data_5H57 # _model_server_result.job_id 9MkDxi2ATNLaC7wpVYQIJw _model_server_result.datetime_utc '2024-10-14 08:27:02' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 5h57 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"K","auth_seq_id":101}' # _entry.id 5H57 # _exptl.entry_id 5H57 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 175.82 _entity.id 2 _entity.src_method man _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER' _entity.pdbx_number_of_molecules 6 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 5H57 _cell.length_a 79.9 _cell.length_b 104.5 _cell.length_c 66.4 _cell.Z_PDB 24 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 5H57 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 1 PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 2 PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 3 PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 4 PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 5 PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 6 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,G,M 1 1 B,H,N 2 1 C,I,O 3 1 D,J,P 4 1 E,K,Q 5 1 F,L,R 6 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 G N N ? 2 H N N ? 2 I N N ? 2 J N N ? 2 K N N ? 2 L N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A SG CYS 40 A CYS 40 1_555 G FE2 FES . A FES 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.368 ? metalc ? metalc2 A SG CYS 45 A CYS 45 1_555 G FE2 FES . A FES 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.35 ? metalc ? metalc3 A SG CYS 48 A CYS 48 1_555 G FE1 FES . A FES 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.371 ? metalc ? metalc4 A SG CYS 78 A CYS 78 1_555 G FE1 FES . A FES 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.347 ? metalc ? metalc5 B SG CYS 40 B CYS 40 1_555 H FE2 FES . B FES 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.42 ? metalc ? metalc6 B SG CYS 45 B CYS 45 1_555 H FE2 FES . B FES 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.377 ? metalc ? metalc7 B SG CYS 48 B CYS 48 1_555 H FE1 FES . B FES 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.287 ? metalc ? metalc8 B SG CYS 78 B CYS 78 1_555 H FE1 FES . B FES 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.393 ? metalc ? metalc9 C SG CYS 40 C CYS 40 1_555 I FE2 FES . C FES 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.443 ? metalc ? metalc10 C SG CYS 45 C CYS 45 1_555 I FE2 FES . C FES 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.335 ? metalc ? metalc11 C SG CYS 48 C CYS 48 1_555 I FE1 FES . C FES 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.312 ? metalc ? metalc12 C SG CYS 78 C CYS 78 1_555 I FE1 FES . C FES 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.388 ? metalc ? metalc13 D SG CYS 40 D CYS 40 1_555 J FE2 FES . D FES 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.491 ? metalc ? metalc14 D SG CYS 45 D CYS 45 1_555 J FE2 FES . D FES 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.29 ? metalc ? metalc15 D SG CYS 48 D CYS 48 1_555 J FE1 FES . D FES 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.359 ? metalc ? metalc16 D SG CYS 78 D CYS 78 1_555 J FE1 FES . D FES 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.289 ? metalc ? metalc17 E SG CYS 40 E CYS 40 1_555 K FE2 FES . E FES 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.404 ? metalc ? metalc18 E SG CYS 45 E CYS 45 1_555 K FE2 FES . E FES 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.371 ? metalc ? metalc19 E SG CYS 48 E CYS 48 1_555 K FE1 FES . E FES 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.384 ? metalc ? metalc20 E SG CYS 78 E CYS 78 1_555 K FE1 FES . E FES 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.385 ? metalc ? metalc21 F SG CYS 40 F CYS 40 1_555 L FE2 FES . F FES 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.432 ? metalc ? metalc22 F SG CYS 45 F CYS 45 1_555 L FE2 FES . F FES 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.353 ? metalc ? metalc23 F SG CYS 48 F CYS 48 1_555 L FE1 FES . F FES 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.377 ? metalc ? metalc24 F SG CYS 78 F CYS 78 1_555 L FE1 FES . F FES 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.408 ? # _chem_comp.formula 'Fe2 S2' _chem_comp.formula_weight 175.82 _chem_comp.id FES _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag FE1 S1 FES sing 67 n n FE1 S2 FES sing 68 n n FE2 S1 FES sing 69 n n FE2 S2 FES sing 70 n n # _atom_sites.entry_id 5H57 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.012516 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.009569 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.01506 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code G 2 FES A 1 101 98 FES FES . H 2 FES B 1 101 98 FES FES . I 2 FES C 1 101 98 FES FES . J 2 FES D 1 101 98 FES FES . K 2 FES E 1 101 98 FES FES . L 2 FES F 1 101 98 FES FES . M 3 HOH A 1 201 89 HOH WAT . M 3 HOH A 2 202 123 HOH WAT . M 3 HOH A 3 203 87 HOH WAT . M 3 HOH A 4 204 79 HOH WAT . M 3 HOH A 5 205 63 HOH WAT . M 3 HOH A 6 206 7 HOH WAT . M 3 HOH A 7 207 128 HOH WAT . M 3 HOH A 8 208 110 HOH WAT . M 3 HOH A 9 209 3 HOH WAT . M 3 HOH A 10 210 1 HOH WAT . M 3 HOH A 11 211 111 HOH WAT . M 3 HOH A 12 212 6 HOH WAT . M 3 HOH A 13 213 75 HOH WAT . M 3 HOH A 14 214 83 HOH WAT . M 3 HOH A 15 215 5 HOH WAT . M 3 HOH A 16 216 88 HOH WAT . M 3 HOH A 17 217 106 HOH WAT . M 3 HOH A 18 218 105 HOH WAT . M 3 HOH A 19 219 107 HOH WAT . M 3 HOH A 20 220 4 HOH WAT . M 3 HOH A 21 221 69 HOH WAT . M 3 HOH A 22 222 2 HOH WAT . M 3 HOH A 23 223 109 HOH WAT . M 3 HOH A 24 224 8 HOH WAT . M 3 HOH A 25 225 61 HOH WAT . N 3 HOH B 1 201 94 HOH WAT . N 3 HOH B 2 202 91 HOH WAT . N 3 HOH B 3 203 11 HOH WAT . N 3 HOH B 4 204 10 HOH WAT . N 3 HOH B 5 205 17 HOH WAT . N 3 HOH B 6 206 112 HOH WAT . N 3 HOH B 7 207 95 HOH WAT . N 3 HOH B 8 208 12 HOH WAT . N 3 HOH B 9 209 70 HOH WAT . N 3 HOH B 10 210 13 HOH WAT . N 3 HOH B 11 211 15 HOH WAT . N 3 HOH B 12 212 85 HOH WAT . N 3 HOH B 13 213 18 HOH WAT . N 3 HOH B 14 214 19 HOH WAT . N 3 HOH B 15 215 16 HOH WAT . N 3 HOH B 16 216 14 HOH WAT . N 3 HOH B 17 217 9 HOH WAT . N 3 HOH B 18 218 86 HOH WAT . N 3 HOH B 19 219 93 HOH WAT . N 3 HOH B 20 220 84 HOH WAT . N 3 HOH B 21 221 135 HOH WAT . O 3 HOH C 1 201 97 HOH WAT . O 3 HOH C 2 202 116 HOH WAT . O 3 HOH C 3 203 124 HOH WAT . O 3 HOH C 4 204 25 HOH WAT . O 3 HOH C 5 205 92 HOH WAT . O 3 HOH C 6 206 20 HOH WAT . O 3 HOH C 7 207 22 HOH WAT . O 3 HOH C 8 208 118 HOH WAT . O 3 HOH C 9 209 117 HOH WAT . O 3 HOH C 10 210 90 HOH WAT . O 3 HOH C 11 211 115 HOH WAT . O 3 HOH C 12 212 23 HOH WAT . O 3 HOH C 13 213 21 HOH WAT . O 3 HOH C 14 214 98 HOH WAT . O 3 HOH C 15 215 113 HOH WAT . O 3 HOH C 16 216 39 HOH WAT . O 3 HOH C 17 217 26 HOH WAT . O 3 HOH C 18 218 24 HOH WAT . O 3 HOH C 19 219 55 HOH WAT . P 3 HOH D 1 201 29 HOH WAT . P 3 HOH D 2 202 120 HOH WAT . P 3 HOH D 3 203 80 HOH WAT . P 3 HOH D 4 204 119 HOH WAT . P 3 HOH D 5 205 28 HOH WAT . P 3 HOH D 6 206 67 HOH WAT . P 3 HOH D 7 207 99 HOH WAT . P 3 HOH D 8 208 27 HOH WAT . P 3 HOH D 9 209 33 HOH WAT . P 3 HOH D 10 210 56 HOH WAT . P 3 HOH D 11 211 59 HOH WAT . P 3 HOH D 12 212 30 HOH WAT . P 3 HOH D 13 213 34 HOH WAT . P 3 HOH D 14 214 64 HOH WAT . P 3 HOH D 15 215 31 HOH WAT . P 3 HOH D 16 216 32 HOH WAT . P 3 HOH D 17 217 66 HOH WAT . P 3 HOH D 18 218 76 HOH WAT . P 3 HOH D 19 219 53 HOH WAT . Q 3 HOH E 1 201 71 HOH WAT . Q 3 HOH E 2 202 129 HOH WAT . Q 3 HOH E 3 203 40 HOH WAT . Q 3 HOH E 4 204 42 HOH WAT . Q 3 HOH E 5 205 81 HOH WAT . Q 3 HOH E 6 206 41 HOH WAT . Q 3 HOH E 7 207 38 HOH WAT . Q 3 HOH E 8 208 73 HOH WAT . Q 3 HOH E 9 209 114 HOH WAT . Q 3 HOH E 10 210 134 HOH WAT . Q 3 HOH E 11 211 35 HOH WAT . Q 3 HOH E 12 212 130 HOH WAT . Q 3 HOH E 13 213 101 HOH WAT . Q 3 HOH E 14 214 54 HOH WAT . Q 3 HOH E 15 215 37 HOH WAT . Q 3 HOH E 16 216 36 HOH WAT . Q 3 HOH E 17 217 72 HOH WAT . Q 3 HOH E 18 218 96 HOH WAT . Q 3 HOH E 19 219 68 HOH WAT . R 3 HOH F 1 201 103 HOH WAT . R 3 HOH F 2 202 122 HOH WAT . R 3 HOH F 3 203 133 HOH WAT . R 3 HOH F 4 204 108 HOH WAT . R 3 HOH F 5 205 74 HOH WAT . R 3 HOH F 6 206 100 HOH WAT . R 3 HOH F 7 207 44 HOH WAT . R 3 HOH F 8 208 45 HOH WAT . R 3 HOH F 9 209 102 HOH WAT . R 3 HOH F 10 210 58 HOH WAT . R 3 HOH F 11 211 50 HOH WAT . R 3 HOH F 12 212 51 HOH WAT . R 3 HOH F 13 213 82 HOH WAT . R 3 HOH F 14 214 65 HOH WAT . R 3 HOH F 15 215 57 HOH WAT . R 3 HOH F 16 216 43 HOH WAT . R 3 HOH F 17 217 121 HOH WAT . R 3 HOH F 18 218 52 HOH WAT . R 3 HOH F 19 219 46 HOH WAT . R 3 HOH F 20 220 47 HOH WAT . R 3 HOH F 21 221 48 HOH WAT . R 3 HOH F 22 222 125 HOH WAT . R 3 HOH F 23 223 127 HOH WAT . R 3 HOH F 24 224 77 HOH WAT . R 3 HOH F 25 225 49 HOH WAT . R 3 HOH F 26 226 78 HOH WAT . R 3 HOH F 27 227 62 HOH WAT . R 3 HOH F 28 228 132 HOH WAT . R 3 HOH F 29 229 104 HOH WAT . R 3 HOH F 30 230 131 HOH WAT . R 3 HOH F 31 231 126 HOH WAT . R 3 HOH F 32 232 60 HOH WAT . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 FE FE1 FES . . . K 2 43.023 8.683 6.091 1 23.57 ? FE1 FES 101 E 1 HETATM 2 FE FE2 FES . . . K 2 40.83 8.548 4.52 1 23.38 ? FE2 FES 101 E 1 HETATM 3 S S1 FES . . . K 2 42.645 7.333 4.427 1 23.46 ? S1 FES 101 E 1 HETATM 4 S S2 FES . . . K 2 41.196 9.954 6.223 1 21.92 ? S2 FES 101 E 1 # _model_server_stats.io_time_ms 9 _model_server_stats.parse_time_ms 10 _model_server_stats.create_model_time_ms 4 _model_server_stats.query_time_ms 281 _model_server_stats.encode_time_ms 18 _model_server_stats.element_count 4 #