data_5CJX # _model_server_result.job_id MHuWy2s5aIuLGTdBtBst-A _model_server_result.datetime_utc '2024-12-01 07:07:33' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 5cjx # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"FA","auth_seq_id":1040}' # _entry.id 5CJX # _exptl.entry_id 5CJX _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 11 _entity.src_method man _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 6 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 101.6 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 5CJX _cell.length_a 117.739 _cell.length_b 195.224 _cell.length_c 119.094 _cell.Z_PDB 6 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 5CJX _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 4 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1 21 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dodecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 12 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 11 CA N N ? 11 DA N N ? 11 EA N N ? 11 FA N N ? 11 GA N N ? 11 HA N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 5 oligosaccharide 6 oligosaccharide 7 oligosaccharide 8 oligosaccharide 9 oligosaccharide 10 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 5 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 5 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 5 4 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 4 ? 5 5 3 MAN BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing 5 ? 6 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 6 ? 7 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 7 ? 7 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 8 ? 7 4 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 9 ? 7 5 4 MAN MAN C1 O1 . O2 HO2 . sing 10 ? 7 6 5 MAN MAN C1 O1 . O2 HO2 . sing 11 ? 7 7 3 MAN BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing 12 ? 7 8 7 MAN MAN C1 O1 . O6 HO6 . sing 13 ? 7 9 8 MAN MAN C1 O1 . O2 HO2 . sing 14 ? 7 10 7 MAN MAN C1 O1 . O3 HO3 . sing 15 ? 8 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 16 ? 8 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 17 ? 8 4 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 18 ? 8 5 4 MAN MAN C1 O1 . O2 HO2 . sing 19 ? 8 6 3 MAN BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing 20 ? 9 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 21 ? 9 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 22 ? 9 4 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 23 ? 10 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 24 ? 10 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 5 n M NAG 1 F 1 NAG B 1030 NAG 5 n M NAG 2 F 2 NAG B 1031 NAG 5 n M BMA 3 F 3 BMA B 1032 BMA 5 n M MAN 4 F 4 MAN B 1033 MAN 5 n M MAN 5 F 5 MAN B 1034 MAN 6 n N NAG 1 I 1 NAG G 1040 NAG 6 n N NAG 2 I 2 NAG G 1041 NAG 6 n O NAG 1 M 1 NAG G 1042 NAG 6 n O NAG 2 M 2 NAG G 1043 NAG 7 n P NAG 1 N 1 NAG G 1000 NAG 7 n P NAG 2 N 2 NAG G 1001 NAG 7 n P BMA 3 N 3 BMA G 1002 BMA 7 n P MAN 4 N 4 MAN G 1003 MAN 7 n P MAN 5 N 5 MAN G 1004 MAN 7 n P MAN 6 N 6 MAN G 1005 MAN 7 n P MAN 7 N 7 MAN G 1006 MAN 7 n P MAN 8 N 8 MAN G 1007 MAN 7 n P MAN 9 N 9 MAN G 1009 MAN 7 n P MAN 10 N 10 MAN G 1008 MAN 8 n Q NAG 1 O 1 NAG G 1020 NAG 8 n Q NAG 2 O 2 NAG G 1021 NAG 8 n Q BMA 3 O 3 BMA G 1022 BMA 8 n Q MAN 4 O 4 MAN G 1023 MAN 8 n Q MAN 5 O 5 MAN G 1025 MAN 8 n Q MAN 6 O 6 MAN G 1024 MAN 6 n R NAG 1 P 1 NAG H 1000 NAG 6 n R NAG 2 P 2 NAG H 1001 NAG 6 n S NAG 1 Q 1 NAG J 1040 NAG 6 n S NAG 2 Q 2 NAG J 1041 NAG 9 n T NAG 1 R 1 NAG J 1030 NAG 9 n T NAG 2 R 2 NAG J 1031 NAG 9 n T BMA 3 R 3 BMA J 1032 BMA 9 n T MAN 4 R 4 MAN J 1033 MAN 7 n U NAG 1 S 1 NAG K 1000 NAG 7 n U NAG 2 S 2 NAG K 1001 NAG 7 n U BMA 3 S 3 BMA K 1002 BMA 7 n U MAN 4 S 4 MAN K 1003 MAN 7 n U MAN 5 S 5 MAN K 1004 MAN 7 n U MAN 6 S 6 MAN K 1005 MAN 7 n U MAN 7 S 7 MAN K 1006 MAN 7 n U MAN 8 S 8 MAN K 1007 MAN 7 n U MAN 9 S 9 MAN K 1009 MAN 7 n U MAN 10 S 10 MAN K 1008 MAN 10 n V NAG 1 T 1 NAG K 1041 NAG 10 n V NAG 2 T 2 NAG K 1042 NAG 10 n V BMA 3 T 3 BMA K 1043 BMA 8 n W NAG 1 U 1 NAG K 1020 NAG 8 n W NAG 2 U 2 NAG K 1021 NAG 8 n W BMA 3 U 3 BMA K 1022 BMA 8 n W MAN 4 U 4 MAN K 1023 MAN 8 n W MAN 5 U 5 MAN K 1025 MAN 8 n W MAN 6 U 6 MAN K 1024 MAN 6 n X NAG 1 V 1 NAG X 1040 NAG 6 n X NAG 2 V 2 NAG X 1041 NAG 9 n Y NAG 1 W 1 NAG X 1030 NAG 9 n Y NAG 2 W 2 NAG X 1031 NAG 9 n Y BMA 3 W 3 BMA X 1032 BMA 9 n Y MAN 4 W 4 MAN X 1033 MAN 7 n Z NAG 1 Z 1 NAG Y 1000 NAG 7 n Z NAG 2 Z 2 NAG Y 1001 NAG 7 n Z BMA 3 Z 3 BMA Y 1002 BMA 7 n Z MAN 4 Z 4 MAN Y 1003 MAN 7 n Z MAN 5 Z 5 MAN Y 1004 MAN 7 n Z MAN 6 Z 6 MAN Y 1005 MAN 7 n Z MAN 7 Z 7 MAN Y 1006 MAN 7 n Z MAN 8 Z 8 MAN Y 1007 MAN 7 n Z MAN 9 Z 9 MAN Y 1009 MAN 7 n Z MAN 10 Z 10 MAN Y 1008 MAN 10 n AA NAG 1 a 1 NAG Y 1042 NAG 10 n AA NAG 2 a 2 NAG Y 1043 NAG 10 n AA BMA 3 a 3 BMA Y 1044 BMA 5 n BA NAG 1 b 1 NAG Y 1020 NAG 5 n BA NAG 2 b 2 NAG Y 1021 NAG 5 n BA BMA 3 b 3 BMA Y 1022 BMA 5 n BA MAN 4 b 4 MAN Y 1023 MAN 5 n BA MAN 5 b 5 MAN Y 1024 MAN # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 22 A CYS 22 1_555 A SG CYS 99 A CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 159 A CYS 140 1_555 A SG CYS 215 A CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf3 B SG CYS 94 B CYS 605 1_555 F SG CYS 467 G CYS 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf4 C SG CYS 23 C CYS 23 1_555 C SG CYS 89 C CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf5 C SG CYS 135 C CYS 134 1_555 C SG CYS 195 C CYS 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf6 D SG CYS 22 D CYS 22 1_555 D SG CYS 99 D CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf7 D SG CYS 159 D CYS 140 1_555 D SG CYS 215 D CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf8 E SG CYS 23 E CYS 23 1_555 E SG CYS 89 E CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? disulf ? disulf9 E SG CYS 135 E CYS 134 1_555 E SG CYS 195 E CYS 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf10 F SG CYS 22 G CYS 54 1_555 F SG CYS 42 G CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf11 F SG CYS 87 G CYS 119 1_555 F SG CYS 173 G CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf12 F SG CYS 99 G CYS 131 1_555 F SG CYS 117 G CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf13 F SG CYS 186 G CYS 218 1_555 F SG CYS 215 G CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf14 F SG CYS 196 G CYS 228 1_555 F SG CYS 207 G CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf15 F SG CYS 345 G CYS 378 1_555 F SG CYS 411 G CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf16 F SG CYS 352 G CYS 385 1_555 F SG CYS 384 G CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf17 G SG CYS 22 H CYS 22 1_555 G SG CYS 99 H CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf18 G SG CYS 159 H CYS 140 1_555 G SG CYS 215 H CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf19 H SG CYS 94 J CYS 605 1_555 I SG CYS 467 K CYS 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf20 I SG CYS 22 K CYS 54 1_555 I SG CYS 42 K CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf21 I SG CYS 87 K CYS 119 1_555 I SG CYS 173 K CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf22 I SG CYS 94 K CYS 126 1_555 I SG CYS 164 K CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? disulf ? disulf23 I SG CYS 99 K CYS 131 1_555 I SG CYS 117 K CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf24 I SG CYS 186 K CYS 218 1_555 I SG CYS 215 K CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf25 I SG CYS 196 K CYS 228 1_555 I SG CYS 207 K CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf26 I SG CYS 264 K CYS 296 1_555 I SG CYS 298 K CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf27 I SG CYS 345 K CYS 378 1_555 I SG CYS 411 K CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf28 I SG CYS 352 K CYS 385 1_555 I SG CYS 384 K CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.048 ? disulf ? disulf29 J SG CYS 23 L CYS 23 1_555 J SG CYS 89 L CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf30 J SG CYS 135 L CYS 134 1_555 J SG CYS 195 L CYS 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf31 K SG CYS 87 X CYS 598 1_555 K SG CYS 93 X CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.081 ? disulf ? disulf32 K SG CYS 94 X CYS 605 1_555 L SG CYS 467 Y CYS 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf33 L SG CYS 22 Y CYS 54 1_555 L SG CYS 42 Y CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf34 L SG CYS 87 Y CYS 119 1_555 L SG CYS 173 Y CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf35 L SG CYS 94 Y CYS 126 1_555 L SG CYS 164 Y CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf36 L SG CYS 99 Y CYS 131 1_555 L SG CYS 117 Y CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf37 L SG CYS 186 Y CYS 218 1_555 L SG CYS 215 Y CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf38 L SG CYS 196 Y CYS 228 1_555 L SG CYS 207 Y CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf39 L SG CYS 345 Y CYS 378 1_555 L SG CYS 411 Y CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf40 L SG CYS 352 Y CYS 385 1_555 L SG CYS 384 Y CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? covale ? covale1 B ND2 ASN 100 B ASN 611 1_555 DA C1 NAG . B NAG 1040 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.458 ? covale ? covale2 B ND2 ASN 126 B ASN 637 1_555 M C1 NAG . F NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale3 F ND2 ASN 202 G ASN 234 1_555 P C1 NAG . N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale4 F ND2 ASN 230 G ASN 262 1_555 O C1 NAG . M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.43 ? covale ? covale5 F ND2 ASN 244 G ASN 276 1_555 Q C1 NAG . O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale6 F ND2 ASN 263 G ASN 295 1_555 N C1 NAG . I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? covale ? covale7 G ND2 ASN 88 H ASN 82 1_555 R C1 NAG . P NAG 1 1_555 B ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? covale ? covale8 H ND2 ASN 100 J ASN 611 1_555 EA C1 NAG . J NAG 1042 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.43 ? covale ? covale9 H ND2 ASN 107 J ASN 618 1_555 S C1 NAG . Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.43 ? covale ? covale10 H ND2 ASN 126 J ASN 637 1_555 T C1 NAG . R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.425 ? covale ? covale11 I ND2 ASN 202 K ASN 234 1_555 U C1 NAG . S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale12 I ND2 ASN 230 K ASN 262 1_555 V C1 NAG . T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale13 I ND2 ASN 244 K ASN 276 1_555 W C1 NAG . U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.43 ? covale ? covale14 I ND2 ASN 263 K ASN 295 1_555 FA C1 NAG . K NAG 1040 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale15 K ND2 ASN 100 X ASN 611 1_555 X C1 NAG . V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale16 K ND2 ASN 126 X ASN 637 1_555 Y C1 NAG . W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.425 ? covale ? covale17 L ND2 ASN 202 Y ASN 234 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale18 L ND2 ASN 230 Y ASN 262 1_555 AA C1 NAG . a NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale19 L ND2 ASN 244 Y ASN 276 1_555 BA C1 NAG . b NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale20 L ND2 ASN 263 Y ASN 295 1_555 GA C1 NAG . Y NAG 1040 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale21 L ND2 ASN 414 Y ASN 448 1_555 HA C1 NAG . Y NAG 1041 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.468 ? covale ? covale22 M O4 NAG . F NAG 1 1_555 M C1 NAG . F NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale23 M O4 NAG . F NAG 2 1_555 M C1 BMA . F BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale24 M O3 BMA . F BMA 3 1_555 M C1 MAN . F MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale25 M O6 BMA . F BMA 3 1_555 M C1 MAN . F MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale26 N O4 NAG . I NAG 1 1_555 N C1 NAG . I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.429 ? covale ? covale27 O O4 NAG . M NAG 1 1_555 O C1 NAG . M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale28 P O4 NAG . N NAG 1 1_555 P C1 NAG . N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.423 ? covale ? covale29 P O4 NAG . N NAG 2 1_555 P C1 BMA . N BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale30 P O3 BMA . N BMA 3 1_555 P C1 MAN . N MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale31 P O6 BMA . N BMA 3 1_555 P C1 MAN . N MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale32 P O2 MAN . N MAN 4 1_555 P C1 MAN . N MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale33 P O2 MAN . N MAN 5 1_555 P C1 MAN . N MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale34 P O6 MAN . N MAN 7 1_555 P C1 MAN . N MAN 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale35 P O3 MAN . N MAN 7 1_555 P C1 MAN . N MAN 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale36 P O2 MAN . N MAN 8 1_555 P C1 MAN . N MAN 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale37 Q O4 NAG . O NAG 1 1_555 Q C1 NAG . O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale38 Q O4 NAG . O NAG 2 1_555 Q C1 BMA . O BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale39 Q O3 BMA . O BMA 3 1_555 Q C1 MAN . O MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? covale ? covale40 Q O6 BMA . O BMA 3 1_555 Q C1 MAN . O MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale41 Q O2 MAN . O MAN 4 1_555 Q C1 MAN . O MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale42 R O4 NAG . P NAG 1 1_555 R C1 NAG . P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale43 S O4 NAG . Q NAG 1 1_555 S C1 NAG . Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale44 T O4 NAG . R NAG 1 1_555 T C1 NAG . R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale45 T O4 NAG . R NAG 2 1_555 T C1 BMA . R BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale46 T O3 BMA . R BMA 3 1_555 T C1 MAN . R MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale47 U O4 NAG . S NAG 1 1_555 U C1 NAG . S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.412 ? covale ? covale48 U O4 NAG . S NAG 2 1_555 U C1 BMA . S BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale49 U O3 BMA . S BMA 3 1_555 U C1 MAN . S MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale50 U O6 BMA . S BMA 3 1_555 U C1 MAN . S MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale51 U O2 MAN . S MAN 4 1_555 U C1 MAN . S MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale52 U O2 MAN . S MAN 5 1_555 U C1 MAN . S MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale53 U O6 MAN . S MAN 7 1_555 U C1 MAN . S MAN 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale54 U O3 MAN . S MAN 7 1_555 U C1 MAN . S MAN 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale55 U O2 MAN . S MAN 8 1_555 U C1 MAN . S MAN 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale56 V O4 NAG . T NAG 1 1_555 V C1 NAG . T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale57 V O4 NAG . T NAG 2 1_555 V C1 BMA . T BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale58 W O4 NAG . U NAG 1 1_555 W C1 NAG . U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.421 ? covale ? covale59 W O4 NAG . U NAG 2 1_555 W C1 BMA . U BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale60 W O3 BMA . U BMA 3 1_555 W C1 MAN . U MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale61 W O6 BMA . U BMA 3 1_555 W C1 MAN . U MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.45 ? covale ? covale62 W O2 MAN . U MAN 4 1_555 W C1 MAN . U MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale63 X O4 NAG . V NAG 1 1_555 X C1 NAG . V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? covale ? covale64 Y O4 NAG . W NAG 1 1_555 Y C1 NAG . W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale65 Y O4 NAG . W NAG 2 1_555 Y C1 BMA . W BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale66 Y O3 BMA . W BMA 3 1_555 Y C1 MAN . W MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale67 Z O4 NAG . Z NAG 1 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.424 ? covale ? covale68 Z O4 NAG . Z NAG 2 1_555 Z C1 BMA . Z BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale69 Z O3 BMA . Z BMA 3 1_555 Z C1 MAN . Z MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale70 Z O6 BMA . Z BMA 3 1_555 Z C1 MAN . Z MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale71 Z O2 MAN . Z MAN 4 1_555 Z C1 MAN . Z MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale72 Z O2 MAN . Z MAN 5 1_555 Z C1 MAN . Z MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale73 Z O6 MAN . Z MAN 7 1_555 Z C1 MAN . Z MAN 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale74 Z O3 MAN . Z MAN 7 1_555 Z C1 MAN . Z MAN 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale75 Z O2 MAN . Z MAN 8 1_555 Z C1 MAN . Z MAN 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale76 AA O4 NAG . a NAG 1 1_555 AA C1 NAG . a NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale77 AA O4 NAG . a NAG 2 1_555 AA C1 BMA . a BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale78 BA O4 NAG . b NAG 1 1_555 BA C1 NAG . b NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? covale ? covale79 BA O4 NAG . b NAG 2 1_555 BA C1 BMA . b BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale80 BA O3 BMA . b BMA 3 1_555 BA C1 MAN . b MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale81 BA O6 BMA . b BMA 3 1_555 BA C1 MAN . b MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 283 n n C1 O1 NAG sing 284 n n C1 O5 NAG sing 285 n n C1 H1 NAG sing 286 n n C2 C3 NAG sing 287 n n C2 N2 NAG sing 288 n n C2 H2 NAG sing 289 n n C3 C4 NAG sing 290 n n C3 O3 NAG sing 291 n n C3 H3 NAG sing 292 n n C4 C5 NAG sing 293 n n C4 O4 NAG sing 294 n n C4 H4 NAG sing 295 n n C5 C6 NAG sing 296 n n C5 O5 NAG sing 297 n n C5 H5 NAG sing 298 n n C6 O6 NAG sing 299 n n C6 H61 NAG sing 300 n n C6 H62 NAG sing 301 n n C7 C8 NAG sing 302 n n C7 N2 NAG sing 303 n n C7 O7 NAG doub 304 n n C8 H81 NAG sing 305 n n C8 H82 NAG sing 306 n n C8 H83 NAG sing 307 n n N2 HN2 NAG sing 308 n n O1 HO1 NAG sing 309 n n O3 HO3 NAG sing 310 n n O4 HO4 NAG sing 311 n n O6 HO6 NAG sing 312 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 5CJX _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.008493 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.001744 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.005122 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.008572 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code CA 11 NAG A 1 1000 1000 NAG NAG . DA 11 NAG B 1 1040 1040 NAG NAG . EA 11 NAG J 1 1042 1042 NAG NAG . FA 11 NAG K 1 1040 1040 NAG NAG . GA 11 NAG Y 1 1040 1040 NAG NAG . HA 11 NAG Y 1 1041 1041 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . FA 11 0.655 72.609 44.851 0.75 135.89 ? C1 NAG 1040 K 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . FA 11 0.171 73.896 44.146 0.75 155.36 ? C2 NAG 1040 K 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . FA 11 -0.993 73.593 43.191 0.75 155.72 ? C3 NAG 1040 K 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . FA 11 -0.694 72.392 42.301 0.75 151.17 ? C4 NAG 1040 K 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . FA 11 -0.222 71.22 43.147 0.75 156.71 ? C5 NAG 1040 K 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . FA 11 0.159 69.995 42.341 0.75 172.77 ? C6 NAG 1040 K 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . FA 11 -0.511 76.166 44.822 0.75 179.44 ? C7 NAG 1040 K 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . FA 11 -0.909 77.045 45.971 0.75 176.41 ? C8 NAG 1040 K 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . FA 11 -0.224 74.895 45.129 0.75 169.55 ? N2 NAG 1040 K 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . FA 11 -1.221 74.719 42.346 0.75 161.74 ? O3 NAG 1040 K 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . FA 11 -1.883 72.013 41.613 0.75 142.46 ? O4 NAG 1040 K 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . FA 11 0.938 71.612 43.885 0.75 143.47 ? O5 NAG 1040 K 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . FA 11 0.319 68.855 43.178 0.75 179.33 ? O6 NAG 1040 K 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . FA 11 -0.463 76.588 43.671 0.75 185.47 ? O7 NAG 1040 K 1 # _model_server_stats.io_time_ms 187 _model_server_stats.parse_time_ms 24 _model_server_stats.create_model_time_ms 27 _model_server_stats.query_time_ms 283 _model_server_stats.encode_time_ms 6 _model_server_stats.element_count 14 #