data_4YCP
#
_model_server_result.job_id            4ZvjkNev6vnLswSkNw3UYA 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-12-26 20:07:05' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          4ycp 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"D","auth_seq_id":402}' 
#
_entry.id    4YCP 
#
_exptl.entry_id    4YCP 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              96.063 
_entity.id                          4 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'SULFATE ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    2 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         120 
_cell.entry_id            4YCP 
_cell.length_a            98.516 
_cell.length_b            98.516 
_cell.length_c            231.172 
_cell.Z_PDB               12 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 4YCP 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        179 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 65 2 2' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    dimeric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      2 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 4 D N N 
? 4 E N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 G O HOH . A HOH 542 1_555 F MG MG . B MG 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.177 ? 
metalc ? metalc2 G O HOH . A HOH 543 1_555 F MG MG . B MG 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.185 ? 
metalc ? metalc3 B OP2 U 17 B U 17 1_555 F MG MG . B MG 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? 
metalc ? metalc4 B OP2 G 19 B G 19 1_555 F MG MG . B MG 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.009 ? 
metalc ? metalc5 F MG MG . B MG 101 1_555 H O HOH . B HOH 207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.179 ? 
metalc ? metalc6 F MG MG . B MG 101 1_555 H O HOH . B HOH 208 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.183 ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog1 B N1 G 5 B G 5 1_555 B N3 C 68 B C 68 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog2 B N2 G 5 B G 5 1_555 B O2 C 68 B C 68 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog3 B O6 G 5 B G 5 1_555 B N4 C 68 B C 68 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog4 B N3 C 6 B C 6 1_555 B N1 G 67 B G 67 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog5 B N4 C 6 B C 6 1_555 B O6 G 67 B G 67 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog6 B O2 C 6 B C 6 1_555 B N2 G 67 B G 67 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog7 B N1 G 7 B G 7 1_555 B N3 C 66 B C 66 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog8 B N2 G 7 B G 7 1_555 B O2 C 66 B C 66 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog9 B O6 G 7 B G 7 1_555 B N4 C 66 B C 66 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog 'REVERSED HOOGSTEEN' hydrog10 B N3 U 8 B U 8 1_555 B N7 A 14 B A 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog 'REVERSED HOOGSTEEN' hydrog11 B O2 U 8 B U 8 1_555 B N6 A 14 B A 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog TYPE_2_PAIR hydrog12 B N6 A 9 B A 9 1_555 B N7 A 23 B A 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog TYPE_2_PAIR hydrog13 B N7 A 9 B A 9 1_555 B N6 A 23 B A 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog14 B N1 G 10 B G 10 1_555 B N3 C 25 B C 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog15 B N2 G 10 B G 10 1_555 B O2 C 25 B C 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog16 B O6 G 10 B G 10 1_555 B N4 C 25 B C 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog 'G-G MISPAIR' hydrog17 B O6 G 10 B G 10 1_555 B N2 G 44 B G 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog TYPE_28_PAIR hydrog18 B N3 U 11 B U 11 1_555 B O6 G 24 B G 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog TYPE_28_PAIR hydrog19 B O2 U 11 B U 11 1_555 B N1 G 24 B G 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog20 B N3 U 12 B U 12 1_555 B N1 A 23 B A 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog21 B O4 U 12 B U 12 1_555 B N6 A 23 B A 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog22 B N3 C 13 B C 13 1_555 B N1 G 22 B G 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog23 B N4 C 13 B C 13 1_555 B O6 G 22 B G 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog24 B O2 C 13 B C 13 1_555 B N2 G 22 B G 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog 'A-A MISPAIR' hydrog25 B N6 A 14 B A 14 1_555 B N3 A 21 B A 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog 'REVERSED WATSON-CRICK' hydrog26 B N1 A 15 B A 15 1_555 B N3 U 48 B U 48 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog 'REVERSED WATSON-CRICK' hydrog27 B N6 A 15 B A 15 1_555 B O2 U 48 B U 48 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog 'G-U MISPAIR' hydrog28 B N1 G 18 B G 18 1_555 B O2 U 55 B U 55 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog29 B N1 G 19 B G 19 1_555 B N3 C 56 B C 56 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog30 B N2 G 19 B G 19 1_555 B O2 C 56 B C 56 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog31 B O6 G 19 B G 19 1_555 B N4 C 56 B C 56 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog TYPE_7_PAIR hydrog32 B N7 G 22 B G 22 1_555 B N1 G 46 B G 46 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog TYPE_7_PAIR hydrog33 B O6 G 22 B G 22 1_555 B N2 G 46 B G 46 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog TYPE_7_PAIR hydrog34 B N7 G 24 B G 24 1_555 B N1 G 44 B G 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog TYPE_7_PAIR hydrog35 B O6 G 24 B G 24 1_555 B N2 G 44 B G 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog36 B N3 C 27 B C 27 1_555 B N1 G 43 B G 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog37 B N4 C 27 B C 27 1_555 B O6 G 43 B G 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog38 B O2 C 27 B C 27 1_555 B N2 G 43 B G 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog39 B N3 C 28 B C 28 1_555 B N1 G 42 B G 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog40 B N4 C 28 B C 28 1_555 B O6 G 42 B G 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog41 B O2 C 28 B C 28 1_555 B N2 G 42 B G 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog42 B N1 G 29 B G 29 1_555 B N3 C 41 B C 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog43 B N2 G 29 B G 29 1_555 B O2 C 41 B C 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog44 B O6 G 29 B G 29 1_555 B N4 C 41 B C 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog45 B N1 G 30 B G 30 1_555 B N3 C 40 B C 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog46 B N2 G 30 B G 30 1_555 B O2 C 40 B C 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog47 B O6 G 30 B G 30 1_555 B N4 C 40 B C 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog48 B N3 U 31 B U 31 1_555 B N1 A 39 B A 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog49 B O4 U 31 B U 31 1_555 B N6 A 39 B A 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog 'C-A MISPAIR' hydrog50 B N3 C 32 B C 32 1_555 B N6 A 38 B A 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog 'C-A MISPAIR' hydrog51 B O2 C 32 B C 32 1_555 B N6 A 38 B A 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog52 B N1 G 49 B G 49 1_555 B N3 C 65 B C 65 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog53 B N2 G 49 B G 49 1_555 B O2 C 65 B C 65 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog54 B O6 G 49 B G 49 1_555 B N4 C 65 B C 65 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog TYPE_28_PAIR hydrog55 B N1 G 50 B G 50 1_555 B O2 U 64 B U 64 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog TYPE_28_PAIR hydrog56 B O6 G 50 B G 50 1_555 B N3 U 64 B U 64 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog57 B N1 G 51 B G 51 1_555 B N3 C 63 B C 63 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog58 B N2 G 51 B G 51 1_555 B O2 C 63 B C 63 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog59 B O6 G 51 B G 51 1_555 B N4 C 63 B C 63 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog60 B N1 A 52 B A 52 1_555 B N3 U 62 B U 62 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog61 B N6 A 52 B A 52 1_555 B O4 U 62 B U 62 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog62 B N1 G 53 B G 53 1_555 B N3 C 61 B C 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog63 B N2 G 53 B G 53 1_555 B O2 C 61 B C 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog64 B O6 G 53 B G 53 1_555 B N4 C 61 B C 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog 'REVERSED HOOGSTEEN' hydrog65 B N3 U 54 B U 54 1_555 B N7 A 58 B A 58 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog 'REVERSED HOOGSTEEN' hydrog66 B O2 U 54 B U 54 1_555 B N6 A 58 B A 58 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
#
_chem_comp.formula           'O4 S -2' 
_chem_comp.formula_weight    96.063 
_chem_comp.id                SO4 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'SULFATE ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
S O1 SO4 doub 459 n n 
S O2 SO4 doub 460 n n 
S O3 SO4 sing 461 n n 
S O4 SO4 sing 462 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     4YCP 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.010151 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0.00586 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.011721 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.004326 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
C 3 FMN A 1 401 1 FMN FMN . 
D 4 SO4 A 1 402 1 SO4 SO4 . 
E 4 SO4 A 1 403 2 SO4 SO4 . 
F 5 MG B 1 101 1 MG MG . 
G 6 HOH A 1 501 38 HOH HOH . 
G 6 HOH A 2 502 42 HOH HOH . 
G 6 HOH A 3 503 5 HOH HOH . 
G 6 HOH A 4 504 28 HOH HOH . 
G 6 HOH A 5 505 31 HOH HOH . 
G 6 HOH A 6 506 25 HOH HOH . 
G 6 HOH A 7 507 14 HOH HOH . 
G 6 HOH A 8 508 39 HOH HOH . 
G 6 HOH A 9 509 1 HOH HOH . 
G 6 HOH A 10 510 2 HOH HOH . 
G 6 HOH A 11 511 3 HOH HOH . 
G 6 HOH A 12 512 4 HOH HOH . 
G 6 HOH A 13 513 6 HOH HOH . 
G 6 HOH A 14 514 7 HOH HOH . 
G 6 HOH A 15 515 8 HOH HOH . 
G 6 HOH A 16 516 9 HOH HOH . 
G 6 HOH A 17 517 10 HOH HOH . 
G 6 HOH A 18 518 11 HOH HOH . 
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