data_4TNR # _model_server_result.job_id DhcSb8siLaQdi2auoE3kKA _model_server_result.datetime_utc '2024-11-28 14:17:33' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 4tnr # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"N","auth_seq_id":702}' # _entry.id 4TNR # _exptl.entry_id 4TNR _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 24.305 _entity.id 4 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MAGNESIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 4 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 115.4 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 4TNR _cell.length_a 84.916 _cell.length_b 141.697 _cell.length_c 97.524 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 4TNR _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 4 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1 21 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tetrameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 4 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 4 H N N ? 4 J N N ? 4 N N N ? 4 Q N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 F O3G GTP . D GTP 702 1_555 Q MG MG . A MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.091 ? metalc ? metalc2 F O2B GTP . D GTP 702 1_555 Q MG MG . A MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.888 ? metalc ? metalc3 F O2A GTP . D GTP 702 1_555 Q MG MG . A MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.219 ? metalc ? metalc4 G O1G DTP . D DTP 703 1_555 J MG MG . C MG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.901 ? metalc ? metalc5 G O1B DTP . D DTP 703 1_555 J MG MG . C MG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.11 ? metalc ? metalc6 H MG MG . D MG 704 1_555 L O3G DTP . C DTP 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.939 ? metalc ? metalc7 H MG MG . D MG 704 1_555 L O1B DTP . C DTP 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.872 ? metalc ? metalc8 H MG MG . D MG 704 1_555 U O HOH . C HOH 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.063 ? metalc ? metalc9 H MG MG . D MG 704 1_555 S O3G GTP . A GTP 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.057 ? metalc ? metalc10 H MG MG . D MG 704 1_555 S O2B GTP . A GTP 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.205 ? metalc ? metalc11 H MG MG . D MG 704 1_555 S O1A GTP . A GTP 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.333 ? metalc ? metalc12 J MG MG . C MG 702 1_555 K O3G GTP . C GTP 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.077 ? metalc ? metalc13 J MG MG . C MG 702 1_555 K O2B GTP . C GTP 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.155 ? metalc ? metalc14 J MG MG . C MG 702 1_555 K O2A GTP . C GTP 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.851 ? metalc ? metalc15 M O3G DTP . B DTP 701 1_555 Q MG MG . A MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.895 ? metalc ? metalc16 M O1B DTP . B DTP 701 1_555 Q MG MG . A MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.984 ? metalc ? metalc17 N MG MG . B MG 702 1_555 O O2B GTP . B GTP 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.001 ? metalc ? metalc18 N MG MG . B MG 702 1_555 O O1A GTP . B GTP 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.088 ? metalc ? metalc19 N MG MG . B MG 702 1_555 O O3G GTP . B GTP 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.748 ? metalc ? metalc20 N MG MG . B MG 702 1_555 R O1B DTP . A DTP 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.489 ? metalc ? metalc21 N MG MG . B MG 702 1_555 R O2G DTP . A DTP 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.264 ? metalc ? metalc22 N MG MG . B MG 702 1_555 W O HOH . A HOH 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.972 ? metalc ? metalc23 V O HOH . B HOH 801 1_555 Q MG MG . A MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.146 ? # _chem_comp.formula 'Mg 2' _chem_comp.formula_weight 24.305 _chem_comp.id MG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MAGNESIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 4TNR _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.011776 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.005591 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.007057 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.011351 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code E 2 DTP D 1 701 700 DTP DTP . F 3 GTP D 1 702 900 GTP GTP . G 2 DTP D 1 703 800 DTP DTP . H 4 MG D 1 704 850 MG MG . I 2 DTP C 1 701 700 DTP DTP . J 4 MG C 1 702 850 MG MG . K 3 GTP C 1 703 900 GTP GTP . L 2 DTP C 1 704 800 DTP DTP . M 2 DTP B 1 701 800 DTP DTP . N 4 MG B 1 702 850 MG MG . O 3 GTP B 1 703 900 GTP GTP . P 2 DTP B 1 704 700 DTP DTP . Q 4 MG A 1 701 850 MG MG . R 2 DTP A 1 702 800 DTP DTP . S 3 GTP A 1 703 900 GTP GTP . T 5 HOH D 1 801 4 HOH HOH . T 5 HOH D 2 802 5 HOH HOH . T 5 HOH D 3 803 6 HOH HOH . T 5 HOH D 4 804 12 HOH HOH . T 5 HOH D 5 805 14 HOH HOH . T 5 HOH D 6 806 15 HOH HOH . T 5 HOH D 7 807 19 HOH HOH . T 5 HOH D 8 808 21 HOH HOH . U 5 HOH C 1 801 9 HOH HOH . U 5 HOH C 2 802 10 HOH HOH . V 5 HOH B 1 801 1 HOH HOH . V 5 HOH B 2 802 2 HOH HOH . V 5 HOH B 3 803 7 HOH HOH . V 5 HOH B 4 804 8 HOH HOH . V 5 HOH B 5 805 13 HOH HOH . V 5 HOH B 6 806 16 HOH HOH . V 5 HOH B 7 807 17 HOH HOH . V 5 HOH B 8 808 18 HOH HOH . V 5 HOH B 9 809 20 HOH HOH . W 5 HOH A 1 801 3 HOH HOH . W 5 HOH A 2 802 11 HOH HOH . W 5 HOH A 3 803 22 HOH HOH . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MG _atom_site.label_atom_id MG _atom_site.label_comp_id MG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id N _atom_site.label_entity_id 4 _atom_site.Cartn_x -34.592 _atom_site.Cartn_y 12.203 _atom_site.Cartn_z 50.409 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 88.78 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MG _atom_site.auth_comp_id MG _atom_site.auth_seq_id 702 _atom_site.auth_asym_id B _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 40 _model_server_stats.parse_time_ms 15 _model_server_stats.create_model_time_ms 34 _model_server_stats.query_time_ms 309 _model_server_stats.encode_time_ms 1 _model_server_stats.element_count 1 #