data_5CG5
#
_model_server_result.job_id            PhNLf8wR2_r2tqctOfYkrQ 
_model_server_result.datetime_utc      '2025-03-06 22:06:26' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          5cg5 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"B","auth_seq_id":401}' 
#
_entry.id    5CG5 
#
loop_
_exptl.entry_id
_exptl.method
5CG5 'X-RAY DIFFRACTION' 
5CG5 'NEUTRON DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              24.305 
_entity.id                          2 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'MAGNESIUM ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    3 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            5CG5 
_cell.length_a            111.966 
_cell.length_b            111.966 
_cell.length_c            72.754 
_cell.Z_PDB               8 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 5CG5 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        92 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 41 21 2' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    dimeric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      2 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1,2 
#
loop_
_pdbx_struct_oper_list.id
_pdbx_struct_oper_list.type
_pdbx_struct_oper_list.name
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]
1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 
2 'crystal symmetry operation' 8_554 -y,-x,-z-1/2 0 -1 0 -1 0 0 0 0 -1 0 0 -36.377 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 2 B N N 
? 2 C N N 
? 2 D N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A OD1 ASP 97 A ASP 103 1_555 B MG MG . A MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.117 ? 
metalc ? metalc2 A OD2 ASP 97 A ASP 103 1_555 C MG MG . A MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.086 ? 
metalc ? metalc3 A OD2 ASP 101 A ASP 107 1_555 B MG MG . A MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.131 ? 
metalc ? metalc4 A OD2 ASP 101 A ASP 107 1_555 C MG MG . A MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.222 ? 
metalc ? metalc5 A OD2 ASP 237 A ASP 243 1_555 D MG MG . A MG 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.185 ? 
metalc ? metalc6 E O17 RIS . A RIS 400 1_555 B MG MG . A MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.135 ? 
metalc ? metalc7 E O12 RIS . A RIS 400 1_555 C MG MG . A MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? 
metalc ? metalc8 E O17 RIS . A RIS 400 1_555 C MG MG . A MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.051 ? 
metalc ? metalc9 E O10 RIS . A RIS 400 1_555 D MG MG . A MG 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.949 ? 
metalc ? metalc10 E O15 RIS . A RIS 400 1_555 D MG MG . A MG 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.049 ? 
metalc ? metalc11 B MG MG . A MG 401 1_555 F O DOD . A DOD 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.085 ? 
metalc ? metalc12 B MG MG . A MG 401 1_555 F O DOD . A DOD 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.124 ? 
metalc ? metalc13 B MG MG . A MG 401 1_555 F O DOD . A DOD 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? 
metalc ? metalc14 C MG MG . A MG 402 1_555 F O DOD . A DOD 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.08 ? 
metalc ? metalc15 C MG MG . A MG 402 1_555 F O DOD . A DOD 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.113 ? 
metalc ? metalc16 D MG MG . A MG 403 1_555 F O DOD . A DOD 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? 
metalc ? metalc17 D MG MG . A MG 403 1_555 F O DOD . A DOD 507 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.181 ? 
metalc ? metalc18 D MG MG . A MG 403 1_555 F O DOD . A DOD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.165 ? 
#
_chem_comp.formula           'Mg 2' 
_chem_comp.formula_weight    24.305 
_chem_comp.id                MG 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'MAGNESIUM ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     5CG5 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.008931 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.008931 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.013745 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
B 2 MG A 1 401 401 MG MG . 
C 2 MG A 1 402 402 MG MG . 
D 2 MG A 1 403 403 MG MG . 
E 3 RIS A 1 400 400 RIS DRG . 
F 4 DOD A 1 501 501 DOD DOD . 
F 4 DOD A 2 502 502 DOD DOD . 
F 4 DOD A 3 503 503 DOD DOD . 
F 4 DOD A 4 504 504 DOD DOD . 
F 4 DOD A 5 505 505 DOD DOD . 
F 4 DOD A 6 506 506 DOD DOD . 
F 4 DOD A 7 507 507 DOD DOD . 
F 4 DOD A 8 508 508 DOD DOD . 
F 4 DOD A 9 509 509 DOD DOD . 
F 4 DOD A 10 510 510 DOD DOD . 
F 4 DOD A 11 511 511 DOD DOD . 
F 4 DOD A 12 512 512 DOD DOD . 
F 4 DOD A 13 513 513 DOD DOD . 
F 4 DOD A 14 514 514 DOD DOD . 
F 4 DOD A 15 515 515 DOD DOD . 
F 4 DOD A 16 516 516 DOD DOD . 
F 4 DOD A 17 517 517 DOD DOD . 
F 4 DOD A 18 518 518 DOD DOD . 
F 4 DOD A 19 519 519 DOD DOD . 
F 4 DOD A 20 520 520 DOD DOD . 
F 4 DOD A 21 521 521 DOD DOD . 
F 4 DOD A 22 522 522 DOD DOD . 
F 4 DOD A 23 523 523 DOD DOD . 
F 4 DOD A 24 524 524 DOD DOD . 
F 4 DOD A 25 525 525 DOD DOD . 
F 4 DOD A 26 526 526 DOD DOD . 
F 4 DOD A 27 527 527 DOD DOD . 
F 4 DOD A 28 528 528 DOD DOD . 
F 4 DOD A 29 529 529 DOD DOD . 
F 4 DOD A 30 530 530 DOD DOD . 
F 4 DOD A 31 531 531 DOD DOD . 
F 4 DOD A 32 532 532 DOD DOD . 
F 4 DOD A 33 533 533 DOD DOD . 
F 4 DOD A 34 534 534 DOD DOD . 
F 4 DOD A 35 535 535 DOD DOD . 
F 4 DOD A 36 536 536 DOD DOD . 
F 4 DOD A 37 537 537 DOD DOD . 
F 4 DOD A 38 538 538 DOD DOD . 
F 4 DOD A 39 539 539 DOD DOD . 
F 4 DOD A 40 540 540 DOD DOD . 
F 4 DOD A 41 541 541 DOD DOD . 
F 4 DOD A 42 542 542 DOD DOD . 
F 4 DOD A 43 543 543 DOD DOD . 
F 4 DOD A 44 544 544 DOD DOD . 
F 4 DOD A 45 545 545 DOD DOD . 
F 4 DOD A 46 546 546 DOD DOD . 
F 4 DOD A 47 547 547 DOD DOD . 
F 4 DOD A 48 548 548 DOD DOD . 
F 4 DOD A 49 549 549 DOD DOD . 
F 4 DOD A 50 550 550 DOD DOD . 
F 4 DOD A 51 551 551 DOD DOD . 
F 4 DOD A 52 552 552 DOD DOD . 
F 4 DOD A 53 553 553 DOD DOD . 
F 4 DOD A 54 554 554 DOD DOD . 
F 4 DOD A 55 555 555 DOD DOD . 
F 4 DOD A 56 556 556 DOD DOD . 
F 4 DOD A 57 557 557 DOD DOD . 
F 4 DOD A 58 558 558 DOD DOD . 
F 4 DOD A 59 559 559 DOD DOD . 
F 4 DOD A 60 560 560 DOD DOD . 
F 4 DOD A 61 561 561 DOD DOD . 
F 4 DOD A 62 562 562 DOD DOD . 
F 4 DOD A 63 563 563 DOD DOD . 
F 4 DOD A 64 564 564 DOD DOD . 
F 4 DOD A 65 565 565 DOD DOD . 
F 4 DOD A 66 566 566 DOD DOD . 
F 4 DOD A 67 567 567 DOD DOD . 
F 4 DOD A 68 568 568 DOD DOD . 
F 4 DOD A 69 569 569 DOD DOD . 
F 4 DOD A 70 570 570 DOD DOD . 
F 4 DOD A 71 571 571 DOD DOD . 
F 4 DOD A 72 572 572 DOD DOD . 
F 4 DOD A 73 573 573 DOD DOD . 
F 4 DOD A 74 574 574 DOD DOD . 
F 4 DOD A 75 575 575 DOD DOD . 
F 4 DOD A 76 576 576 DOD DOD . 
F 4 DOD A 77 577 577 DOD DOD . 
F 4 DOD A 78 578 578 DOD DOD . 
F 4 DOD A 79 579 579 DOD DOD . 
F 4 DOD A 80 580 580 DOD DOD . 
F 4 DOD A 81 581 581 DOD DOD . 
F 4 DOD A 82 582 582 DOD DOD . 
F 4 DOD A 83 583 583 DOD DOD . 
F 4 DOD A 84 584 584 DOD DOD . 
F 4 DOD A 85 585 585 DOD DOD . 
F 4 DOD A 86 586 586 DOD DOD . 
F 4 DOD A 87 587 587 DOD DOD . 
F 4 DOD A 88 588 588 DOD DOD . 
F 4 DOD A 89 589 589 DOD DOD . 
F 4 DOD A 90 590 590 DOD DOD . 
F 4 DOD A 91 591 591 DOD DOD . 
F 4 DOD A 92 592 592 DOD DOD . 
F 4 DOD A 93 593 593 DOD DOD . 
F 4 DOD A 94 594 594 DOD DOD . 
F 4 DOD A 95 595 595 DOD DOD . 
F 4 DOD A 96 596 596 DOD DOD . 
F 4 DOD A 97 597 597 DOD DOD . 
F 4 DOD A 98 598 598 DOD DOD . 
F 4 DOD A 99 599 599 DOD DOD . 
F 4 DOD A 100 600 600 DOD DOD . 
F 4 DOD A 101 601 601 DOD DOD . 
F 4 DOD A 102 602 602 DOD DOD . 
F 4 DOD A 103 603 603 DOD DOD . 
F 4 DOD A 104 604 604 DOD DOD . 
F 4 DOD A 105 605 605 DOD DOD . 
F 4 DOD A 106 606 606 DOD DOD . 
#
_atom_site.group_PDB             HETATM 
_atom_site.id                    1 
_atom_site.type_symbol           MG 
_atom_site.label_atom_id         MG 
_atom_site.label_comp_id         MG 
_atom_site.label_seq_id          . 
_atom_site.label_alt_id          . 
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code     . 
_atom_site.label_asym_id         B 
_atom_site.label_entity_id       2 
_atom_site.Cartn_x               19.956 
_atom_site.Cartn_y               -33.041 
_atom_site.Cartn_z               -8.705 
_atom_site.occupancy             1 
_atom_site.B_iso_or_equiv        6.84 
_atom_site.pdbx_formal_charge    ? 
_atom_site.auth_atom_id          MG 
_atom_site.auth_comp_id          MG 
_atom_site.auth_seq_id           401 
_atom_site.auth_asym_id          A 
_atom_site.pdbx_PDB_model_num    1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              10 
_model_server_stats.parse_time_ms           11 
_model_server_stats.create_model_time_ms    5 
_model_server_stats.query_time_ms           274 
_model_server_stats.encode_time_ms          1 
_model_server_stats.element_count           1 
#