data_4ZMX # _model_server_result.job_id teDZSjwALClsHCMW5PvJbQ _model_server_result.datetime_utc '2024-10-19 08:36:26' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 4zmx # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"G","auth_seq_id":302}' # _entry.id 4ZMX # _exptl.entry_id 4ZMX _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 40.078 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CALCIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 6 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 120 _cell.entry_id 4ZMX _cell.length_a 181.46 _cell.length_b 181.46 _cell.length_c 40.73 _cell.Z_PDB 12 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 4ZMX _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 173 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 63' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 C N N ? 2 D N N ? 2 E N N ? 2 F N N ? 2 G N N ? 2 H N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OE1 GLU 11 A GLU 11 1_555 C CA CA . A CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.343 ? metalc ? metalc2 A OE2 GLU 11 A GLU 11 1_555 D CA CA . A CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.354 ? metalc ? metalc3 A OD1 ASP 67 A ASP 67 1_555 C CA CA . A CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.202 ? metalc ? metalc4 A OE1 GLU 69 A GLU 69 1_555 C CA CA . A CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.343 ? metalc ? metalc5 A OE2 GLU 69 A GLU 69 1_555 D CA CA . A CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.257 ? metalc ? metalc6 A OD1 ASP 100 A ASP 100 1_555 D CA CA . A CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.305 ? metalc ? metalc7 A O GLN 101 A GLN 101 1_555 D CA CA . A CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.387 ? metalc ? metalc8 A OD1 ASN 102 A ASN 102 1_555 E CA CA . A CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.309 ? metalc ? metalc9 A OD2 ASP 103 A ASP 103 1_555 C CA CA . A CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.289 ? metalc ? metalc10 A OD1 ASP 103 A ASP 103 1_555 D CA CA . A CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.44 ? metalc ? metalc11 A O HIS 104 A HIS 104 1_555 E CA CA . A CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.263 ? metalc ? metalc12 A OD1 ASP 134 A ASP 134 1_555 E CA CA . A CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.589 ? metalc ? metalc13 A OD2 ASP 134 A ASP 134 1_555 E CA CA . A CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.433 ? metalc ? metalc14 A OD1 ASP 136 A ASP 136 1_555 D CA CA . A CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.353 ? metalc ? metalc15 A OD2 ASP 136 A ASP 136 1_555 E CA CA . A CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.311 ? metalc ? metalc16 A O ASN 143 A ASN 143 1_555 E CA CA . A CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.367 ? metalc ? metalc17 A OD2 ASP 195 A ASP 195 1_555 E CA CA . A CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.513 ? metalc ? metalc18 B OE1 GLU 11 B GLU 11 1_555 F CA CA . B CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.519 ? metalc ? metalc19 B OE2 GLU 11 B GLU 11 1_555 G CA CA . B CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.45 ? metalc ? metalc20 B OD1 ASP 67 B ASP 67 1_555 F CA CA . B CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.124 ? metalc ? metalc21 B OE1 GLU 69 B GLU 69 1_555 F CA CA . B CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.425 ? metalc ? metalc22 B OE1 GLU 69 B GLU 69 1_555 G CA CA . B CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.075 ? metalc ? metalc23 B OE2 GLU 69 B GLU 69 1_555 G CA CA . B CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.373 ? metalc ? metalc24 B OD1 ASP 100 B ASP 100 1_555 G CA CA . B CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.187 ? metalc ? metalc25 B O GLN 101 B GLN 101 1_555 G CA CA . B CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.347 ? metalc ? metalc26 B OD1 ASN 102 B ASN 102 1_555 H CA CA . B CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.284 ? metalc ? metalc27 B OD2 ASP 103 B ASP 103 1_555 F CA CA . B CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.196 ? metalc ? metalc28 B OD1 ASP 103 B ASP 103 1_555 G CA CA . B CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.263 ? metalc ? metalc29 B O HIS 104 B HIS 104 1_555 H CA CA . B CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.247 ? metalc ? metalc30 B OD1 ASP 134 B ASP 134 1_555 H CA CA . B CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.672 ? metalc ? metalc31 B OD2 ASP 134 B ASP 134 1_555 H CA CA . B CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.299 ? metalc ? metalc32 B OD1 ASP 136 B ASP 136 1_555 G CA CA . B CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.443 ? metalc ? metalc33 B OD2 ASP 136 B ASP 136 1_555 H CA CA . B CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.369 ? metalc ? metalc34 B O ASN 143 B ASN 143 1_555 H CA CA . B CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.466 ? metalc ? metalc35 B OD2 ASP 195 B ASP 195 1_555 H CA CA . B CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.329 ? # _chem_comp.formula 'Ca 2' _chem_comp.formula_weight 40.078 _chem_comp.id CA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CALCIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 4ZMX _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.005511 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.003182 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.006363 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.024552 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 2 CA A 1 301 1 CA CA . D 2 CA A 1 302 2 CA CA . E 2 CA A 1 303 3 CA CA . F 2 CA B 1 301 11 CA CA . G 2 CA B 1 302 12 CA CA . H 2 CA B 1 303 13 CA CA . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CA _atom_site.label_atom_id CA _atom_site.label_comp_id CA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id G _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x 62.45 _atom_site.Cartn_y 7.167 _atom_site.Cartn_z 2.134 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 41.58 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CA _atom_site.auth_comp_id CA _atom_site.auth_seq_id 302 _atom_site.auth_asym_id B _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 14 _model_server_stats.parse_time_ms 21 _model_server_stats.create_model_time_ms 16 _model_server_stats.query_time_ms 264 _model_server_stats.encode_time_ms 8 _model_server_stats.element_count 1 #