data_4X4R # _model_server_result.job_id t-9EyV0joMAV9E7w5pK4zA _model_server_result.datetime_utc '2024-12-27 01:58:42' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 4x4r # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"G","auth_seq_id":502}' # _entry.id 4X4R # _exptl.entry_id 4X4R _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 24.305 _entity.id 5 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MAGNESIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 4X4R _cell.length_a 111.1 _cell.length_b 217.368 _cell.length_c 58.562 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 4X4R _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 18 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 2' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id ? dimeric 2 author_defined_assembly 1 ? trimeric 3 author_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,B,F,G,H,I,J 1 1 C,D,E,K,L,M,N,O 2 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 5 G N N ? 5 L N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OD2 ASP 61 A ASP 61 1_555 G MG MG . A MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.65 ? metalc ? metalc2 F O2G APC . A APC 501 1_555 G MG MG . A MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.914 ? metalc ? metalc3 F O1B APC . A APC 501 1_555 G MG MG . A MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.631 ? metalc ? metalc4 C OG SER 47 C SER 47 1_555 L MG MG . C MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.923 ? metalc ? metalc5 C OD2 ASP 61 C ASP 61 1_555 L MG MG . C MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.624 ? metalc ? metalc6 K O1B APC . C APC 501 1_555 L MG MG . C MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.387 ? hydrog WATSON-CRICK hydrog1 B N1 G 1 B G 1 1_555 B N3 C 34 B C 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog2 B N2 G 1 B G 1 1_555 B O2 C 34 B C 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 B O6 G 1 B G 1 1_555 B N4 C 34 B C 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 B N1 G 2 B G 2 1_555 B N3 C 33 B C 33 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 B N2 G 2 B G 2 1_555 B O2 C 33 B C 33 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 B O6 G 2 B G 2 1_555 B N4 C 33 B C 33 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 B N3 C 3 B C 3 1_555 B N1 G 32 B G 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 B N4 C 3 B C 3 1_555 B O6 G 32 B G 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 B O2 C 3 B C 3 1_555 B N2 G 32 B G 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'C-G PAIR' hydrog10 B O2 C 4 B C 4 1_555 B N2 G 28 B G 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-C PAIR' hydrog11 B N1 G 5 B G 5 1_555 B N3 C 27 B C 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 B N3 C 6 B C 6 1_555 B N1 G 26 B G 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog13 B N4 C 6 B C 6 1_555 B O6 G 26 B G 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog14 B O2 C 6 B C 6 1_555 B N2 G 26 B G 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 B N1 G 7 B G 7 1_555 B N3 C 25 B C 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 B N2 G 7 B G 7 1_555 B O2 C 25 B C 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 B O6 G 7 B G 7 1_555 B N4 C 25 B C 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 B N1 G 8 B G 8 1_555 B N3 C 24 B C 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog19 B N2 G 8 B G 8 1_555 B O2 C 24 B C 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog20 B O6 G 8 B G 8 1_555 B N4 C 24 B C 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog21 B N3 C 9 B C 9 1_555 B N1 G 23 B G 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog22 B N4 C 9 B C 9 1_555 B O6 G 23 B G 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog23 B O2 C 9 B C 9 1_555 B N2 G 23 B G 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 B N1 A 10 B A 10 1_555 B N3 U 22 B U 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog25 B N6 A 10 B A 10 1_555 B O4 U 22 B U 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog26 B N1 G 11 B G 11 1_555 B N3 C 21 B C 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog27 B N2 G 11 B G 11 1_555 B O2 C 21 B C 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog28 B O6 G 11 B G 11 1_555 B N4 C 21 B C 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog29 B N1 G 12 B G 12 1_555 B N3 C 20 B C 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog30 B N2 G 12 B G 12 1_555 B O2 C 20 B C 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog31 B O6 G 12 B G 12 1_555 B N4 C 20 B C 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'REVERSED HOOGSTEEN' hydrog32 B N3 U 13 B U 13 1_555 B N7 A 17 B A 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'REVERSED HOOGSTEEN' hydrog33 B O2 U 13 B U 13 1_555 B N6 A 17 B A 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog34 D N1 G 1 D G 1 1_555 D N3 C 34 D C 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog35 D N2 G 1 D G 1 1_555 D O2 C 34 D C 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog36 D O6 G 1 D G 1 1_555 D N4 C 34 D C 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog37 D N1 G 2 D G 2 1_555 D N3 C 33 D C 33 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog38 D N2 G 2 D G 2 1_555 D O2 C 33 D C 33 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog39 D O6 G 2 D G 2 1_555 D N4 C 33 D C 33 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'C-G PAIR' hydrog40 D O2 C 3 D C 3 1_555 D N2 G 32 D G 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog41 D N1 G 7 D G 7 1_555 D N3 C 25 D C 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog42 D N2 G 7 D G 7 1_555 D O2 C 25 D C 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog43 D O6 G 7 D G 7 1_555 D N4 C 25 D C 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog44 D N1 G 8 D G 8 1_555 D N3 C 24 D C 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog45 D N2 G 8 D G 8 1_555 D O2 C 24 D C 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog46 D O6 G 8 D G 8 1_555 D N4 C 24 D C 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog47 D N3 C 9 D C 9 1_555 D N1 G 23 D G 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog48 D N4 C 9 D C 9 1_555 D O6 G 23 D G 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog49 D O2 C 9 D C 9 1_555 D N2 G 23 D G 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog50 D N1 A 10 D A 10 1_555 D N3 U 22 D U 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog51 D N6 A 10 D A 10 1_555 D O4 U 22 D U 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-C PAIR' hydrog52 D N2 G 11 D G 11 1_555 D O2 C 21 D C 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog53 D N1 G 12 D G 12 1_555 D N3 C 20 D C 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog54 D N2 G 12 D G 12 1_555 D O2 C 20 D C 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog55 D O6 G 12 D G 12 1_555 D N4 C 20 D C 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog56 D N3 C 15 D C 15 1_555 E N1 G 2 H G 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog57 D N4 C 15 D C 15 1_555 E O6 G 2 H G 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog58 D O2 C 15 D C 15 1_555 E N2 G 2 H G 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog59 D N1 G 16 D G 16 1_555 E N3 C 1 H C 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog60 D N2 G 16 D G 16 1_555 E O2 C 1 H C 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog61 D O6 G 16 D G 16 1_555 E N4 C 1 H C 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'Mg 2' _chem_comp.formula_weight 24.305 _chem_comp.id MG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MAGNESIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 4X4R _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.009001 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.0046 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.017076 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code F 4 APC A 1 501 50 APC APC . G 5 MG A 1 502 500 MG MG . H 6 MES A 1 503 1 MES MES . I 7 GOL A 1 504 2 GOL GOL . J 7 GOL A 1 505 8 GOL GOL . K 4 APC C 1 501 50 APC APC . L 5 MG C 1 502 500 MG MG . M 7 GOL C 1 503 3 GOL GOL . N 8 TAR C 1 504 6 TAR TAR . O 9 PEG C 1 505 7 PEG PEG . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MG _atom_site.label_atom_id MG _atom_site.label_comp_id MG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id G _atom_site.label_entity_id 5 _atom_site.Cartn_x 6.959 _atom_site.Cartn_y 58.038 _atom_site.Cartn_z 36.66 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 33.69 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MG _atom_site.auth_comp_id MG _atom_site.auth_seq_id 502 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 15 _model_server_stats.parse_time_ms 12 _model_server_stats.create_model_time_ms 22 _model_server_stats.query_time_ms 331 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 1 #