data_5C1M
#
_model_server_result.job_id            rbBG9Zo5JVuNrbieu7YoHw 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-05 00:30:32' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          5c1m 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"I","auth_seq_id":407}' 
#
_entry.id    5C1M 
#
_exptl.entry_id    5C1M 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              428.566 
_entity.id                          7 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            (2R,3S,3aR,5aR,6R,11bR,11cS)-3a-methoxy-3,14-dimethyl-2-phenyl-2,3,3a,6,7,11c-hexahydro-1H-6,11b-(epiminoethano)-3,5a-methanonaphtho[2,1-g]indol-10-ol 
_entity.pdbx_number_of_molecules    1 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            5C1M 
_cell.length_a            44.43 
_cell.length_b            144 
_cell.length_c            209.9 
_cell.Z_PDB               8 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 5C1M 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        24 
_symmetry.space_group_name_Hall    'I 2b 2c' 
_symmetry.space_group_name_H-M     'I 21 21 21' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    dimeric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      2 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
_struct_asym.details                        ? 
_struct_asym.entity_id                      7 
_struct_asym.id                             I 
_struct_asym.pdbx_modified                  N 
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag    N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 A SG CYS 89 A CYS 140 1_555 A SG CYS 166 A CYS 217 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? 
disulf ? disulf2 B SG CYS 22 B CYS 24 1_555 B SG CYS 94 B CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? 
covale ? covale1 A C LEU 5 A LEU 56 1_555 A N YCM 6 A YCM 57 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? 
covale ? covale2 A C YCM 6 A YCM 57 1_555 A N PRO 7 A PRO 58 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.342 ? 
#
_chem_comp.formula           'C28 H32 N2 O2' 
_chem_comp.formula_weight    428.566 
_chem_comp.id                VF1 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              (2R,3S,3aR,5aR,6R,11bR,11cS)-3a-methoxy-3,14-dimethyl-2-phenyl-2,3,3a,6,7,11c-hexahydro-1H-6,11b-(epiminoethano)-3,5a-methanonaphtho[2,1-g]indol-10-ol 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     BU72 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
CAA OAT VF1 sing 565 n n 
OAT CBE VF1 sing 566 n n 
CAJ CAH VF1 doub 567 n y 
CAJ CAV VF1 sing 568 n y 
CAC CBC VF1 sing 569 n n 
CBE CAF VF1 sing 570 n n 
CBE CBC VF1 sing 571 n n 
CBE CBA VF1 sing 572 n n 
CAH CAG VF1 sing 573 n y 
CAY CBC VF1 sing 574 n n 
CAY CAV VF1 sing 575 n n 
CAY NAS VF1 sing 576 n n 
CAF CAE VF1 doub 577 n n 
CBC CAR VF1 sing 578 n n 
CAV CAK VF1 doub 579 n y 
NAS CBA VF1 sing 580 n n 
CBA CBF VF1 sing 581 n n 
OAD CAU VF1 sing 582 n n 
CAG CAI VF1 doub 583 n y 
CAN CAU VF1 doub 584 n y 
CAN CAX VF1 sing 585 n y 
CAE CBD VF1 sing 586 n n 
CAU CAL VF1 sing 587 n y 
CAK CAI VF1 sing 588 n y 
CAR CBD VF1 sing 589 n n 
CBF CAX VF1 sing 590 n n 
CBF CBD VF1 sing 591 n n 
CBF CAP VF1 sing 592 n n 
CAX CAW VF1 doub 593 n y 
CBD CAZ VF1 sing 594 n n 
CAL CAM VF1 doub 595 n y 
CAP CAO VF1 sing 596 n n 
CAW CAM VF1 sing 597 n y 
CAW CAQ VF1 sing 598 n n 
CAZ CAQ VF1 sing 599 n n 
CAZ NBB VF1 sing 600 n n 
CAO NBB VF1 sing 601 n n 
NBB CAB VF1 sing 602 n n 
CAP H1 VF1 sing 603 n n 
CAP H2 VF1 sing 604 n n 
CAO H3 VF1 sing 605 n n 
CAO H4 VF1 sing 606 n n 
CAB H6 VF1 sing 607 n n 
CAB H7 VF1 sing 608 n n 
CAB H8 VF1 sing 609 n n 
CAZ H9 VF1 sing 610 n n 
CAQ H10 VF1 sing 611 n n 
CAQ H11 VF1 sing 612 n n 
CAM H12 VF1 sing 613 n n 
CAL H13 VF1 sing 614 n n 
OAD H14 VF1 sing 615 n n 
CAN H15 VF1 sing 616 n n 
CBA H16 VF1 sing 617 n n 
NAS H17 VF1 sing 618 n n 
CAA H19 VF1 sing 619 n n 
CAA H20 VF1 sing 620 n n 
CAA H21 VF1 sing 621 n n 
CAF H22 VF1 sing 622 n n 
CAE H24 VF1 sing 623 n n 
CAR H26 VF1 sing 624 n n 
CAR H27 VF1 sing 625 n n 
CAC H28 VF1 sing 626 n n 
CAC H29 VF1 sing 627 n n 
CAC H30 VF1 sing 628 n n 
CAY H31 VF1 sing 629 n n 
CAJ H32 VF1 sing 630 n n 
CAH H33 VF1 sing 631 n n 
CAG H34 VF1 sing 632 n n 
CAI H35 VF1 sing 633 n n 
CAK H36 VF1 sing 634 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     5C1M 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.022507 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.006944 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.004764 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
C 3 OLC A 1 401 402 OLC OLC . 
D 3 OLC A 1 402 403 OLC OLC . 
E 4 CLR A 1 403 404 CLR CLR . 
F 5 PO4 A 1 404 405 PO4 PO4 . 
G 6 P6G A 1 405 406 P6G P6G . 
H 6 P6G A 1 406 407 P6G P6G . 
I 7 VF1 A 1 407 601 VF1 4VO . 
J 8 HOH A 1 501 501 HOH HOH . 
J 8 HOH A 2 502 502 HOH HOH . 
J 8 HOH A 3 503 508 HOH HOH . 
J 8 HOH A 4 504 509 HOH HOH . 
J 8 HOH A 5 505 514 HOH HOH . 
J 8 HOH A 6 506 506 HOH HOH . 
J 8 HOH A 7 507 516 HOH HOH . 
J 8 HOH A 8 508 505 HOH HOH . 
J 8 HOH A 9 509 512 HOH HOH . 
J 8 HOH A 10 510 504 HOH HOH . 
J 8 HOH A 11 511 513 HOH HOH . 
J 8 HOH A 12 512 515 HOH HOH . 
J 8 HOH A 13 513 510 HOH HOH . 
J 8 HOH A 14 514 511 HOH HOH . 
J 8 HOH A 15 515 503 HOH HOH . 
J 8 HOH A 16 516 520 HOH HOH . 
J 8 HOH A 17 517 517 HOH HOH . 
J 8 HOH A 18 518 507 HOH HOH . 
J 8 HOH A 19 519 521 HOH HOH . 
J 8 HOH A 20 520 529 HOH HOH . 
J 8 HOH A 21 521 524 HOH HOH . 
J 8 HOH A 22 522 518 HOH HOH . 
J 8 HOH A 23 523 535 HOH HOH . 
J 8 HOH A 24 524 519 HOH HOH . 
J 8 HOH A 25 525 526 HOH HOH . 
J 8 HOH A 26 526 523 HOH HOH . 
J 8 HOH A 27 527 522 HOH HOH . 
J 8 HOH A 28 528 525 HOH HOH . 
J 8 HOH A 29 529 539 HOH HOH . 
J 8 HOH A 30 530 532 HOH HOH . 
J 8 HOH A 31 531 527 HOH HOH . 
J 8 HOH A 32 532 534 HOH HOH . 
J 8 HOH A 33 533 533 HOH HOH . 
J 8 HOH A 34 534 536 HOH HOH . 
J 8 HOH A 35 535 545 HOH HOH . 
J 8 HOH A 36 536 547 HOH HOH . 
J 8 HOH A 37 537 530 HOH HOH . 
J 8 HOH A 38 538 528 HOH HOH . 
J 8 HOH A 39 539 549 HOH HOH . 
J 8 HOH A 40 540 531 HOH HOH . 
J 8 HOH A 41 541 546 HOH HOH . 
J 8 HOH A 42 542 540 HOH HOH . 
J 8 HOH A 43 543 555 HOH HOH . 
J 8 HOH A 44 544 542 HOH HOH . 
J 8 HOH A 45 545 552 HOH HOH . 
J 8 HOH A 46 546 538 HOH HOH . 
J 8 HOH A 47 547 543 HOH HOH . 
J 8 HOH A 48 548 548 HOH HOH . 
J 8 HOH A 49 549 553 HOH HOH . 
J 8 HOH A 50 550 541 HOH HOH . 
J 8 HOH A 51 551 550 HOH HOH . 
J 8 HOH A 52 552 551 HOH HOH . 
J 8 HOH A 53 553 554 HOH HOH . 
J 8 HOH A 54 554 537 HOH HOH . 
J 8 HOH A 55 555 558 HOH HOH . 
J 8 HOH A 56 556 556 HOH HOH . 
J 8 HOH A 57 557 557 HOH HOH . 
J 8 HOH A 58 558 559 HOH HOH . 
J 8 HOH A 59 559 561 HOH HOH . 
J 8 HOH A 60 560 560 HOH HOH . 
J 8 HOH A 61 561 562 HOH HOH . 
J 8 HOH A 62 562 563 HOH HOH . 
J 8 HOH A 63 563 565 HOH HOH . 
J 8 HOH A 64 564 564 HOH HOH . 
J 8 HOH A 65 565 566 HOH HOH . 
J 8 HOH A 66 566 567 HOH HOH . 
J 8 HOH A 67 567 568 HOH HOH . 
K 8 HOH B 1 201 201 HOH HOH . 
K 8 HOH B 2 202 207 HOH HOH . 
K 8 HOH B 3 203 203 HOH HOH . 
K 8 HOH B 4 204 202 HOH HOH . 
K 8 HOH B 5 205 208 HOH HOH . 
K 8 HOH B 6 206 204 HOH HOH . 
K 8 HOH B 7 207 205 HOH HOH . 
K 8 HOH B 8 208 209 HOH HOH . 
K 8 HOH B 9 209 214 HOH HOH . 
K 8 HOH B 10 210 212 HOH HOH . 
K 8 HOH B 11 211 206 HOH HOH . 
K 8 HOH B 12 212 211 HOH HOH . 
K 8 HOH B 13 213 213 HOH HOH . 
K 8 HOH B 14 214 210 HOH HOH . 
K 8 HOH B 15 215 216 HOH HOH . 
K 8 HOH B 16 216 215 HOH HOH . 
K 8 HOH B 17 217 219 HOH HOH . 
K 8 HOH B 18 218 217 HOH HOH . 
K 8 HOH B 19 219 218 HOH HOH . 
K 8 HOH B 20 220 544 HOH HOH . 
K 8 HOH B 21 221 222 HOH HOH . 
K 8 HOH B 22 222 220 HOH HOH . 
K 8 HOH B 23 223 221 HOH HOH . 
K 8 HOH B 24 224 223 HOH HOH . 
K 8 HOH B 25 225 224 HOH HOH . 
K 8 HOH B 26 226 226 HOH HOH . 
K 8 HOH B 27 227 225 HOH HOH . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 C CAP VF1 . . . I 7 2.29 15.541 -57.816 1 33.88 ? CAP VF1 407 A 1 
HETATM 2 C CAO VF1 . . . I 7 1.904 15.578 -56.324 1 38.06 ? CAO VF1 407 A 1 
HETATM 3 N NBB VF1 . . . I 7 1.066 16.759 -56.069 1 37.28 ? NBB VF1 407 A 1 
HETATM 4 C CAB VF1 . . . I 7 0.683 16.848 -54.649 1 40.63 ? CAB VF1 407 A 1 
HETATM 5 C CAZ VF1 . . . I 7 -0.146 16.749 -56.925 1 34.18 ? CAZ VF1 407 A 1 
HETATM 6 C CAQ VF1 . . . I 7 -1.053 15.501 -56.684 1 41.38 ? CAQ VF1 407 A 1 
HETATM 7 C CAW VF1 . . . I 7 -0.738 14.375 -57.485 1 40 ? CAW VF1 407 A 1 
HETATM 8 C CAM VF1 . . . I 7 -1.477 13.21 -57.306 1 39.15 ? CAM VF1 407 A 1 
HETATM 9 C CAL VF1 . . . I 7 -1.21 12.087 -58.083 1 44.9 ? CAL VF1 407 A 1 
HETATM 10 C CAU VF1 . . . I 7 -0.216 12.125 -59.05 1 45.21 ? CAU VF1 407 A 1 
HETATM 11 O OAD VF1 . . . I 7 0.041 11.022 -59.809 1 37.71 ? OAD VF1 407 A 1 
HETATM 12 C CAN VF1 . . . I 7 0.515 13.291 -59.237 1 40.78 ? CAN VF1 407 A 1 
HETATM 13 C CAX VF1 . . . I 7 0.259 14.428 -58.476 1 34.42 ? CAX VF1 407 A 1 
HETATM 14 C CBF VF1 . . . I 7 1.037 15.59 -58.711 1 35.95 ? CBF VF1 407 A 1 
HETATM 15 C CBA VF1 . . . I 7 1.517 15.721 -60.173 1 34.27 ? CBA VF1 407 A 1 
HETATM 16 N NAS VF1 . . . I 7 2.861 16.363 -60.197 1 39.6 ? NAS VF1 407 A 1 
HETATM 17 C CBE VF1 . . . I 7 0.679 16.781 -60.933 1 38.05 ? CBE VF1 407 A 1 
HETATM 18 O OAT VF1 . . . I 7 0.975 16.736 -62.355 1 41.66 ? OAT VF1 407 A 1 
HETATM 19 C CAA VF1 . . . I 7 0.531 15.496 -62.92 1 43.5 ? CAA VF1 407 A 1 
HETATM 20 C CAF VF1 . . . I 7 -0.812 16.656 -60.704 1 36.03 ? CAF VF1 407 A 1 
HETATM 21 C CAE VF1 . . . I 7 -1.091 16.847 -59.236 1 30.51 ? CAE VF1 407 A 1 
HETATM 22 C CBD VF1 . . . I 7 0.21 16.816 -58.401 1 31.67 ? CBD VF1 407 A 1 
HETATM 23 C CAR VF1 . . . I 7 1.011 18.058 -58.77 1 35.44 ? CAR VF1 407 A 1 
HETATM 24 C CBC VF1 . . . I 7 1.247 18.048 -60.316 1 41.07 ? CBC VF1 407 A 1 
HETATM 25 C CAC VF1 . . . I 7 0.692 19.318 -60.986 1 39.42 ? CAC VF1 407 A 1 
HETATM 26 C CAY VF1 . . . I 7 2.678 17.731 -60.738 1 37.19 ? CAY VF1 407 A 1 
HETATM 27 C CAV VF1 . . . I 7 3.695 18.801 -60.279 1 39.36 ? CAV VF1 407 A 1 
HETATM 28 C CAJ VF1 . . . I 7 4.035 19.841 -61.14 1 42.51 ? CAJ VF1 407 A 1 
HETATM 29 C CAH VF1 . . . I 7 4.944 20.817 -60.748 1 45.93 ? CAH VF1 407 A 1 
HETATM 30 C CAG VF1 . . . I 7 5.528 20.751 -59.488 1 48.22 ? CAG VF1 407 A 1 
HETATM 31 C CAI VF1 . . . I 7 5.198 19.71 -58.626 1 43.93 ? CAI VF1 407 A 1 
HETATM 32 C CAK VF1 . . . I 7 4.288 18.737 -59.022 1 38.96 ? CAK VF1 407 A 1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              15 
_model_server_stats.parse_time_ms           11 
_model_server_stats.create_model_time_ms    3 
_model_server_stats.query_time_ms           323 
_model_server_stats.encode_time_ms          7 
_model_server_stats.element_count           32 
#