data_4RZ8
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_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-05 10:51:22' 
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_model_server_result.entry_id          4rz8 
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_model_server_params.name     atom_site 
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_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
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_entity.details                     ? 
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_entity.src_method                  man 
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_entity.pdbx_number_of_molecules    40 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
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_cell.pdbx_unique_axis    ? 
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_symmetry.entry_id                 4RZ8 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        4 
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_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1 21 1' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
? monomeric 1 author_defined_assembly 1 
? monomeric 1 author_defined_assembly 2 
? monomeric 1 author_defined_assembly 3 
? monomeric 1 author_defined_assembly 4 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,AB 1 1 
B,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,BB 2 1 
C,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,CB 3 1 
D,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,DB 4 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 2 E N N 
? 2 F N N 
? 2 G N N 
? 2 H N N 
? 2 I N N 
? 2 J N N 
? 2 K N N 
? 2 L N N 
? 2 M N N 
? 2 P N N 
? 2 Q N N 
? 2 R N N 
? 2 S N N 
? 2 T N N 
? 2 U N N 
? 2 V N N 
? 2 W N N 
? 2 X N N 
? 2 AA N N 
? 2 BA N N 
? 2 CA N N 
? 2 DA N N 
? 2 EA N N 
? 2 FA N N 
? 2 GA N N 
? 2 HA N N 
? 2 IA N N 
? 2 JA N N 
? 2 KA N N 
? 2 NA N N 
? 2 OA N N 
? 2 PA N N 
? 2 QA N N 
? 2 RA N N 
? 2 SA N N 
? 2 TA N N 
? 2 UA N N 
? 2 VA N N 
? 2 WA N N 
? 2 XA N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 A SG CYS 11 A CYS 54 1_555 A SG CYS 31 A CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? 
disulf ? disulf2 A SG CYS 76 A CYS 119 1_555 A SG CYS 89 A CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? 
disulf ? disulf3 A SG CYS 102 A CYS 218 1_555 A SG CYS 131 A CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? 
disulf ? disulf4 A SG CYS 112 A CYS 228 1_555 A SG CYS 123 A CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? 
disulf ? disulf5 A SG CYS 180 A CYS 296 1_555 A SG CYS 199 A CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? 
disulf ? disulf6 A SG CYS 245 A CYS 378 1_555 A SG CYS 306 A CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? 
disulf ? disulf7 A SG CYS 252 A CYS 385 1_555 A SG CYS 279 A CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? 
disulf ? disulf8 B SG CYS 11 B CYS 54 1_555 B SG CYS 31 B CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? 
disulf ? disulf9 B SG CYS 76 B CYS 119 1_555 B SG CYS 89 B CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? 
disulf ? disulf10 B SG CYS 102 B CYS 218 1_555 B SG CYS 131 B CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? 
disulf ? disulf11 B SG CYS 112 B CYS 228 1_555 B SG CYS 123 B CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? 
disulf ? disulf12 B SG CYS 180 B CYS 296 1_555 B SG CYS 199 B CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? 
disulf ? disulf13 B SG CYS 245 B CYS 378 1_555 B SG CYS 306 B CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? 
disulf ? disulf14 B SG CYS 252 B CYS 385 1_555 B SG CYS 279 B CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? 
disulf ? disulf15 C SG CYS 11 C CYS 54 1_555 C SG CYS 31 C CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? 
disulf ? disulf16 C SG CYS 76 C CYS 119 1_555 C SG CYS 89 C CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? 
disulf ? disulf17 C SG CYS 102 C CYS 218 1_555 C SG CYS 131 C CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? 
disulf ? disulf18 C SG CYS 112 C CYS 228 1_555 C SG CYS 123 C CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? 
disulf ? disulf19 C SG CYS 180 C CYS 296 1_555 C SG CYS 199 C CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? 
disulf ? disulf20 C SG CYS 245 C CYS 378 1_555 C SG CYS 306 C CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? 
disulf ? disulf21 C SG CYS 252 C CYS 385 1_555 C SG CYS 279 C CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? 
disulf ? disulf22 D SG CYS 11 D CYS 54 1_555 D SG CYS 31 D CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? 
disulf ? disulf23 D SG CYS 76 D CYS 119 1_555 D SG CYS 89 D CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? 
disulf ? disulf24 D SG CYS 102 D CYS 218 1_555 D SG CYS 131 D CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? 
disulf ? disulf25 D SG CYS 112 D CYS 228 1_555 D SG CYS 123 D CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? 
disulf ? disulf26 D SG CYS 180 D CYS 296 1_555 D SG CYS 199 D CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? 
disulf ? disulf27 D SG CYS 245 D CYS 378 1_555 D SG CYS 306 D CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? 
disulf ? disulf28 D SG CYS 252 D CYS 385 1_555 D SG CYS 279 D CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? 
covale ? covale1 A ND2 ASN 118 A ASN 234 1_555 E C1 NAG . A NAG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? 
covale ? covale2 A ND2 ASN 125 A ASN 241 1_555 F C1 NAG . A NAG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? 
covale ? covale3 A ND2 ASN 146 A ASN 262 1_555 G C1 NAG . A NAG 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? 
covale ? covale4 A ND2 ASN 160 A ASN 276 1_555 H C1 NAG . A NAG 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? 
covale ? covale5 A ND2 ASN 173 A ASN 289 1_555 I C1 NAG . A NAG 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? 
covale ? covale6 A ND2 ASN 179 A ASN 295 1_555 J C1 NAG . A NAG 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? 
covale ? covale7 A ND2 ASN 202 A ASN 334 1_555 K C1 NAG . A NAG 507 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? 
covale ? covale8 A ND2 ASN 253 A ASN 386 1_555 L C1 NAG . A NAG 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? 
covale ? covale9 A ND2 ASN 309 A ASN 448 1_555 M C1 NAG . A NAG 509 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? 
covale ? covale10 B ND2 ASN 118 B ASN 234 1_555 P C1 NAG . B NAG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? 
covale ? covale11 B ND2 ASN 125 B ASN 241 1_555 Q C1 NAG . B NAG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? 
covale ? covale12 B ND2 ASN 146 B ASN 262 1_555 R C1 NAG . B NAG 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? 
covale ? covale13 B ND2 ASN 160 B ASN 276 1_555 S C1 NAG . B NAG 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? 
covale ? covale14 B ND2 ASN 173 B ASN 289 1_555 T C1 NAG . B NAG 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? 
covale ? covale15 B ND2 ASN 179 B ASN 295 1_555 U C1 NAG . B NAG 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? 
covale ? covale16 B ND2 ASN 202 B ASN 334 1_555 V C1 NAG . B NAG 507 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? 
covale ? covale17 B ND2 ASN 253 B ASN 386 1_555 W C1 NAG . B NAG 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? 
covale ? covale18 B ND2 ASN 309 B ASN 448 1_555 X C1 NAG . B NAG 509 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? 
covale ? covale19 C ND2 ASN 118 C ASN 234 1_555 AA C1 NAG . C NAG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? 
covale ? covale20 C ND2 ASN 125 C ASN 241 1_555 BA C1 NAG . C NAG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? 
covale ? covale21 C ND2 ASN 146 C ASN 262 1_555 CA C1 NAG . C NAG 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? 
covale ? covale22 C ND2 ASN 160 C ASN 276 1_555 DA C1 NAG . C NAG 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? 
covale ? covale23 C ND2 ASN 173 C ASN 289 1_555 EA C1 NAG . C NAG 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? 
covale ? covale24 C ND2 ASN 179 C ASN 295 1_555 FA C1 NAG . C NAG 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? 
covale ? covale25 C ND2 ASN 202 C ASN 334 1_555 GA C1 NAG . C NAG 507 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? 
covale ? covale26 C ND2 ASN 223 C ASN 355 1_555 HA C1 NAG . C NAG 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? 
covale ? covale27 C ND2 ASN 253 C ASN 386 1_555 IA C1 NAG . C NAG 509 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? 
covale ? covale28 C ND2 ASN 259 C ASN 392 1_555 JA C1 NAG . C NAG 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? 
covale ? covale29 C ND2 ASN 309 C ASN 448 1_555 KA C1 NAG . C NAG 511 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? 
covale ? covale30 D ND2 ASN 118 D ASN 234 1_555 NA C1 NAG . D NAG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? 
covale ? covale31 D ND2 ASN 125 D ASN 241 1_555 OA C1 NAG . D NAG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? 
covale ? covale32 D ND2 ASN 146 D ASN 262 1_555 PA C1 NAG . D NAG 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? 
covale ? covale33 D ND2 ASN 160 D ASN 276 1_555 QA C1 NAG . D NAG 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? 
covale ? covale34 D ND2 ASN 173 D ASN 289 1_555 RA C1 NAG . D NAG 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? 
covale ? covale35 D ND2 ASN 179 D ASN 295 1_555 SA C1 NAG . D NAG 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? 
covale ? covale36 D ND2 ASN 202 D ASN 334 1_555 TA C1 NAG . D NAG 507 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? 
covale ? covale37 D ND2 ASN 223 D ASN 355 1_555 UA C1 NAG . D NAG 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? 
covale ? covale38 D ND2 ASN 253 D ASN 386 1_555 VA C1 NAG . D NAG 509 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? 
covale ? covale39 D ND2 ASN 259 D ASN 392 1_555 WA C1 NAG . D NAG 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? 
covale ? covale40 D ND2 ASN 309 D ASN 448 1_555 XA C1 NAG . D NAG 511 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? 
#
_chem_comp.formula           'C8 H15 N O6' 
_chem_comp.formula_weight    221.208 
_chem_comp.id                NAG 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose 
_chem_comp.type              'd-saccharide, beta linking' 
_chem_comp.pdbx_synonyms     N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
C1 C2 NAG sing 328 n n 
C1 O1 NAG sing 329 n n 
C1 O5 NAG sing 330 n n 
C1 H1 NAG sing 331 n n 
C2 C3 NAG sing 332 n n 
C2 N2 NAG sing 333 n n 
C2 H2 NAG sing 334 n n 
C3 C4 NAG sing 335 n n 
C3 O3 NAG sing 336 n n 
C3 H3 NAG sing 337 n n 
C4 C5 NAG sing 338 n n 
C4 O4 NAG sing 339 n n 
C4 H4 NAG sing 340 n n 
C5 C6 NAG sing 341 n n 
C5 O5 NAG sing 342 n n 
C5 H5 NAG sing 343 n n 
C6 O6 NAG sing 344 n n 
C6 H61 NAG sing 345 n n 
C6 H62 NAG sing 346 n n 
C7 C8 NAG sing 347 n n 
C7 N2 NAG sing 348 n n 
C7 O7 NAG doub 349 n n 
C8 H81 NAG sing 350 n n 
C8 H82 NAG sing 351 n n 
C8 H83 NAG sing 352 n n 
N2 HN2 NAG sing 353 n n 
O1 HO1 NAG sing 354 n n 
O3 HO3 NAG sing 355 n n 
O4 HO4 NAG sing 356 n n 
O6 HO6 NAG sing 357 n n 
#
loop_
_pdbx_chem_comp_identifier.comp_id
_pdbx_chem_comp_identifier.identifier
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CB 5 HOH C 45 645 121 HOH HOH . 
CB 5 HOH C 46 646 122 HOH HOH . 
CB 5 HOH C 47 647 124 HOH HOH . 
CB 5 HOH C 48 648 128 HOH HOH . 
CB 5 HOH C 49 649 130 HOH HOH . 
CB 5 HOH C 50 650 131 HOH HOH . 
CB 5 HOH C 51 651 134 HOH HOH . 
CB 5 HOH C 52 652 138 HOH HOH . 
CB 5 HOH C 53 653 139 HOH HOH . 
CB 5 HOH C 54 654 140 HOH HOH . 
CB 5 HOH C 55 655 141 HOH HOH . 
CB 5 HOH C 56 656 142 HOH HOH . 
CB 5 HOH C 57 657 143 HOH HOH . 
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CB 5 HOH C 61 661 160 HOH HOH . 
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CB 5 HOH C 105 705 265 HOH HOH . 
CB 5 HOH C 106 706 280 HOH HOH . 
CB 5 HOH C 107 707 281 HOH HOH . 
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CB 5 HOH C 115 715 310 HOH HOH . 
CB 5 HOH C 116 716 317 HOH HOH . 
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CB 5 HOH C 119 719 323 HOH HOH . 
CB 5 HOH C 120 720 324 HOH HOH . 
CB 5 HOH C 121 721 326 HOH HOH . 
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CB 5 HOH C 179 779 534 HOH HOH . 
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CB 5 HOH C 232 832 690 HOH HOH . 
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