data_4TNY # _model_server_result.job_id aPiHIhMBWJeyRtOacvbwKg _model_server_result.datetime_utc '2024-11-25 01:27:38' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 4tny # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"P","auth_seq_id":701}' # _entry.id 4TNY # _exptl.entry_id 4TNY _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 24.305 _entity.id 4 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MAGNESIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 4 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 116.38 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 4TNY _cell.length_a 86.253 _cell.length_b 141.874 _cell.length_c 98.333 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 4TNY _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 4 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1 21 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tetrameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 4 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 4 G N N ? 4 K N N ? 4 L N N ? 4 P N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 F O3G DTP . A DTP 702 1_555 L MG MG . B MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.967 ? metalc ? metalc2 F O1B DTP . A DTP 702 1_555 L MG MG . B MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.976 ? metalc ? metalc3 G MG MG . A MG 703 1_555 O O1B DTP . B DTP 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.834 ? metalc ? metalc4 G MG MG . A MG 703 1_555 T O2G DGT . D DGT 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.065 ? metalc ? metalc5 G MG MG . A MG 703 1_555 T O1B DGT . D DGT 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.796 ? metalc ? metalc6 G MG MG . A MG 703 1_555 T O2A DGT . D DGT 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.922 ? metalc ? metalc7 G MG MG . A MG 703 1_555 X O HOH . D HOH 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.182 ? metalc ? metalc8 U O HOH . A HOH 801 1_555 L MG MG . B MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.838 ? metalc ? metalc9 H O3G DTP . C DTP 701 1_555 P MG MG . D MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? metalc ? metalc10 H O1B DTP . C DTP 701 1_555 P MG MG . D MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? metalc ? metalc11 J O1B DGT . C DGT 703 1_555 L MG MG . B MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.253 ? metalc ? metalc12 J O2A DGT . C DGT 703 1_555 L MG MG . B MG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.103 ? metalc ? metalc13 K MG MG . C MG 704 1_555 N O2G DGT . B DGT 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.803 ? metalc ? metalc14 K MG MG . C MG 704 1_555 N O1B DGT . B DGT 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.194 ? metalc ? metalc15 K MG MG . C MG 704 1_555 N O2A DGT . B DGT 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.049 ? metalc ? metalc16 K MG MG . C MG 704 1_555 W O HOH . B HOH 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.886 ? metalc ? metalc17 K MG MG . C MG 704 1_555 R O1B DTP . D DTP 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.952 ? metalc ? metalc18 K MG MG . C MG 704 1_555 R O3G DTP . D DTP 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.701 ? metalc ? metalc19 P MG MG . D MG 701 1_555 Q O1B DGT . D DGT 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.955 ? metalc ? metalc20 P MG MG . D MG 701 1_555 Q O2G DGT . D DGT 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.77 ? metalc ? metalc21 P MG MG . D MG 701 1_555 Q O2A DGT . D DGT 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.012 ? metalc ? metalc22 P MG MG . D MG 701 1_555 X O HOH . D HOH 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.004 ? # _chem_comp.formula 'Mg 2' _chem_comp.formula_weight 24.305 _chem_comp.id MG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MAGNESIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 4TNY _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.011594 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.005751 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.007049 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.011352 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code E 2 DGT A 1 701 700 DGT DGT . F 3 DTP A 1 702 800 DTP DTP . G 4 MG A 1 703 850 MG MG . H 3 DTP C 1 701 800 DTP DTP . I 2 DGT C 1 702 700 DGT DGT . J 2 DGT C 1 703 900 DGT DGT . K 4 MG C 1 704 850 MG MG . L 4 MG B 1 701 850 MG MG . M 2 DGT B 1 702 700 DGT DGT . N 2 DGT B 1 703 900 DGT DGT . O 3 DTP B 1 704 800 DTP DTP . P 4 MG D 1 701 850 MG MG . Q 2 DGT D 1 702 900 DGT DGT . R 3 DTP D 1 703 800 DTP DTP . S 2 DGT D 1 704 700 DGT DGT . T 2 DGT D 1 705 900 DGT DGT . U 5 HOH A 1 801 6 HOH HOH . U 5 HOH A 2 802 8 HOH HOH . U 5 HOH A 3 803 9 HOH HOH . U 5 HOH A 4 804 10 HOH HOH . U 5 HOH A 5 805 11 HOH HOH . U 5 HOH A 6 806 13 HOH HOH . U 5 HOH A 7 807 14 HOH HOH . V 5 HOH C 1 801 7 HOH HOH . V 5 HOH C 2 802 12 HOH HOH . V 5 HOH C 3 803 15 HOH HOH . W 5 HOH B 1 801 5 HOH HOH . X 5 HOH D 1 801 1 HOH HOH . X 5 HOH D 2 802 2 HOH HOH . X 5 HOH D 3 803 3 HOH HOH . X 5 HOH D 4 804 4 HOH HOH . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MG _atom_site.label_atom_id MG _atom_site.label_comp_id MG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id P _atom_site.label_entity_id 4 _atom_site.Cartn_x 11.835 _atom_site.Cartn_y -19.385 _atom_site.Cartn_z -0.714 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 30.27 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MG _atom_site.auth_comp_id MG _atom_site.auth_seq_id 701 _atom_site.auth_asym_id D _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 146 _model_server_stats.parse_time_ms 14 _model_server_stats.create_model_time_ms 31 _model_server_stats.query_time_ms 279 _model_server_stats.encode_time_ms 1 _model_server_stats.element_count 1 #