data_5H4Z
#
_model_server_result.job_id            R4Q3Vd8Tl4e6Lw4xQwROkQ 
_model_server_result.datetime_utc      '2025-02-26 09:08:08' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          5h4z 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"E","auth_seq_id":303}' 
#
_entry.id    5H4Z 
#
_exptl.entry_id    5H4Z 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              40.078 
_entity.id                          2 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'CALCIUM ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    6 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            5H4Z 
_cell.length_a            76.005 
_cell.length_b            118.656 
_cell.length_c            109.464 
_cell.Z_PDB               16 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 5H4Z 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        20 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'C 2 2 21' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 1 
PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 2 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,C,D,E,J 1 1 
B,F,G,H,I,K 2 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 2 C N N 
? 2 D N N 
? 2 E N N 
? 2 F N N 
? 2 G N N 
? 2 H N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A O LEU 46 A LEU 138 1_555 D CA CA . A CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.416 ? 
metalc ? metalc2 A OD1 ASP 47 A ASP 139 1_555 C CA CA . A CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.577 ? 
metalc ? metalc3 A OD2 ASP 47 A ASP 139 1_555 C CA CA . A CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.71 ? 
metalc ? metalc4 A OD1 ASP 47 A ASP 139 1_555 D CA CA . A CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.316 ? 
metalc ? metalc5 A OD2 ASP 53 A ASP 145 1_555 C CA CA . A CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.186 ? 
metalc ? metalc6 A OD1 ASP 105 A ASP 197 1_555 C CA CA . A CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.318 ? 
metalc ? metalc7 A OD2 ASP 105 A ASP 197 1_555 C CA CA . A CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.03 ? 
metalc ? metalc8 A OD2 ASP 105 A ASP 197 1_555 D CA CA . A CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.24 ? 
metalc ? metalc9 A O PHE 106 A PHE 198 1_555 C CA CA . A CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.502 ? 
metalc ? metalc10 A OD1 ASP 107 A ASP 199 1_555 C CA CA . A CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.371 ? 
metalc ? metalc11 A OD1 ASP 107 A ASP 199 1_555 D CA CA . A CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.307 ? 
metalc ? metalc12 A OD2 ASP 107 A ASP 199 1_555 D CA CA . A CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.63 ? 
metalc ? metalc13 A OD2 ASP 107 A ASP 199 1_555 E CA CA . A CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.3 ? 
metalc ? metalc14 A O ARG 111 A ARG 203 1_555 E CA CA . A CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.422 ? 
metalc ? metalc15 A OD2 ASP 113 A ASP 205 1_555 D CA CA . A CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.35 ? 
metalc ? metalc16 A OD1 ASP 113 A ASP 205 1_555 E CA CA . A CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.363 ? 
metalc ? metalc17 A OD1 ASP 126 A ASP 218 1_555 D CA CA . A CA 302 8_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.215 ? 
metalc ? metalc18 A OD2 ASP 126 A ASP 218 1_555 E CA CA . A CA 303 8_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? 
metalc ? metalc19 C CA CA . A CA 301 1_555 J O HOH . A HOH 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.367 ? 
metalc ? metalc20 E CA CA . A CA 303 1_555 J O HOH . A HOH 416 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.322 ? 
metalc ? metalc21 E CA CA . A CA 303 1_555 J O HOH . A HOH 417 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.593 ? 
metalc ? metalc22 B O LEU 46 B LEU 138 1_555 G CA CA . B CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.235 ? 
metalc ? metalc23 B OD1 ASP 47 B ASP 139 1_555 F CA CA . B CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.436 ? 
metalc ? metalc24 B OD2 ASP 47 B ASP 139 1_555 F CA CA . B CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.3 ? 
metalc ? metalc25 B OD1 ASP 47 B ASP 139 1_555 G CA CA . B CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.301 ? 
metalc ? metalc26 B OD2 ASP 53 B ASP 145 1_555 F CA CA . B CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.254 ? 
metalc ? metalc27 B OD1 ASP 105 B ASP 197 1_555 F CA CA . B CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.54 ? 
metalc ? metalc28 B OD2 ASP 105 B ASP 197 1_555 F CA CA . B CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.16 ? 
metalc ? metalc29 B OD2 ASP 105 B ASP 197 1_555 G CA CA . B CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.347 ? 
metalc ? metalc30 B O PHE 106 B PHE 198 1_555 F CA CA . B CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.333 ? 
metalc ? metalc31 B OD1 ASP 107 B ASP 199 1_555 F CA CA . B CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.257 ? 
metalc ? metalc32 B OD1 ASP 107 B ASP 199 1_555 G CA CA . B CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.772 ? 
metalc ? metalc33 B OD2 ASP 107 B ASP 199 1_555 G CA CA . B CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.429 ? 
metalc ? metalc34 B OD2 ASP 107 B ASP 199 1_555 H CA CA . B CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.342 ? 
metalc ? metalc35 B O ARG 111 B ARG 203 1_555 H CA CA . B CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.61 ? 
metalc ? metalc36 B OD2 ASP 113 B ASP 205 1_555 G CA CA . B CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.172 ? 
metalc ? metalc37 B OD1 ASP 113 B ASP 205 1_555 H CA CA . B CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.767 ? 
metalc ? metalc38 B OD2 ASP 113 B ASP 205 1_555 H CA CA . B CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.133 ? 
metalc ? metalc39 G CA CA . B CA 302 1_555 K O HOH . B HOH 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.679 ? 
metalc ? metalc40 H CA CA . B CA 303 1_555 K O HOH . B HOH 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.674 ? 
metalc ? metalc41 H CA CA . B CA 303 1_555 K O HOH . B HOH 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.566 ? 
#
_chem_comp.formula           'Ca 2' 
_chem_comp.formula_weight    40.078 
_chem_comp.id                CA 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'CALCIUM ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     5H4Z 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.013157 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.008428 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.009135 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
C 2 CA A 1 301 1 CA CA . 
D 2 CA A 1 302 2 CA CA . 
E 2 CA A 1 303 3 CA CA . 
F 2 CA B 1 301 1 CA CA . 
G 2 CA B 1 302 2 CA CA . 
H 2 CA B 1 303 3 CA CA . 
I 3 CL B 1 304 1 CL CL . 
J 4 HOH A 1 401 34 HOH HOH . 
J 4 HOH A 2 402 6 HOH HOH . 
J 4 HOH A 3 403 19 HOH HOH . 
J 4 HOH A 4 404 24 HOH HOH . 
J 4 HOH A 5 405 29 HOH HOH . 
J 4 HOH A 6 406 1 HOH HOH . 
J 4 HOH A 7 407 2 HOH HOH . 
J 4 HOH A 8 408 20 HOH HOH . 
J 4 HOH A 9 409 42 HOH HOH . 
J 4 HOH A 10 410 39 HOH HOH . 
J 4 HOH A 11 411 15 HOH HOH . 
J 4 HOH A 12 412 36 HOH HOH . 
J 4 HOH A 13 413 4 HOH HOH . 
J 4 HOH A 14 414 10 HOH HOH . 
J 4 HOH A 15 415 8 HOH HOH . 
J 4 HOH A 16 416 40 HOH HOH . 
J 4 HOH A 17 417 41 HOH HOH . 
J 4 HOH A 18 418 30 HOH HOH . 
J 4 HOH A 19 419 16 HOH HOH . 
J 4 HOH A 20 420 35 HOH HOH . 
J 4 HOH A 21 421 46 HOH HOH . 
J 4 HOH A 22 422 27 HOH HOH . 
J 4 HOH A 23 423 5 HOH HOH . 
J 4 HOH A 24 424 14 HOH HOH . 
J 4 HOH A 25 425 11 HOH HOH . 
J 4 HOH A 26 426 21 HOH HOH . 
K 4 HOH B 1 401 25 HOH HOH . 
K 4 HOH B 2 402 38 HOH HOH . 
K 4 HOH B 3 403 32 HOH HOH . 
K 4 HOH B 4 404 45 HOH HOH . 
K 4 HOH B 5 405 7 HOH HOH . 
K 4 HOH B 6 406 18 HOH HOH . 
K 4 HOH B 7 407 13 HOH HOH . 
K 4 HOH B 8 408 3 HOH HOH . 
K 4 HOH B 9 409 33 HOH HOH . 
K 4 HOH B 10 410 31 HOH HOH . 
K 4 HOH B 11 411 44 HOH HOH . 
K 4 HOH B 12 412 26 HOH HOH . 
K 4 HOH B 13 413 28 HOH HOH . 
K 4 HOH B 14 414 12 HOH HOH . 
K 4 HOH B 15 415 43 HOH HOH . 
K 4 HOH B 16 416 47 HOH HOH . 
K 4 HOH B 17 417 23 HOH HOH . 
K 4 HOH B 18 418 9 HOH HOH . 
K 4 HOH B 19 419 37 HOH HOH . 
K 4 HOH B 20 420 17 HOH HOH . 
K 4 HOH B 21 421 22 HOH HOH . 
#
_atom_site.group_PDB             HETATM 
_atom_site.id                    1 
_atom_site.type_symbol           CA 
_atom_site.label_atom_id         CA 
_atom_site.label_comp_id         CA 
_atom_site.label_seq_id          . 
_atom_site.label_alt_id          . 
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code     . 
_atom_site.label_asym_id         E 
_atom_site.label_entity_id       2 
_atom_site.Cartn_x               -10.062 
_atom_site.Cartn_y               32.6 
_atom_site.Cartn_z               3.312 
_atom_site.occupancy             1 
_atom_site.B_iso_or_equiv        24.66 
_atom_site.pdbx_formal_charge    ? 
_atom_site.auth_atom_id          CA 
_atom_site.auth_comp_id          CA 
_atom_site.auth_seq_id           303 
_atom_site.auth_asym_id          A 
_atom_site.pdbx_PDB_model_num    1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              9 
_model_server_stats.parse_time_ms           27 
_model_server_stats.create_model_time_ms    2 
_model_server_stats.query_time_ms           268 
_model_server_stats.encode_time_ms          2 
_model_server_stats.element_count           1 
#