data_5FTT # _model_server_result.job_id cqbk6Rln-snDjv7Vthemjg _model_server_result.datetime_utc '2025-09-09 23:07:26' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 5ftt # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"X","auth_seq_id":1464}' # _entry.id 5FTT # _exptl.entry_id 5FTT _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 40.078 _entity.id 6 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CALCIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 4 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 117.94 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 5FTT _cell.length_a 231.961 _cell.length_b 141.486 _cell.length_c 151.491 _cell.Z_PDB 16 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 5FTT _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 5 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'C 1 2 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details PQS _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details octameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 8 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 6 N N N ? 6 P N N ? 6 V N N ? 6 X N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 42 A CYS 73 1_555 A SG CYS 103 A CYS 134 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 54 A CYS 85 1_555 A SG CYS 101 A CYS 132 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 147 A CYS 178 1_555 A SG CYS 198 A CYS 229 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 231 A CYS 262 1_555 A SG CYS 268 A CYS 299 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 235 A CYS 266 1_555 A SG CYS 272 A CYS 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 246 A CYS 277 1_555 A SG CYS 258 A CYS 289 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf7 B SG CYS 4 B CYS 36 1_555 B SG CYS 10 B CYS 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf8 B SG CYS 8 B CYS 40 1_555 B SG CYS 17 B CYS 49 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf9 B SG CYS 282 B CYS 314 1_555 B SG CYS 307 B CYS 339 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf10 B SG CYS 284 B CYS 316 1_555 B SG CYS 328 B CYS 360 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf11 C SG CYS 15 C CYS 104 1_555 C SG CYS 45 C CYS 134 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf12 C SG CYS 24 C CYS 113 1_555 C SG CYS 102 C CYS 191 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf13 C SG CYS 57 C CYS 146 1_555 C SG CYS 89 C CYS 178 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf14 C SG CYS 70 C CYS 159 1_555 C SG CYS 76 C CYS 165 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf15 C SG CYS 114 C CYS 203 1_555 C SG CYS 296 C CYS 385 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf16 D SG CYS 114 D CYS 203 1_555 D SG CYS 296 D CYS 385 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf17 E SG CYS 42 E CYS 73 1_555 E SG CYS 103 E CYS 134 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf18 E SG CYS 54 E CYS 85 1_555 E SG CYS 101 E CYS 132 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf19 E SG CYS 147 E CYS 178 1_555 E SG CYS 198 E CYS 229 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf20 E SG CYS 231 E CYS 262 1_555 E SG CYS 268 E CYS 299 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf21 E SG CYS 235 E CYS 266 1_555 E SG CYS 272 E CYS 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf22 E SG CYS 246 E CYS 277 1_555 E SG CYS 258 E CYS 289 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf23 F SG CYS 4 F CYS 36 1_555 F SG CYS 10 F CYS 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf24 F SG CYS 8 F CYS 40 1_555 F SG CYS 17 F CYS 49 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf25 F SG CYS 282 F CYS 314 1_555 F SG CYS 307 F CYS 339 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf26 F SG CYS 284 F CYS 316 1_555 F SG CYS 328 F CYS 360 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf27 G SG CYS 15 G CYS 104 1_555 G SG CYS 45 G CYS 134 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf28 G SG CYS 24 G CYS 113 1_555 G SG CYS 102 G CYS 191 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf29 G SG CYS 57 G CYS 146 1_555 G SG CYS 89 G CYS 178 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf30 G SG CYS 70 G CYS 159 1_555 G SG CYS 76 G CYS 165 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf31 G SG CYS 114 G CYS 203 1_555 G SG CYS 296 G CYS 385 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? disulf ? disulf32 H SG CYS 114 H CYS 203 1_555 H SG CYS 296 H CYS 385 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 84 A ASN 115 1_555 I C1 NAG . A NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 195 A ASN 226 1_555 J C1 NAG . A NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale3 B ND2 ASN 170 B ASN 202 1_555 K C1 NAG . B NAG 1362 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale4 C ND2 ASN 72 C ASN 161 1_555 L C1 NAG . C NAG 1465 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale5 E ND2 ASN 84 E ASN 115 1_555 Q C1 NAG . E NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale6 E ND2 ASN 195 E ASN 226 1_555 R C1 NAG . E NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? covale ? covale7 F ND2 ASN 170 F ASN 202 1_555 S C1 NAG . F NAG 1368 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? covale ? covale8 G ND2 ASN 72 G ASN 161 1_555 T C1 NAG . G NAG 1465 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? metalc ? metalc1 C O GLY 189 C GLY 278 1_555 M NA NA . C NA 1466 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.019 ? metalc ? metalc2 C O PHE 190 C PHE 279 1_555 M NA NA . C NA 1466 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.1 ? metalc ? metalc3 C OD1 ASP 243 C ASP 332 1_555 N CA CA . C CA 1467 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.855 ? metalc ? metalc4 C OD2 ASP 243 C ASP 332 1_555 N CA CA . C CA 1467 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.776 ? metalc ? metalc5 C OD1 ASN 291 C ASN 380 1_555 N CA CA . C CA 1467 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.746 ? metalc ? metalc6 C O ALA 292 C ALA 381 1_555 N CA CA . C CA 1467 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.598 ? metalc ? metalc7 C O VAL 346 C VAL 435 1_555 N CA CA . C CA 1467 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.248 ? metalc ? metalc8 C OD2 ASP 347 C ASP 436 1_555 M NA NA . C NA 1466 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.483 ? metalc ? metalc9 C OD1 ASP 347 C ASP 436 1_555 M NA NA . C NA 1466 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.556 ? metalc ? metalc10 D O PHE 190 D PHE 279 1_555 O NA NA . D NA 1465 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.592 ? metalc ? metalc11 D OD2 ASP 243 D ASP 332 1_555 P CA CA . D CA 1466 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.319 ? metalc ? metalc12 D OD1 ASP 243 D ASP 332 1_555 P CA CA . D CA 1466 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.983 ? metalc ? metalc13 D O LEU 244 D LEU 333 1_555 O NA NA . D NA 1465 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.883 ? metalc ? metalc14 D OD1 ASN 291 D ASN 380 1_555 P CA CA . D CA 1466 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.024 ? metalc ? metalc15 D O ALA 292 D ALA 381 1_555 P CA CA . D CA 1466 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.579 ? metalc ? metalc16 D O VAL 346 D VAL 435 1_555 P CA CA . D CA 1466 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.563 ? metalc ? metalc17 D OD2 ASP 347 D ASP 436 1_555 O NA NA . D NA 1465 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.057 ? metalc ? metalc18 D OD1 ASP 347 D ASP 436 1_555 O NA NA . D NA 1465 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.795 ? metalc ? metalc19 G O THR 188 G THR 277 1_555 U NA NA . G NA 1466 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.175 ? metalc ? metalc20 G OD1 ASP 243 G ASP 332 1_555 U NA NA . G NA 1466 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.069 ? metalc ? metalc21 G OD2 ASP 243 G ASP 332 1_555 V CA CA . G CA 1467 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.369 ? metalc ? metalc22 G OD1 ASP 243 G ASP 332 1_555 V CA CA . G CA 1467 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.141 ? metalc ? metalc23 G OD1 ASN 291 G ASN 380 1_555 V CA CA . G CA 1467 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.588 ? metalc ? metalc24 G O ALA 292 G ALA 381 1_555 V CA CA . G CA 1467 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.548 ? metalc ? metalc25 G O VAL 346 G VAL 435 1_555 V CA CA . G CA 1467 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.369 ? metalc ? metalc26 G OD2 ASP 347 G ASP 436 1_555 U NA NA . G NA 1466 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.985 ? metalc ? metalc27 H O GLY 189 H GLY 278 1_555 W NA NA . H NA 1463 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.719 ? metalc ? metalc28 H O PHE 190 H PHE 279 1_555 W NA NA . H NA 1463 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.255 ? metalc ? metalc29 H OD2 ASP 243 H ASP 332 1_555 X CA CA . H CA 1464 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.559 ? metalc ? metalc30 H OD1 ASP 243 H ASP 332 1_555 X CA CA . H CA 1464 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.695 ? metalc ? metalc31 H O LEU 244 H LEU 333 1_555 W NA NA . H NA 1463 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.901 ? metalc ? metalc32 H OD1 ASN 291 H ASN 380 1_555 X CA CA . H CA 1464 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.755 ? metalc ? metalc33 H O ALA 292 H ALA 381 1_555 X CA CA . H CA 1464 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.753 ? metalc ? metalc34 H O VAL 346 H VAL 435 1_555 X CA CA . H CA 1464 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.455 ? # _chem_comp.formula 'Ca 2' _chem_comp.formula_weight 40.078 _chem_comp.id CA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CALCIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 5FTT _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.004311 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.002286 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.007068 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.007472 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code I 4 NAG A 1 1308 1308 NAG NAG . J 4 NAG A 1 1309 1309 NAG NAG . K 4 NAG B 1 1362 1362 NAG NAG . L 4 NAG C 1 1465 1465 NAG NAG . M 5 NA C 1 1466 1466 NA NA . N 6 CA C 1 1467 1467 CA CA . O 5 NA D 1 1465 1465 NA NA . P 6 CA D 1 1466 1466 CA CA . Q 4 NAG E 1 1304 1304 NAG NAG . R 4 NAG E 1 1305 1305 NAG NAG . S 4 NAG F 1 1368 1368 NAG NAG . T 4 NAG G 1 1465 1465 NAG NAG . U 5 NA G 1 1466 1466 NA NA . V 6 CA G 1 1467 1467 CA CA . W 5 NA H 1 1463 1463 NA NA . X 6 CA H 1 1464 1464 CA CA . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CA _atom_site.label_atom_id CA _atom_site.label_comp_id CA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id X _atom_site.label_entity_id 6 _atom_site.Cartn_x -24.074 _atom_site.Cartn_y 14.685 _atom_site.Cartn_z 1.611 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 196.81 _atom_site.pdbx_formal_charge 2 _atom_site.auth_atom_id CA _atom_site.auth_comp_id CA _atom_site.auth_seq_id 1464 _atom_site.auth_asym_id H _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 34 _model_server_stats.parse_time_ms 9 _model_server_stats.create_model_time_ms 17 _model_server_stats.query_time_ms 256 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 1 #