data_4X0P # _model_server_result.job_id KHjturzF3h2ESuvEBnaLbQ _model_server_result.datetime_utc '2024-10-19 03:56:15' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 4x0p # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"X","auth_seq_id":2604}' # _entry.id 4X0P # _exptl.entry_id 4X0P _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 475.182 _entity.id 6 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description "2',3'-dideoxyadenosine triphosphate" _entity.pdbx_number_of_molecules 4 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 4X0P _cell.length_a 126.921 _cell.length_b 136.971 _cell.length_c 247.991 _cell.Z_PDB 16 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 4X0P _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id PISA trimeric 3 author_and_software_defined_assembly 1 PISA trimeric 3 author_and_software_defined_assembly 2 PISA trimeric 3 author_and_software_defined_assembly 3 PISA trimeric 3 author_and_software_defined_assembly 4 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,E,F,M,N,O,P 1 1 B,G,H,Q,R,S,T 2 1 C,I,J,U,V,W,X 3 1 D,K,L,Y,Z,AA,BA 4 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 6 P N N ? 6 T N N ? 6 X N N ? 6 BA N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OD1 ASP 539 A ASP 2330 1_555 O CA CA . A CA 2603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.519 ? metalc ? metalc2 A OD2 ASP 539 A ASP 2330 1_555 O CA CA . A CA 2603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.472 ? metalc ? metalc3 A O TYR 540 A TYR 2331 1_555 O CA CA . A CA 2603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.99 ? metalc ? metalc4 A OD1 ASP 749 A ASP 2540 1_555 O CA CA . A CA 2603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.246 ? metalc ? metalc5 O CA CA . A CA 2603 1_555 P O1A DDS . A DDS 2604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.162 ? metalc ? metalc6 O CA CA . A CA 2603 1_555 P O1B DDS . A DDS 2604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.105 ? metalc ? metalc7 B OD1 ASP 539 B ASP 2330 1_555 S CA CA . B CA 2603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.337 ? metalc ? metalc8 B OD2 ASP 539 B ASP 2330 1_555 S CA CA . B CA 2603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.043 ? metalc ? metalc9 B O TYR 540 B TYR 2331 1_555 S CA CA . B CA 2603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.016 ? metalc ? metalc10 S CA CA . B CA 2603 1_555 T O1G DDS . B DDS 2604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.158 ? metalc ? metalc11 S CA CA . B CA 2603 1_555 T O1A DDS . B DDS 2604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.571 ? metalc ? metalc12 S CA CA . B CA 2603 1_555 T O1B DDS . B DDS 2604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.956 ? metalc ? metalc13 C OD1 ASP 539 C ASP 2330 1_555 W CA CA . C CA 2603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.346 ? metalc ? metalc14 C OD2 ASP 539 C ASP 2330 1_555 W CA CA . C CA 2603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.07 ? metalc ? metalc15 C O TYR 540 C TYR 2331 1_555 W CA CA . C CA 2603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.201 ? metalc ? metalc16 W CA CA . C CA 2603 1_555 X O1A DDS . C DDS 2604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.078 ? metalc ? metalc17 W CA CA . C CA 2603 1_555 X O1G DDS . C DDS 2604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.049 ? metalc ? metalc18 D OD1 ASP 539 D ASP 2330 1_555 AA CA CA . D CA 2603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.112 ? metalc ? metalc19 D OD2 ASP 539 D ASP 2330 1_555 AA CA CA . D CA 2603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.44 ? metalc ? metalc20 D O TYR 540 D TYR 2331 1_555 AA CA CA . D CA 2603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.9 ? metalc ? metalc21 D OD1 ASP 749 D ASP 2540 1_555 AA CA CA . D CA 2603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.188 ? metalc ? metalc22 AA CA CA . D CA 2603 1_555 BA O1A DDS . D DDS 2604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.1 ? metalc ? metalc23 AA CA CA . D CA 2603 1_555 BA O1G DDS . D DDS 2604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.55 ? hydrog 'DC-DC MISPAIR' hydrog1 F N3 DC 1 E DC 1 1_555 H N4 DC 1 G DC 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog2 E N3 DC 2 F DC 2 1_555 F N1 DG 16 E DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 E N4 DC 2 F DC 2 1_555 F O6 DG 16 E DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 E O2 DC 2 F DC 2 1_555 F N2 DG 16 E DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 E N1 DG 3 F DG 3 1_555 F N3 DC 15 E DC 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 E N2 DG 3 F DG 3 1_555 F O2 DC 15 E DC 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 E O6 DG 3 F DG 3 1_555 F N4 DC 15 E DC 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 E N1 DG 4 F DG 4 1_555 F N3 DC 14 E DC 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 E N2 DG 4 F DG 4 1_555 F O2 DC 14 E DC 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 E O6 DG 4 F DG 4 1_555 F N4 DC 14 E DC 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 E N3 DC 5 F DC 5 1_555 F N1 DG 13 E DG 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 E N4 DC 5 F DC 5 1_555 F O6 DG 13 E DG 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog13 E O2 DC 5 F DC 5 1_555 F N2 DG 13 E DG 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog14 E N3 DT 6 F DT 6 1_555 F N1 DA 12 E DA 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 E O4 DT 6 F DT 6 1_555 F N6 DA 12 E DA 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 E N1 DG 7 F DG 7 1_555 F N3 DC 11 E DC 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 E N2 DG 7 F DG 7 1_555 F O2 DC 11 E DC 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 E O6 DG 7 F DG 7 1_555 F N4 DC 11 E DC 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog19 E N3 DT 8 F DT 8 1_555 F N1 DA 10 E DA 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog20 E O4 DT 8 F DT 8 1_555 F N6 DA 10 E DA 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog21 E N3 DC 9 F DC 9 1_555 F N1 DG 9 E DG 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog22 E N4 DC 9 F DC 9 1_555 F O6 DG 9 E DG 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog23 E O2 DC 9 F DC 9 1_555 F N2 DG 9 E DG 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 E N1 DA 10 F DA 10 1_555 F N3 DT 8 E DT 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog25 E N6 DA 10 F DA 10 1_555 F O4 DT 8 E DT 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog26 E N3 DT 11 F DT 11 1_555 F N1 DA 7 E DA 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog27 E O4 DT 11 F DT 11 1_555 F N6 DA 7 E DA 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog28 E N3 DT 12 F DT 12 1_555 F N1 DA 6 E DA 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog29 E O4 DT 12 F DT 12 1_555 F N6 DA 6 E DA 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DC-DG PAIR' hydrog30 E O2 DC 13 F DC 13 1_555 F N2 DG 5 E DG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog31 G N1 DG 1 H DG 1 1_555 H N3 DC 17 G DC 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog32 G N2 DG 1 H DG 1 1_555 H O2 DC 17 G DC 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog33 G O6 DG 1 H DG 1 1_555 H N4 DC 17 G DC 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog34 G N3 DC 2 H DC 2 1_555 H N1 DG 16 G DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog35 G N4 DC 2 H DC 2 1_555 H O6 DG 16 G DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog36 G O2 DC 2 H DC 2 1_555 H N2 DG 16 G DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog37 G N1 DG 3 H DG 3 1_555 H N3 DC 15 G DC 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog38 G N2 DG 3 H DG 3 1_555 H O2 DC 15 G DC 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog39 G O6 DG 3 H DG 3 1_555 H N4 DC 15 G DC 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog40 G N1 DG 4 H DG 4 1_555 H N3 DC 14 G DC 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog41 G N2 DG 4 H DG 4 1_555 H O2 DC 14 G DC 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog42 G O6 DG 4 H DG 4 1_555 H N4 DC 14 G DC 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DC-DG PAIR' hydrog43 G O2 DC 5 H DC 5 1_555 H N2 DG 13 G DG 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog44 G N3 DT 6 H DT 6 1_555 H N1 DA 12 G DA 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog45 G O4 DT 6 H DT 6 1_555 H N6 DA 12 G DA 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog46 G N1 DG 7 H DG 7 1_555 H N3 DC 11 G DC 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog47 G N2 DG 7 H DG 7 1_555 H O2 DC 11 G DC 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog48 G O6 DG 7 H DG 7 1_555 H N4 DC 11 G DC 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog49 G N3 DT 8 H DT 8 1_555 H N1 DA 10 G DA 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog50 G O4 DT 8 H DT 8 1_555 H N6 DA 10 G DA 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog51 G N3 DC 9 H DC 9 1_555 H N1 DG 9 G DG 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog52 G N4 DC 9 H DC 9 1_555 H O6 DG 9 G DG 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog53 G O2 DC 9 H DC 9 1_555 H N2 DG 9 G DG 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog54 G N1 DA 10 H DA 10 1_555 H N3 DT 8 G DT 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog55 G N6 DA 10 H DA 10 1_555 H O4 DT 8 G DT 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DT-DA PAIR' hydrog56 G N3 DT 11 H DT 11 1_555 H N1 DA 7 G DA 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog57 G N3 DT 12 H DT 12 1_555 H N1 DA 6 G DA 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog58 G O4 DT 12 H DT 12 1_555 H N6 DA 6 G DA 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog59 G N3 DC 13 H DC 13 1_555 H N1 DG 5 G DG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog60 G N4 DC 13 H DC 13 1_555 H O6 DG 5 G DG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog61 G O2 DC 13 H DC 13 1_555 H N2 DG 5 G DG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog62 I N3 DC 2 J DC 2 1_555 J N1 DG 16 I DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog63 I N4 DC 2 J DC 2 1_555 J O6 DG 16 I DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog64 I O2 DC 2 J DC 2 1_555 J N2 DG 16 I DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog65 I N1 DG 3 J DG 3 1_555 J N3 DC 15 I DC 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog66 I N2 DG 3 J DG 3 1_555 J O2 DC 15 I DC 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog67 I O6 DG 3 J DG 3 1_555 J N4 DC 15 I DC 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog68 I N1 DG 4 J DG 4 1_555 J N3 DC 14 I DC 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog69 I N2 DG 4 J DG 4 1_555 J O2 DC 14 I DC 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog70 I O6 DG 4 J DG 4 1_555 J N4 DC 14 I DC 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog71 I N3 DC 5 J DC 5 1_555 J N1 DG 13 I DG 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog72 I N4 DC 5 J DC 5 1_555 J O6 DG 13 I DG 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog73 I O2 DC 5 J DC 5 1_555 J N2 DG 13 I DG 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog74 I N3 DT 6 J DT 6 1_555 J N1 DA 12 I DA 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog75 I O4 DT 6 J DT 6 1_555 J N6 DA 12 I DA 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog76 I N1 DG 7 J DG 7 1_555 J N3 DC 11 I DC 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog77 I N2 DG 7 J DG 7 1_555 J O2 DC 11 I DC 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog78 I O6 DG 7 J DG 7 1_555 J N4 DC 11 I DC 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog79 I N3 DT 8 J DT 8 1_555 J N1 DA 10 I DA 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog80 I O4 DT 8 J DT 8 1_555 J N6 DA 10 I DA 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog81 I N3 DC 9 J DC 9 1_555 J N1 DG 9 I DG 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog82 I N4 DC 9 J DC 9 1_555 J O6 DG 9 I DG 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog83 I O2 DC 9 J DC 9 1_555 J N2 DG 9 I DG 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DA-DA MISPAIR' hydrog84 I N6 DA 10 J DA 10 1_555 J N1 DA 7 I DA 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog85 I N1 DA 10 J DA 10 1_555 J N3 DT 8 I DT 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog86 I N6 DA 10 J DA 10 1_555 J O4 DT 8 I DT 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog87 I N3 DT 11 J DT 11 1_555 J N1 DA 7 I DA 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog88 I O4 DT 11 J DT 11 1_555 J N6 DA 7 I DA 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog89 I N3 DT 12 J DT 12 1_555 J N1 DA 6 I DA 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog90 I O4 DT 12 J DT 12 1_555 J N6 DA 6 I DA 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog91 I N3 DC 13 J DC 13 1_555 J N1 DG 5 I DG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog92 I N4 DC 13 J DC 13 1_555 J O6 DG 5 I DG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog93 I O2 DC 13 J DC 13 1_555 J N2 DG 5 I DG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog94 K N1 DG 1 L DG 1 1_555 L N3 DC 17 K DC 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog95 K N2 DG 1 L DG 1 1_555 L O2 DC 17 K DC 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog96 K O6 DG 1 L DG 1 1_555 L N4 DC 17 K DC 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog97 K N3 DC 2 L DC 2 1_555 L N1 DG 16 K DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog98 K N4 DC 2 L DC 2 1_555 L O6 DG 16 K DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog99 K O2 DC 2 L DC 2 1_555 L N2 DG 16 K DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DG-DC PAIR' hydrog100 K N1 DG 3 L DG 3 1_555 L N3 DC 15 K DC 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DG-DC PAIR' hydrog101 K N2 DG 4 L DG 4 1_555 L O2 DC 14 K DC 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog102 K N3 DC 5 L DC 5 1_555 L N1 DG 13 K DG 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog103 K N4 DC 5 L DC 5 1_555 L O6 DG 13 K DG 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog104 K O2 DC 5 L DC 5 1_555 L N2 DG 13 K DG 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog105 K N3 DT 6 L DT 6 1_555 L N1 DA 12 K DA 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog106 K O4 DT 6 L DT 6 1_555 L N6 DA 12 K DA 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog107 K N1 DG 7 L DG 7 1_555 L N3 DC 11 K DC 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog108 K N2 DG 7 L DG 7 1_555 L O2 DC 11 K DC 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog109 K O6 DG 7 L DG 7 1_555 L N4 DC 11 K DC 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog110 K N3 DT 8 L DT 8 1_555 L N1 DA 10 K DA 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog111 K O4 DT 8 L DT 8 1_555 L N6 DA 10 K DA 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog112 K N3 DC 9 L DC 9 1_555 L N1 DG 9 K DG 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog113 K N4 DC 9 L DC 9 1_555 L O6 DG 9 K DG 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog114 K O2 DC 9 L DC 9 1_555 L N2 DG 9 K DG 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog115 K N1 DA 10 L DA 10 1_555 L N3 DT 8 K DT 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog116 K N6 DA 10 L DA 10 1_555 L O4 DT 8 K DT 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog117 K N3 DT 11 L DT 11 1_555 L N1 DA 7 K DA 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog118 K O4 DT 11 L DT 11 1_555 L N6 DA 7 K DA 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog119 K N3 DT 12 L DT 12 1_555 L N1 DA 6 K DA 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog120 K O4 DT 12 L DT 12 1_555 L N6 DA 6 K DA 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog121 K N3 DC 13 L DC 13 1_555 L N1 DG 5 K DG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog122 K N4 DC 13 L DC 13 1_555 L O6 DG 5 K DG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog123 K O2 DC 13 L DC 13 1_555 L N2 DG 5 K DG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'C10 H16 N5 O11 P3' _chem_comp.formula_weight 475.182 _chem_comp.id DDS _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name "2',3'-dideoxyadenosine triphosphate" _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag N1 C2 DDS doub 156 n y N1 C6 DDS sing 157 n y C2 N3 DDS sing 158 n y N3 C4 DDS doub 159 n y C4 C5 DDS sing 160 n y C4 N9 DDS sing 161 n y C5 C6 DDS doub 162 n y C5 N7 DDS sing 163 n y C6 N6 DDS sing 164 n n N7 C8 DDS doub 165 n y C8 N9 DDS sing 166 n y N9 C1' DDS sing 167 n n PA O1A DDS doub 168 n n PA O2A DDS sing 169 n n PA O3A DDS sing 170 n n PA O5' DDS sing 171 n n PB O1B DDS doub 172 n n PB O2B DDS sing 173 n n PB O3A DDS sing 174 n n PB O3B DDS sing 175 n n PG O1G DDS doub 176 n n PG O2G DDS sing 177 n n PG O3B DDS sing 178 n n PG O3G DDS sing 179 n n C1' C2' DDS sing 180 n n C1' O4' DDS sing 181 n n C2' C3' DDS sing 182 n n C3' C4' DDS sing 183 n n C4' O4' DDS sing 184 n n C4' C5' DDS sing 185 n n C5' O5' DDS sing 186 n n C2 H2 DDS sing 187 n n N6 HN6 DDS sing 188 n n N6 HN6A DDS sing 189 n n C8 H8 DDS sing 190 n n C1' H1' DDS sing 191 n n C2' H2' DDS sing 192 n n C2' "H2'A" DDS sing 193 n n C3' H3' DDS sing 194 n n C3' "H3'A" DDS sing 195 n n C4' H4' DDS sing 196 n n C5' H5' DDS sing 197 n n C5' "H5'A" DDS sing 198 n n O2A HO2A DDS sing 199 n n O2B HO2B DDS sing 200 n n O2G HO2G DDS sing 201 n n O3G HO3G DDS sing 202 n n # _atom_sites.entry_id 4X0P _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.007879 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.007301 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.004032 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code M 4 GOL A 1 2601 100 GOL GOL . N 4 GOL A 1 2602 101 GOL GOL . O 5 CA A 1 2603 1 CA CA . P 6 DDS A 1 2604 1 DDS DDS . Q 4 GOL B 1 2601 100 GOL GOL . R 4 GOL B 1 2602 101 GOL GOL . S 5 CA B 1 2603 1 CA CA . T 6 DDS B 1 2604 2 DDS DDS . U 4 GOL C 1 2601 100 GOL GOL . V 4 GOL C 1 2602 101 GOL GOL . W 5 CA C 1 2603 1 CA CA . X 6 DDS C 1 2604 2 DDS DDS . Y 4 GOL D 1 2601 100 GOL GOL . Z 4 GOL D 1 2602 101 GOL GOL . AA 5 CA D 1 2603 1 CA CA . BA 6 DDS D 1 2604 2 DDS DDS . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 N N1 DDS . . . X 6 7.324 -63.968 -97.772 1 162.91 ? N1 DDS 2604 C 1 HETATM 2 C C2 DDS . . . X 6 7.162 -63.551 -99.067 1 165.12 ? C2 DDS 2604 C 1 HETATM 3 N N3 DDS . . . X 6 6.825 -62.341 -99.553 1 167.61 ? N3 DDS 2604 C 1 HETATM 4 C C4 DDS . . . X 6 6.635 -61.451 -98.574 1 171.38 ? C4 DDS 2604 C 1 HETATM 5 C C5 DDS . . . X 6 6.758 -61.694 -97.151 1 166.26 ? C5 DDS 2604 C 1 HETATM 6 C C6 DDS . . . X 6 7.133 -63.065 -96.767 1 161 ? C6 DDS 2604 C 1 HETATM 7 N N6 DDS . . . X 6 7.292 -63.47 -95.495 1 161.17 ? N6 DDS 2604 C 1 HETATM 8 N N7 DDS . . . X 6 6.506 -60.61 -96.452 1 176.05 ? N7 DDS 2604 C 1 HETATM 9 C C8 DDS . . . X 6 6.223 -59.668 -97.38 1 186.37 ? C8 DDS 2604 C 1 HETATM 10 N N9 DDS . . . X 6 6.298 -60.14 -98.667 1 183.36 ? N9 DDS 2604 C 1 HETATM 11 P PA DDS . . . X 6 3.98 -56.334 -96.553 1 160.76 ? PA DDS 2604 C 1 HETATM 12 P PB DDS . . . X 6 1.456 -55.883 -97.549 1 185.76 ? PB DDS 2604 C 1 HETATM 13 P PG DDS . . . X 6 0.87 -53.994 -95.527 1 245.04 ? PG DDS 2604 C 1 HETATM 14 C C1' DDS . . . X 6 6.038 -59.406 -99.924 1 187.4 ? C1' DDS 2604 C 1 HETATM 15 O O1A DDS . . . X 6 4.047 -54.838 -96.763 1 165.23 ? O1A DDS 2604 C 1 HETATM 16 O O1B DDS . . . X 6 2.308 -54.839 -98.224 1 205.83 ? O1B DDS 2604 C 1 HETATM 17 O O1G DDS . . . X 6 1.561 -52.977 -96.399 1 249.9 ? O1G DDS 2604 C 1 HETATM 18 C C2' DDS . . . X 6 4.567 -59.404 -100.307 1 187.38 ? C2' DDS 2604 C 1 HETATM 19 O O2A DDS . . . X 6 4.638 -56.979 -95.359 1 157.33 ? O2A DDS 2604 C 1 HETATM 20 O O2B DDS . . . X 6 0.673 -56.873 -98.379 1 163.77 ? O2B DDS 2604 C 1 HETATM 21 O O2G DDS . . . X 6 1.777 -54.652 -94.514 1 243.56 ? O2G DDS 2604 C 1 HETATM 22 C C3' DDS . . . X 6 4.228 -57.955 -100.645 1 190.43 ? C3' DDS 2604 C 1 HETATM 23 O O3A DDS . . . X 6 2.424 -56.716 -96.58 1 177.95 ? O3A DDS 2604 C 1 HETATM 24 O O3B DDS . . . X 6 0.434 -55.186 -96.519 1 166.61 ? O3B DDS 2604 C 1 HETATM 25 O O3G DDS . . . X 6 -0.452 -53.532 -94.964 1 241.71 ? O3G DDS 2604 C 1 HETATM 26 C C4' DDS . . . X 6 5.407 -57.135 -100.113 1 162.65 ? C4' DDS 2604 C 1 HETATM 27 O O4' DDS . . . X 6 6.422 -58.055 -99.724 1 160.32 ? O4' DDS 2604 C 1 HETATM 28 C C5' DDS . . . X 6 5.069 -56.247 -98.932 1 162.65 ? C5' DDS 2604 C 1 HETATM 29 O O5' DDS . . . X 6 4.518 -57.035 -97.887 1 159.18 ? O5' DDS 2604 C 1 # _model_server_stats.io_time_ms 46 _model_server_stats.parse_time_ms 16 _model_server_stats.create_model_time_ms 41 _model_server_stats.query_time_ms 347 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 29 #