data_4TR2 # _model_server_result.job_id f7nGijCq80ZmouaN4Z5nLA _model_server_result.datetime_utc '2024-11-04 22:50:54' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 4tr2 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"G","auth_seq_id":805}' # _entry.id 4TR2 # _exptl.entry_id 4TR2 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 94.971 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'PHOSPHATE ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 5 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 4TR2 _cell.length_a 95 _cell.length_b 95 _cell.length_c 287.76 _cell.Z_PDB 16 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 4TR2 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 96 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 43 21 2' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id ? Monomeric 1 author_defined_assembly 1 ? Monomeric 1 author_defined_assembly 2 PISA Dimeric 2 software_defined_assembly 3 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,C,D,E,F,G,H,I,P 1 1 B,J,K,L,M,N,O,Q 2 1 A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q 3 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 3 G N N ? 3 H N N ? 3 I N N ? 3 N N N ? 3 O N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 329 A CYS 313 1_555 A SG CYS 439 A CYS 423 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 418 A CYS 402 1_555 A SG CYS 435 A CYS 419 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 481 A CYS 465 1_555 A SG CYS 494 A CYS 478 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf4 B SG CYS 329 B CYS 313 1_555 B SG CYS 439 B CYS 423 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? disulf ? disulf5 B SG CYS 418 B CYS 402 1_555 B SG CYS 435 B CYS 419 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf6 B SG CYS 481 B CYS 465 1_555 B SG CYS 494 B CYS 478 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.045 ? metalc ? metalc1 A OE1 GLU 145 A GLU 129 1_555 D CA CA . A CA 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.068 ? metalc ? metalc2 A O ASN 146 A ASN 130 1_555 D CA CA . A CA 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.362 ? metalc ? metalc3 A O THR 149 A THR 133 1_555 D CA CA . A CA 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.984 ? metalc ? metalc4 A OG1 THR 149 A THR 133 1_555 D CA CA . A CA 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.135 ? metalc ? metalc5 A O PRO 151 A PRO 135 1_555 D CA CA . A CA 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.648 ? metalc ? metalc6 A O GLY 206 A GLY 190 1_555 D CA CA . A CA 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.904 ? metalc ? metalc7 A OD2 ASP 297 A ASP 281 1_555 C CA CA . A CA 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.234 ? metalc ? metalc8 A OD1 ASP 341 A ASP 325 1_555 C CA CA . A CA 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.523 ? metalc ? metalc9 A OD2 ASP 341 A ASP 325 1_555 C CA CA . A CA 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.607 ? metalc ? metalc10 A OE2 GLU 352 A GLU 336 1_555 E CA CA . A CA 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.484 ? metalc ? metalc11 A OE1 GLU 352 A GLU 336 1_555 F CA CA . A CA 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.372 ? metalc ? metalc12 A O ARG 356 A ARG 340 1_555 F CA CA . A CA 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.312 ? metalc ? metalc13 A O VAL 359 A VAL 343 1_555 F CA CA . A CA 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.805 ? metalc ? metalc14 A OD1 ASP 360 A ASP 344 1_555 E CA CA . A CA 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.485 ? metalc ? metalc15 A OD1 ASP 361 A ASP 345 1_555 F CA CA . A CA 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.145 ? metalc ? metalc16 A OD1 ASP 362 A ASP 346 1_555 E CA CA . A CA 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.517 ? metalc ? metalc17 A OD1 ASN 364 A ASN 348 1_555 E CA CA . A CA 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.252 ? metalc ? metalc18 A O VAL 366 A VAL 350 1_555 E CA CA . A CA 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.071 ? metalc ? metalc19 A OD1 ASP 368 A ASP 352 1_555 F CA CA . A CA 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.373 ? metalc ? metalc20 A OD1 ASP 369 A ASP 353 1_555 E CA CA . A CA 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.441 ? metalc ? metalc21 A O VAL 399 A VAL 383 1_555 C CA CA . A CA 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.117 ? metalc ? metalc22 A OD1 ASN 402 A ASN 386 1_555 C CA CA . A CA 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.403 ? metalc ? metalc23 A O ILE 404 A ILE 388 1_555 C CA CA . A CA 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.447 ? metalc ? metalc24 A O ILE 406 A ILE 390 1_555 C CA CA . A CA 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.206 ? metalc ? metalc25 B OE2 GLU 145 B GLU 129 1_555 K CA CA . B CA 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.931 ? metalc ? metalc26 B O ASN 146 B ASN 130 1_555 K CA CA . B CA 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.437 ? metalc ? metalc27 B O THR 149 B THR 133 1_555 K CA CA . B CA 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.083 ? metalc ? metalc28 B OG1 THR 149 B THR 133 1_555 K CA CA . B CA 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.166 ? metalc ? metalc29 B O PRO 151 B PRO 135 1_555 K CA CA . B CA 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.652 ? metalc ? metalc30 B O GLY 206 B GLY 190 1_555 K CA CA . B CA 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.779 ? metalc ? metalc31 B OD2 ASP 297 B ASP 281 1_555 J CA CA . B CA 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.235 ? metalc ? metalc32 B OD1 ASP 341 B ASP 325 1_555 J CA CA . B CA 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.297 ? metalc ? metalc33 B OD2 ASP 341 B ASP 325 1_555 J CA CA . B CA 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.838 ? metalc ? metalc34 B OE2 GLU 352 B GLU 336 1_555 L CA CA . B CA 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.261 ? metalc ? metalc35 B OE1 GLU 352 B GLU 336 1_555 M CA CA . B CA 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.543 ? metalc ? metalc36 B O ARG 356 B ARG 340 1_555 M CA CA . B CA 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.398 ? metalc ? metalc37 B O VAL 359 B VAL 343 1_555 M CA CA . B CA 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.33 ? metalc ? metalc38 B OD1 ASP 360 B ASP 344 1_555 L CA CA . B CA 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.196 ? metalc ? metalc39 B OD1 ASP 361 B ASP 345 1_555 M CA CA . B CA 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.25 ? metalc ? metalc40 B OD1 ASP 362 B ASP 346 1_555 L CA CA . B CA 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.478 ? metalc ? metalc41 B OD1 ASN 364 B ASN 348 1_555 L CA CA . B CA 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.142 ? metalc ? metalc42 B O VAL 366 B VAL 350 1_555 L CA CA . B CA 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.157 ? metalc ? metalc43 B OD1 ASP 368 B ASP 352 1_555 M CA CA . B CA 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.346 ? metalc ? metalc44 B OD1 ASP 369 B ASP 353 1_555 L CA CA . B CA 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.281 ? metalc ? metalc45 B O VAL 399 B VAL 383 1_555 J CA CA . B CA 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.277 ? metalc ? metalc46 B OD1 ASN 402 B ASN 386 1_555 J CA CA . B CA 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.128 ? metalc ? metalc47 B O ILE 404 B ILE 388 1_555 J CA CA . B CA 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.291 ? metalc ? metalc48 B O ILE 406 B ILE 390 1_555 J CA CA . B CA 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.552 ? metalc ? metalc49 M CA CA . B CA 804 1_555 Q O HOH . B HOH 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.14 ? # _chem_comp.formula 'O4 P -3' _chem_comp.formula_weight 94.971 _chem_comp.id PO4 _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'PHOSPHATE ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag P O1 PO4 doub 260 n n P O2 PO4 sing 261 n n P O3 PO4 sing 262 n n P O4 PO4 sing 263 n n # _atom_sites.entry_id 4TR2 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.010526 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.010526 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.003475 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 2 CA A 1 801 801 CA CA . D 2 CA A 1 802 802 CA CA . E 2 CA A 1 803 803 CA CA . F 2 CA A 1 804 804 CA CA . G 3 PO4 A 1 805 811 PO4 PO4 . H 3 PO4 A 1 806 812 PO4 PO4 . I 3 PO4 A 1 807 813 PO4 PO4 . J 2 CA B 1 801 801 CA CA . K 2 CA B 1 802 802 CA CA . L 2 CA B 1 803 803 CA CA . M 2 CA B 1 804 804 CA CA . N 3 PO4 B 1 805 811 PO4 PO4 . O 3 PO4 B 1 806 812 PO4 PO4 . P 4 HOH A 1 901 10 HOH HOH . P 4 HOH A 2 902 8 HOH HOH . P 4 HOH A 3 903 7 HOH HOH . P 4 HOH A 4 904 12 HOH HOH . P 4 HOH A 5 905 14 HOH HOH . P 4 HOH A 6 906 11 HOH HOH . P 4 HOH A 7 907 9 HOH HOH . Q 4 HOH B 1 901 2 HOH HOH . Q 4 HOH B 2 902 13 HOH HOH . Q 4 HOH B 3 903 3 HOH HOH . Q 4 HOH B 4 904 5 HOH HOH . Q 4 HOH B 5 905 4 HOH HOH . Q 4 HOH B 6 906 6 HOH HOH . Q 4 HOH B 7 907 1 HOH HOH . Q 4 HOH B 8 908 15 HOH HOH . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 P P PO4 . . . G 3 -8.504 -36.598 47.587 1 101.73 ? P PO4 805 A 1 HETATM 2 O O1 PO4 . . . G 3 -7.7 -36.115 46.335 1 100.81 ? O1 PO4 805 A 1 HETATM 3 O O2 PO4 . . . G 3 -10.064 -36.733 47.26 1 103.65 ? O2 PO4 805 A 1 HETATM 4 O O3 PO4 . . . G 3 -7.933 -38.031 48.002 1 101.07 ? O3 PO4 805 A 1 HETATM 5 O O4 PO4 . . . G 3 -8.348 -35.571 48.802 1 100.42 ? O4 PO4 805 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 23 _model_server_stats.parse_time_ms 12 _model_server_stats.create_model_time_ms 25 _model_server_stats.query_time_ms 302 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 5 #