data_4UMO # _model_server_result.job_id j6HEj1XTzNpvRPlSQuH5Uw _model_server_result.datetime_utc '2024-12-01 20:17:35' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 4umo # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"K","auth_seq_id":305}' # _entry.id 4UMO # _exptl.entry_id 4UMO _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 39.098 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'POTASSIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 4 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 120 _cell.entry_id 4UMO _cell.length_a 151.76 _cell.length_b 151.76 _cell.length_c 56.091 _cell.Z_PDB 12 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 4UMO _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 170 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 65' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tetrameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 4 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 3 E N N ? 3 F N N ? 3 H N N ? 3 K N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 C OD1 ASP 21 C ASP 20 1_555 I CA CA . C CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.363 ? metalc ? metalc2 C OD2 ASP 23 C ASP 22 1_555 I CA CA . C CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.362 ? metalc ? metalc3 C OD1 ASP 23 C ASP 22 1_555 I CA CA . C CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.364 ? metalc ? metalc4 C OD2 ASP 25 C ASP 24 1_555 I CA CA . C CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.366 ? metalc ? metalc5 C OD1 ASP 25 C ASP 24 1_555 I CA CA . C CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.352 ? metalc ? metalc6 C O THR 27 C THR 26 1_555 I CA CA . C CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.376 ? metalc ? metalc7 C OE1 GLU 32 C GLU 31 1_555 I CA CA . C CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.361 ? metalc ? metalc8 C OE2 GLU 32 C GLU 31 1_555 I CA CA . C CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.36 ? metalc ? metalc9 C OD1 ASP 57 C ASP 56 1_555 J CA CA . C CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.359 ? metalc ? metalc10 C OD2 ASP 59 C ASP 58 1_555 J CA CA . C CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.36 ? metalc ? metalc11 C OD1 ASP 59 C ASP 58 1_555 J CA CA . C CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.361 ? metalc ? metalc12 C OD1 ASN 61 C ASN 60 1_555 J CA CA . C CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.379 ? metalc ? metalc13 C O THR 63 C THR 62 1_555 J CA CA . C CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.374 ? metalc ? metalc14 C OE2 GLU 68 C GLU 67 1_555 J CA CA . C CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.361 ? metalc ? metalc15 C OE1 GLU 68 C GLU 67 1_555 J CA CA . C CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.359 ? metalc ? metalc16 D OD1 ASP 21 D ASP 20 1_555 L CA CA . D CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.36 ? metalc ? metalc17 D OD2 ASP 23 D ASP 22 1_555 L CA CA . D CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.362 ? metalc ? metalc18 D OD1 ASP 23 D ASP 22 1_555 L CA CA . D CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.358 ? metalc ? metalc19 D OD1 ASP 25 D ASP 24 1_555 L CA CA . D CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.363 ? metalc ? metalc20 D O THR 27 D THR 26 1_555 L CA CA . D CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.375 ? metalc ? metalc21 D OE1 GLU 32 D GLU 31 1_555 L CA CA . D CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.362 ? metalc ? metalc22 D OE2 GLU 32 D GLU 31 1_555 L CA CA . D CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.36 ? metalc ? metalc23 D OD1 ASP 57 D ASP 56 1_555 M CA CA . D CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.359 ? metalc ? metalc24 D OD2 ASP 59 D ASP 58 1_555 M CA CA . D CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.36 ? metalc ? metalc25 D OD1 ASP 59 D ASP 58 1_555 M CA CA . D CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.362 ? metalc ? metalc26 D OD1 ASN 61 D ASN 60 1_555 M CA CA . D CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.381 ? metalc ? metalc27 D O THR 63 D THR 62 1_555 M CA CA . D CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.375 ? metalc ? metalc28 D OE1 GLU 68 D GLU 67 1_555 M CA CA . D CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.36 ? metalc ? metalc29 D OE2 GLU 68 D GLU 67 1_555 M CA CA . D CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.362 ? # _chem_comp.formula 'K 1' _chem_comp.formula_weight 39.098 _chem_comp.id K _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'POTASSIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 4UMO _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.006589 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.003804 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.007609 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.017828 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code E 3 K A 1 301 301 K K . F 3 K A 1 302 302 K K . G 4 SCN A 1 1536 1536 SCN SCN . H 3 K B 1 303 303 K K . I 5 CA C 1 201 201 CA CA . J 5 CA C 1 202 202 CA CA . K 3 K C 1 305 305 K K . L 5 CA D 1 201 201 CA CA . M 5 CA D 1 202 202 CA CA . N 6 HOH D 1 2001 2001 HOH HOH . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol K _atom_site.label_atom_id K _atom_site.label_comp_id K _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id K _atom_site.label_entity_id 3 _atom_site.Cartn_x 21.331 _atom_site.Cartn_y 39.361 _atom_site.Cartn_z 19.267 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 79.37 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id K _atom_site.auth_comp_id K _atom_site.auth_seq_id 305 _atom_site.auth_asym_id C _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 52 _model_server_stats.parse_time_ms 9 _model_server_stats.create_model_time_ms 11 _model_server_stats.query_time_ms 295 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 1 #