XD 31 DGD C 1 518 661 DGD DGD . YD 29 LMG C 1 519 729 LMG LMG . ZD 29 LMG C 1 520 776 LMG LMG . AE 22 CLA c 1 501 628 CLA CLA . BE 22 CLA c 1 502 629 CLA CLA . CE 22 CLA c 1 503 630 CLA CLA . DE 22 CLA c 1 504 631 CLA CLA . EE 22 CLA c 1 505 632 CLA CLA . FE 22 CLA c 1 506 633 CLA CLA . GE 22 CLA c 1 507 634 CLA CLA . HE 22 CLA c 1 508 635 CLA CLA . IE 22 CLA c 1 509 636 CLA CLA . JE 22 CLA c 1 510 637 CLA CLA . KE 22 CLA c 1 511 638 CLA CLA . LE 22 CLA c 1 512 639 CLA CLA . ME 22 CLA c 1 513 640 CLA CLA . NE 24 BCR c 1 514 654 BCR BCR . OE 24 BCR c 1 515 655 BCR BCR . PE 31 DGD c 1 516 657 DGD DGD . QE 31 DGD c 1 517 660 DGD DGD . RE 31 DGD c 1 518 661 DGD DGD . SE 29 LMG c 1 519 729 LMG LMG . TE 29 LMG c 1 520 776 LMG LMG . UE 22 CLA D 1 401 605 CLA CLA . VE 22 CLA D 1 402 606 CLA CLA . WE 22 CLA D 1 403 611 CLA CLA . XE 24 BCR D 1 404 651 BCR BCR . YE 32 LHG D 1 405 664 LHG LHG . ZE 29 LMG D 1 406 692 LMG LMG . AF 32 LHG D 1 407 702 LHG LHG . BF 28 PL9 D 1 408 712 PL9 PL9 . CF 32 LHG D 1 409 714 LHG LHG . DF 31 DGD D 1 410 755 DGD DGD . EF 25 SQD D 1 411 768 SQD SQD . FF 22 CLA d 1 401 605 CLA CLA . GF 22 CLA d 1 402 606 CLA CLA . HF 22 CLA d 1 403 611 CLA CLA . IF 24 BCR d 1 404 651 BCR BCR . JF 32 LHG d 1 405 664 LHG LHG . KF 29 LMG d 1 406 692 LMG LMG . LF 32 LHG d 1 407 702 LHG LHG . MF 28 PL9 d 1 408 712 PL9 PL9 . NF 32 LHG d 1 409 714 LHG LHG . OF 31 DGD d 1 410 755 DGD DGD . PF 25 SQD d 1 411 768 SQD SQD . QF 32 LHG E 1 101 772 LHG LHG . RF 32 LHG e 1 101 772 LHG LHG . SF 33 HEM F 1 101 641 HEM HEM . TF 30 CA F 1 102 796 CA CA . UF 33 HEM f 1 101 641 HEM HEM . VF 30 CA f 1 102 796 CA CA . WF 24 BCR H 1 101 650 BCR BCR . XF 31 DGD H 1 102 663 DGD DGD . YF 24 BCR h 1 101 650 BCR BCR . ZF 31 DGD h 1 102 663 DGD DGD . AG 34 MG J 1 101 771 MG MG . BG 34 MG j 1 101 771 MG MG . CG 24 BCR K 1 101 652 BCR BCR . DG 24 BCR K 1 102 653 BCR BCR . EG 24 BCR k 1 101 652 BCR BCR . FG 24 BCR k 1 102 653 BCR BCR . GG 25 SQD L 1 101 668 SQD SQD . HG 32 LHG L 1 102 694 LHG LHG . IG 25 SQD l 1 101 668 SQD SQD . JG 25 SQD l 1 102 668 SQD SQD . KG 32 LHG l 1 103 694 LHG LHG . LG 30 CA O 1 301 767 CA CA . MG 30 CA o 1 301 767 CA CA . NG 24 BCR T 1 101 646 BCR BCR . OG 24 BCR T 1 102 649 BCR BCR . PG 24 BCR t 1 101 649 BCR BCR . QG 26 CL U 1 201 808 CL CL . RG 26 CL u 1 201 808 CL CL . SG 33 HEM V 1 201 642 HEM HEM . TG 33 HEM v 1 201 642 HEM HEM . UG 29 LMG Z 1 101 784 LMG LMG . VG 29 LMG z 1 101 784 LMG LMG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1A DGD . . . VD 31 -44.592 46.834 -63.525 1 33.51 ? C1A DGD 516 C 1 HETATM 2 C C2A DGD . . . VD 31 -44.99 47.048 -62.082 1 36.4 ? C2A DGD 516 C 1 HETATM 3 C C3A DGD . . . VD 31 -45.648 45.832 -61.442 1 39.61 ? C3A DGD 516 C 1 HETATM 4 C C4A DGD . . . VD 31 -45.864 46.051 -59.944 1 42.69 ? C4A DGD 516 C 1 HETATM 5 C C5A DGD . . . VD 31 -46.707 47.289 -59.671 1 46.39 ? C5A DGD 516 C 1 HETATM 6 C C6A DGD . . . VD 31 -47.418 47.224 -58.324 1 49.61 ? C6A DGD 516 C 1 HETATM 7 C C7A DGD . . . VD 31 -48.901 46.917 -58.534 1 53.61 ? C7A DGD 516 C 1 HETATM 8 C C8A DGD . . . VD 31 -49.792 47.699 -57.57 1 56.16 ? C8A DGD 516 C 1 HETATM 9 C C9A DGD . . . VD 31 -50.338 46.797 -56.467 1 58.19 ? C9A DGD 516 C 1 HETATM 10 C CAA DGD . . . VD 31 -51.353 47.534 -55.599 1 59.72 ? CAA DGD 516 C 1 HETATM 11 C CBA DGD . . . VD 31 -50.687 48.176 -54.383 1 60.69 ? CBA DGD 516 C 1 HETATM 12 C CCA DGD . . . VD 31 -51.507 49.352 -53.862 1 61.4 ? CCA DGD 516 C 1 HETATM 13 C CDA DGD . . . VD 31 -51.098 50.671 -54.517 1 62.52 ? CDA DGD 516 C 1 HETATM 14 C CEA DGD . . . VD 31 -52.279 51.635 -54.63 1 62.73 ? CEA DGD 516 C 1 HETATM 15 C CFA DGD . . . VD 31 -51.799 53.074 -54.782 1 62.87 ? CFA DGD 516 C 1 HETATM 16 C CGA DGD . . . VD 31 -52.701 54.039 -54.023 1 62.66 ? CGA DGD 516 C 1 HETATM 17 O O1A DGD . . . VD 31 -44.068 45.814 -63.949 1 33.08 ? O1A DGD 516 C 1 HETATM 18 C C1B DGD . . . VD 31 -47.674 49.628 -65.501 1 32.32 ? C1B DGD 516 C 1 HETATM 19 C C2B DGD . . . VD 31 -48.04 50.898 -64.773 1 35.73 ? C2B DGD 516 C 1 HETATM 20 C C3B DGD . . . VD 31 -46.857 51.417 -63.967 1 39.97 ? C3B DGD 516 C 1 HETATM 21 C C4B DGD . . . VD 31 -46.768 50.811 -62.575 1 40.57 ? C4B DGD 516 C 1 HETATM 22 C C5B DGD . . . VD 31 -46.083 51.796 -61.631 1 42.12 ? C5B DGD 516 C 1 HETATM 23 C C6B DGD . . . VD 31 -44.59 51.524 -61.49 1 41.71 ? C6B DGD 516 C 1 HETATM 24 C C7B DGD . . . VD 31 -44.273 51.028 -60.085 1 41.58 ? C7B DGD 516 C 1 HETATM 25 C C8B DGD . . . VD 31 -43.324 51.976 -59.372 1 39.77 ? C8B DGD 516 C 1 HETATM 26 C C9B DGD . . . VD 31 -43.728 52.136 -57.916 1 39.78 ? C9B DGD 516 C 1 HETATM 27 C CAB DGD . . . VD 31 -42.496 52.112 -57.023 1 39.63 ? CAB DGD 516 C 1 HETATM 28 C CBB DGD . . . VD 31 -42.472 53.315 -56.102 1 39.61 ? CBB DGD 516 C 1 HETATM 29 C CCB DGD . . . VD 31 -41.277 53.291 -55.158 1 39.49 ? CCB DGD 516 C 1 HETATM 30 C CDB DGD . . . VD 31 -41.754 53.356 -53.708 1 39.26 ? CDB DGD 516 C 1 HETATM 31 C CEB DGD . . . VD 31 -40.71 54.002 -52.799 1 38.79 ? CEB DGD 516 C 1 HETATM 32 C CFB DGD . . . VD 31 -41.138 53.88 -51.337 1 37.16 ? CFB DGD 516 C 1 HETATM 33 C CGB DGD . . . VD 31 -40.179 54.63 -50.427 1 35.88 ? CGB DGD 516 C 1 HETATM 34 O O1B DGD . . . VD 31 -48.49 48.731 -65.593 1 33.15 ? O1B DGD 516 C 1 HETATM 35 O O1G DGD . . . VD 31 -44.832 47.931 -64.43 1 33.06 ? O1G DGD 516 C 1 HETATM 36 C C1G DGD . . . VD 31 -44.662 47.802 -65.828 1 30.38 ? C1G DGD 516 C 1 HETATM 37 C C2G DGD . . . VD 31 -46.017 48.127 -66.433 1 28.71 ? C2G DGD 516 C 1 HETATM 38 O O2G DGD . . . VD 31 -46.361 49.467 -66.095 1 30.56 ? O2G DGD 516 C 1 HETATM 39 C C3G DGD . . . VD 31 -45.888 47.964 -67.931 1 26.65 ? C3G DGD 516 C 1 HETATM 40 O O3G DGD . . . VD 31 -45.77 46.559 -68.13 1 25.3 ? O3G DGD 516 C 1 HETATM 41 C C1D DGD . . . VD 31 -45.315 46.209 -69.419 1 25.67 ? C1D DGD 516 C 1 HETATM 42 C C2D DGD . . . VD 31 -45.086 44.695 -69.45 1 25.18 ? C2D DGD 516 C 1 HETATM 43 O O2D DGD . . . VD 31 -43.991 44.358 -68.581 1 26.39 ? O2D DGD 516 C 1 HETATM 44 C C3D DGD . . . VD 31 -44.798 44.236 -70.876 1 24.41 ? C3D DGD 516 C 1 HETATM 45 O O3D DGD . . . VD 31 -44.647 42.815 -70.941 1 23.36 ? O3D DGD 516 C 1 HETATM 46 C C4D DGD . . . VD 31 -45.916 44.69 -71.813 1 26.48 ? C4D DGD 516 C 1 HETATM 47 O O4D DGD . . . VD 31 -47.163 44.052 -71.461 1 27.48 ? O4D DGD 516 C 1 HETATM 48 C C5D DGD . . . VD 31 -46.003 46.217 -71.7 1 25.42 ? C5D DGD 516 C 1 HETATM 49 O O5D DGD . . . VD 31 -46.338 46.982 -73.906 1 25.47 ? O5D DGD 516 C 1 HETATM 50 C C6D DGD . . . VD 31 -47.004 46.836 -72.662 1 26.06 ? C6D DGD 516 C 1 HETATM 51 O O6D DGD . . . VD 31 -46.323 46.602 -70.363 1 25.96 ? O6D DGD 516 C 1 HETATM 52 C C1E DGD . . . VD 31 -46.994 46.235 -74.936 1 26.08 ? C1E DGD 516 C 1 HETATM 53 C C2E DGD . . . VD 31 -45.923 45.636 -75.842 1 24.79 ? C2E DGD 516 C 1 HETATM 54 O O2E DGD . . . VD 31 -45.168 44.694 -75.09 1 24.85 ? O2E DGD 516 C 1 HETATM 55 C C3E DGD . . . VD 31 -45.052 46.779 -76.377 1 25.3 ? C3E DGD 516 C 1 HETATM 56 O O3E DGD . . . VD 31 -43.957 46.303 -77.176 1 23.65 ? O3E DGD 516 C 1 HETATM 57 C C4E DGD . . . VD 31 -45.921 47.755 -77.175 1 25.72 ? C4E DGD 516 C 1 HETATM 58 O O4E DGD . . . VD 31 -46.369 47.115 -78.38 1 25.76 ? O4E DGD 516 C 1 HETATM 59 C C5E DGD . . . VD 31 -47.106 48.241 -76.321 1 25.95 ? C5E DGD 516 C 1 HETATM 60 O O6E DGD . . . VD 31 -47.801 47.124 -75.719 1 26.85 ? O6E DGD 516 C 1 HETATM 61 C C6E DGD . . . VD 31 -48.096 49.093 -77.117 1 27.76 ? C6E DGD 516 C 1 HETATM 62 O O5E DGD . . . VD 31 -47.422 50.114 -77.873 1 26.82 ? O5E DGD 516 C 1 # _model_server_stats.io_time_ms 24 _model_server_stats.parse_time_ms 11 _model_server_stats.create_model_time_ms 80 _model_server_stats.query_time_ms 259 _model_server_stats.encode_time_ms 11 _model_server_stats.element_count 62 #