data_4TR2
#
_model_server_result.job_id            mEADXqVbLwJjQeM6R6v72Q 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-04 22:51:48' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          4tr2 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"J","auth_seq_id":801}' 
#
_entry.id    4TR2 
#
_exptl.entry_id    4TR2 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              40.078 
_entity.id                          2 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'CALCIUM ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    8 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            4TR2 
_cell.length_a            95 
_cell.length_b            95 
_cell.length_c            287.76 
_cell.Z_PDB               16 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 4TR2 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        96 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 43 21 2' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
? Monomeric 1 author_defined_assembly 1 
? Monomeric 1 author_defined_assembly 2 
PISA Dimeric 2 software_defined_assembly 3 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,C,D,E,F,G,H,I,P 1 1 
B,J,K,L,M,N,O,Q 2 1 
A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q 3 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 2 C N N 
? 2 D N N 
? 2 E N N 
? 2 F N N 
? 2 J N N 
? 2 K N N 
? 2 L N N 
? 2 M N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 A SG CYS 329 A CYS 313 1_555 A SG CYS 439 A CYS 423 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? 
disulf ? disulf2 A SG CYS 418 A CYS 402 1_555 A SG CYS 435 A CYS 419 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? 
disulf ? disulf3 A SG CYS 481 A CYS 465 1_555 A SG CYS 494 A CYS 478 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? 
disulf ? disulf4 B SG CYS 329 B CYS 313 1_555 B SG CYS 439 B CYS 423 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? 
disulf ? disulf5 B SG CYS 418 B CYS 402 1_555 B SG CYS 435 B CYS 419 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? 
disulf ? disulf6 B SG CYS 481 B CYS 465 1_555 B SG CYS 494 B CYS 478 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.045 ? 
metalc ? metalc1 A OE1 GLU 145 A GLU 129 1_555 D CA CA . A CA 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.068 ? 
metalc ? metalc2 A O ASN 146 A ASN 130 1_555 D CA CA . A CA 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.362 ? 
metalc ? metalc3 A O THR 149 A THR 133 1_555 D CA CA . A CA 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.984 ? 
metalc ? metalc4 A OG1 THR 149 A THR 133 1_555 D CA CA . A CA 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.135 ? 
metalc ? metalc5 A O PRO 151 A PRO 135 1_555 D CA CA . A CA 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.648 ? 
metalc ? metalc6 A O GLY 206 A GLY 190 1_555 D CA CA . A CA 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.904 ? 
metalc ? metalc7 A OD2 ASP 297 A ASP 281 1_555 C CA CA . A CA 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.234 ? 
metalc ? metalc8 A OD1 ASP 341 A ASP 325 1_555 C CA CA . A CA 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.523 ? 
metalc ? metalc9 A OD2 ASP 341 A ASP 325 1_555 C CA CA . A CA 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.607 ? 
metalc ? metalc10 A OE2 GLU 352 A GLU 336 1_555 E CA CA . A CA 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.484 ? 
metalc ? metalc11 A OE1 GLU 352 A GLU 336 1_555 F CA CA . A CA 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.372 ? 
metalc ? metalc12 A O ARG 356 A ARG 340 1_555 F CA CA . A CA 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.312 ? 
metalc ? metalc13 A O VAL 359 A VAL 343 1_555 F CA CA . A CA 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.805 ? 
metalc ? metalc14 A OD1 ASP 360 A ASP 344 1_555 E CA CA . A CA 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.485 ? 
metalc ? metalc15 A OD1 ASP 361 A ASP 345 1_555 F CA CA . A CA 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.145 ? 
metalc ? metalc16 A OD1 ASP 362 A ASP 346 1_555 E CA CA . A CA 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.517 ? 
metalc ? metalc17 A OD1 ASN 364 A ASN 348 1_555 E CA CA . A CA 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.252 ? 
metalc ? metalc18 A O VAL 366 A VAL 350 1_555 E CA CA . A CA 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.071 ? 
metalc ? metalc19 A OD1 ASP 368 A ASP 352 1_555 F CA CA . A CA 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.373 ? 
metalc ? metalc20 A OD1 ASP 369 A ASP 353 1_555 E CA CA . A CA 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.441 ? 
metalc ? metalc21 A O VAL 399 A VAL 383 1_555 C CA CA . A CA 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.117 ? 
metalc ? metalc22 A OD1 ASN 402 A ASN 386 1_555 C CA CA . A CA 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.403 ? 
metalc ? metalc23 A O ILE 404 A ILE 388 1_555 C CA CA . A CA 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.447 ? 
metalc ? metalc24 A O ILE 406 A ILE 390 1_555 C CA CA . A CA 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.206 ? 
metalc ? metalc25 B OE2 GLU 145 B GLU 129 1_555 K CA CA . B CA 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.931 ? 
metalc ? metalc26 B O ASN 146 B ASN 130 1_555 K CA CA . B CA 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.437 ? 
metalc ? metalc27 B O THR 149 B THR 133 1_555 K CA CA . B CA 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.083 ? 
metalc ? metalc28 B OG1 THR 149 B THR 133 1_555 K CA CA . B CA 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.166 ? 
metalc ? metalc29 B O PRO 151 B PRO 135 1_555 K CA CA . B CA 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.652 ? 
metalc ? metalc30 B O GLY 206 B GLY 190 1_555 K CA CA . B CA 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.779 ? 
metalc ? metalc31 B OD2 ASP 297 B ASP 281 1_555 J CA CA . B CA 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.235 ? 
metalc ? metalc32 B OD1 ASP 341 B ASP 325 1_555 J CA CA . B CA 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.297 ? 
metalc ? metalc33 B OD2 ASP 341 B ASP 325 1_555 J CA CA . B CA 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.838 ? 
metalc ? metalc34 B OE2 GLU 352 B GLU 336 1_555 L CA CA . B CA 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.261 ? 
metalc ? metalc35 B OE1 GLU 352 B GLU 336 1_555 M CA CA . B CA 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.543 ? 
metalc ? metalc36 B O ARG 356 B ARG 340 1_555 M CA CA . B CA 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.398 ? 
metalc ? metalc37 B O VAL 359 B VAL 343 1_555 M CA CA . B CA 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.33 ? 
metalc ? metalc38 B OD1 ASP 360 B ASP 344 1_555 L CA CA . B CA 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.196 ? 
metalc ? metalc39 B OD1 ASP 361 B ASP 345 1_555 M CA CA . B CA 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.25 ? 
metalc ? metalc40 B OD1 ASP 362 B ASP 346 1_555 L CA CA . B CA 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.478 ? 
metalc ? metalc41 B OD1 ASN 364 B ASN 348 1_555 L CA CA . B CA 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.142 ? 
metalc ? metalc42 B O VAL 366 B VAL 350 1_555 L CA CA . B CA 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.157 ? 
metalc ? metalc43 B OD1 ASP 368 B ASP 352 1_555 M CA CA . B CA 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.346 ? 
metalc ? metalc44 B OD1 ASP 369 B ASP 353 1_555 L CA CA . B CA 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.281 ? 
metalc ? metalc45 B O VAL 399 B VAL 383 1_555 J CA CA . B CA 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.277 ? 
metalc ? metalc46 B OD1 ASN 402 B ASN 386 1_555 J CA CA . B CA 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.128 ? 
metalc ? metalc47 B O ILE 404 B ILE 388 1_555 J CA CA . B CA 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.291 ? 
metalc ? metalc48 B O ILE 406 B ILE 390 1_555 J CA CA . B CA 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.552 ? 
metalc ? metalc49 M CA CA . B CA 804 1_555 Q O HOH . B HOH 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.14 ? 
#
_chem_comp.formula           'Ca 2' 
_chem_comp.formula_weight    40.078 
_chem_comp.id                CA 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'CALCIUM ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     4TR2 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.010526 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.010526 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.003475 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
C 2 CA A 1 801 801 CA CA . 
D 2 CA A 1 802 802 CA CA . 
E 2 CA A 1 803 803 CA CA . 
F 2 CA A 1 804 804 CA CA . 
G 3 PO4 A 1 805 811 PO4 PO4 . 
H 3 PO4 A 1 806 812 PO4 PO4 . 
I 3 PO4 A 1 807 813 PO4 PO4 . 
J 2 CA B 1 801 801 CA CA . 
K 2 CA B 1 802 802 CA CA . 
L 2 CA B 1 803 803 CA CA . 
M 2 CA B 1 804 804 CA CA . 
N 3 PO4 B 1 805 811 PO4 PO4 . 
O 3 PO4 B 1 806 812 PO4 PO4 . 
P 4 HOH A 1 901 10 HOH HOH . 
P 4 HOH A 2 902 8 HOH HOH . 
P 4 HOH A 3 903 7 HOH HOH . 
P 4 HOH A 4 904 12 HOH HOH . 
P 4 HOH A 5 905 14 HOH HOH . 
P 4 HOH A 6 906 11 HOH HOH . 
P 4 HOH A 7 907 9 HOH HOH . 
Q 4 HOH B 1 901 2 HOH HOH . 
Q 4 HOH B 2 902 13 HOH HOH . 
Q 4 HOH B 3 903 3 HOH HOH . 
Q 4 HOH B 4 904 5 HOH HOH . 
Q 4 HOH B 5 905 4 HOH HOH . 
Q 4 HOH B 6 906 6 HOH HOH . 
Q 4 HOH B 7 907 1 HOH HOH . 
Q 4 HOH B 8 908 15 HOH HOH . 
#
_atom_site.group_PDB             HETATM 
_atom_site.id                    1 
_atom_site.type_symbol           CA 
_atom_site.label_atom_id         CA 
_atom_site.label_comp_id         CA 
_atom_site.label_seq_id          . 
_atom_site.label_alt_id          . 
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code     . 
_atom_site.label_asym_id         J 
_atom_site.label_entity_id       2 
_atom_site.Cartn_x               9.119 
_atom_site.Cartn_y               -78.737 
_atom_site.Cartn_z               85.876 
_atom_site.occupancy             1 
_atom_site.B_iso_or_equiv        69.05 
_atom_site.pdbx_formal_charge    2 
_atom_site.auth_atom_id          CA 
_atom_site.auth_comp_id          CA 
_atom_site.auth_seq_id           801 
_atom_site.auth_asym_id          B 
_atom_site.pdbx_PDB_model_num    1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              20 
_model_server_stats.parse_time_ms           12 
_model_server_stats.create_model_time_ms    8 
_model_server_stats.query_time_ms           267 
_model_server_stats.encode_time_ms          2 
_model_server_stats.element_count           1 
#