data_4Z7Z
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_model_server_result.job_id            Blf5-6WSQcVxRm_C8YCxMQ 
_model_server_result.datetime_utc      '2025-04-11 01:39:17' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          4z7z 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"D","auth_seq_id":401}' 
#
_entry.id    4Z7Z 
#
_exptl.entry_id    4Z7Z 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              62.068 
_entity.id                          4 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            1,2-ETHANEDIOL 
_entity.pdbx_number_of_molecules    1 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
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_cell.entry_id            4Z7Z 
_cell.length_a            90.729 
_cell.length_b            53.46 
_cell.length_c            82.033 
_cell.Z_PDB               4 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 4Z7Z 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        5 
_symmetry.space_group_name_Hall    . 
_symmetry.space_group_name_H-M     'C 1 2 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    trimeric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      3 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
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_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
_struct_asym.details                        ? 
_struct_asym.entity_id                      4 
_struct_asym.id                             D 
_struct_asym.pdbx_modified                  N 
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag    N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
covale ? covale1 C O3' DA 16 D DA 16 1_555 C P ORP 17 D ORP 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.606 ? 
covale ? covale2 C O3 ORP 17 D ORP 17 1_555 C P DG 18 D DG 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.572 ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog1 B N3 DC 1 C DC 1 1_555 C N1 DG 28 D DG 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog2 B N4 DC 1 C DC 1 1_555 C O6 DG 28 D DG 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog3 B O2 DC 1 C DC 1 1_555 C N2 DG 28 D DG 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog4 B N1 DA 2 C DA 2 1_555 C N3 DT 27 D DT 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog5 B N6 DA 2 C DA 2 1_555 C O4 DT 27 D DT 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog6 B N1 DG 3 C DG 3 1_555 C N3 DC 26 D DC 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog7 B N2 DG 3 C DG 3 1_555 C O2 DC 26 D DC 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog8 B O6 DG 3 C DG 3 1_555 C N4 DC 26 D DC 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog9 B N3 DC 4 C DC 4 1_555 C N1 DG 25 D DG 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog10 B N4 DC 4 C DC 4 1_555 C O6 DG 25 D DG 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog11 B O2 DC 4 C DC 4 1_555 C N2 DG 25 D DG 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog12 B N3 DT 5 C DT 5 1_555 C N1 DA 24 D DA 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog13 B O4 DT 5 C DT 5 1_555 C N6 DA 24 D DA 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog14 B N3 DC 6 C DC 6 1_555 C N1 DG 23 D DG 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog15 B N4 DC 6 C DC 6 1_555 C O6 DG 23 D DG 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog16 B O2 DC 6 C DC 6 1_555 C N2 DG 23 D DG 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog17 B N3 DT 7 C DT 7 1_555 C N1 DA 22 D DA 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog18 B O4 DT 7 C DT 7 1_555 C N6 DA 22 D DA 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog19 B N1 DG 8 C DG 8 1_555 C N3 DC 21 D DC 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog20 B N2 DG 8 C DG 8 1_555 C O2 DC 21 D DC 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog21 B O6 DG 8 C DG 8 1_555 C N4 DC 21 D DC 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog22 B N3 DT 9 C DT 9 1_555 C N1 DA 20 D DA 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog23 B O4 DT 9 C DT 9 1_555 C N6 DA 20 D DA 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog24 B N1 DA 10 C DA 10 1_555 C N3 DT 19 D DT 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog25 B N6 DA 10 C DA 10 1_555 C O4 DT 19 D DT 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog26 B N3 DC 11 C DC 11 1_555 C N1 DG 18 D DG 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog27 B N4 DC 11 C DC 11 1_555 C O6 DG 18 D DG 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog28 B O2 DC 11 C DC 11 1_555 C N2 DG 18 D DG 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog29 B N3 DT 13 C DT 13 1_555 C N1 DA 16 D DA 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog30 B O4 DT 13 C DT 13 1_555 C N6 DA 16 D DA 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
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hydrog WATSON-CRICK hydrog32 B N2 DG 14 C DG 14 1_555 C O2 DC 15 D DC 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog33 B O6 DG 14 C DG 14 1_555 C N4 DC 15 D DC 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog34 B N1 DA 15 C DA 15 1_555 C N3 DT 14 D DT 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog35 B N6 DA 15 C DA 15 1_555 C O4 DT 14 D DT 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog36 B N1 DG 16 C DG 16 1_555 C N3 DC 13 D DC 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog37 B N2 DG 16 C DG 16 1_555 C O2 DC 13 D DC 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog38 B O6 DG 16 C DG 16 1_555 C N4 DC 13 D DC 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog39 B N3 DC 17 C DC 17 1_555 C N1 DG 12 D DG 12 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog40 B N4 DC 17 C DC 17 1_555 C O6 DG 12 D DG 12 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog41 B O2 DC 17 C DC 17 1_555 C N2 DG 12 D DG 12 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog42 B N1 DG 18 C DG 18 1_555 C N3 DC 11 D DC 11 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog43 B N2 DG 18 C DG 18 1_555 C O2 DC 11 D DC 11 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog44 B O6 DG 18 C DG 18 1_555 C N4 DC 11 D DC 11 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog45 B N1 DA 19 C DA 19 1_555 C N3 DT 10 D DT 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog46 B N6 DA 19 C DA 19 1_555 C O4 DT 10 D DT 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog47 B N3 DT 20 C DT 20 1_555 C N1 DA 9 D DA 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog48 B O4 DT 20 C DT 20 1_555 C N6 DA 9 D DA 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog49 B N1 DG 21 C DG 21 1_555 C N3 DC 8 D DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog50 B N2 DG 21 C DG 21 1_555 C O2 DC 8 D DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog51 B O6 DG 21 C DG 21 1_555 C N4 DC 8 D DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog52 B N1 DG 22 C DG 22 1_555 C N3 DC 7 D DC 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog53 B N2 DG 22 C DG 22 1_555 C O2 DC 7 D DC 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog54 B O6 DG 22 C DG 22 1_555 C N4 DC 7 D DC 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog55 B N1 DA 23 C DA 23 1_555 C N3 DT 6 D DT 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog56 B N6 DA 23 C DA 23 1_555 C O4 DT 6 D DT 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog57 B N3 DC 24 C DC 24 1_555 C N1 DG 5 D DG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog58 B N4 DC 24 C DC 24 1_555 C O6 DG 5 D DG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog59 B O2 DC 24 C DC 24 1_555 C N2 DG 5 D DG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog60 B N1 DA 25 C DA 25 1_555 C N3 DT 4 D DT 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog61 B N6 DA 25 C DA 25 1_555 C O4 DT 4 D DT 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog62 B N1 DG 26 C DG 26 1_555 C N3 DC 3 D DC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog63 B N2 DG 26 C DG 26 1_555 C O2 DC 3 D DC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog64 B O6 DG 26 C DG 26 1_555 C N4 DC 3 D DC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog65 B N3 DC 27 C DC 27 1_555 C N1 DG 2 D DG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog66 B N4 DC 27 C DC 27 1_555 C O6 DG 2 D DG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog67 B O2 DC 27 C DC 27 1_555 C N2 DG 2 D DG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog68 B N3 DT 28 C DT 28 1_555 C N1 DA 1 D DA 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog69 B O4 DT 28 C DT 28 1_555 C N6 DA 1 D DA 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
#
_chem_comp.formula           'C2 H6 O2' 
_chem_comp.formula_weight    62.068 
_chem_comp.id                EDO 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              1,2-ETHANEDIOL 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     'ETHYLENE GLYCOL' 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
C1 O1 EDO sing 239 n n 
C1 C2 EDO sing 240 n n 
C1 H11 EDO sing 241 n n 
C1 H12 EDO sing 242 n n 
O1 HO1 EDO sing 243 n n 
C2 O2 EDO sing 244 n n 
C2 H21 EDO sing 245 n n 
C2 H22 EDO sing 246 n n 
O2 HO2 EDO sing 247 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     4Z7Z 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.011022 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.001069 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.018706 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.012247 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
D 4 EDO A 1 401 2 EDO EDO . 
E 5 ACY A 1 402 1 ACY ACY . 
F 6 HOH A 1 501 20 HOH HOH . 
F 6 HOH A 2 502 11 HOH HOH . 
F 6 HOH A 3 503 16 HOH HOH . 
F 6 HOH A 4 504 21 HOH HOH . 
F 6 HOH A 5 505 90 HOH HOH . 
F 6 HOH A 6 506 26 HOH HOH . 
F 6 HOH A 7 507 293 HOH HOH . 
F 6 HOH A 8 508 48 HOH HOH . 
F 6 HOH A 9 509 72 HOH HOH . 
F 6 HOH A 10 510 102 HOH HOH . 
F 6 HOH A 11 511 100 HOH HOH . 
F 6 HOH A 12 512 37 HOH HOH . 
F 6 HOH A 13 513 13 HOH HOH . 
F 6 HOH A 14 514 94 HOH HOH . 
F 6 HOH A 15 515 27 HOH HOH . 
F 6 HOH A 16 516 69 HOH HOH . 
F 6 HOH A 17 517 58 HOH HOH . 
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F 6 HOH A 19 519 247 HOH HOH . 
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