data_4W5A
#
_model_server_result.job_id            T3xatDtLMr-yXMxvxUXx0A 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-10-28 02:28:53' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          4w5a 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"J","auth_seq_id":501}' 
#
_entry.id    4W5A 
#
_exptl.entry_id    4W5A 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              65.409 
_entity.id                          3 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'ZINC ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    9 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         120 
_cell.entry_id            4W5A 
_cell.length_a            75.522 
_cell.length_b            75.522 
_cell.length_c            137.599 
_cell.Z_PDB               18 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 4W5A 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        154 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 32 2 1' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 1 
PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 2 
PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 3 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,B,G,H,I,P 1 1 
C,D,J,K,L,Q,R 2 1 
E,F,M,N,O 3 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 3 G N N 
? 3 H N N 
? 3 I N N 
? 3 J N N 
? 3 K N N 
? 3 L N N 
? 3 M N N 
? 3 N N N 
? 3 O N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
covale ? covale1 B C ARG 8 C ARG 8 1_555 B N M3L 9 C M3L 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale2 B C M3L 9 C M3L 9 1_555 B N SEP 10 C SEP 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? 
covale ? covale3 B C SEP 10 C SEP 10 1_555 B N THR 11 C THR 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale4 D C ARG 8 D ARG 8 1_555 D N M3L 9 D M3L 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale5 D C M3L 9 D M3L 9 1_555 D N SEP 10 D SEP 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? 
covale ? covale6 D C SEP 10 D SEP 10 1_555 D N THR 11 D THR 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale7 F C ARG 8 F ARG 8 1_555 F N M3L 9 F M3L 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale8 F C M3L 9 F M3L 9 1_555 F N SEP 10 F SEP 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale9 F C SEP 10 F SEP 10 1_555 F N THR 11 F THR 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
metalc ? metalc1 A SG CYS 11 A CYS 11 1_555 G ZN ZN . A ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.236 ? 
metalc ? metalc2 A SG CYS 14 A CYS 14 1_555 G ZN ZN . A ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.298 ? 
metalc ? metalc3 A SG CYS 37 A CYS 37 1_555 G ZN ZN . A ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.416 ? 
metalc ? metalc4 A SG CYS 40 A CYS 40 1_555 G ZN ZN . A ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.348 ? 
metalc ? metalc5 A SG CYS 60 A CYS 60 1_555 H ZN ZN . A ZN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.45 ? 
metalc ? metalc6 A SG CYS 63 A CYS 63 1_555 H ZN ZN . A ZN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.45 ? 
metalc ? metalc7 A SG CYS 72 A CYS 72 1_555 I ZN ZN . A ZN 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.332 ? 
metalc ? metalc8 A SG CYS 75 A CYS 75 1_555 I ZN ZN . A ZN 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.258 ? 
metalc ? metalc9 A SG CYS 80 A CYS 80 1_555 H ZN ZN . A ZN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.313 ? 
metalc ? metalc10 A SG CYS 83 A CYS 83 1_555 H ZN ZN . A ZN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.309 ? 
metalc ? metalc11 A SG CYS 105 A CYS 105 1_555 I ZN ZN . A ZN 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.374 ? 
metalc ? metalc12 A SG CYS 108 A CYS 108 1_555 I ZN ZN . A ZN 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.276 ? 
metalc ? metalc13 C SG CYS 11 B CYS 11 1_555 J ZN ZN . B ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.347 ? 
metalc ? metalc14 C SG CYS 14 B CYS 14 1_555 J ZN ZN . B ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.288 ? 
metalc ? metalc15 C SG CYS 37 B CYS 37 1_555 J ZN ZN . B ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.354 ? 
metalc ? metalc16 C SG CYS 40 B CYS 40 1_555 J ZN ZN . B ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.374 ? 
metalc ? metalc17 C SG CYS 60 B CYS 60 1_555 K ZN ZN . B ZN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.449 ? 
metalc ? metalc18 C SG CYS 63 B CYS 63 1_555 K ZN ZN . B ZN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.339 ? 
metalc ? metalc19 C SG CYS 72 B CYS 72 1_555 L ZN ZN . B ZN 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.264 ? 
metalc ? metalc20 C SG CYS 75 B CYS 75 1_555 L ZN ZN . B ZN 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.302 ? 
metalc ? metalc21 C SG CYS 80 B CYS 80 1_555 K ZN ZN . B ZN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.274 ? 
metalc ? metalc22 C SG CYS 83 B CYS 83 1_555 K ZN ZN . B ZN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.271 ? 
metalc ? metalc23 C SG CYS 105 B CYS 105 1_555 L ZN ZN . B ZN 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.428 ? 
metalc ? metalc24 C SG CYS 108 B CYS 108 1_555 L ZN ZN . B ZN 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.276 ? 
metalc ? metalc25 E SG CYS 11 E CYS 11 1_555 M ZN ZN . E ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.517 ? 
metalc ? metalc26 E SG CYS 14 E CYS 14 1_555 M ZN ZN . E ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.528 ? 
metalc ? metalc27 E SG CYS 37 E CYS 37 1_555 M ZN ZN . E ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.368 ? 
metalc ? metalc28 E SG CYS 40 E CYS 40 1_555 M ZN ZN . E ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.519 ? 
metalc ? metalc29 E SG CYS 60 E CYS 60 1_555 N ZN ZN . E ZN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.688 ? 
metalc ? metalc30 E SG CYS 63 E CYS 63 1_555 N ZN ZN . E ZN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.398 ? 
metalc ? metalc31 E SG CYS 72 E CYS 72 1_555 O ZN ZN . E ZN 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.657 ? 
metalc ? metalc32 E SG CYS 75 E CYS 75 1_555 O ZN ZN . E ZN 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.414 ? 
metalc ? metalc33 E SG CYS 80 E CYS 80 1_555 N ZN ZN . E ZN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.607 ? 
metalc ? metalc34 E SG CYS 83 E CYS 83 1_555 N ZN ZN . E ZN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.514 ? 
metalc ? metalc35 E SG CYS 105 E CYS 105 1_555 O ZN ZN . E ZN 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.433 ? 
metalc ? metalc36 E SG CYS 108 E CYS 108 1_555 O ZN ZN . E ZN 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.532 ? 
#
_chem_comp.formula           'Zn 2' 
_chem_comp.formula_weight    65.409 
_chem_comp.id                ZN 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'ZINC ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     4W5A 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.013241 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0.007645 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.01529 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.007267 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
G 3 ZN A 1 501 501 ZN ZN . 
H 3 ZN A 1 502 502 ZN ZN . 
I 3 ZN A 1 503 503 ZN ZN . 
J 3 ZN B 1 501 501 ZN ZN . 
K 3 ZN B 1 502 502 ZN ZN . 
L 3 ZN B 1 503 503 ZN ZN . 
M 3 ZN E 1 501 501 ZN ZN . 
N 3 ZN E 1 502 502 ZN ZN . 
O 3 ZN E 1 503 503 ZN ZN . 
P 4 HOH A 1 601 6 HOH HOH . 
P 4 HOH A 2 602 17 HOH HOH . 
P 4 HOH A 3 603 19 HOH HOH . 
P 4 HOH A 4 604 9 HOH HOH . 
P 4 HOH A 5 605 1 HOH HOH . 
P 4 HOH A 6 606 2 HOH HOH . 
P 4 HOH A 7 607 3 HOH HOH . 
P 4 HOH A 8 608 10 HOH HOH . 
P 4 HOH A 9 609 11 HOH HOH . 
P 4 HOH A 10 610 12 HOH HOH . 
P 4 HOH A 11 611 13 HOH HOH . 
P 4 HOH A 12 612 14 HOH HOH . 
P 4 HOH A 13 613 18 HOH HOH . 
Q 4 HOH B 1 601 4 HOH HOH . 
Q 4 HOH B 2 602 7 HOH HOH . 
Q 4 HOH B 3 603 8 HOH HOH . 
Q 4 HOH B 4 604 15 HOH HOH . 
Q 4 HOH B 5 605 16 HOH HOH . 
R 4 HOH D 1 101 5 HOH HOH . 
#
_atom_site.group_PDB             HETATM 
_atom_site.id                    1 
_atom_site.type_symbol           ZN 
_atom_site.label_atom_id         ZN 
_atom_site.label_comp_id         ZN 
_atom_site.label_seq_id          . 
_atom_site.label_alt_id          . 
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code     . 
_atom_site.label_asym_id         J 
_atom_site.label_entity_id       3 
_atom_site.Cartn_x               -20.414 
_atom_site.Cartn_y               -27.284 
_atom_site.Cartn_z               -18.498 
_atom_site.occupancy             1 
_atom_site.B_iso_or_equiv        57.18 
_atom_site.pdbx_formal_charge    ? 
_atom_site.auth_atom_id          ZN 
_atom_site.auth_comp_id          ZN 
_atom_site.auth_seq_id           501 
_atom_site.auth_asym_id          B 
_atom_site.pdbx_PDB_model_num    1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              60 
_model_server_stats.parse_time_ms           10 
_model_server_stats.create_model_time_ms    4 
_model_server_stats.query_time_ms           265 
_model_server_stats.encode_time_ms          1 
_model_server_stats.element_count           1 
#