data_5HKK
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_model_server_result.job_id            1HLV5wTeAjWBZvy0ECiQbA 
_model_server_result.datetime_utc      '2025-03-13 19:48:45' 
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_model_server_result.entry_id          5hkk 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"KA","auth_seq_id":601}' 
#
_entry.id    5HKK 
#
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_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
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_entity.id                          6 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'MAGNESIUM ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    12 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
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_cell.entry_id            5HKK 
_cell.length_a            147.82 
_cell.length_b            130.79 
_cell.length_c            210.39 
_cell.Z_PDB               12 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 5HKK 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        4 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1 21 1' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
PISA octameric 8 author_and_software_defined_assembly 1 
PISA octameric 8 author_and_software_defined_assembly 2 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,B,C,D,E,F,G,H,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB 1 1 
I,J,K,L,M,N,O,P,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB 2 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 6 R N N 
? 6 U N N 
? 6 W N N 
? 6 Y N N 
? 6 CA N N 
? 6 DA N N 
? 6 GA N N 
? 6 IA N N 
? 6 KA N N 
? 6 MA N N 
? 6 QA N N 
? 6 RA N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A OG1 THR 176 A THR 176 1_555 R MG MG . A MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.18 ? 
metalc ? metalc2 Q O2B ADP . A ADP 601 1_555 R MG MG . A MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.174 ? 
metalc ? metalc3 R MG MG . A MG 602 1_555 TA O HOH . A HOH 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.173 ? 
metalc ? metalc4 R MG MG . A MG 602 1_555 TA O HOH . A HOH 709 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.178 ? 
metalc ? metalc5 R MG MG . A MG 602 1_555 TA O HOH . A HOH 712 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.175 ? 
metalc ? metalc6 R MG MG . A MG 602 1_555 TA O HOH . A HOH 717 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.175 ? 
metalc ? metalc7 B OG1 THR 176 B THR 176 1_555 U MG MG . B MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.178 ? 
metalc ? metalc8 T O1B ADP . B ADP 600 1_555 U MG MG . B MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.174 ? 
metalc ? metalc9 U MG MG . B MG 601 1_555 UA O HOH . B HOH 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.185 ? 
metalc ? metalc10 U MG MG . B MG 601 1_555 UA O HOH . B HOH 714 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.179 ? 
metalc ? metalc11 U MG MG . B MG 601 1_555 UA O HOH . B HOH 715 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.179 ? 
metalc ? metalc12 U MG MG . B MG 601 1_555 UA O HOH . B HOH 717 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.175 ? 
metalc ? metalc13 C OG1 THR 176 C THR 176 1_555 W MG MG . C MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.172 ? 
metalc ? metalc14 V O2B ADP . C ADP 600 1_555 W MG MG . C MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.18 ? 
metalc ? metalc15 W MG MG . C MG 601 1_555 VA O HOH . C HOH 710 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.176 ? 
metalc ? metalc16 W MG MG . C MG 601 1_555 VA O HOH . C HOH 712 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.178 ? 
metalc ? metalc17 W MG MG . C MG 601 1_555 VA O HOH . C HOH 718 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.178 ? 
metalc ? metalc18 W MG MG . C MG 601 1_555 VA O HOH . C HOH 721 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.182 ? 
metalc ? metalc19 D OG1 THR 158 D THR 158 1_555 Y MG MG . D MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.175 ? 
metalc ? metalc20 X O2B ADP . D ADP 600 1_555 Y MG MG . D MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.18 ? 
metalc ? metalc21 Y MG MG . D MG 601 1_555 WA O HOH . D HOH 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.18 ? 
metalc ? metalc22 Y MG MG . D MG 601 1_555 WA O HOH . D HOH 712 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.185 ? 
metalc ? metalc23 Y MG MG . D MG 601 1_555 WA O HOH . D HOH 714 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.187 ? 
metalc ? metalc24 Y MG MG . D MG 601 1_555 WA O HOH . D HOH 717 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.179 ? 
metalc ? metalc25 F OG1 THR 158 F THR 158 1_555 CA MG MG . F MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.176 ? 
metalc ? metalc26 BA O1B ADP . F ADP 600 1_555 CA MG MG . F MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.184 ? 
metalc ? metalc27 CA MG MG . F MG 601 1_555 YA O HOH . F HOH 708 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.177 ? 
metalc ? metalc28 CA MG MG . F MG 601 1_555 YA O HOH . F HOH 711 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.176 ? 
metalc ? metalc29 CA MG MG . F MG 601 1_555 YA O HOH . F HOH 718 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.175 ? 
metalc ? metalc30 CA MG MG . F MG 601 1_555 YA O HOH . F HOH 725 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.185 ? 
metalc ? metalc31 DA MG MG . G MG 601 1_555 EA O1A ATP . H ATP 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.185 ? 
metalc ? metalc32 DA MG MG . G MG 601 1_555 EA O1B ATP . H ATP 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.058 ? 
metalc ? metalc33 DA MG MG . G MG 601 1_555 AB O HOH . H HOH 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.187 ? 
metalc ? metalc34 DA MG MG . G MG 601 1_555 AB O HOH . H HOH 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.191 ? 
metalc ? metalc35 DA MG MG . G MG 601 1_555 AB O HOH . H HOH 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.196 ? 
metalc ? metalc36 DA MG MG . G MG 601 1_555 AB O HOH . H HOH 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.164 ? 
metalc ? metalc37 I OG1 THR 176 I THR 176 1_555 GA MG MG . I MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.184 ? 
metalc ? metalc38 FA O2B ADP . I ADP 600 1_555 GA MG MG . I MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.176 ? 
metalc ? metalc39 GA MG MG . I MG 601 1_555 BB O HOH . I HOH 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.181 ? 
metalc ? metalc40 GA MG MG . I MG 601 1_555 BB O HOH . I HOH 709 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.172 ? 
metalc ? metalc41 GA MG MG . I MG 601 1_555 BB O HOH . I HOH 711 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.181 ? 
metalc ? metalc42 GA MG MG . I MG 601 1_555 BB O HOH . I HOH 712 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.179 ? 
metalc ? metalc43 J OG1 THR 176 J THR 176 1_555 IA MG MG . J MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.181 ? 
metalc ? metalc44 HA O2B ADP . J ADP 600 1_555 IA MG MG . J MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.17 ? 
metalc ? metalc45 IA MG MG . J MG 601 1_555 CB O HOH . J HOH 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.181 ? 
metalc ? metalc46 IA MG MG . J MG 601 1_555 CB O HOH . J HOH 708 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.176 ? 
metalc ? metalc47 IA MG MG . J MG 601 1_555 CB O HOH . J HOH 709 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.179 ? 
metalc ? metalc48 IA MG MG . J MG 601 1_555 CB O HOH . J HOH 710 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.177 ? 
metalc ? metalc49 K OG1 THR 176 K THR 176 1_555 KA MG MG . K MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.175 ? 
metalc ? metalc50 JA O2B ADP . K ADP 600 1_555 KA MG MG . K MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.177 ? 
metalc ? metalc51 KA MG MG . K MG 601 1_555 DB O HOH . K HOH 715 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.179 ? 
metalc ? metalc52 KA MG MG . K MG 601 1_555 DB O HOH . K HOH 716 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.18 ? 
metalc ? metalc53 KA MG MG . K MG 601 1_555 DB O HOH . K HOH 717 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.176 ? 
metalc ? metalc54 KA MG MG . K MG 601 1_555 DB O HOH . K HOH 719 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.181 ? 
metalc ? metalc55 L OG1 THR 158 L THR 158 1_555 MA MG MG . L MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.179 ? 
metalc ? metalc56 LA O2B ADP . L ADP 600 1_555 MA MG MG . L MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.176 ? 
metalc ? metalc57 MA MG MG . L MG 601 1_555 EB O HOH . L HOH 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.186 ? 
metalc ? metalc58 MA MG MG . L MG 601 1_555 EB O HOH . L HOH 715 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.183 ? 
metalc ? metalc59 MA MG MG . L MG 601 1_555 EB O HOH . L HOH 726 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.183 ? 
metalc ? metalc60 MA MG MG . L MG 601 1_555 EB O HOH . L HOH 727 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.184 ? 
metalc ? metalc61 N OG1 THR 158 N THR 158 1_555 QA MG MG . N MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.18 ? 
metalc ? metalc62 PA O1B ADP . N ADP 600 1_555 QA MG MG . N MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.174 ? 
metalc ? metalc63 QA MG MG . N MG 601 1_555 GB O HOH . N HOH 708 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.179 ? 
metalc ? metalc64 QA MG MG . N MG 601 1_555 GB O HOH . N HOH 717 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.176 ? 
metalc ? metalc65 QA MG MG . N MG 601 1_555 GB O HOH . N HOH 722 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.185 ? 
metalc ? metalc66 QA MG MG . N MG 601 1_555 GB O HOH . N HOH 727 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.182 ? 
metalc ? metalc67 RA MG MG . O MG 601 1_555 HB O HOH . O HOH 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.176 ? 
metalc ? metalc68 RA MG MG . O MG 601 1_555 SA O1B ATP . P ATP 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.993 ? 
metalc ? metalc69 RA MG MG . O MG 601 1_555 SA O2A ATP . P ATP 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.905 ? 
metalc ? metalc70 RA MG MG . O MG 601 1_555 IB O HOH . P HOH 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.194 ? 
metalc ? metalc71 RA MG MG . O MG 601 1_555 IB O HOH . P HOH 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.185 ? 
metalc ? metalc72 RA MG MG . O MG 601 1_555 IB O HOH . P HOH 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.187 ? 
#
_chem_comp.formula           'Mg 2' 
_chem_comp.formula_weight    24.305 
_chem_comp.id                MG 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'MAGNESIUM ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     5HKK 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.006765 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.002194 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.007646 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.004997 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
Q 5 ADP A 1 601 600 ADP ADP . 
R 6 MG A 1 602 601 MG MG . 
S 7 GOL A 1 603 1 GOL GOL . 
T 5 ADP B 1 600 600 ADP ADP . 
U 6 MG B 1 601 601 MG MG . 
V 5 ADP C 1 600 600 ADP ADP . 
W 6 MG C 1 601 601 MG MG . 
X 5 ADP D 1 600 600 ADP ADP . 
Y 6 MG D 1 601 601 MG MG . 
Z 5 ADP E 1 501 600 ADP ADP . 
AA 8 PO4 E 1 502 602 PO4 PO4 . 
BA 5 ADP F 1 600 600 ADP ADP . 
CA 6 MG F 1 601 601 MG MG . 
DA 6 MG G 1 601 601 MG MG . 
EA 9 ATP H 1 201 1002 ATP ATP . 
FA 5 ADP I 1 600 600 ADP ADP . 
GA 6 MG I 1 601 601 MG MG . 
HA 5 ADP J 1 600 600 ADP ADP . 
IA 6 MG J 1 601 601 MG MG . 
JA 5 ADP K 1 600 600 ADP ADP . 
KA 6 MG K 1 601 601 MG MG . 
LA 5 ADP L 1 600 600 ADP ADP . 
MA 6 MG L 1 601 601 MG MG . 
NA 5 ADP M 1 501 600 ADP ADP . 
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