data_4V4O
#
_model_server_result.job_id            SsB4PAXuZpb4UOeECWZcnw 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-10-19 10:37:43' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          4v4o 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"FC","auth_seq_id":701}' 
#
_entry.id    4V4O 
#
_exptl.entry_id    4V4O 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              78.133 
_entity.id                          5 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'DIMETHYL SULFOXIDE' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    14 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         82.88 
_cell.angle_beta          85.35 
_cell.angle_gamma         68.52 
_cell.entry_id            4V4O 
_cell.length_a            140.378 
_cell.length_b            156.424 
_cell.length_c            273.153 
_cell.Z_PDB               28 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 4V4O 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        1 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
? 21-meric 21 author_defined_assembly 1 
? 21-meric 21 author_defined_assembly 2 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB 1 1 
V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,AC,BC,CC,DC,EC,FC 2 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 5 EB N N 
? 5 FB N N 
? 5 GB N N 
? 5 HB N N 
? 5 IB N N 
? 5 JB N N 
? 5 KB N N 
? 5 ZB N N 
? 5 AC N N 
? 5 BC N N 
? 5 CC N N 
? 5 DC N N 
? 5 EC N N 
? 5 FC N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A OD1 ASP 86 A ASP 87 1_555 QA MG MG . A MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.233 ? 
metalc ? metalc2 QA MG MG . A MG 601 1_555 RA O2A ADP . A ADP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.385 ? 
metalc ? metalc3 QA MG MG . A MG 601 1_555 RA O1B ADP . A ADP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.688 ? 
metalc ? metalc4 B OD1 ASP 86 B ASP 87 1_555 SA MG MG . B MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.271 ? 
metalc ? metalc5 SA MG MG . B MG 601 1_555 TA O1B ADP . B ADP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.603 ? 
metalc ? metalc6 SA MG MG . B MG 601 1_555 TA O2A ADP . B ADP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.401 ? 
metalc ? metalc7 C OD1 ASP 86 C ASP 87 1_555 UA MG MG . C MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.344 ? 
metalc ? metalc8 C O SER 150 C SER 151 1_555 UA MG MG . C MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.039 ? 
metalc ? metalc9 UA MG MG . C MG 601 1_555 VA O1B ADP . C ADP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.787 ? 
metalc ? metalc10 UA MG MG . C MG 601 1_555 VA O2A ADP . C ADP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.535 ? 
metalc ? metalc11 D OD1 ASP 86 D ASP 87 1_555 WA MG MG . D MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.371 ? 
metalc ? metalc12 WA MG MG . D MG 601 1_555 XA O2A ADP . D ADP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.483 ? 
metalc ? metalc13 WA MG MG . D MG 601 1_555 XA O1B ADP . D ADP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.639 ? 
metalc ? metalc14 E OD1 ASP 86 E ASP 87 1_555 YA MG MG . E MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.383 ? 
metalc ? metalc15 YA MG MG . E MG 601 1_555 ZA O2A ADP . E ADP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.379 ? 
metalc ? metalc16 YA MG MG . E MG 601 1_555 ZA O1B ADP . E ADP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.626 ? 
metalc ? metalc17 F OD1 ASP 86 F ASP 87 1_555 AB MG MG . F MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.311 ? 
metalc ? metalc18 AB MG MG . F MG 601 1_555 BB O2A ADP . F ADP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.491 ? 
metalc ? metalc19 AB MG MG . F MG 601 1_555 BB O1B ADP . F ADP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.752 ? 
metalc ? metalc20 G OD1 ASP 86 G ASP 87 1_555 CB MG MG . G MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.23 ? 
metalc ? metalc21 CB MG MG . G MG 601 1_555 DB O1B ADP . G ADP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.706 ? 
metalc ? metalc22 CB MG MG . G MG 601 1_555 DB O2A ADP . G ADP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.543 ? 
metalc ? metalc23 V OD1 ASP 86 a ASP 87 1_555 LB MG MG . a MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.343 ? 
metalc ? metalc24 V O SER 150 a SER 151 1_555 LB MG MG . a MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.15 ? 
metalc ? metalc25 LB MG MG . a MG 601 1_555 MB O1B ADP . a ADP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.937 ? 
metalc ? metalc26 LB MG MG . a MG 601 1_555 MB O2A ADP . a ADP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.461 ? 
metalc ? metalc27 W OD1 ASP 86 b ASP 87 1_555 NB MG MG . b MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.451 ? 
metalc ? metalc28 NB MG MG . b MG 601 1_555 OB O1B ADP . b ADP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.819 ? 
metalc ? metalc29 NB MG MG . b MG 601 1_555 OB O2A ADP . b ADP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.494 ? 
metalc ? metalc30 X OD1 ASP 86 c ASP 87 1_555 PB MG MG . c MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.4 ? 
metalc ? metalc31 PB MG MG . c MG 601 1_555 QB O1B ADP . c ADP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.753 ? 
metalc ? metalc32 PB MG MG . c MG 601 1_555 QB O2A ADP . c ADP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.701 ? 
metalc ? metalc33 Y OD1 ASP 86 d ASP 87 1_555 RB MG MG . d MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.896 ? 
metalc ? metalc34 Y O SER 150 d SER 151 1_555 RB MG MG . d MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.113 ? 
metalc ? metalc35 RB MG MG . d MG 601 1_555 SB O2A ADP . d ADP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.893 ? 
metalc ? metalc36 Z OD1 ASP 86 e ASP 87 1_555 TB MG MG . e MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.548 ? 
metalc ? metalc37 Z O SER 150 e SER 151 1_555 TB MG MG . e MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.685 ? 
metalc ? metalc38 TB MG MG . e MG 601 1_555 UB O2A ADP . e ADP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.516 ? 
metalc ? metalc39 AA OD1 ASP 86 f ASP 87 1_555 VB MG MG . f MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.59 ? 
metalc ? metalc40 VB MG MG . f MG 601 1_555 WB O2A ADP . f ADP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.862 ? 
metalc ? metalc41 BA OD1 ASP 86 g ASP 87 1_555 XB MG MG . g MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.634 ? 
metalc ? metalc42 XB MG MG . g MG 601 1_555 YB O2A ADP . g ADP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.443 ? 
#
_chem_comp.formula           'C2 H6 O S' 
_chem_comp.formula_weight    78.133 
_chem_comp.id                DMS 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'DIMETHYL SULFOXIDE' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
S O DMS doub 114 n n 
S C1 DMS sing 115 n n 
S C2 DMS sing 116 n n 
C1 H11 DMS sing 117 n n 
C1 H12 DMS sing 118 n n 
C1 H13 DMS sing 119 n n 
C2 H21 DMS sing 120 n n 
C2 H22 DMS sing 121 n n 
C2 H23 DMS sing 122 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     4V4O 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.007124 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    -0.002803 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    -0.000296 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.00687 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    -0.000702 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.003692 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
QA 3 MG A 1 601 550 MG MG . 
RA 4 ADP A 1 602 1 ADP ADP . 
SA 3 MG B 1 601 550 MG MG . 
TA 4 ADP B 1 602 1 ADP ADP . 
UA 3 MG C 1 601 550 MG MG . 
VA 4 ADP C 1 602 1 ADP ADP . 
WA 3 MG D 1 601 550 MG MG . 
XA 4 ADP D 1 602 1 ADP ADP . 
YA 3 MG E 1 601 550 MG MG . 
ZA 4 ADP E 1 602 1 ADP ADP . 
AB 3 MG F 1 601 550 MG MG . 
BB 4 ADP F 1 602 1 ADP ADP . 
CB 3 MG G 1 601 550 MG MG . 
DB 4 ADP G 1 602 1 ADP ADP . 
EB 5 DMS H 1 601 1 DMS DMS . 
FB 5 DMS I 1 601 1 DMS DMS . 
GB 5 DMS J 1 601 1 DMS DMS . 
HB 5 DMS K 1 601 1 DMS DMS . 
IB 5 DMS L 1 601 1 DMS DMS . 
JB 5 DMS M 1 601 1 DMS DMS . 
KB 5 DMS N 1 701 1 DMS DMS . 
LB 3 MG a 1 601 550 MG MG . 
MB 4 ADP a 1 602 1 ADP ADP . 
NB 3 MG b 1 601 550 MG MG . 
OB 4 ADP b 1 602 1 ADP ADP . 
PB 3 MG c 1 601 550 MG MG . 
QB 4 ADP c 1 602 1 ADP ADP . 
RB 3 MG d 1 601 550 MG MG . 
SB 4 ADP d 1 602 1 ADP ADP . 
TB 3 MG e 1 601 550 MG MG . 
UB 4 ADP e 1 602 1 ADP ADP . 
VB 3 MG f 1 601 550 MG MG . 
WB 4 ADP f 1 602 1 ADP ADP . 
XB 3 MG g 1 601 550 MG MG . 
YB 4 ADP g 1 602 1 ADP ADP . 
ZB 5 DMS h 1 601 1 DMS DMS . 
AC 5 DMS i 1 601 1 DMS DMS . 
BC 5 DMS j 1 601 1 DMS DMS . 
CC 5 DMS k 1 601 1 DMS DMS . 
DC 5 DMS l 1 601 1 DMS DMS . 
EC 5 DMS m 1 601 1 DMS DMS . 
FC 5 DMS n 1 701 1 DMS DMS . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 S S DMS . . . FC 5 125.065 50.575 106.667 1 99.32 ? S DMS 701 n 1 
HETATM 2 O O DMS . . . FC 5 124.181 51.2 107.698 1 87.36 ? O DMS 701 n 1 
HETATM 3 C C1 DMS . . . FC 5 126.728 50.879 107.145 1 85.95 ? C1 DMS 701 n 1 
HETATM 4 C C2 DMS . . . FC 5 124.948 48.795 106.762 1 69.66 ? C2 DMS 701 n 1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              49 
_model_server_stats.parse_time_ms           21 
_model_server_stats.create_model_time_ms    539 
_model_server_stats.query_time_ms           317 
_model_server_stats.encode_time_ms          10 
_model_server_stats.element_count           4 
#