data_5HLN # _model_server_result.job_id 6FMtcumy6DEnFiBWhauVHQ _model_server_result.datetime_utc '2024-11-19 20:47:25' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 5hln # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"H","auth_seq_id":503}' # _entry.id 5HLN # _exptl.entry_id 5HLN _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 195.237 _entity.id 4 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description '2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID' _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 120 _cell.entry_id 5HLN _cell.length_a 163.521 _cell.length_b 163.521 _cell.length_c 84.93 _cell.Z_PDB 12 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 5HLN _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 170 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 65' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 _pdbx_struct_assembly.details software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 4 E N N ? 4 H N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale ? covale1 A C SER 219 A SER 215 1_555 A N PTR 220 A PTR 216 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? covale ? covale2 A C PTR 220 A PTR 216 1_555 A N ILE 221 A ILE 217 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.34 ? covale ? covale3 B C SER 219 B SER 215 1_555 B N PTR 220 B PTR 216 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale4 B C PTR 220 B PTR 216 1_555 B N ILE 221 B ILE 217 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.351 ? metalc ? metalc1 A OD2 ASP 268 A ASP 264 1_555 D MG MG . A MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.195 ? metalc ? metalc2 A OE1 GLU 272 A GLU 268 1_555 D MG MG . A MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.203 ? metalc ? metalc3 A OE2 GLU 272 A GLU 268 1_555 D MG MG . A MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.219 ? metalc ? metalc4 B OD2 ASP 268 B ASP 264 1_555 G MG MG . B MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.19 ? metalc ? metalc5 B OE1 GLU 272 B GLU 268 1_555 G MG MG . B MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.202 ? metalc ? metalc6 B OE2 GLU 272 B GLU 268 1_555 G MG MG . B MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.2 ? # _chem_comp.formula 'C6 H13 N O4 S' _chem_comp.formula_weight 195.237 _chem_comp.id MES _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name '2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag O1 C2 MES sing 269 n n O1 C6 MES sing 270 n n C2 C3 MES sing 271 n n C2 H21 MES sing 272 n n C2 H22 MES sing 273 n n C3 N4 MES sing 274 n n C3 H31 MES sing 275 n n C3 H32 MES sing 276 n n N4 C5 MES sing 277 n n N4 C7 MES sing 278 n n N4 HN4 MES sing 279 n n C5 C6 MES sing 280 n n C5 H51 MES sing 281 n n C5 H52 MES sing 282 n n C6 H61 MES sing 283 n n C6 H62 MES sing 284 n n C7 C8 MES sing 285 n n C7 H71 MES sing 286 n n C7 H72 MES sing 287 n n C8 S MES sing 288 n n C8 H81 MES sing 289 n n C8 H82 MES sing 290 n n S O1S MES doub 291 n n S O2S MES doub 292 n n S O3S MES sing 293 n n # _atom_sites.entry_id 5HLN _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.006115 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.003531 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.007061 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.011774 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 2 65C A 1 501 401 65C 902 . D 3 MG A 1 502 402 MG MG . E 4 MES A 1 503 1 MES MES . F 2 65C B 1 501 401 65C 902 . G 3 MG B 1 502 402 MG MG . H 4 MES B 1 503 2 MES MES . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 O O1 MES . . . H 4 65.397 -37.642 1.963 1 119.59 ? O1 MES 503 B 1 HETATM 2 C C2 MES . . . H 4 64.729 -37.537 0.698 1 111.1 ? C2 MES 503 B 1 HETATM 3 C C3 MES . . . H 4 63.307 -37.028 0.904 1 104.87 ? C3 MES 503 B 1 HETATM 4 N N4 MES . . . H 4 62.587 -37.96 1.807 1 108.2 ? N4 MES 503 B 1 HETATM 5 C C5 MES . . . H 4 63.274 -37.986 3.124 1 105.01 ? C5 MES 503 B 1 HETATM 6 C C6 MES . . . H 4 64.698 -38.468 2.907 1 114.26 ? C6 MES 503 B 1 HETATM 7 C C7 MES . . . H 4 61.12 -37.652 1.814 1 109.44 ? C7 MES 503 B 1 HETATM 8 C C8 MES . . . H 4 60.464 -37.329 3.165 1 107.64 ? C8 MES 503 B 1 HETATM 9 S S MES . . . H 4 59.412 -38.469 3.785 1 108.16 ? S MES 503 B 1 HETATM 10 O O1S MES . . . H 4 58.126 -37.756 3.756 1 118.21 ? O1S MES 503 B 1 HETATM 11 O O2S MES . . . H 4 59.251 -39.644 2.887 1 98.55 ? O2S MES 503 B 1 HETATM 12 O O3S MES . . . H 4 59.757 -38.869 5.21 1 95.97 ? O3S MES 503 B 1 # _model_server_stats.io_time_ms 8 _model_server_stats.parse_time_ms 9 _model_server_stats.create_model_time_ms 10 _model_server_stats.query_time_ms 232 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 12 #