data_4UMO
#
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_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-27 06:08:54' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
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_model_server_result.entry_id          4umo 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"M","auth_seq_id":202}' 
#
_entry.id    4UMO 
#
_exptl.entry_id    4UMO 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              40.078 
_entity.id                          5 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'CALCIUM ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    4 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
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_cell.angle_gamma         120 
_cell.entry_id            4UMO 
_cell.length_a            151.76 
_cell.length_b            151.76 
_cell.length_c            56.091 
_cell.Z_PDB               12 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 4UMO 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        170 
_symmetry.space_group_name_Hall    . 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 65' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    tetrameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      4 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
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_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 5 I N N 
? 5 J N N 
? 5 L N N 
? 5 M N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 C OD1 ASP 21 C ASP 20 1_555 I CA CA . C CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.363 ? 
metalc ? metalc2 C OD2 ASP 23 C ASP 22 1_555 I CA CA . C CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.362 ? 
metalc ? metalc3 C OD1 ASP 23 C ASP 22 1_555 I CA CA . C CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.364 ? 
metalc ? metalc4 C OD2 ASP 25 C ASP 24 1_555 I CA CA . C CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.366 ? 
metalc ? metalc5 C OD1 ASP 25 C ASP 24 1_555 I CA CA . C CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.352 ? 
metalc ? metalc6 C O THR 27 C THR 26 1_555 I CA CA . C CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.376 ? 
metalc ? metalc7 C OE1 GLU 32 C GLU 31 1_555 I CA CA . C CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.361 ? 
metalc ? metalc8 C OE2 GLU 32 C GLU 31 1_555 I CA CA . C CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.36 ? 
metalc ? metalc9 C OD1 ASP 57 C ASP 56 1_555 J CA CA . C CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.359 ? 
metalc ? metalc10 C OD2 ASP 59 C ASP 58 1_555 J CA CA . C CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.36 ? 
metalc ? metalc11 C OD1 ASP 59 C ASP 58 1_555 J CA CA . C CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.361 ? 
metalc ? metalc12 C OD1 ASN 61 C ASN 60 1_555 J CA CA . C CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.379 ? 
metalc ? metalc13 C O THR 63 C THR 62 1_555 J CA CA . C CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.374 ? 
metalc ? metalc14 C OE2 GLU 68 C GLU 67 1_555 J CA CA . C CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.361 ? 
metalc ? metalc15 C OE1 GLU 68 C GLU 67 1_555 J CA CA . C CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.359 ? 
metalc ? metalc16 D OD1 ASP 21 D ASP 20 1_555 L CA CA . D CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.36 ? 
metalc ? metalc17 D OD2 ASP 23 D ASP 22 1_555 L CA CA . D CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.362 ? 
metalc ? metalc18 D OD1 ASP 23 D ASP 22 1_555 L CA CA . D CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.358 ? 
metalc ? metalc19 D OD1 ASP 25 D ASP 24 1_555 L CA CA . D CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.363 ? 
metalc ? metalc20 D O THR 27 D THR 26 1_555 L CA CA . D CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.375 ? 
metalc ? metalc21 D OE1 GLU 32 D GLU 31 1_555 L CA CA . D CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.362 ? 
metalc ? metalc22 D OE2 GLU 32 D GLU 31 1_555 L CA CA . D CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.36 ? 
metalc ? metalc23 D OD1 ASP 57 D ASP 56 1_555 M CA CA . D CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.359 ? 
metalc ? metalc24 D OD2 ASP 59 D ASP 58 1_555 M CA CA . D CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.36 ? 
metalc ? metalc25 D OD1 ASP 59 D ASP 58 1_555 M CA CA . D CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.362 ? 
metalc ? metalc26 D OD1 ASN 61 D ASN 60 1_555 M CA CA . D CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.381 ? 
metalc ? metalc27 D O THR 63 D THR 62 1_555 M CA CA . D CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.375 ? 
metalc ? metalc28 D OE1 GLU 68 D GLU 67 1_555 M CA CA . D CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.36 ? 
metalc ? metalc29 D OE2 GLU 68 D GLU 67 1_555 M CA CA . D CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.362 ? 
#
_chem_comp.formula           'Ca 2' 
_chem_comp.formula_weight    40.078 
_chem_comp.id                CA 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'CALCIUM ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     4UMO 
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_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0.003804 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
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_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.007609 
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_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.017828 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
E 3 K A 1 301 301 K K . 
F 3 K A 1 302 302 K K . 
G 4 SCN A 1 1536 1536 SCN SCN . 
H 3 K B 1 303 303 K K . 
I 5 CA C 1 201 201 CA CA . 
J 5 CA C 1 202 202 CA CA . 
K 3 K C 1 305 305 K K . 
L 5 CA D 1 201 201 CA CA . 
M 5 CA D 1 202 202 CA CA . 
N 6 HOH D 1 2001 2001 HOH HOH . 
#
_atom_site.group_PDB             HETATM 
_atom_site.id                    1 
_atom_site.type_symbol           CA 
_atom_site.label_atom_id         CA 
_atom_site.label_comp_id         CA 
_atom_site.label_seq_id          . 
_atom_site.label_alt_id          . 
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code     . 
_atom_site.label_asym_id         M 
_atom_site.label_entity_id       5 
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_atom_site.Cartn_y               23.633 
_atom_site.Cartn_z               49.012 
_atom_site.occupancy             0.63 
_atom_site.B_iso_or_equiv        59.54 
_atom_site.pdbx_formal_charge    ? 
_atom_site.auth_atom_id          CA 
_atom_site.auth_comp_id          CA 
_atom_site.auth_seq_id           202 
_atom_site.auth_asym_id          D 
_atom_site.pdbx_PDB_model_num    1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              16 
_model_server_stats.parse_time_ms           11 
_model_server_stats.create_model_time_ms    10 
_model_server_stats.query_time_ms           260 
_model_server_stats.encode_time_ms          5 
_model_server_stats.element_count           1 
#