data_5FMA
#
_model_server_result.job_id            y91w84lJUHxQDZpGupC-XQ 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-05 00:30:23' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          5fma 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"F","auth_seq_id":1295}' 
#
_entry.id    5FMA 
#
_exptl.entry_id    5FMA 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              40.078 
_entity.id                          2 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'CALCIUM ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    5 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          107.58 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            5FMA 
_cell.length_a            40.94 
_cell.length_b            86.83 
_cell.length_c            53.45 
_cell.Z_PDB               4 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 5FMA 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        4 
_symmetry.space_group_name_Hall    . 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1 21 1' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 1 
PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 2 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,C,D,E,K 1 1 
B,F,G,H,I,J,L 2 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 2 C N N 
? 2 D N N 
? 2 E N N 
? 2 F N N 
? 2 G N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 A SG CYS 4 A CYS 144 1_555 A SG CYS 15 A CYS 155 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? 
disulf ? disulf2 A SG CYS 9 A CYS 149 1_555 A SG CYS 24 A CYS 164 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? 
disulf ? disulf3 A SG CYS 26 A CYS 166 1_555 A SG CYS 35 A CYS 175 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? 
disulf ? disulf4 A SG CYS 42 A CYS 182 1_555 A SG CYS 55 A CYS 195 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? 
disulf ? disulf5 A SG CYS 49 A CYS 189 1_555 A SG CYS 64 A CYS 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? 
disulf ? disulf6 A SG CYS 66 A CYS 206 1_555 A SG CYS 75 A CYS 215 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? 
disulf ? disulf7 A SG CYS 82 A CYS 222 1_555 A SG CYS 93 A CYS 233 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? 
disulf ? disulf8 A SG CYS 87 A CYS 227 1_555 A SG CYS 103 A CYS 243 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? 
disulf ? disulf9 A SG CYS 105 A CYS 245 1_555 A SG CYS 114 A CYS 254 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? 
disulf ? disulf10 A SG CYS 121 A CYS 261 1_555 A SG CYS 132 A CYS 272 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? 
disulf ? disulf11 A SG CYS 126 A CYS 266 1_555 A SG CYS 141 A CYS 281 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? 
disulf ? disulf12 A SG CYS 143 A CYS 283 1_555 A SG CYS 152 A CYS 292 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? 
disulf ? disulf13 B SG CYS 4 B CYS 144 1_555 B SG CYS 15 B CYS 155 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? 
disulf ? disulf14 B SG CYS 9 B CYS 149 1_555 B SG CYS 24 B CYS 164 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? 
disulf ? disulf15 B SG CYS 26 B CYS 166 1_555 B SG CYS 35 B CYS 175 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? 
disulf ? disulf16 B SG CYS 42 B CYS 182 1_555 B SG CYS 55 B CYS 195 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? 
disulf ? disulf17 B SG CYS 49 B CYS 189 1_555 B SG CYS 64 B CYS 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? 
disulf ? disulf18 B SG CYS 66 B CYS 206 1_555 B SG CYS 75 B CYS 215 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? 
disulf ? disulf19 B SG CYS 105 B CYS 245 1_555 B SG CYS 114 B CYS 254 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? 
disulf ? disulf20 B SG CYS 121 B CYS 261 1_555 B SG CYS 132 B CYS 272 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? 
disulf ? disulf21 B SG CYS 126 B CYS 266 1_555 B SG CYS 141 B CYS 281 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? 
disulf ? disulf22 B SG CYS 143 B CYS 283 1_555 B SG CYS 152 B CYS 292 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? 
metalc ? metalc1 A OD2 ASP 38 A ASP 178 1_555 C CA CA . A CA 1295 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.506 ? 
metalc ? metalc2 A OD1 ASP 38 A ASP 178 1_555 C CA CA . A CA 1295 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.747 ? 
metalc ? metalc3 A O VAL 39 A VAL 179 1_555 C CA CA . A CA 1295 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.618 ? 
metalc ? metalc4 A OE1 GLU 41 A GLU 181 1_555 C CA CA . A CA 1295 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.384 ? 
metalc ? metalc5 A OD1 ASN 57 A ASN 197 1_555 C CA CA . A CA 1295 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.344 ? 
metalc ? metalc6 A O GLU 58 A GLU 198 1_555 C CA CA . A CA 1295 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.599 ? 
metalc ? metalc7 A O SER 61 A SER 201 1_555 C CA CA . A CA 1295 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.566 ? 
metalc ? metalc8 A OD1 ASN 117 A ASN 257 1_555 D CA CA . A CA 1296 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.168 ? 
metalc ? metalc9 A O ILE 118 A ILE 258 1_555 D CA CA . A CA 1296 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.219 ? 
metalc ? metalc10 A OD2 ASP 120 A ASP 260 1_555 D CA CA . A CA 1296 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.738 ? 
metalc ? metalc11 A OD2 ASP 134 A ASP 274 1_555 D CA CA . A CA 1296 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.193 ? 
metalc ? metalc12 A OD1 ASP 134 A ASP 274 1_555 D CA CA . A CA 1296 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.623 ? 
metalc ? metalc13 A O GLY 135 A GLY 275 1_555 D CA CA . A CA 1296 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.349 ? 
metalc ? metalc14 B OD2 ASP 38 B ASP 178 1_555 F CA CA . B CA 1295 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.386 ? 
metalc ? metalc15 B OD1 ASP 38 B ASP 178 1_555 F CA CA . B CA 1295 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.604 ? 
metalc ? metalc16 B O VAL 39 B VAL 179 1_555 F CA CA . B CA 1295 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.457 ? 
metalc ? metalc17 B OE1 GLU 41 B GLU 181 1_555 F CA CA . B CA 1295 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.54 ? 
metalc ? metalc18 B OD1 ASN 57 B ASN 197 1_555 F CA CA . B CA 1295 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.251 ? 
metalc ? metalc19 B O GLU 58 B GLU 198 1_555 F CA CA . B CA 1295 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.621 ? 
metalc ? metalc20 B O SER 61 B SER 201 1_555 F CA CA . B CA 1295 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.767 ? 
metalc ? metalc21 B OD1 ASN 117 B ASN 257 1_555 G CA CA . B CA 1296 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.303 ? 
metalc ? metalc22 B O ILE 118 B ILE 258 1_555 G CA CA . B CA 1296 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.281 ? 
metalc ? metalc23 B OD2 ASP 120 B ASP 260 1_555 G CA CA . B CA 1296 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.389 ? 
metalc ? metalc24 B OD2 ASP 134 B ASP 274 1_555 G CA CA . B CA 1296 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.694 ? 
metalc ? metalc25 B OD1 ASP 134 B ASP 274 1_555 G CA CA . B CA 1296 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.915 ? 
metalc ? metalc26 B O GLY 135 B GLY 275 1_555 G CA CA . B CA 1296 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.3 ? 
#
_chem_comp.formula           'Ca 2' 
_chem_comp.formula_weight    40.078 
_chem_comp.id                CA 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'CALCIUM ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     5FMA 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.024426 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.007739 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.011517 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.019626 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
C 2 CA A 1 1295 1295 CA CA . 
D 2 CA A 1 1296 1296 CA CA . 
E 2 CA A 1 1297 1297 CA CA . 
F 2 CA B 1 1295 1295 CA CA . 
G 2 CA B 1 1296 1296 CA CA . 
H 3 CL B 1 1297 1297 CL CL . 
I 4 EDO B 1 1298 1298 EDO EDO . 
J 3 CL B 1 1299 1299 CL CL . 
K 5 HOH A 1 2001 2001 HOH HOH . 
K 5 HOH A 2 2002 2002 HOH HOH . 
K 5 HOH A 3 2003 2003 HOH HOH . 
K 5 HOH A 4 2004 2004 HOH HOH . 
K 5 HOH A 5 2005 2005 HOH HOH . 
K 5 HOH A 6 2006 2006 HOH HOH . 
K 5 HOH A 7 2007 2007 HOH HOH . 
K 5 HOH A 8 2008 2008 HOH HOH . 
K 5 HOH A 9 2009 2009 HOH HOH . 
K 5 HOH A 10 2010 2010 HOH HOH . 
L 5 HOH B 1 2001 2001 HOH HOH . 
L 5 HOH B 2 2002 2002 HOH HOH . 
L 5 HOH B 3 2003 2003 HOH HOH . 
L 5 HOH B 4 2004 2004 HOH HOH . 
L 5 HOH B 5 2005 2005 HOH HOH . 
L 5 HOH B 6 2006 2006 HOH HOH . 
L 5 HOH B 7 2007 2007 HOH HOH . 
L 5 HOH B 8 2008 2008 HOH HOH . 
#
_atom_site.group_PDB             HETATM 
_atom_site.id                    1 
_atom_site.type_symbol           CA 
_atom_site.label_atom_id         CA 
_atom_site.label_comp_id         CA 
_atom_site.label_seq_id          . 
_atom_site.label_alt_id          . 
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code     . 
_atom_site.label_asym_id         F 
_atom_site.label_entity_id       2 
_atom_site.Cartn_x               12.662 
_atom_site.Cartn_y               40.119 
_atom_site.Cartn_z               69.907 
_atom_site.occupancy             1 
_atom_site.B_iso_or_equiv        46.86 
_atom_site.pdbx_formal_charge    2 
_atom_site.auth_atom_id          CA 
_atom_site.auth_comp_id          CA 
_atom_site.auth_seq_id           1295 
_atom_site.auth_asym_id          B 
_atom_site.pdbx_PDB_model_num    1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              8 
_model_server_stats.parse_time_ms           9 
_model_server_stats.create_model_time_ms    3 
_model_server_stats.query_time_ms           319 
_model_server_stats.encode_time_ms          1 
_model_server_stats.element_count           1 
#