data_5FKD # _model_server_result.job_id 3_agxO8dXiLew1CiszLxGw _model_server_result.datetime_utc '2024-11-09 23:21:44' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 5fkd # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"B","auth_seq_id":1095}' # _entry.id 5FKD # _exptl.entry_id 5FKD _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 398.437 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description S-ADENOSYLMETHIONINE _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 5FKD _cell.length_a 61.77 _cell.length_b 61.77 _cell.length_c 153.928 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 5FKD _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 96 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 43 21 2' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1,2 # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 2 'crystal symmetry operation' 7_555 y,x,-z 0 1 0 1 0 0 0 0 -1 0 0 0 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 2 _struct_asym.id B _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OP1 G 1 A G 1 1_555 F BA BA . A BA 1099 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.74 ? metalc ? metalc2 A OP3 G 1 A G 1 1_555 F BA BA . A BA 1099 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.138 ? metalc ? metalc3 A OP2 G 1 A G 1 1_555 F BA BA . A BA 1099 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.837 ? metalc ? metalc4 A OP2 G 1 A G 1 8_555 P BA BA . A BA 1113 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.552 ? metalc ? metalc5 A N7 G 1 A G 1 8_555 P BA BA . A BA 1113 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.848 ? metalc ? metalc6 A OP2 A 10 A A 10 1_555 L BA BA . A BA 1105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.986 ? metalc ? metalc7 A O6 G 11 A G 11 1_555 C BA BA . A BA 1096 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.766 ? metalc ? metalc8 A O6 G 16 A G 16 1_555 E BA BA . A BA 1098 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.387 ? metalc ? metalc9 A N7 G 32 A G 32 1_555 K BA BA . A BA 1104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.131 ? metalc ? metalc10 A N7 G 32 A G 32 7_555 K BA BA . A BA 1104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.974 ? metalc ? metalc11 A O6 G 32 A G 32 1_555 K BA BA . A BA 1104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.634 ? metalc ? metalc12 A O6 G 43 A G 43 1_555 O BA BA . A BA 1112 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.216 ? metalc ? metalc13 A N7 G 50 A G 50 1_555 I BA BA . A BA 1102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.099 ? metalc ? metalc14 A O6 G 50 A G 50 1_555 I BA BA . A BA 1102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.784 ? metalc ? metalc15 A OP1 A 52 A A 52 1_555 I BA BA . A BA 1102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.582 ? metalc ? metalc16 A O2' U 64 A U 64 1_555 H BA BA . A BA 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.784 ? metalc ? metalc17 A O2 U 64 A U 64 1_555 H BA BA . A BA 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.578 ? metalc ? metalc18 A OP2 U 64 A U 64 1_555 L BA BA . A BA 1105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.238 ? metalc ? metalc19 A O4 U 67 A U 67 1_555 H BA BA . A BA 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.04 ? metalc ? metalc20 A N7 G 74 A G 74 1_555 J BA BA . A BA 1103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.893 ? metalc ? metalc21 A O6 G 74 A G 74 1_555 J BA BA . A BA 1103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.551 ? metalc ? metalc22 A N7 G 86 A G 86 1_555 D BA BA . A BA 1097 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.035 ? metalc ? metalc23 A O6 G 86 A G 86 1_555 D BA BA . A BA 1097 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.347 ? metalc ? metalc24 A O4 U 88 A U 88 1_555 M K K . A K 1106 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.492 ? metalc ? metalc25 B O SAM . A SAM 1095 1_555 C BA BA . A BA 1096 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.497 ? hydrog WATSON-CRICK hydrog1 A N1 G 1 A G 1 1_555 A N3 C 93 A C 93 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog2 A N2 G 1 A G 1 1_555 A O2 C 93 A C 93 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 A O6 G 1 A G 1 1_555 A N4 C 93 A C 93 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 A N1 G 2 A G 2 1_555 A N3 C 92 A C 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 A N2 G 2 A G 2 1_555 A O2 C 92 A C 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 A O6 G 2 A G 2 1_555 A N4 C 92 A C 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 A N3 C 3 A C 3 1_555 A N1 G 91 A G 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 A N4 C 3 A C 3 1_555 A O6 G 91 A G 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 A O2 C 3 A C 3 1_555 A N2 G 91 A G 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 A N3 U 4 A U 4 1_555 A N1 A 90 A A 90 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 A O4 U 4 A U 4 1_555 A N6 A 90 A A 90 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog12 A N3 U 5 A U 5 1_555 A O6 G 89 A G 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog13 A O2 U 5 A U 5 1_555 A N1 G 89 A G 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog14 A N1 A 6 A A 6 1_555 A N3 U 88 A U 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 A N6 A 6 A A 6 1_555 A O4 U 88 A U 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 A N3 U 7 A U 7 1_555 A N1 A 87 A A 87 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 A O4 U 7 A U 7 1_555 A N6 A 87 A A 87 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 A N3 C 8 A C 8 1_555 A N1 G 86 A G 86 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog19 A N4 C 8 A C 8 1_555 A O6 G 86 A G 86 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog20 A O2 C 8 A C 8 1_555 A N2 G 86 A G 86 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-C PAIR' hydrog21 A N2 G 11 A G 11 1_555 A O2 C 44 A C 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'A-G MISPAIR' hydrog22 A N3 A 12 A A 12 1_555 A N2 G 43 A G 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog23 A N1 G 13 A G 13 1_555 A N3 C 41 A C 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 A N2 G 13 A G 13 1_555 A O2 C 41 A C 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog25 A O6 G 13 A G 13 1_555 A N4 C 41 A C 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog26 A N1 G 15 A G 15 1_555 A N3 C 40 A C 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog27 A N2 G 15 A G 15 1_555 A O2 C 40 A C 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog28 A O6 G 15 A G 15 1_555 A N4 C 40 A C 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog29 A N1 G 16 A G 16 1_555 A N3 C 39 A C 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog30 A N2 G 16 A G 16 1_555 A O2 C 39 A C 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog31 A O6 G 16 A G 16 1_555 A N4 C 39 A C 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog32 A N1 G 17 A G 17 1_555 A N3 C 38 A C 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog33 A N2 G 17 A G 17 1_555 A O2 C 38 A C 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog34 A O6 G 17 A G 17 1_555 A N4 C 38 A C 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-A MISPAIR' hydrog35 A N2 G 19 A G 19 1_555 A N7 A 36 A A 36 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_11_PAIR hydrog36 A N6 A 20 A A 20 1_555 A N3 G 35 A G 35 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_11_PAIR hydrog37 A N7 A 20 A A 20 1_555 A N2 G 35 A G 35 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog38 A N1 G 21 A G 21 1_555 A N3 C 31 A C 31 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog39 A N2 G 21 A G 21 1_555 A O2 C 31 A C 31 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog40 A O6 G 21 A G 21 1_555 A N4 C 31 A C 31 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog41 A N3 C 22 A C 22 1_555 A N1 G 30 A G 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog42 A N4 C 22 A C 22 1_555 A O6 G 30 A G 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog43 A O2 C 22 A C 22 1_555 A N2 G 30 A G 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog44 A N1 G 23 A G 23 1_555 A N3 C 29 A C 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog45 A N2 G 23 A G 23 1_555 A O2 C 29 A C 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog46 A O6 G 23 A G 23 1_555 A N4 C 29 A C 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'A-A MISPAIR' hydrog47 A N6 A 24 A A 24 1_555 A N3 A 85 A A 85 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog48 A N3 C 25 A C 25 1_555 A N1 G 68 A G 68 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog49 A N4 C 25 A C 25 1_555 A O6 G 68 A G 68 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog50 A O2 C 25 A C 25 1_555 A N2 G 68 A G 68 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_16_PAIR hydrog51 A N3 U 26 A U 26 1_555 A O2 U 67 A U 67 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_16_PAIR hydrog52 A O4 U 26 A U 26 1_555 A N3 U 67 A U 67 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog53 A N1 G 27 A G 27 1_555 A N3 C 66 A C 66 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog54 A N2 G 27 A G 27 1_555 A O2 C 66 A C 66 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog55 A O6 G 27 A G 27 1_555 A N4 C 66 A C 66 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog56 A N1 G 28 A G 28 1_555 A N3 C 65 A C 65 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog57 A N2 G 28 A G 28 1_555 A O2 C 65 A C 65 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog58 A O6 G 28 A G 28 1_555 A N4 C 65 A C 65 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-A MISPAIR' hydrog59 A N3 G 30 A G 30 1_555 A N6 A 61 A A 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-C PAIR' hydrog60 A O6 G 42 A G 42 1_555 A N4 C 60 A C 60 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog61 A N1 G 43 A G 43 1_555 A N3 C 59 A C 59 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog62 A N2 G 43 A G 43 1_555 A O2 C 59 A C 59 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog63 A O6 G 43 A G 43 1_555 A N4 C 59 A C 59 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog64 A N3 C 44 A C 44 1_555 A N1 G 58 A G 58 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog65 A N4 C 44 A C 44 1_555 A O6 G 58 A G 58 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog66 A O2 C 44 A C 44 1_555 A N2 G 58 A G 58 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'A-C MISPAIR' hydrog67 A N3 A 46 A A 46 1_555 A N4 C 48 A C 48 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog68 A N3 C 47 A C 47 1_555 A N1 G 56 A G 56 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog69 A N4 C 47 A C 47 1_555 A O6 G 56 A G 56 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog70 A O2 C 47 A C 47 1_555 A N2 G 56 A G 56 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog71 A N3 C 48 A C 48 1_555 A N1 G 55 A G 55 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog72 A N4 C 48 A C 48 1_555 A O6 G 55 A G 55 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog73 A O2 C 48 A C 48 1_555 A N2 G 55 A G 55 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog74 A N1 A 49 A A 49 1_555 A N3 U 54 A U 54 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog75 A N6 A 49 A A 49 1_555 A O4 U 54 A U 54 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-A MISPAIR' hydrog76 A N2 G 50 A G 50 1_555 A N7 A 53 A A 53 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog77 A N3 U 64 A U 64 1_555 A N1 A 85 A A 85 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog78 A O4 U 64 A U 64 1_555 A N6 A 85 A A 85 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog79 A N3 C 69 A C 69 1_555 A N1 G 82 A G 82 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog80 A N4 C 69 A C 69 1_555 A O6 G 82 A G 82 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog81 A O2 C 69 A C 69 1_555 A N2 G 82 A G 82 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog82 A N1 A 70 A A 70 1_555 A N3 U 81 A U 81 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog83 A N6 A 70 A A 70 1_555 A O4 U 81 A U 81 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog84 A N1 G 71 A G 71 1_555 A O2 U 80 A U 80 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog85 A O6 G 71 A G 71 1_555 A N3 U 80 A U 80 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog86 A N3 C 72 A C 72 1_555 A N1 G 79 A G 79 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog87 A N4 C 72 A C 72 1_555 A O6 G 79 A G 79 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog88 A O2 C 72 A C 72 1_555 A N2 G 79 A G 79 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog89 A N1 G 73 A G 73 1_555 A N3 C 78 A C 78 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog90 A N2 G 73 A G 73 1_555 A O2 C 78 A C 78 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog91 A O6 G 73 A G 73 1_555 A N4 C 78 A C 78 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'C15 H22 N6 O5 S' _chem_comp.formula_weight 398.437 _chem_comp.id SAM _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name S-ADENOSYLMETHIONINE _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag N CA SAM sing 116 n n N HN1 SAM sing 117 n n N HN2 SAM sing 118 n n CA C SAM sing 119 n n CA CB SAM sing 120 n n CA HA SAM sing 121 n n C O SAM doub 122 n n C OXT SAM sing 123 n n CB CG SAM sing 124 n n CB HB1 SAM sing 125 n n CB HB2 SAM sing 126 n n CG SD SAM sing 127 n n CG HG1 SAM sing 128 n n CG HG2 SAM sing 129 n n SD CE SAM sing 130 n n SD C5' SAM sing 131 n n CE HE1 SAM sing 132 n n CE HE2 SAM sing 133 n n CE HE3 SAM sing 134 n n C5' C4' SAM sing 135 n n C5' "H5'1" SAM sing 136 n n C5' "H5'2" SAM sing 137 n n C4' O4' SAM sing 138 n n C4' C3' SAM sing 139 n n C4' H4' SAM sing 140 n n O4' C1' SAM sing 141 n n C3' O3' SAM sing 142 n n C3' C2' SAM sing 143 n n C3' H3' SAM sing 144 n n O3' HO3' SAM sing 145 n n C2' O2' SAM sing 146 n n C2' C1' SAM sing 147 n n C2' H2' SAM sing 148 n n O2' HO2' SAM sing 149 n n C1' N9 SAM sing 150 n n C1' H1' SAM sing 151 n n N9 C8 SAM sing 152 n y N9 C4 SAM sing 153 n y C8 N7 SAM doub 154 n y C8 H8 SAM sing 155 n n N7 C5 SAM sing 156 n y C5 C6 SAM sing 157 n y C5 C4 SAM doub 158 n y C6 N6 SAM sing 159 n n C6 N1 SAM doub 160 n y N6 HN61 SAM sing 161 n n N6 HN62 SAM sing 162 n n N1 C2 SAM sing 163 n y C2 N3 SAM doub 164 n y C2 H2 SAM sing 165 n n N3 C4 SAM sing 166 n y # _atom_sites.entry_id 5FKD _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.016189 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.016189 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.006497 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 SAM A 1 1095 1095 SAM SAM . C 3 BA A 1 1096 1096 BA BA . D 3 BA A 1 1097 1097 BA BA . E 3 BA A 1 1098 1098 BA BA . F 3 BA A 1 1099 1099 BA BA . G 3 BA A 1 1100 1100 BA BA . H 3 BA A 1 1101 1101 BA BA . I 3 BA A 1 1102 1102 BA BA . J 3 BA A 1 1103 1103 BA BA . K 3 BA A 1 1104 1104 BA BA . L 3 BA A 1 1105 1105 BA BA . M 4 K A 1 1106 1106 K K . N 3 BA A 1 1111 1111 BA BA . O 3 BA A 1 1112 1112 BA BA . P 3 BA A 1 1113 1113 BA BA . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 N N SAM . . . B 2 -15.343 -2.924 27.669 1 111.38 ? N SAM 1095 A 1 HETATM 2 C CA SAM . . . B 2 -14.789 -4.058 26.932 1 128.63 ? CA SAM 1095 A 1 HETATM 3 C C SAM . . . B 2 -15.844 -4.649 26.001 1 149.28 ? C SAM 1095 A 1 HETATM 4 O O SAM . . . B 2 -15.525 -5.31 25.014 1 151.27 ? O SAM 1095 A 1 HETATM 5 O OXT SAM . . . B 2 -17.042 -4.457 26.209 1 147.69 ? OXT SAM 1095 A 1 HETATM 6 C CB SAM . . . B 2 -14.219 -5.104 27.891 1 120.85 ? CB SAM 1095 A 1 HETATM 7 C CG SAM . . . B 2 -14.847 -6.492 27.837 1 126.51 ? CG SAM 1095 A 1 HETATM 8 S SD SAM . . . B 2 -13.78 -7.707 28.648 1 108.8 ? SD SAM 1095 A 1 HETATM 9 C CE SAM . . . B 2 -14.078 -9.195 27.661 1 114.41 ? CE SAM 1095 A 1 HETATM 10 C C5' SAM . . . B 2 -14.783 -8.035 30.114 1 118 ? C5' SAM 1095 A 1 HETATM 11 C C4' SAM . . . B 2 -14.125 -7.431 31.343 1 124.68 ? C4' SAM 1095 A 1 HETATM 12 O O4' SAM . . . B 2 -13.688 -6.115 31.061 1 106.48 ? O4' SAM 1095 A 1 HETATM 13 C C3' SAM . . . B 2 -15.087 -7.323 32.51 1 96.15 ? C3' SAM 1095 A 1 HETATM 14 O O3' SAM . . . B 2 -14.878 -8.383 33.411 1 84.9 ? O3' SAM 1095 A 1 HETATM 15 C C2' SAM . . . B 2 -14.739 -6.006 33.165 1 75.98 ? C2' SAM 1095 A 1 HETATM 16 O O2' SAM . . . B 2 -14.086 -6.267 34.384 1 94.97 ? O2' SAM 1095 A 1 HETATM 17 C C1' SAM . . . B 2 -13.781 -5.303 32.216 1 65.22 ? C1' SAM 1095 A 1 HETATM 18 N N9 SAM . . . B 2 -14.265 -3.951 31.859 1 38.91 ? N9 SAM 1095 A 1 HETATM 19 C C8 SAM . . . B 2 -13.499 -2.814 31.827 1 51.24 ? C8 SAM 1095 A 1 HETATM 20 N N7 SAM . . . B 2 -14.274 -1.769 31.454 1 37.49 ? N7 SAM 1095 A 1 HETATM 21 C C5 SAM . . . B 2 -15.53 -2.221 31.246 1 36.95 ? C5 SAM 1095 A 1 HETATM 22 C C6 SAM . . . B 2 -16.701 -1.578 30.856 1 45.51 ? C6 SAM 1095 A 1 HETATM 23 N N6 SAM . . . B 2 -16.698 -0.269 30.615 1 45.93 ? N6 SAM 1095 A 1 HETATM 24 N N1 SAM . . . B 2 -17.869 -2.302 30.718 1 45.64 ? N1 SAM 1095 A 1 HETATM 25 C C2 SAM . . . B 2 -17.865 -3.659 30.968 1 55.56 ? C2 SAM 1095 A 1 HETATM 26 N N3 SAM . . . B 2 -16.697 -4.287 31.353 1 56.93 ? N3 SAM 1095 A 1 HETATM 27 C C4 SAM . . . B 2 -15.543 -3.588 31.494 1 40.29 ? C4 SAM 1095 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 9 _model_server_stats.parse_time_ms 8 _model_server_stats.create_model_time_ms 3 _model_server_stats.query_time_ms 293 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 27 #