data_4Z31 # _model_server_result.job_id qJ_G6uN8thjw5VYJ1K5HDw _model_server_result.datetime_utc '2024-12-23 12:40:04' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 4z31 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"G","auth_seq_id":1000}' # _entry.id 4Z31 # _exptl.entry_id 4Z31 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight ? _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'UNKNOWN ATOM OR ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 114.12 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 4Z31 _cell.length_a 60.299 _cell.length_b 174.734 _cell.length_c 61.29 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 4Z31 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 4 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1 21 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details hexameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 6 _pdbx_struct_assembly.details software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 3 G N N ? 3 H N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order hydrog WATSON-CRICK hydrog1 C N3 U 2 C U 2 1_555 D N1 A 14 D A 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog2 C O4 U 2 C U 2 1_555 D N6 A 14 D A 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 C N1 G 3 C G 3 1_555 D N3 C 13 D C 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 C N2 G 3 C G 3 1_555 D O2 C 13 D C 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 C O6 G 3 C G 3 1_555 D N4 C 13 D C 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 C N3 U 4 C U 4 1_555 D N1 A 12 D A 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 C O4 U 4 C U 4 1_555 D N6 A 12 D A 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 C N3 U 5 C U 5 1_555 D N1 A 11 D A 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 C O4 U 5 C U 5 1_555 D N6 A 11 D A 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 C N3 C 6 C C 6 1_555 D N1 G 10 D G 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 C N4 C 6 C C 6 1_555 D O6 G 10 D G 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 C O2 C 6 C C 6 1_555 D N2 G 10 D G 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_16_PAIR hydrog13 C N3 U 7 C U 7 1_555 D O4 U 9 D U 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_16_PAIR hydrog14 C O2 U 7 C U 7 1_555 D N3 U 9 D U 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'U-U MISPAIR' hydrog15 C N3 U 9 C U 9 1_555 D O2 U 7 D U 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 C N1 G 10 C G 10 1_555 D N3 C 6 D C 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 C N2 G 10 C G 10 1_555 D O2 C 6 D C 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 C O6 G 10 C G 10 1_555 D N4 C 6 D C 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog19 C N1 A 11 C A 11 1_555 D N3 U 5 D U 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog20 C N6 A 11 C A 11 1_555 D O4 U 5 D U 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog21 C N1 A 12 C A 12 1_555 D N3 U 4 D U 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog22 C N6 A 12 C A 12 1_555 D O4 U 4 D U 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog23 C N3 C 13 C C 13 1_555 D N1 G 3 D G 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 C N4 C 13 C C 13 1_555 D O6 G 3 D G 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog25 C O2 C 13 C C 13 1_555 D N2 G 3 D G 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog26 C N1 A 14 C A 14 1_555 D N3 U 2 D U 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog27 C N6 A 14 C A 14 1_555 D O4 U 2 D U 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'C-A MISPAIR' hydrog28 C N3 C 15 C C 15 1_555 D N6 A 1 D A 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'C-A MISPAIR' hydrog29 C O2 C 15 C C 15 1_555 D N6 A 1 D A 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'A-C MISPAIR' hydrog30 E N6 A 1 E A 1 1_555 E N3 C 15 E C 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'A-C MISPAIR' hydrog31 E N6 A 1 E A 1 1_555 E O2 C 15 E C 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog32 E N3 U 2 E U 2 1_555 E N1 A 14 E A 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog33 E O4 U 2 E U 2 1_555 E N6 A 14 E A 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog34 E N1 G 3 E G 3 1_555 E N3 C 13 E C 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog35 E N2 G 3 E G 3 1_555 E O2 C 13 E C 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog36 E O6 G 3 E G 3 1_555 E N4 C 13 E C 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog37 E N3 U 4 E U 4 1_555 E N1 A 12 E A 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog38 E O4 U 4 E U 4 1_555 E N6 A 12 E A 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog39 E N3 U 5 E U 5 1_555 E N1 A 11 E A 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog40 E O4 U 5 E U 5 1_555 E N6 A 11 E A 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog41 E N3 C 6 E C 6 1_555 E N1 G 10 E G 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog42 E N4 C 6 E C 6 1_555 E O6 G 10 E G 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog43 E O2 C 6 E C 6 1_555 E N2 G 10 E G 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'A-C MISPAIR' hydrog44 F N6 A 1 F A 1 1_555 F N3 C 15 F C 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'A-C MISPAIR' hydrog45 F N6 A 1 F A 1 1_555 F O2 C 15 F C 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog46 F N3 U 2 F U 2 1_555 F N1 A 14 F A 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog47 F O4 U 2 F U 2 1_555 F N6 A 14 F A 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog48 F N1 G 3 F G 3 1_555 F N3 C 13 F C 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog49 F N2 G 3 F G 3 1_555 F O2 C 13 F C 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog50 F O6 G 3 F G 3 1_555 F N4 C 13 F C 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog51 F N3 U 4 F U 4 1_555 F N1 A 12 F A 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog52 F O4 U 4 F U 4 1_555 F N6 A 12 F A 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog53 F N3 U 5 F U 5 1_555 F N1 A 11 F A 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog54 F O4 U 5 F U 5 1_555 F N6 A 11 F A 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog55 F N3 C 6 F C 6 1_555 F N1 G 10 F G 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog56 F N4 C 6 F C 6 1_555 F O6 G 10 F G 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog57 F O2 C 6 F C 6 1_555 F N2 G 10 F G 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula ? _chem_comp.formula_weight ? _chem_comp.id UNX _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'UNKNOWN ATOM OR ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 4Z31 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.016584 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.007426 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.005723 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.017877 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code G 3 UNX A 1 1000 1000 UNX UNX . H 3 UNX A 1 1001 1001 UNX UNX . I 4 CL B 1 501 1 CL CL . J 5 HOH A 1 1101 30 HOH HOH . J 5 HOH A 2 1102 26 HOH HOH . J 5 HOH A 3 1103 40 HOH HOH . J 5 HOH A 4 1104 27 HOH HOH . J 5 HOH A 5 1105 28 HOH HOH . J 5 HOH A 6 1106 14 HOH HOH . J 5 HOH A 7 1107 9 HOH HOH . J 5 HOH A 8 1108 33 HOH HOH . J 5 HOH A 9 1109 18 HOH HOH . J 5 HOH A 10 1110 6 HOH HOH . J 5 HOH A 11 1111 22 HOH HOH . J 5 HOH A 12 1112 12 HOH HOH . J 5 HOH A 13 1113 8 HOH HOH . J 5 HOH A 14 1114 5 HOH HOH . J 5 HOH A 15 1115 37 HOH HOH . J 5 HOH A 16 1116 29 HOH HOH . J 5 HOH A 17 1117 36 HOH HOH . J 5 HOH A 18 1118 32 HOH HOH . J 5 HOH A 19 1119 34 HOH HOH . J 5 HOH A 20 1120 20 HOH HOH . J 5 HOH A 21 1121 19 HOH HOH . J 5 HOH A 22 1122 11 HOH HOH . J 5 HOH A 23 1123 24 HOH HOH . J 5 HOH A 24 1124 1 HOH HOH . J 5 HOH A 25 1125 4 HOH HOH . J 5 HOH A 26 1126 10 HOH HOH . J 5 HOH A 27 1127 41 HOH HOH . J 5 HOH A 28 1128 25 HOH HOH . K 5 HOH B 1 601 13 HOH HOH . K 5 HOH B 2 602 42 HOH HOH . K 5 HOH B 3 603 46 HOH HOH . K 5 HOH B 4 604 16 HOH HOH . K 5 HOH B 5 605 3 HOH HOH . K 5 HOH B 6 606 43 HOH HOH . L 5 HOH D 1 101 2 HOH HOH . L 5 HOH D 2 102 7 HOH HOH . M 5 HOH E 1 101 44 HOH HOH . N 5 HOH F 1 101 38 HOH HOH . N 5 HOH F 2 102 17 HOH HOH . N 5 HOH F 3 103 39 HOH HOH . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol X _atom_site.label_atom_id UNK _atom_site.label_comp_id UNX _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id G _atom_site.label_entity_id 3 _atom_site.Cartn_x 11.022 _atom_site.Cartn_y 164.805 _atom_site.Cartn_z 1.764 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 30 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id UNK _atom_site.auth_comp_id UNX _atom_site.auth_seq_id 1000 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 11 _model_server_stats.parse_time_ms 14 _model_server_stats.create_model_time_ms 13 _model_server_stats.query_time_ms 316 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 1 #