data_4UQ8
#
_model_server_result.job_id            39jkCt-_SZC2VafaL8iNEw 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-10-15 09:15:47' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          4uq8 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"BB","auth_seq_id":802}' 
#
_entry.id    4UQ8 
#
_exptl.entry_id    4UQ8 
_exptl.method      'ELECTRON MICROSCOPY' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              351.64 
_entity.id                          44 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'IRON/SULFUR CLUSTER' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    6 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            4UQ8 
_cell.length_a            1 
_cell.length_b            1 
_cell.length_c            1 
_cell.Z_PDB               1 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 4UQ8 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        1 
_symmetry.space_group_name_Hall    . 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        PQS 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    49-meric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      49 
_pdbx_struct_assembly.details               software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 44 XA N N 
? 44 ZA N N 
? 44 AB N N 
? 44 BB N N 
? 44 DB N N 
? 44 EB N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 B SG CYS 28 B CYS 54 1_555 XA FE3 SF4 . B SF4 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.308 ? 
metalc ? metalc2 B SG CYS 29 B CYS 55 1_555 XA FE2 SF4 . B SF4 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.312 ? 
metalc ? metalc3 B SG CYS 93 B CYS 119 1_555 XA FE1 SF4 . B SF4 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.899 ? 
metalc ? metalc4 B SG CYS 123 B CYS 149 1_555 XA FE4 SF4 . B SF4 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.27 ? 
metalc ? metalc5 E SG CYS 84 E CYS 103 1_555 YA FE1 FES . E FES 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.313 ? 
metalc ? metalc6 E SG CYS 89 E CYS 108 1_555 YA FE1 FES . E FES 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.349 ? 
metalc ? metalc7 E SG CYS 125 E CYS 144 1_555 YA FE2 FES . E FES 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.323 ? 
metalc ? metalc8 E SG CYS 129 E CYS 148 1_555 YA FE2 FES . E FES 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.326 ? 
metalc ? metalc9 F SG CYS 329 F CYS 359 1_555 ZA FE4 SF4 . F SF4 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.314 ? 
metalc ? metalc10 F SG CYS 332 F CYS 362 1_555 ZA FE1 SF4 . F SF4 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.311 ? 
metalc ? metalc11 F SG CYS 335 F CYS 365 1_555 ZA FE2 SF4 . F SF4 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.302 ? 
metalc ? metalc12 F SG CYS 375 F CYS 405 1_555 ZA FE3 SF4 . F SF4 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.318 ? 
metalc ? metalc13 G SG CYS 34 G CYS 41 1_555 CB FE1 FES . G FES 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.345 ? 
metalc ? metalc14 G SG CYS 45 G CYS 52 1_555 CB FE1 FES . G FES 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.309 ? 
metalc ? metalc15 G SG CYS 48 G CYS 55 1_555 CB FE2 FES . G FES 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.317 ? 
metalc ? metalc16 G SG CYS 62 G CYS 69 1_555 CB FE2 FES . G FES 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.335 ? 
metalc ? metalc17 G NE2 HIS 94 G HIS 101 1_555 AB FE3 SF4 . G SF4 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.993 ? 
metalc ? metalc18 G SG CYS 98 G CYS 105 1_555 AB FE2 SF4 . G SF4 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.313 ? 
metalc ? metalc19 G SG CYS 101 G CYS 108 1_555 AB FE4 SF4 . G SF4 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.292 ? 
metalc ? metalc20 G SG CYS 107 G CYS 114 1_555 AB FE1 SF4 . G SF4 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.336 ? 
metalc ? metalc21 G SG CYS 147 G CYS 153 1_555 BB FE2 SF4 . G SF4 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.304 ? 
metalc ? metalc22 G SG CYS 150 G CYS 156 1_555 BB FE1 SF4 . G SF4 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.344 ? 
metalc ? metalc23 G SG CYS 153 G CYS 159 1_555 BB FE3 SF4 . G SF4 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.314 ? 
metalc ? metalc24 G SG CYS 197 G CYS 203 1_555 BB FE4 SF4 . G SF4 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.32 ? 
metalc ? metalc25 I SG CYS 63 I CYS 77 1_555 EB FE3 SF4 . I SF4 223 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.309 ? 
metalc ? metalc26 I SG CYS 66 I CYS 80 1_555 EB FE4 SF4 . I SF4 223 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.327 ? 
metalc ? metalc27 I SG CYS 69 I CYS 83 1_555 EB FE2 SF4 . I SF4 223 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.31 ? 
metalc ? metalc28 I SG CYS 73 I CYS 87 1_555 DB FE4 SF4 . I SF4 222 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.307 ? 
metalc ? metalc29 I SG CYS 102 I CYS 116 1_555 DB FE2 SF4 . I SF4 222 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.317 ? 
metalc ? metalc30 I SG CYS 105 I CYS 119 1_555 DB FE1 SF4 . I SF4 222 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.298 ? 
metalc ? metalc31 I SG CYS 108 I CYS 122 1_555 DB FE3 SF4 . I SF4 222 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.319 ? 
metalc ? metalc32 I SG CYS 112 I CYS 126 1_555 EB FE1 SF4 . I SF4 223 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.226 ? 
#
_chem_comp.formula           'Fe4 S4' 
_chem_comp.formula_weight    351.64 
_chem_comp.id                SF4 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'IRON/SULFUR CLUSTER' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
FE1 S2 SF4 sing 51 n n 
FE1 S3 SF4 sing 52 n n 
FE1 S4 SF4 sing 53 n n 
FE2 S1 SF4 sing 54 n n 
FE2 S3 SF4 sing 55 n n 
FE2 S4 SF4 sing 56 n n 
FE3 S1 SF4 sing 57 n n 
FE3 S2 SF4 sing 58 n n 
FE3 S4 SF4 sing 59 n n 
FE4 S1 SF4 sing 60 n n 
FE4 S2 SF4 sing 61 n n 
FE4 S3 SF4 sing 62 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     4UQ8 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    1 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
XA 44 SF4 B 1 201 201 SF4 SF4 . 
YA 45 FES E 1 201 201 FES FES . 
ZA 44 SF4 F 1 508 508 SF4 SF4 . 
AB 44 SF4 G 1 801 801 SF4 SF4 . 
BB 44 SF4 G 1 802 802 SF4 SF4 . 
CB 45 FES G 1 804 804 FES FES . 
DB 44 SF4 I 1 222 222 SF4 SF4 . 
EB 44 SF4 I 1 223 223 SF4 SF4 . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 FE FE1 SF4 . . . BB 44 270.777 204.097 333.44 1 30 ? FE1 SF4 802 G 1 
HETATM 2 FE FE2 SF4 . . . BB 44 269.84 205.211 335.824 1 30 ? FE2 SF4 802 G 1 
HETATM 3 FE FE3 SF4 . . . BB 44 272.394 205.559 335.15 1 30 ? FE3 SF4 802 G 1 
HETATM 4 FE FE4 SF4 . . . BB 44 270.456 206.821 333.789 1 30 ? FE4 SF4 802 G 1 
HETATM 5 S S1 SF4 . . . BB 44 271 207.192 335.984 1 30 ? S1 SF4 802 G 1 
HETATM 6 S S2 SF4 . . . BB 44 272.269 205.743 332.868 1 30 ? S2 SF4 802 G 1 
HETATM 7 S S3 SF4 . . . BB 44 268.783 205.197 333.779 1 30 ? S3 SF4 802 G 1 
HETATM 8 S S4 SF4 . . . BB 44 271.394 203.533 335.569 1 30 ? S4 SF4 802 G 1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              33 
_model_server_stats.parse_time_ms           9 
_model_server_stats.create_model_time_ms    36 
_model_server_stats.query_time_ms           313 
_model_server_stats.encode_time_ms          3 
_model_server_stats.element_count           8 
#