data_4ZPS # _model_server_result.job_id baAP27l7eIK9zPw93tJIFA _model_server_result.datetime_utc '2025-09-07 11:27:49' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 4zps # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"H","auth_seq_id":807}' # _entry.id 4ZPS # _exptl.entry_id 4ZPS _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 40.078 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CALCIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 7 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 4ZPS _cell.length_a 64.06 _cell.length_b 78.12 _cell.length_c 167.73 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 4ZPS _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 24 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'I 21 21 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details monomeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 3 D N N ? 3 E N N ? 3 F N N ? 3 G N N ? 3 H N N ? 3 I N N ? 3 J N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 67 A CYS 67 1_555 A SG CYS 73 A CYS 73 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 283 A CYS 283 1_555 A SG CYS 283 A CYS 283 7_556 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? covale ? covale1 A OG SER 194 A SER 194 1_555 B C1 MAN . A MAN 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale2 A OG1 THR 196 A THR 196 1_555 C C1 MAN . A MAN 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.43 ? metalc ? metalc1 A OE2 GLU 8 A GLU 8 1_555 H CA CA . A CA 807 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.373 ? metalc ? metalc2 A OE1 GLU 8 A GLU 8 1_555 I CA CA . A CA 808 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.003 ? metalc ? metalc3 A OE2 GLU 8 A GLU 8 1_555 I CA CA . A CA 808 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.519 ? metalc ? metalc4 A OD1 ASP 62 A ASP 62 1_555 I CA CA . A CA 808 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.441 ? metalc ? metalc5 A OE2 GLU 64 A GLU 64 1_555 H CA CA . A CA 807 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.453 ? metalc ? metalc6 A OE1 GLU 64 A GLU 64 1_555 I CA CA . A CA 808 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.448 ? metalc ? metalc7 A OD2 ASP 96 A ASP 96 1_555 H CA CA . A CA 807 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.401 ? metalc ? metalc8 A O ILE 97 A ILE 97 1_555 H CA CA . A CA 807 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.554 ? metalc ? metalc9 A OD1 ASN 98 A ASN 98 1_555 D CA CA . A CA 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.557 ? metalc ? metalc10 A OD1 ASP 99 A ASP 99 1_555 I CA CA . A CA 808 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.524 ? metalc ? metalc11 A OD2 ASP 99 A ASP 99 1_555 I CA CA . A CA 808 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.438 ? metalc ? metalc12 A O ASN 100 A ASN 100 1_555 D CA CA . A CA 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.484 ? metalc ? metalc13 A OE1 GLU 115 A GLU 115 1_555 E CA CA . A CA 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.877 ? metalc ? metalc14 A OE1 GLU 115 A GLU 115 1_555 G CA CA . A CA 806 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.019 ? metalc ? metalc15 A OE2 GLU 115 A GLU 115 1_555 G CA CA . A CA 806 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.048 ? metalc ? metalc16 A OD2 ASP 132 A ASP 132 1_555 D CA CA . A CA 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.892 ? metalc ? metalc17 A OD1 ASP 132 A ASP 132 1_555 H CA CA . A CA 807 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.142 ? metalc ? metalc18 A O ASN 136 A ASN 136 1_555 D CA CA . A CA 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.986 ? metalc ? metalc19 A OD1 ASP 172 A ASP 172 1_555 G CA CA . A CA 806 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.387 ? metalc ? metalc20 A OE1 GLU 174 A GLU 174 1_555 E CA CA . A CA 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.434 ? metalc ? metalc21 A OE2 GLU 174 A GLU 174 1_555 E CA CA . A CA 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.463 ? metalc ? metalc22 A OE2 GLU 174 A GLU 174 1_555 G CA CA . A CA 806 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.51 ? metalc ? metalc23 A OD2 ASP 187 A ASP 187 1_555 D CA CA . A CA 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.532 ? metalc ? metalc24 A OD1 ASP 205 A ASP 205 1_555 E CA CA . A CA 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.47 ? metalc ? metalc25 A O THR 206 A THR 206 1_555 E CA CA . A CA 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.501 ? metalc ? metalc26 A OD1 ASN 207 A ASN 207 1_555 F CA CA . A CA 805 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.683 ? metalc ? metalc27 A OD1 ASP 208 A ASP 208 1_555 E CA CA . A CA 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.922 ? metalc ? metalc28 A OD2 ASP 208 A ASP 208 1_555 G CA CA . A CA 806 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.459 ? metalc ? metalc29 A O ASN 209 A ASN 209 1_555 F CA CA . A CA 805 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.396 ? metalc ? metalc30 A OE2 GLU 224 A GLU 224 1_555 J CA CA . A CA 809 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.139 ? metalc ? metalc31 A OD1 ASP 239 A ASP 239 1_555 F CA CA . A CA 805 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.629 ? metalc ? metalc32 A OD2 ASP 239 A ASP 239 1_555 F CA CA . A CA 805 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.515 ? metalc ? metalc33 A OD1 ASP 241 A ASP 241 1_555 E CA CA . A CA 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.84 ? metalc ? metalc34 A OD2 ASP 241 A ASP 241 1_555 F CA CA . A CA 805 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.537 ? metalc ? metalc35 A O ASN 245 A ASN 245 1_555 F CA CA . A CA 805 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.463 ? metalc ? metalc36 A OD1 ASP 279 A ASP 279 1_555 J CA CA . A CA 809 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.024 ? metalc ? metalc37 A OD2 ASP 294 A ASP 294 1_555 F CA CA . A CA 805 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.604 ? metalc ? metalc38 A OD1 ASP 310 A ASP 310 1_555 J CA CA . A CA 809 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.959 ? metalc ? metalc39 A OD2 ASP 310 A ASP 310 1_555 J CA CA . A CA 809 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.467 ? metalc ? metalc40 A OD1 ASN 312 A ASN 312 1_555 J CA CA . A CA 809 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.131 ? # _chem_comp.formula 'Ca 2' _chem_comp.formula_weight 40.078 _chem_comp.id CA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CALCIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 4ZPS _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.01561 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.012801 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.005962 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 MAN A 1 801 801 MAN MAN . C 2 MAN A 1 802 802 MAN MAN . D 3 CA A 1 803 1 CA CA . E 3 CA A 1 804 2 CA CA . F 3 CA A 1 805 3 CA CA . G 3 CA A 1 806 4 CA CA . H 3 CA A 1 807 5 CA CA . I 3 CA A 1 808 6 CA CA . J 3 CA A 1 809 7 CA CA . K 4 HOH A 1 901 10 HOH HOH . K 4 HOH A 2 902 8 HOH HOH . K 4 HOH A 3 903 2 HOH HOH . K 4 HOH A 4 904 14 HOH HOH . K 4 HOH A 5 905 18 HOH HOH . K 4 HOH A 6 906 4 HOH HOH . K 4 HOH A 7 907 6 HOH HOH . K 4 HOH A 8 908 19 HOH HOH . K 4 HOH A 9 909 20 HOH HOH . K 4 HOH A 10 910 3 HOH HOH . K 4 HOH A 11 911 12 HOH HOH . K 4 HOH A 12 912 9 HOH HOH . K 4 HOH A 13 913 5 HOH HOH . K 4 HOH A 14 914 7 HOH HOH . K 4 HOH A 15 915 11 HOH HOH . K 4 HOH A 16 916 16 HOH HOH . K 4 HOH A 17 917 15 HOH HOH . K 4 HOH A 18 918 17 HOH HOH . K 4 HOH A 19 919 1 HOH HOH . K 4 HOH A 20 920 13 HOH HOH . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CA _atom_site.label_atom_id CA _atom_site.label_comp_id CA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id H _atom_site.label_entity_id 3 _atom_site.Cartn_x -7.232 _atom_site.Cartn_y -10.743 _atom_site.Cartn_z -2.606 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 60.56 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CA _atom_site.auth_comp_id CA _atom_site.auth_seq_id 807 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 12 _model_server_stats.parse_time_ms 11 _model_server_stats.create_model_time_ms 4 _model_server_stats.query_time_ms 310 _model_server_stats.encode_time_ms 5 _model_server_stats.element_count 1 #