data_5GIP # _model_server_result.job_id yjfa3cjTdCGvYLLiJUB3nQ _model_server_result.datetime_utc '2025-06-18 18:22:31' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 5gip # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"W","auth_seq_id":301}' # _entry.id 5GIP # _exptl.entry_id 5GIP _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 384.411 _entity.id 6 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE _entity.pdbx_number_of_molecules 4 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 108.98 _cell.angle_beta 104.42 _cell.angle_gamma 89.86 _cell.entry_id 5GIP _cell.length_a 97.916 _cell.length_b 97.718 _cell.length_c 128.793 _cell.Z_PDB 4 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 5GIP _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id PISA decameric 10 author_and_software_defined_assembly 1 PISA decameric 10 author_and_software_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,U,V 1 1 K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,W,X 2 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 6 U N N ? 6 V N N ? 6 W N N ? 6 X N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order hydrog 'U-A PAIR' hydrog1 G O4 U 6 G U 6 1_555 H N6 A 36 H A 36 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'U-C MISPAIR' hydrog2 G O4 U 6 G U 6 1_555 H N4 C 37 H C 37 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 G N3 C 7 G C 7 1_555 H N1 G 35 H G 35 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 G N4 C 7 G C 7 1_555 H O6 G 35 H G 35 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 G O2 C 7 G C 7 1_555 H N2 G 35 H G 35 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 G N3 U 8 G U 8 1_555 H N1 A 34 H A 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 G O4 U 8 G U 8 1_555 H N6 A 34 H A 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'U-A PAIR' hydrog8 G O2 U 9 G U 9 1_555 H N6 A 34 H A 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_11_PAIR hydrog9 G N2 G 12 G G 12 1_555 H N7 A 33 H A 33 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_11_PAIR hydrog10 G N3 G 12 G G 12 1_555 H N6 A 33 H A 33 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_11_PAIR hydrog11 G N6 A 13 G A 13 1_555 H N3 G 32 H G 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_11_PAIR hydrog12 G N7 A 13 G A 13 1_555 H N2 G 32 H G 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_16_PAIR hydrog13 G N3 U 14 G U 14 1_555 H O2 U 31 H U 31 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_16_PAIR hydrog14 G O4 U 14 G U 14 1_555 H N3 U 31 H U 31 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 G N1 G 15 G G 15 1_555 H N3 C 30 H C 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 G N2 G 15 G G 15 1_555 H O2 C 30 H C 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 G O6 G 15 G G 15 1_555 H N4 C 30 H C 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'A-C MISPAIR' hydrog18 G N1 A 16 G A 16 1_555 H N4 C 30 H C 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog19 G N1 A 19 G A 19 1_555 I N3 U 10 I U 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog20 G N6 A 19 G A 19 1_555 I O4 U 10 I U 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog21 G N3 C 20 G C 20 1_555 I N1 G 9 I G 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog22 G N4 C 20 G C 20 1_555 I O6 G 9 I G 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog23 G O2 C 20 G C 20 1_555 I N2 G 9 I G 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 G N1 A 21 G A 21 1_555 I N3 U 8 I U 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog25 G N6 A 21 G A 21 1_555 I O4 U 8 I U 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog26 G N3 C 22 G C 22 1_555 I N1 G 7 I G 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog27 G N4 C 22 G C 22 1_555 I O6 G 7 I G 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog28 G O2 C 22 G C 22 1_555 I N2 G 7 I G 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog29 G N3 U 23 G U 23 1_555 I N1 A 6 I A 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog30 G O4 U 23 G U 23 1_555 I N6 A 6 I A 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog31 G N3 C 24 G C 24 1_555 I N1 G 5 I G 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog32 G N4 C 24 G C 24 1_555 I O6 G 5 I G 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog33 G O2 C 24 G C 24 1_555 I N2 G 5 I G 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog34 G N1 A 25 G A 25 1_555 I N3 U 4 I U 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog35 G N6 A 25 G A 25 1_555 I O4 U 4 I U 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog36 G N3 U 26 G U 26 1_555 I N1 A 3 I A 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog37 G O4 U 26 G U 26 1_555 I N6 A 3 I A 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog38 G N1 G 27 G G 27 1_555 I N3 C 2 I C 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog39 G N2 G 27 G G 27 1_555 I O2 C 2 I C 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog40 G O6 G 27 G G 27 1_555 I N4 C 2 I C 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog41 G N1 G 28 G G 28 1_555 I N3 C 1 I C 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog42 G N2 G 28 G G 28 1_555 I O2 C 1 I C 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog43 G O6 G 28 G G 28 1_555 I N4 C 1 I C 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog44 G N3 C 30 G C 30 1_555 H N1 G 15 H G 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog45 G N4 C 30 G C 30 1_555 H O6 G 15 H G 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog46 G O2 C 30 G C 30 1_555 H N2 G 15 H G 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_16_PAIR hydrog47 G N3 U 31 G U 31 1_555 H O4 U 14 H U 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_16_PAIR hydrog48 G O2 U 31 G U 31 1_555 H N3 U 14 H U 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_11_PAIR hydrog49 G N2 G 32 G G 32 1_555 H N7 A 13 H A 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_11_PAIR hydrog50 G N3 G 32 G G 32 1_555 H N6 A 13 H A 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_11_PAIR hydrog51 G N6 A 33 G A 33 1_555 H N3 G 12 H G 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_11_PAIR hydrog52 G N7 A 33 G A 33 1_555 H N2 G 12 H G 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog53 G N1 A 34 G A 34 1_555 H N3 U 8 H U 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog54 G N6 A 34 G A 34 1_555 H O4 U 8 H U 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog55 H N1 A 19 H A 19 1_555 J N3 U 10 J U 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog56 H N6 A 19 H A 19 1_555 J O4 U 10 J U 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog57 H N3 C 20 H C 20 1_555 J N1 G 9 J G 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog58 H N4 C 20 H C 20 1_555 J O6 G 9 J G 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog59 H O2 C 20 H C 20 1_555 J N2 G 9 J G 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog60 H N1 A 21 H A 21 1_555 J N3 U 8 J U 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog61 H N6 A 21 H A 21 1_555 J O4 U 8 J U 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog62 H N3 C 22 H C 22 1_555 J N1 G 7 J G 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog63 H N4 C 22 H C 22 1_555 J O6 G 7 J G 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog64 H O2 C 22 H C 22 1_555 J N2 G 7 J G 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog65 H N3 U 23 H U 23 1_555 J N1 A 6 J A 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog66 H O4 U 23 H U 23 1_555 J N6 A 6 J A 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog67 H N3 C 24 H C 24 1_555 J N1 G 5 J G 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog68 H N4 C 24 H C 24 1_555 J O6 G 5 J G 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog69 H O2 C 24 H C 24 1_555 J N2 G 5 J G 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog70 H N1 A 25 H A 25 1_555 J N3 U 4 J U 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog71 H N6 A 25 H A 25 1_555 J O4 U 4 J U 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog72 H N3 U 26 H U 26 1_555 J N1 A 3 J A 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog73 H O4 U 26 H U 26 1_555 J N6 A 3 J A 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog74 H N1 G 27 H G 27 1_555 J N3 C 2 J C 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog75 H N2 G 27 H G 27 1_555 J O2 C 2 J C 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog76 H O6 G 27 H G 27 1_555 J N4 C 2 J C 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog77 H N1 G 28 H G 28 1_555 J N3 C 1 J C 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog78 H N2 G 28 H G 28 1_555 J O2 C 1 J C 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog79 H O6 G 28 H G 28 1_555 J N4 C 1 J C 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog80 Q N3 C 7 Q C 7 1_555 R N1 G 35 R G 35 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog81 Q N4 C 7 Q C 7 1_555 R O6 G 35 R G 35 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog82 Q O2 C 7 Q C 7 1_555 R N2 G 35 R G 35 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog83 Q N3 U 8 Q U 8 1_555 R N1 A 34 R A 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog84 Q O4 U 8 Q U 8 1_555 R N6 A 34 R A 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_11_PAIR hydrog85 Q N2 G 12 Q G 12 1_555 R N7 A 33 R A 33 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_11_PAIR hydrog86 Q N3 G 12 Q G 12 1_555 R N6 A 33 R A 33 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_11_PAIR hydrog87 Q N6 A 13 Q A 13 1_555 R N3 G 32 R G 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_11_PAIR hydrog88 Q N7 A 13 Q A 13 1_555 R N2 G 32 R G 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_16_PAIR hydrog89 Q N3 U 14 Q U 14 1_555 R O2 U 31 R U 31 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_16_PAIR hydrog90 Q O4 U 14 Q U 14 1_555 R N3 U 31 R U 31 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog91 Q N1 G 15 Q G 15 1_555 R N3 C 30 R C 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog92 Q N2 G 15 Q G 15 1_555 R O2 C 30 R C 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog93 Q O6 G 15 Q G 15 1_555 R N4 C 30 R C 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog94 Q N1 A 19 Q A 19 1_555 S N3 U 10 S U 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog95 Q N6 A 19 Q A 19 1_555 S O4 U 10 S U 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog96 Q N3 C 20 Q C 20 1_555 S N1 G 9 S G 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog97 Q N4 C 20 Q C 20 1_555 S O6 G 9 S G 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog98 Q O2 C 20 Q C 20 1_555 S N2 G 9 S G 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog99 Q N1 A 21 Q A 21 1_555 S N3 U 8 S U 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog100 Q N6 A 21 Q A 21 1_555 S O4 U 8 S U 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog101 Q N3 C 22 Q C 22 1_555 S N1 G 7 S G 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog102 Q N4 C 22 Q C 22 1_555 S O6 G 7 S G 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog103 Q O2 C 22 Q C 22 1_555 S N2 G 7 S G 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog104 Q N3 U 23 Q U 23 1_555 S N1 A 6 S A 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog105 Q O4 U 23 Q U 23 1_555 S N6 A 6 S A 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'C-G PAIR' hydrog106 Q O2 C 24 Q C 24 1_555 S N2 G 5 S G 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog107 Q N1 A 25 Q A 25 1_555 S N3 U 4 S U 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog108 Q N6 A 25 Q A 25 1_555 S O4 U 4 S U 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog109 Q N3 U 26 Q U 26 1_555 S N1 A 3 S A 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog110 Q O4 U 26 Q U 26 1_555 S N6 A 3 S A 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog111 Q N1 G 27 Q G 27 1_555 S N3 C 2 S C 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog112 Q N2 G 27 Q G 27 1_555 S O2 C 2 S C 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog113 Q O6 G 27 Q G 27 1_555 S N4 C 2 S C 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog114 Q N1 G 28 Q G 28 1_555 S N3 C 1 S C 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog115 Q N2 G 28 Q G 28 1_555 S O2 C 1 S C 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog116 Q O6 G 28 Q G 28 1_555 S N4 C 1 S C 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog117 Q N3 C 30 Q C 30 1_555 R N1 G 15 R G 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog118 Q N4 C 30 Q C 30 1_555 R O6 G 15 R G 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog119 Q O2 C 30 Q C 30 1_555 R N2 G 15 R G 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_16_PAIR hydrog120 Q N3 U 31 Q U 31 1_555 R O4 U 14 R U 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_16_PAIR hydrog121 Q O2 U 31 Q U 31 1_555 R N3 U 14 R U 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_11_PAIR hydrog122 Q N2 G 32 Q G 32 1_555 R N7 A 13 R A 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_11_PAIR hydrog123 Q N3 G 32 Q G 32 1_555 R N6 A 13 R A 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_11_PAIR hydrog124 Q N6 A 33 Q A 33 1_555 R N3 G 12 R G 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_11_PAIR hydrog125 Q N7 A 33 Q A 33 1_555 R N2 G 12 R G 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog126 Q N1 A 34 Q A 34 1_555 R N3 U 8 R U 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog127 Q N6 A 34 Q A 34 1_555 R O4 U 8 R U 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog128 R N1 A 19 R A 19 1_555 T N3 U 10 T U 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog129 R N6 A 19 R A 19 1_555 T O4 U 10 T U 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog130 R N3 C 20 R C 20 1_555 T N1 G 9 T G 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog131 R N4 C 20 R C 20 1_555 T O6 G 9 T G 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog132 R O2 C 20 R C 20 1_555 T N2 G 9 T G 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog133 R N1 A 21 R A 21 1_555 T N3 U 8 T U 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog134 R N6 A 21 R A 21 1_555 T O4 U 8 T U 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog135 R N3 C 22 R C 22 1_555 T N1 G 7 T G 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog136 R N4 C 22 R C 22 1_555 T O6 G 7 T G 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog137 R O2 C 22 R C 22 1_555 T N2 G 7 T G 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog138 R N3 U 23 R U 23 1_555 T N1 A 6 T A 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog139 R O4 U 23 R U 23 1_555 T N6 A 6 T A 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog140 R N3 C 24 R C 24 1_555 T N1 G 5 T G 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog141 R N4 C 24 R C 24 1_555 T O6 G 5 T G 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog142 R O2 C 24 R C 24 1_555 T N2 G 5 T G 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog143 R N1 A 25 R A 25 1_555 T N3 U 4 T U 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog144 R N6 A 25 R A 25 1_555 T O4 U 4 T U 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog145 R N3 U 26 R U 26 1_555 T N1 A 3 T A 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog146 R O4 U 26 R U 26 1_555 T N6 A 3 T A 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog147 R N1 G 27 R G 27 1_555 T N3 C 2 T C 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog148 R N2 G 27 R G 27 1_555 T O2 C 2 T C 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog149 R O6 G 27 R G 27 1_555 T N4 C 2 T C 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog150 R N1 G 28 R G 28 1_555 T N3 C 1 T C 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog151 R N2 G 28 R G 28 1_555 T O2 C 1 T C 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog152 R O6 G 28 R G 28 1_555 T N4 C 1 T C 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'C14 H20 N6 O5 S' _chem_comp.formula_weight 384.411 _chem_comp.id SAH _chem_comp.mon_nstd_flag n _chem_comp.name S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE _chem_comp.type 'l-peptide linking' _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag N CA SAH sing 390 n n N HN1 SAH sing 391 n n N HN2 SAH sing 392 n n CA CB SAH sing 393 n n CA C SAH sing 394 n n CA HA SAH sing 395 n n CB CG SAH sing 396 n n CB HB1 SAH sing 397 n n CB HB2 SAH sing 398 n n CG SD SAH sing 399 n n CG HG1 SAH sing 400 n n CG HG2 SAH sing 401 n n SD C5' SAH sing 402 n n C O SAH doub 403 n n C OXT SAH sing 404 n n OXT HXT SAH sing 405 n n C5' C4' SAH sing 406 n n C5' "H5'1" SAH sing 407 n n C5' "H5'2" SAH sing 408 n n C4' O4' SAH sing 409 n n C4' C3' SAH sing 410 n n C4' H4' SAH sing 411 n n O4' C1' SAH sing 412 n n C3' O3' SAH sing 413 n n C3' C2' SAH sing 414 n n C3' H3' SAH sing 415 n n O3' HO3' SAH sing 416 n n C2' O2' SAH sing 417 n n C2' C1' SAH sing 418 n n C2' H2' SAH sing 419 n n O2' HO2' SAH sing 420 n n C1' N9 SAH sing 421 n n C1' H1' SAH sing 422 n n N9 C8 SAH sing 423 n y N9 C4 SAH sing 424 n y C8 N7 SAH doub 425 n y C8 H8 SAH sing 426 n n N7 C5 SAH sing 427 n y C5 C6 SAH sing 428 n y C5 C4 SAH doub 429 n y C6 N6 SAH sing 430 n n C6 N1 SAH doub 431 n y N6 HN61 SAH sing 432 n n N6 HN62 SAH sing 433 n n N1 C2 SAH sing 434 n y C2 N3 SAH doub 435 n y C2 H2 SAH sing 436 n n N3 C4 SAH sing 437 n y # _atom_sites.entry_id 5GIP _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.010213 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] -0.000025 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.002777 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.010234 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0.003641 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.008509 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code U 6 SAH E 1 301 301 SAH SAH . V 6 SAH F 1 301 301 SAH SAH . W 6 SAH O 1 301 301 SAH SAH . X 6 SAH P 1 301 301 SAH SAH . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 N N SAH . . . W 6 54.781 -89.992 81.147 1 61.74 ? N SAH 301 O 1 HETATM 2 C CA SAH . . . W 6 54.633 -91.152 80.276 1 60.83 ? CA SAH 301 O 1 HETATM 3 C CB SAH . . . W 6 53.164 -91.528 80.057 1 62.4 ? CB SAH 301 O 1 HETATM 4 C CG SAH . . . W 6 52.125 -90.651 80.764 1 66.63 ? CG SAH 301 O 1 HETATM 5 S SD SAH . . . W 6 50.424 -91.011 80.238 1 69.38 ? SD SAH 301 O 1 HETATM 6 C C SAH . . . W 6 55.373 -90.925 78.959 1 66.06 ? C SAH 301 O 1 HETATM 7 O O SAH . . . W 6 55.328 -89.829 78.372 1 66.33 ? O SAH 301 O 1 HETATM 8 O OXT SAH . . . W 6 56.05 -91.842 78.476 1 62.45 ? OXT SAH 301 O 1 HETATM 9 C C5' SAH . . . W 6 49.746 -90.832 81.916 1 58.16 ? C5' SAH 301 O 1 HETATM 10 C C4' SAH . . . W 6 49.775 -92.07 82.818 1 55.66 ? C4' SAH 301 O 1 HETATM 11 O O4' SAH . . . W 6 49.498 -91.638 84.127 1 54.04 ? O4' SAH 301 O 1 HETATM 12 C C3' SAH . . . W 6 48.711 -93.133 82.553 1 62.07 ? C3' SAH 301 O 1 HETATM 13 O O3' SAH . . . W 6 49.253 -94.352 82.088 1 62.95 ? O3' SAH 301 O 1 HETATM 14 C C2' SAH . . . W 6 48.097 -93.445 83.896 1 55.16 ? C2' SAH 301 O 1 HETATM 15 O O2' SAH . . . W 6 48.235 -94.816 84.124 1 59.51 ? O2' SAH 301 O 1 HETATM 16 C C1' SAH . . . W 6 48.978 -92.714 84.871 1 53.23 ? C1' SAH 301 O 1 HETATM 17 N N9 SAH . . . W 6 48.271 -92.273 86.095 1 56.52 ? N9 SAH 301 O 1 HETATM 18 C C8 SAH . . . W 6 47.131 -91.508 86.197 1 58.62 ? C8 SAH 301 O 1 HETATM 19 N N7 SAH . . . W 6 46.834 -91.341 87.512 1 55.05 ? N7 SAH 301 O 1 HETATM 20 C C5 SAH . . . W 6 47.778 -91.977 88.254 1 56.44 ? C5 SAH 301 O 1 HETATM 21 C C6 SAH . . . W 6 47.976 -92.143 89.629 1 55.56 ? C6 SAH 301 O 1 HETATM 22 N N6 SAH . . . W 6 47.145 -91.608 90.514 1 59.3 ? N6 SAH 301 O 1 HETATM 23 N N1 SAH . . . W 6 49.044 -92.877 90.098 1 52.76 ? N1 SAH 301 O 1 HETATM 24 C C2 SAH . . . W 6 49.919 -93.45 89.205 1 50.31 ? C2 SAH 301 O 1 HETATM 25 N N3 SAH . . . W 6 49.716 -93.286 87.851 1 52.79 ? N3 SAH 301 O 1 HETATM 26 C C4 SAH . . . W 6 48.675 -92.563 87.374 1 53.25 ? C4 SAH 301 O 1 # _model_server_stats.io_time_ms 33 _model_server_stats.parse_time_ms 69 _model_server_stats.create_model_time_ms 100 _model_server_stats.query_time_ms 1159 _model_server_stats.encode_time_ms 22 _model_server_stats.element_count 26 #