data_4TSF # _model_server_result.job_id ooAnkt6PsJ3zogiThvGi4w _model_server_result.datetime_utc '2024-11-05 06:50:06' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 4tsf # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"O","auth_seq_id":601}' # _entry.id 4TSF # _exptl.entry_id 4TSF _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 24.305 _entity.id 6 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MAGNESIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 5 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 4TSF _cell.length_a 108.015 _cell.length_b 154.42 _cell.length_c 269.465 _cell.Z_PDB 12 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 4TSF _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details Nonameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 9 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 6 K N N ? 6 M N N ? 6 O N N ? 6 Q N N ? 6 S N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OG1 THR 176 A THR 176 1_555 K MG MG . A MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.18 ? metalc ? metalc2 J O2G ATP . A ATP 600 1_555 K MG MG . A MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.147 ? metalc ? metalc3 J O2B ATP . A ATP 600 1_555 K MG MG . A MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.163 ? metalc ? metalc4 K MG MG . A MG 601 1_555 T O HOH . A HOH 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.178 ? metalc ? metalc5 K MG MG . A MG 601 1_555 T O HOH . A HOH 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.182 ? metalc ? metalc6 K MG MG . A MG 601 1_555 T O HOH . A HOH 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.18 ? metalc ? metalc7 B OG1 THR 176 B THR 176 1_555 M MG MG . B MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.18 ? metalc ? metalc8 L O2G ATP . B ATP 600 1_555 M MG MG . B MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.171 ? metalc ? metalc9 L O3G ATP . B ATP 600 1_555 M MG MG . B MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.927 ? metalc ? metalc10 L O2B ATP . B ATP 600 1_555 M MG MG . B MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.129 ? metalc ? metalc11 M MG MG . B MG 601 1_555 U O HOH . B HOH 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.18 ? metalc ? metalc12 M MG MG . B MG 601 1_555 U O HOH . B HOH 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.183 ? metalc ? metalc13 M MG MG . B MG 601 1_555 U O HOH . B HOH 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.18 ? metalc ? metalc14 C OG1 THR 176 C THR 176 1_555 O MG MG . C MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.179 ? metalc ? metalc15 N O2G ATP . C ATP 600 1_555 O MG MG . C MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.19 ? metalc ? metalc16 N O2B ATP . C ATP 600 1_555 O MG MG . C MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.168 ? metalc ? metalc17 O MG MG . C MG 601 1_555 V O HOH . C HOH 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.179 ? metalc ? metalc18 O MG MG . C MG 601 1_555 V O HOH . C HOH 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.183 ? metalc ? metalc19 O MG MG . C MG 601 1_555 V O HOH . C HOH 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.182 ? metalc ? metalc20 D OG1 THR 165 D THR 163 1_555 Q MG MG . D MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.18 ? metalc ? metalc21 P O2B ADP . D ADP 600 1_555 Q MG MG . D MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.181 ? metalc ? metalc22 Q MG MG . D MG 601 1_555 W O HOH . D HOH 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.179 ? metalc ? metalc23 Q MG MG . D MG 601 1_555 W O HOH . D HOH 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.181 ? metalc ? metalc24 Q MG MG . D MG 601 1_555 W O HOH . D HOH 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.182 ? metalc ? metalc25 Q MG MG . D MG 601 1_555 W O HOH . D HOH 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.178 ? metalc ? metalc26 F OG1 THR 165 F THR 163 1_555 S MG MG . F MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.179 ? metalc ? metalc27 R O2B ADP . F ADP 600 1_555 S MG MG . F MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.214 ? metalc ? metalc28 R O3B ADP . F ADP 600 1_555 S MG MG . F MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.996 ? metalc ? metalc29 S MG MG . F MG 601 1_555 X O HOH . F HOH 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.179 ? metalc ? metalc30 S MG MG . F MG 601 1_555 X O HOH . F HOH 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.181 ? metalc ? metalc31 S MG MG . F MG 601 1_555 X O HOH . F HOH 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.18 ? metalc ? metalc32 S MG MG . F MG 601 1_555 X O HOH . F HOH 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.181 ? # _chem_comp.formula 'Mg 2' _chem_comp.formula_weight 24.305 _chem_comp.id MG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MAGNESIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 4TSF _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.009258 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.006476 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.003711 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code J 5 ATP A 1 600 600 ATP ATP . K 6 MG A 1 601 601 MG MO6 . L 5 ATP B 1 600 600 ATP ATP . M 6 MG B 1 601 601 MG MO6 . N 5 ATP C 1 600 600 ATP ATP . O 6 MG C 1 601 601 MG MO6 . P 7 ADP D 1 600 600 ADP ADP . Q 6 MG D 1 601 601 MG MO6 . R 7 ADP F 1 600 600 ADP ADP . S 6 MG F 1 601 601 MG MO6 . T 8 HOH A 1 701 601 HOH MO6 . T 8 HOH A 2 702 601 HOH MO6 . T 8 HOH A 3 703 601 HOH MO6 . U 8 HOH B 1 701 601 HOH MO6 . U 8 HOH B 2 702 601 HOH MO6 . U 8 HOH B 3 703 601 HOH MO6 . V 8 HOH C 1 701 601 HOH MO6 . V 8 HOH C 2 702 601 HOH MO6 . V 8 HOH C 3 703 601 HOH MO6 . W 8 HOH D 1 701 601 HOH MO6 . W 8 HOH D 2 702 601 HOH MO6 . W 8 HOH D 3 703 601 HOH MO6 . W 8 HOH D 4 704 601 HOH MO6 . X 8 HOH F 1 701 601 HOH MO6 . X 8 HOH F 2 702 601 HOH MO6 . X 8 HOH F 3 703 601 HOH MO6 . X 8 HOH F 4 704 601 HOH MO6 . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MG _atom_site.label_atom_id MG _atom_site.label_comp_id MG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id O _atom_site.label_entity_id 6 _atom_site.Cartn_x 42.146 _atom_site.Cartn_y 19.036 _atom_site.Cartn_z -33.489 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 72.78 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MG _atom_site.auth_comp_id MG _atom_site.auth_seq_id 601 _atom_site.auth_asym_id C _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 18 _model_server_stats.parse_time_ms 11 _model_server_stats.create_model_time_ms 31 _model_server_stats.query_time_ms 280 _model_server_stats.encode_time_ms 9 _model_server_stats.element_count 1 #