data_4XGZ
#
_model_server_result.job_id            F8wH7uYGIEA6i9TQE-fBAQ 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-17 20:30:06' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          4xgz 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"WA","auth_seq_id":301}' 
#
_entry.id    4XGZ 
#
_exptl.entry_id    4XGZ 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              62.005 
_entity.id                          4 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'NITRATE ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    12 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         94.65 
_cell.angle_beta          95.28 
_cell.angle_gamma         114.53 
_cell.entry_id            4XGZ 
_cell.length_a            108.189 
_cell.length_b            111.004 
_cell.length_c            143.865 
_cell.Z_PDB               12 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 4XGZ 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        1 
_symmetry.space_group_name_Hall    . 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
PISA trimeric 3 author_and_software_defined_assembly 1 
PISA trimeric 3 author_and_software_defined_assembly 2 
PISA trimeric 3 author_and_software_defined_assembly 3 
PISA trimeric 3 author_and_software_defined_assembly 4 
PISA trimeric 3 author_and_software_defined_assembly 5 
PISA trimeric 3 author_and_software_defined_assembly 6 
PISA trimeric 3 author_and_software_defined_assembly 7 
PISA trimeric 3 author_and_software_defined_assembly 8 
PISA trimeric 3 author_and_software_defined_assembly 9 
PISA trimeric 3 author_and_software_defined_assembly 10 
PISA trimeric 3 author_and_software_defined_assembly 11 
PISA trimeric 3 author_and_software_defined_assembly 12 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,B,Y,KA,ZA,AB,XB 1 1 
C,D,Z,LA,BB,CB,YB 2 1 
E,F,AA,MA,DB,EB,ZB 3 1 
G,I,BA,NA,FB,HB,AC 4 1 
H,L,CA,PA,GB,KB 5 1 
J,K,DA,OA,IB,JB,BC 6 1 
M,N,EA,QA,RA,LB,MB,CC 7 1 
O,P,FA,SA,NB,OB,DC 8 1 
Q,R,GA,TA,UA,PB,QB,EC 9 1 
S,T,HA,VA,RB,SB,FC 10 1 
U,V,IA,WA,TB,UB,GC 11 1 
W,X,JA,XA,YA,VB,WB,HC 12 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 4 KA N N 
? 4 LA N N 
? 4 MA N N 
? 4 NA N N 
? 4 OA N N 
? 4 PA N N 
? 4 RA N N 
? 4 SA N N 
? 4 UA N N 
? 4 VA N N 
? 4 WA N N 
? 4 YA N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 A SG CYS 25 A CYS 22 1_555 A SG CYS 99 A CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.989 ? 
disulf ? disulf2 A SG CYS 148 A CYS 140 1_555 A SG CYS 204 A CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? 
disulf ? disulf3 A SG CYS 224 A CYS 216 1_555 B SG CYS 215 B CYS 214 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? 
disulf ? disulf4 B SG CYS 24 B CYS 23 1_555 B SG CYS 89 B CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? 
disulf ? disulf5 B SG CYS 135 B CYS 134 1_555 B SG CYS 195 B CYS 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? 
disulf ? disulf6 C SG CYS 25 C CYS 22 1_555 C SG CYS 99 C CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? 
disulf ? disulf7 C SG CYS 148 C CYS 140 1_555 C SG CYS 204 C CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? 
disulf ? disulf8 C SG CYS 224 C CYS 216 1_555 D SG CYS 215 D CYS 214 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? 
disulf ? disulf9 D SG CYS 24 D CYS 23 1_555 D SG CYS 89 D CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? 
disulf ? disulf10 D SG CYS 135 D CYS 134 1_555 D SG CYS 195 D CYS 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.047 ? 
disulf ? disulf11 E SG CYS 25 E CYS 22 1_555 E SG CYS 99 E CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? 
disulf ? disulf12 E SG CYS 148 E CYS 140 1_555 E SG CYS 204 E CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? 
disulf ? disulf13 F SG CYS 24 F CYS 23 1_555 F SG CYS 89 F CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? 
disulf ? disulf14 F SG CYS 135 F CYS 134 1_555 F SG CYS 195 F CYS 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? 
disulf ? disulf15 G SG CYS 25 G CYS 22 1_555 G SG CYS 99 G CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? 
disulf ? disulf16 G SG CYS 148 G CYS 140 1_555 G SG CYS 204 G CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? 
disulf ? disulf17 G SG CYS 224 G CYS 216 1_555 I SG CYS 215 I CYS 214 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? 
disulf ? disulf18 H SG CYS 25 H CYS 22 1_555 H SG CYS 99 H CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.049 ? 
disulf ? disulf19 H SG CYS 148 H CYS 140 1_555 H SG CYS 204 H CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? 
disulf ? disulf20 I SG CYS 24 I CYS 23 1_555 I SG CYS 89 I CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? 
disulf ? disulf21 I SG CYS 135 I CYS 134 1_555 I SG CYS 195 I CYS 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? 
disulf ? disulf22 J SG CYS 25 J CYS 22 1_555 J SG CYS 99 J CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.045 ? 
disulf ? disulf23 J SG CYS 148 J CYS 140 1_555 J SG CYS 204 J CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? 
disulf ? disulf24 J SG CYS 224 J CYS 216 1_555 K SG CYS 215 K CYS 214 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? 
disulf ? disulf25 K SG CYS 24 K CYS 23 1_555 K SG CYS 89 K CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? 
disulf ? disulf26 K SG CYS 135 K CYS 134 1_555 K SG CYS 195 K CYS 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.048 ? 
disulf ? disulf27 L SG CYS 24 L CYS 23 1_555 L SG CYS 89 L CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? 
disulf ? disulf28 L SG CYS 135 L CYS 134 1_555 L SG CYS 195 L CYS 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? 
disulf ? disulf29 M SG CYS 25 M CYS 22 1_555 M SG CYS 99 M CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? 
disulf ? disulf30 M SG CYS 148 M CYS 140 1_555 M SG CYS 204 M CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? 
disulf ? disulf31 M SG CYS 224 M CYS 216 1_555 N SG CYS 215 N CYS 214 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.02 ? 
disulf ? disulf32 N SG CYS 24 N CYS 23 1_555 N SG CYS 89 N CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? 
disulf ? disulf33 N SG CYS 135 N CYS 134 1_555 N SG CYS 195 N CYS 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? 
disulf ? disulf34 O SG CYS 25 O CYS 22 1_555 O SG CYS 99 O CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? 
disulf ? disulf35 O SG CYS 148 O CYS 140 1_555 O SG CYS 204 O CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? 
disulf ? disulf36 O SG CYS 224 O CYS 216 1_555 P SG CYS 215 P CYS 214 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? 
disulf ? disulf37 P SG CYS 24 P CYS 23 1_555 P SG CYS 89 P CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? 
disulf ? disulf38 P SG CYS 135 P CYS 134 1_555 P SG CYS 195 P CYS 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? 
disulf ? disulf39 Q SG CYS 25 Q CYS 22 1_555 Q SG CYS 99 Q CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.049 ? 
disulf ? disulf40 Q SG CYS 148 Q CYS 140 1_555 Q SG CYS 204 Q CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? 
disulf ? disulf41 Q SG CYS 224 Q CYS 216 1_555 R SG CYS 215 R CYS 214 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? 
disulf ? disulf42 R SG CYS 24 R CYS 23 1_555 R SG CYS 89 R CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? 
disulf ? disulf43 R SG CYS 135 R CYS 134 1_555 R SG CYS 195 R CYS 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? 
disulf ? disulf44 S SG CYS 25 S CYS 22 1_555 S SG CYS 99 S CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? 
disulf ? disulf45 S SG CYS 148 S CYS 140 1_555 S SG CYS 204 S CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? 
disulf ? disulf46 T SG CYS 24 T CYS 23 1_555 T SG CYS 89 T CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? 
disulf ? disulf47 T SG CYS 135 T CYS 134 1_555 T SG CYS 195 T CYS 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? 
disulf ? disulf48 U SG CYS 25 U CYS 22 1_555 U SG CYS 99 U CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? 
disulf ? disulf49 U SG CYS 148 U CYS 140 1_555 U SG CYS 204 U CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? 
disulf ? disulf50 U SG CYS 224 U CYS 216 1_555 V SG CYS 215 V CYS 214 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? 
disulf ? disulf51 V SG CYS 24 V CYS 23 1_555 V SG CYS 89 V CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? 
disulf ? disulf52 V SG CYS 135 V CYS 134 1_555 V SG CYS 195 V CYS 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? 
disulf ? disulf53 W SG CYS 25 W CYS 22 1_555 W SG CYS 99 W CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? 
disulf ? disulf54 W SG CYS 148 W CYS 140 1_555 W SG CYS 204 W CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? 
disulf ? disulf55 W SG CYS 224 W CYS 216 1_555 X SG CYS 215 X CYS 214 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? 
disulf ? disulf56 X SG CYS 24 X CYS 23 1_555 X SG CYS 89 X CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? 
disulf ? disulf57 X SG CYS 135 X CYS 134 1_555 X SG CYS 195 X CYS 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.045 ? 
#
_chem_comp.formula           'N O3 -1' 
_chem_comp.formula_weight    62.005 
_chem_comp.id                NO3 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'NITRATE ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
N O1 NO3 doub 246 n n 
N O2 NO3 sing 247 n n 
N O3 NO3 sing 248 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     4XGZ 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.009243 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0.004218 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.001422 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.009902 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0.001315 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.007042 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
KA 4 NO3 B 1 301 301 NO3 NO3 . 
LA 4 NO3 D 1 301 301 NO3 NO3 . 
MA 4 NO3 F 1 301 301 NO3 NO3 . 
NA 4 NO3 I 1 301 301 NO3 NO3 . 
OA 4 NO3 K 1 301 301 NO3 NO3 . 
PA 4 NO3 L 1 301 301 NO3 NO3 . 
QA 5 EDO N 1 301 301 EDO EDO . 
RA 4 NO3 N 1 302 302 NO3 NO3 . 
SA 4 NO3 P 1 301 301 NO3 NO3 . 
TA 5 EDO Q 1 301 301 EDO EDO . 
UA 4 NO3 R 1 301 301 NO3 NO3 . 
VA 4 NO3 T 1 301 301 NO3 NO3 . 
WA 4 NO3 V 1 301 301 NO3 NO3 . 
XA 5 EDO W 1 301 301 EDO EDO . 
YA 4 NO3 X 1 301 301 NO3 NO3 . 
ZA 6 HOH A 1 301 301 HOH HOH . 
ZA 6 HOH A 2 302 302 HOH HOH . 
ZA 6 HOH A 3 303 303 HOH HOH . 
ZA 6 HOH A 4 304 304 HOH HOH . 
ZA 6 HOH A 5 305 305 HOH HOH . 
ZA 6 HOH A 6 306 306 HOH HOH . 
ZA 6 HOH A 7 307 307 HOH HOH . 
ZA 6 HOH A 8 308 308 HOH HOH . 
ZA 6 HOH A 9 309 309 HOH HOH . 
ZA 6 HOH A 10 310 310 HOH HOH . 
ZA 6 HOH A 11 311 311 HOH HOH . 
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OB 6 HOH P 1 401 401 HOH HOH . 
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RB 6 HOH S 13 313 313 HOH HOH . 
RB 6 HOH S 14 314 314 HOH HOH . 
RB 6 HOH S 15 315 315 HOH HOH . 
RB 6 HOH S 16 316 316 HOH HOH . 
RB 6 HOH S 17 317 317 HOH HOH . 
RB 6 HOH S 18 318 318 HOH HOH . 
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SB 6 HOH T 1 401 401 HOH HOH . 
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TB 6 HOH U 1 301 301 HOH HOH . 
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TB 6 HOH U 10 310 310 HOH HOH . 
UB 6 HOH V 1 401 401 HOH HOH . 
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VB 6 HOH W 1 401 401 HOH HOH . 
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VB 6 HOH W 10 410 410 HOH HOH . 
VB 6 HOH W 11 411 411 HOH HOH . 
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WB 6 HOH X 6 406 406 HOH HOH . 
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WB 6 HOH X 11 411 411 HOH HOH . 
WB 6 HOH X 12 412 412 HOH HOH . 
XB 6 HOH a 1 300 300 HOH HOH . 
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BC 6 HOH j 2 102 102 HOH HOH . 
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CC 6 HOH m 1 101 101 HOH HOH . 
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EC 6 HOH q 3 103 103 HOH HOH . 
FC 6 HOH s 1 101 101 HOH HOH . 
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