data_5BUC
#
_model_server_result.job_id            HKUMMlMSBtVt2V6Lx7r4Qg 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-27 21:07:51' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          5buc 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"E","auth_seq_id":303}' 
#
_entry.id    5BUC 
#
_exptl.entry_id    5BUC 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              314.404 
_entity.id                          4 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            ETHIDIUM 
_entity.pdbx_number_of_molecules    3 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            5BUC 
_cell.length_a            56.81 
_cell.length_b            82.85 
_cell.length_c            106.43 
_cell.Z_PDB               8 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 5BUC 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        19 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 21 21 21' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    dimeric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      2 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 4 E N N 
? 4 F N N 
? 4 H N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A ND1 HIS 173 A HIS 173 1_555 C ZN ZN . A ZN 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? 
metalc ? metalc2 A ND1 HIS 177 A HIS 177 1_555 C ZN ZN . A ZN 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.06 ? 
metalc ? metalc3 A O CYS 222 A CYS 222 1_555 C ZN ZN . A ZN 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.129 ? 
metalc ? metalc4 A SG CYS 222 A CYS 222 1_555 C ZN ZN . A ZN 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.227 ? 
metalc ? metalc5 B ND1 HIS 173 B HIS 173 1_555 I ZN ZN . B ZN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? 
metalc ? metalc6 B ND1 HIS 177 B HIS 177 1_555 I ZN ZN . B ZN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.088 ? 
metalc ? metalc7 B O CYS 222 B CYS 222 1_555 I ZN ZN . B ZN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.123 ? 
metalc ? metalc8 B SG CYS 222 B CYS 222 1_555 I ZN ZN . B ZN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.277 ? 
#
_chem_comp.formula           'C21 H20 N3 1' 
_chem_comp.formula_weight    314.404 
_chem_comp.id                ET 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              ETHIDIUM 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
C1 C2 ET doub 83 n y 
C1 C13 ET sing 84 n y 
C1 H1 ET sing 85 n n 
C2 C3 ET sing 86 n y 
C2 H2 ET sing 87 n n 
C3 C4 ET doub 88 n y 
C3 N23 ET sing 89 n n 
C4 C14 ET sing 90 n y 
C4 H4 ET sing 91 n n 
N5 C6 ET doub 92 n y 
N5 C14 ET sing 93 n y 
N5 C21 ET sing 94 n n 
C6 C11 ET sing 95 n y 
C6 C15 ET sing 96 n y 
C7 C8 ET doub 97 n y 
C7 C11 ET sing 98 n y 
C7 H7 ET sing 99 n n 
C8 C9 ET sing 100 n y 
C8 N24 ET sing 101 n n 
C9 C10 ET doub 102 n y 
C9 H9 ET sing 103 n n 
C10 C12 ET sing 104 n y 
C10 H10 ET sing 105 n n 
C11 C12 ET doub 106 n y 
C12 C13 ET sing 107 n y 
C13 C14 ET doub 108 n y 
C15 C16 ET doub 109 n y 
C15 C20 ET sing 110 n y 
C16 C17 ET sing 111 n y 
C16 H16 ET sing 112 n n 
C17 C18 ET doub 113 n y 
C17 H17 ET sing 114 n n 
C18 C19 ET sing 115 n y 
C18 H18 ET sing 116 n n 
C19 C20 ET doub 117 n y 
C19 H19 ET sing 118 n n 
C20 H20 ET sing 119 n n 
C21 C22 ET sing 120 n n 
C21 H211 ET sing 121 n n 
C21 H212 ET sing 122 n n 
C22 H221 ET sing 123 n n 
C22 H222 ET sing 124 n n 
C22 H223 ET sing 125 n n 
N23 H231 ET sing 126 n n 
N23 H232 ET sing 127 n n 
N24 H241 ET sing 128 n n 
N24 H242 ET sing 129 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     5BUC 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.017603 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.01207 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.009396 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
C 2 ZN A 1 301 301 ZN ZN . 
D 3 FAD A 1 302 302 FAD FAD . 
E 4 ET A 1 303 303 ET ET . 
F 4 ET A 1 304 303 ET ET . 
G 5 SO4 A 1 305 501 SO4 SO4 . 
H 4 ET B 1 301 304 ET ET . 
I 2 ZN B 1 302 301 ZN ZN . 
J 3 FAD B 1 303 302 FAD FAD . 
K 6 HOH A 1 401 1 HOH HOH . 
K 6 HOH A 2 402 414 HOH HOH . 
K 6 HOH A 3 403 61 HOH HOH . 
K 6 HOH A 4 404 291 HOH HOH . 
K 6 HOH A 5 405 213 HOH HOH . 
K 6 HOH A 6 406 174 HOH HOH . 
K 6 HOH A 7 407 62 HOH HOH . 
K 6 HOH A 8 408 258 HOH HOH . 
K 6 HOH A 9 409 104 HOH HOH . 
K 6 HOH A 10 410 194 HOH HOH . 
K 6 HOH A 11 411 100 HOH HOH . 
K 6 HOH A 12 412 148 HOH HOH . 
K 6 HOH A 13 413 63 HOH HOH . 
K 6 HOH A 14 414 21 HOH HOH . 
K 6 HOH A 15 415 204 HOH HOH . 
K 6 HOH A 16 416 91 HOH HOH . 
K 6 HOH A 17 417 39 HOH HOH . 
K 6 HOH A 18 418 107 HOH HOH . 
K 6 HOH A 19 419 343 HOH HOH . 
K 6 HOH A 20 420 147 HOH HOH . 
K 6 HOH A 21 421 153 HOH HOH . 
K 6 HOH A 22 422 269 HOH HOH . 
K 6 HOH A 23 423 48 HOH HOH . 
K 6 HOH A 24 424 92 HOH HOH . 
K 6 HOH A 25 425 34 HOH HOH . 
K 6 HOH A 26 426 141 HOH HOH . 
K 6 HOH A 27 427 15 HOH HOH . 
K 6 HOH A 28 428 38 HOH HOH . 
K 6 HOH A 29 429 8 HOH HOH . 
K 6 HOH A 30 430 374 HOH HOH . 
K 6 HOH A 31 431 280 HOH HOH . 
K 6 HOH A 32 432 384 HOH HOH . 
K 6 HOH A 33 433 388 HOH HOH . 
K 6 HOH A 34 434 359 HOH HOH . 
K 6 HOH A 35 435 328 HOH HOH . 
K 6 HOH A 36 436 156 HOH HOH . 
K 6 HOH A 37 437 181 HOH HOH . 
K 6 HOH A 38 438 11 HOH HOH . 
K 6 HOH A 39 439 44 HOH HOH . 
K 6 HOH A 40 440 257 HOH HOH . 
K 6 HOH A 41 441 103 HOH HOH . 
K 6 HOH A 42 442 46 HOH HOH . 
K 6 HOH A 43 443 37 HOH HOH . 
K 6 HOH A 44 444 12 HOH HOH . 
K 6 HOH A 45 445 30 HOH HOH . 
K 6 HOH A 46 446 335 HOH HOH . 
K 6 HOH A 47 447 159 HOH HOH . 
K 6 HOH A 48 448 190 HOH HOH . 
K 6 HOH A 49 449 14 HOH HOH . 
K 6 HOH A 50 450 31 HOH HOH . 
K 6 HOH A 51 451 50 HOH HOH . 
K 6 HOH A 52 452 355 HOH HOH . 
K 6 HOH A 53 453 169 HOH HOH . 
K 6 HOH A 54 454 72 HOH HOH . 
K 6 HOH A 55 455 367 HOH HOH . 
K 6 HOH A 56 456 17 HOH HOH . 
K 6 HOH A 57 457 69 HOH HOH . 
K 6 HOH A 58 458 330 HOH HOH . 
K 6 HOH A 59 459 375 HOH HOH . 
K 6 HOH A 60 460 391 HOH HOH . 
K 6 HOH A 61 461 158 HOH HOH . 
K 6 HOH A 62 462 86 HOH HOH . 
K 6 HOH A 63 463 42 HOH HOH . 
K 6 HOH A 64 464 98 HOH HOH . 
K 6 HOH A 65 465 339 HOH HOH . 
K 6 HOH A 66 466 224 HOH HOH . 
K 6 HOH A 67 467 121 HOH HOH . 
K 6 HOH A 68 468 311 HOH HOH . 
K 6 HOH A 69 469 52 HOH HOH . 
K 6 HOH A 70 470 175 HOH HOH . 
K 6 HOH A 71 471 36 HOH HOH . 
K 6 HOH A 72 472 271 HOH HOH . 
K 6 HOH A 73 473 212 HOH HOH . 
K 6 HOH A 74 474 295 HOH HOH . 
K 6 HOH A 75 475 308 HOH HOH . 
K 6 HOH A 76 476 369 HOH HOH . 
K 6 HOH A 77 477 3 HOH HOH . 
K 6 HOH A 78 478 60 HOH HOH . 
K 6 HOH A 79 479 24 HOH HOH . 
K 6 HOH A 80 480 372 HOH HOH . 
K 6 HOH A 81 481 22 HOH HOH . 
K 6 HOH A 82 482 267 HOH HOH . 
K 6 HOH A 83 483 178 HOH HOH . 
K 6 HOH A 84 484 10 HOH HOH . 
K 6 HOH A 85 485 236 HOH HOH . 
K 6 HOH A 86 486 54 HOH HOH . 
K 6 HOH A 87 487 238 HOH HOH . 
K 6 HOH A 88 488 422 HOH HOH . 
K 6 HOH A 89 489 410 HOH HOH . 
K 6 HOH A 90 490 383 HOH HOH . 
K 6 HOH A 91 491 272 HOH HOH . 
K 6 HOH A 92 492 94 HOH HOH . 
K 6 HOH A 93 493 116 HOH HOH . 
K 6 HOH A 94 494 88 HOH HOH . 
K 6 HOH A 95 495 302 HOH HOH . 
K 6 HOH A 96 496 348 HOH HOH . 
K 6 HOH A 97 497 215 HOH HOH . 
K 6 HOH A 98 498 4 HOH HOH . 
K 6 HOH A 99 499 93 HOH HOH . 
K 6 HOH A 100 500 242 HOH HOH . 
K 6 HOH A 101 501 216 HOH HOH . 
K 6 HOH A 102 502 325 HOH HOH . 
K 6 HOH A 103 503 303 HOH HOH . 
K 6 HOH A 104 504 232 HOH HOH . 
K 6 HOH A 105 505 230 HOH HOH . 
K 6 HOH A 106 506 140 HOH HOH . 
K 6 HOH A 107 507 118 HOH HOH . 
K 6 HOH A 108 508 77 HOH HOH . 
K 6 HOH A 109 509 144 HOH HOH . 
K 6 HOH A 110 510 265 HOH HOH . 
K 6 HOH A 111 511 404 HOH HOH . 
K 6 HOH A 112 512 231 HOH HOH . 
K 6 HOH A 113 513 237 HOH HOH . 
K 6 HOH A 114 514 185 HOH HOH . 
K 6 HOH A 115 515 244 HOH HOH . 
K 6 HOH A 116 516 408 HOH HOH . 
K 6 HOH A 117 517 130 HOH HOH . 
K 6 HOH A 118 518 117 HOH HOH . 
K 6 HOH A 119 519 119 HOH HOH . 
K 6 HOH A 120 520 151 HOH HOH . 
K 6 HOH A 121 521 377 HOH HOH . 
K 6 HOH A 122 522 217 HOH HOH . 
K 6 HOH A 123 523 268 HOH HOH . 
K 6 HOH A 124 524 286 HOH HOH . 
K 6 HOH A 125 525 55 HOH HOH . 
K 6 HOH A 126 526 259 HOH HOH . 
K 6 HOH A 127 527 296 HOH HOH . 
K 6 HOH A 128 528 160 HOH HOH . 
K 6 HOH A 129 529 122 HOH HOH . 
K 6 HOH A 130 530 105 HOH HOH . 
K 6 HOH A 131 531 413 HOH HOH . 
K 6 HOH A 132 532 420 HOH HOH . 
K 6 HOH A 133 533 293 HOH HOH . 
K 6 HOH A 134 534 150 HOH HOH . 
K 6 HOH A 135 535 395 HOH HOH . 
K 6 HOH A 136 536 73 HOH HOH . 
K 6 HOH A 137 537 188 HOH HOH . 
K 6 HOH A 138 538 368 HOH HOH . 
K 6 HOH A 139 539 256 HOH HOH . 
K 6 HOH A 140 540 350 HOH HOH . 
K 6 HOH A 141 541 322 HOH HOH . 
K 6 HOH A 142 542 201 HOH HOH . 
K 6 HOH A 143 543 357 HOH HOH . 
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K 6 HOH A 145 545 253 HOH HOH . 
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HETATM 26 H H2 ET . . . E 4 -24.244 -10.215 12.023 1 22.48 ? H2 ET 303 A 1 
HETATM 27 H H4 ET . . . E 4 -27.646 -11.049 14.176 1 19.33 ? H4 ET 303 A 1 
HETATM 28 H H7 ET . . . E 4 -25.215 -17.041 15.642 1 21.2 ? H7 ET 303 A 1 
HETATM 29 H H9 ET . . . E 4 -21.82 -16.217 13.496 1 23.56 ? H9 ET 303 A 1 
HETATM 30 H H10 ET . . . E 4 -22.656 -14.066 12.951 1 18.93 ? H10 ET 303 A 1 
HETATM 31 H H16 ET . . . E 4 -26.937 -14.886 17.963 1 26.23 ? H16 ET 303 A 1 
HETATM 32 H H17 ET . . . E 4 -28.29 -16.406 19.168 1 31.84 ? H17 ET 303 A 1 
HETATM 33 H H18 ET . . . E 4 -29.491 -18.096 18.027 1 40.74 ? H18 ET 303 A 1 
HETATM 34 H H19 ET . . . E 4 -29.337 -18.266 15.668 1 37.71 ? H19 ET 303 A 1 
HETATM 35 H H20 ET . . . E 4 -27.982 -16.743 14.461 1 40.49 ? H20 ET 303 A 1 
HETATM 36 H H211 ET . . . E 4 -28.858 -13.873 15.657 1 30.81 ? H211 ET 303 A 1 
HETATM 37 H H212 ET . . . E 4 -28.765 -12.52 14.806 1 30.81 ? H212 ET 303 A 1 
HETATM 38 H H221 ET . . . E 4 -28.34 -11.349 16.612 1 34.68 ? H221 ET 303 A 1 
HETATM 39 H H222 ET . . . E 4 -27.136 -12.33 16.999 1 34.68 ? H222 ET 303 A 1 
HETATM 40 H H223 ET . . . E 4 -28.625 -12.669 17.477 1 34.68 ? H223 ET 303 A 1 
HETATM 41 H H231 ET . . . E 4 -27.359 -9.018 12.445 1 31.74 ? H231 ET 303 A 1 
HETATM 42 H H232 ET . . . E 4 -25.903 -8.436 12.676 1 31.74 ? H232 ET 303 A 1 
HETATM 43 H H241 ET . . . E 4 -23.265 -18.538 15.683 1 25.32 ? H241 ET 303 A 1 
HETATM 44 H H242 ET . . . E 4 -22.323 -18.501 14.408 1 25.32 ? H242 ET 303 A 1 
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