data_5IRY # _model_server_result.job_id tt7sCsc9OI-fBOB1RazfwA _model_server_result.datetime_utc '2024-10-19 17:36:43' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 5iry # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"AA","auth_seq_id":606}' # _entry.id 5IRY # _exptl.entry_id 5IRY _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 40.078 _entity.id 4 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CALCIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 24 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 127.15 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 5IRY _cell.length_a 213.806 _cell.length_b 66.174 _cell.length_c 141.633 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 5IRY _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 5 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'C 1 2 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 4 E N N ? 4 F N N ? 4 G N N ? 4 H N N ? 4 I N N ? 4 J N N ? 4 K N N ? 4 L N N ? 4 M N N ? 4 N N N ? 4 O N N ? 4 P N N ? 4 V N N ? 4 W N N ? 4 X N N ? 4 Y N N ? 4 Z N N ? 4 AA N N ? 4 BA N N ? 4 CA N N ? 4 DA N N ? 4 EA N N ? 4 FA N N ? 4 GA N N # _pdbx_entity_branch.entity_id 2 _pdbx_entity_branch.type oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 2 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 2 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 2 n C NAG 1 C 1 NAG A 640 NAG 2 n C NAG 2 C 2 NAG A 644 NAG 2 n C BMA 3 C 3 BMA A 642 BMA # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 337 A CYS 337 1_555 A SG CYS 425 A CYS 425 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 450 A CYS 450 1_555 A SG CYS 533 A CYS 533 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 531 A CYS 531 1_555 A SG CYS 539 A CYS 539 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf4 B SG CYS 337 B CYS 337 1_555 B SG CYS 425 B CYS 425 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf5 B SG CYS 450 B CYS 450 1_555 B SG CYS 533 B CYS 533 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf6 B SG CYS 531 B CYS 531 1_555 B SG CYS 539 B CYS 539 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.011 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 31 A ASN 31 1_555 D C1 NAG . A NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale2 A OG SER 126 A SER 126 1_555 Q C1 MAN . A MAN 617 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale3 A OG1 THR 203 A THR 203 1_555 S C1 MAN . A MAN 619 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale4 A OG1 THR 205 A THR 205 1_555 T C1 MAN . A MAN 620 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 412 A ASN 412 1_555 C C1 NAG . C NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale6 A OG1 THR 426 A THR 426 1_555 R C1 MAN . A MAN 618 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? covale ? covale7 B OG SER 126 B SER 126 1_555 HA C1 MAN . B MAN 613 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale8 B OG1 THR 203 B THR 203 1_555 KA C1 MAN . B MAN 616 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale9 B OG1 THR 205 B THR 205 1_555 IA C1 MAN . B MAN 614 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale10 B OG SER 424 B SER 424 1_555 JA C1 MAN . B MAN 615 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale11 B OG1 THR 428 B THR 428 1_555 LA C1 MAN . B MAN 617 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale12 C O4 NAG . C NAG 1 1_555 C C1 NAG . C NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale13 C O4 NAG . C NAG 2 1_555 C C1 BMA . C BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.461 ? metalc ? metalc1 A OE1 GLU 11 A GLU 11 1_555 E CA CA . A CA 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.454 ? metalc ? metalc2 A OE2 GLU 11 A GLU 11 1_555 N CA CA . A CA 614 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.474 ? metalc ? metalc3 A OD1 ASP 67 A ASP 67 1_555 E CA CA . A CA 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.234 ? metalc ? metalc4 A OD2 ASP 67 A ASP 67 1_555 E CA CA . A CA 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.812 ? metalc ? metalc5 A OE1 GLU 69 A GLU 69 1_555 E CA CA . A CA 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.302 ? metalc ? metalc6 A OE2 GLU 69 A GLU 69 1_555 N CA CA . A CA 614 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.296 ? metalc ? metalc7 A OD2 ASP 100 A ASP 100 1_555 N CA CA . A CA 614 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.326 ? metalc ? metalc8 A O ASP 101 A ASP 101 1_555 N CA CA . A CA 614 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.327 ? metalc ? metalc9 A OD2 ASP 103 A ASP 103 1_555 E CA CA . A CA 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.315 ? metalc ? metalc10 A OD1 ASP 103 A ASP 103 1_555 N CA CA . A CA 614 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.23 ? metalc ? metalc11 A O ASN 104 A ASN 104 1_555 F CA CA . A CA 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.397 ? metalc ? metalc12 A OE1 GLU 119 A GLU 119 1_555 O CA CA . A CA 615 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.402 ? metalc ? metalc13 A OE1 GLU 119 A GLU 119 1_555 P CA CA . A CA 616 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.893 ? metalc ? metalc14 A OE2 GLU 119 A GLU 119 1_555 P CA CA . A CA 616 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.1 ? metalc ? metalc15 A OD1 ASN 120 A ASN 120 1_555 O CA CA . A CA 615 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.691 ? metalc ? metalc16 A OD1 ASP 134 A ASP 134 1_555 F CA CA . A CA 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.762 ? metalc ? metalc17 A OD2 ASP 134 A ASP 134 1_555 F CA CA . A CA 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.423 ? metalc ? metalc18 A OD2 ASP 136 A ASP 136 1_555 F CA CA . A CA 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.314 ? metalc ? metalc19 A OD1 ASP 136 A ASP 136 1_555 N CA CA . A CA 614 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.434 ? metalc ? metalc20 A O HIS 142 A HIS 142 1_555 F CA CA . A CA 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.563 ? metalc ? metalc21 A OD1 ASP 177 A ASP 177 1_555 O CA CA . A CA 615 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.497 ? metalc ? metalc22 A OE1 GLU 179 A GLU 179 1_555 O CA CA . A CA 615 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.099 ? metalc ? metalc23 A OE2 GLU 179 A GLU 179 1_555 P CA CA . A CA 616 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.108 ? metalc ? metalc24 A OD2 ASP 192 A ASP 192 1_555 F CA CA . A CA 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.394 ? metalc ? metalc25 A OD1 ASP 212 A ASP 212 1_555 P CA CA . A CA 616 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.432 ? metalc ? metalc26 A O GLU 213 A GLU 213 1_555 P CA CA . A CA 616 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.32 ? metalc ? metalc27 A OD1 ASN 214 A ASN 214 1_555 G CA CA . A CA 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.328 ? metalc ? metalc28 A OD2 ASP 215 A ASP 215 1_555 O CA CA . A CA 615 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.332 ? metalc ? metalc29 A OD1 ASP 215 A ASP 215 1_555 P CA CA . A CA 616 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.404 ? metalc ? metalc30 A O ASN 216 A ASN 216 1_555 G CA CA . A CA 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.381 ? metalc ? metalc31 A OE2 GLU 231 A GLU 231 1_555 H CA CA . A CA 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.861 ? metalc ? metalc32 A OE1 GLU 231 A GLU 231 1_555 L CA CA . A CA 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.306 ? metalc ? metalc33 A OE2 GLU 231 A GLU 231 1_555 L CA CA . A CA 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.689 ? metalc ? metalc34 A OD1 ASP 245 A ASP 245 1_555 G CA CA . A CA 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.347 ? metalc ? metalc35 A OD2 ASP 245 A ASP 245 1_555 G CA CA . A CA 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.492 ? metalc ? metalc36 A OD2 ASP 247 A ASP 247 1_555 G CA CA . A CA 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.51 ? metalc ? metalc37 A OD1 ASP 247 A ASP 247 1_555 P CA CA . A CA 616 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.619 ? metalc ? metalc38 A O HIS 253 A HIS 253 1_555 G CA CA . A CA 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.373 ? metalc ? metalc39 A OE2 GLU 291 A GLU 291 1_555 H CA CA . A CA 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.478 ? metalc ? metalc40 A OE1 GLU 291 A GLU 291 1_555 L CA CA . A CA 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.191 ? metalc ? metalc41 A OE2 GLU 291 A GLU 291 1_555 L CA CA . A CA 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.772 ? metalc ? metalc42 A OD1 ASN 304 A ASN 304 1_555 G CA CA . A CA 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.549 ? metalc ? metalc43 A OD1 ASP 330 A ASP 330 1_555 H CA CA . A CA 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.123 ? metalc ? metalc44 A O SER 331 A SER 331 1_555 H CA CA . A CA 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.299 ? metalc ? metalc45 A OD1 ASP 332 A ASP 332 1_555 M CA CA . A CA 613 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.519 ? metalc ? metalc46 A OD2 ASP 332 A ASP 332 1_555 M CA CA . A CA 613 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.376 ? metalc ? metalc47 A OE1 GLU 333 A GLU 333 1_555 L CA CA . A CA 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.443 ? metalc ? metalc48 A OE2 GLU 333 A GLU 333 1_555 L CA CA . A CA 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.279 ? metalc ? metalc49 A O GLU 333 A GLU 333 1_555 M CA CA . A CA 613 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.475 ? metalc ? metalc50 A OD1 ASP 348 A ASP 348 1_555 I CA CA . A CA 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.453 ? metalc ? metalc51 A OD1 ASP 348 A ASP 348 1_555 J CA CA . A CA 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.072 ? metalc ? metalc52 A OE1 GLU 365 A GLU 365 1_555 M CA CA . A CA 613 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.484 ? metalc ? metalc53 A OE2 GLU 365 A GLU 365 1_555 M CA CA . A CA 613 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.297 ? metalc ? metalc54 A OD1 ASP 400 A ASP 400 1_555 I CA CA . A CA 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.447 ? metalc ? metalc55 A OE1 GLU 402 A GLU 402 1_555 I CA CA . A CA 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.3 ? metalc ? metalc56 A OE2 GLU 402 A GLU 402 1_555 I CA CA . A CA 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.496 ? metalc ? metalc57 A OE2 GLU 402 A GLU 402 1_555 J CA CA . A CA 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.327 ? metalc ? metalc58 A OD2 ASP 435 A ASP 435 1_555 J CA CA . A CA 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.197 ? metalc ? metalc59 A O TYR 436 A TYR 436 1_555 J CA CA . A CA 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.493 ? metalc ? metalc60 A OD1 ASN 437 A ASN 437 1_555 K CA CA . A CA 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.697 ? metalc ? metalc61 A OD2 ASP 438 A ASP 438 1_555 I CA CA . A CA 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.332 ? metalc ? metalc62 A OD1 ASP 438 A ASP 438 1_555 J CA CA . A CA 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.636 ? metalc ? metalc63 A O HIS 439 A HIS 439 1_555 K CA CA . A CA 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.088 ? metalc ? metalc64 A OD1 ASP 463 A ASP 463 1_555 K CA CA . A CA 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.964 ? metalc ? metalc65 A OD2 ASP 463 A ASP 463 1_555 K CA CA . A CA 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.167 ? metalc ? metalc66 A OD1 ASP 465 A ASP 465 1_555 J CA CA . A CA 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.832 ? metalc ? metalc67 A OD2 ASP 465 A ASP 465 1_555 K CA CA . A CA 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.865 ? metalc ? metalc68 A O ASN 469 A ASN 469 1_555 K CA CA . A CA 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.756 ? metalc ? metalc69 A OD2 ASP 516 A ASP 516 1_555 K CA CA . A CA 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.254 ? metalc ? metalc70 B OE1 GLU 11 B GLU 11 1_555 V CA CA . B CA 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.622 ? metalc ? metalc71 B OE2 GLU 11 B GLU 11 1_555 DA CA CA . B CA 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.527 ? metalc ? metalc72 B OD1 ASP 67 B ASP 67 1_555 V CA CA . B CA 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.182 ? metalc ? metalc73 B OD2 ASP 67 B ASP 67 1_555 V CA CA . B CA 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.661 ? metalc ? metalc74 B OE1 GLU 69 B GLU 69 1_555 V CA CA . B CA 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.441 ? metalc ? metalc75 B OE2 GLU 69 B GLU 69 1_555 DA CA CA . B CA 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.281 ? metalc ? metalc76 B OD1 ASP 100 B ASP 100 1_555 DA CA CA . B CA 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.534 ? metalc ? metalc77 B OD2 ASP 100 B ASP 100 1_555 DA CA CA . B CA 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.272 ? metalc ? metalc78 B O ASP 101 B ASP 101 1_555 DA CA CA . B CA 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.227 ? metalc ? metalc79 B OD1 ASN 102 B ASN 102 1_555 W CA CA . B CA 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.62 ? metalc ? metalc80 B OD2 ASP 103 B ASP 103 1_555 V CA CA . B CA 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.319 ? metalc ? metalc81 B OD1 ASP 103 B ASP 103 1_555 DA CA CA . B CA 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.496 ? metalc ? metalc82 B O ASN 104 B ASN 104 1_555 W CA CA . B CA 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.305 ? metalc ? metalc83 B OE2 GLU 119 B GLU 119 1_555 EA CA CA . B CA 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.452 ? metalc ? metalc84 B OE1 GLU 119 B GLU 119 1_555 FA CA CA . B CA 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.475 ? metalc ? metalc85 B OD1 ASP 134 B ASP 134 1_555 W CA CA . B CA 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.653 ? metalc ? metalc86 B OD2 ASP 134 B ASP 134 1_555 W CA CA . B CA 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.464 ? metalc ? metalc87 B OD2 ASP 136 B ASP 136 1_555 W CA CA . B CA 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.348 ? metalc ? metalc88 B OD1 ASP 136 B ASP 136 1_555 DA CA CA . B CA 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.409 ? metalc ? metalc89 B O HIS 142 B HIS 142 1_555 W CA CA . B CA 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.481 ? metalc ? metalc90 B OD1 ASP 177 B ASP 177 1_555 FA CA CA . B CA 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.402 ? metalc ? metalc91 B OD2 ASP 177 B ASP 177 1_555 FA CA CA . B CA 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.713 ? metalc ? metalc92 B OE2 GLU 179 B GLU 179 1_555 EA CA CA . B CA 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.999 ? metalc ? metalc93 B OE1 GLU 179 B GLU 179 1_555 FA CA CA . B CA 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.346 ? metalc ? metalc94 B OD2 ASP 192 B ASP 192 1_555 W CA CA . B CA 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.47 ? metalc ? metalc95 B OD1 ASP 212 B ASP 212 1_555 EA CA CA . B CA 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.946 ? metalc ? metalc96 B O GLU 213 B GLU 213 1_555 EA CA CA . B CA 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.732 ? metalc ? metalc97 B OD1 ASN 214 B ASN 214 1_555 X CA CA . B CA 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.432 ? metalc ? metalc98 B OD1 ASP 215 B ASP 215 1_555 EA CA CA . B CA 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.54 ? metalc ? metalc99 B OD2 ASP 215 B ASP 215 1_555 FA CA CA . B CA 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.085 ? metalc ? metalc100 B O ASN 216 B ASN 216 1_555 X CA CA . B CA 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.584 ? metalc ? metalc101 B OE2 GLU 231 B GLU 231 1_555 Y CA CA . B CA 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.318 ? metalc ? metalc102 B OE1 GLU 231 B GLU 231 1_555 Z CA CA . B CA 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.578 ? metalc ? metalc103 B OD1 ASP 245 B ASP 245 1_555 X CA CA . B CA 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.692 ? metalc ? metalc104 B OD2 ASP 245 B ASP 245 1_555 X CA CA . B CA 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.177 ? metalc ? metalc105 B OD2 ASP 247 B ASP 247 1_555 X CA CA . B CA 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.768 ? metalc ? metalc106 B OD1 ASP 247 B ASP 247 1_555 EA CA CA . B CA 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.686 ? metalc ? metalc107 B O HIS 253 B HIS 253 1_555 X CA CA . B CA 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.26 ? metalc ? metalc108 B OD1 ASN 289 B ASN 289 1_555 Z CA CA . B CA 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.87 ? metalc ? metalc109 B OE2 GLU 291 B GLU 291 1_555 Y CA CA . B CA 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.414 ? metalc ? metalc110 B OE1 GLU 291 B GLU 291 1_555 Z CA CA . B CA 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.151 ? metalc ? metalc111 B OD1 ASP 330 B ASP 330 1_555 Y CA CA . B CA 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.693 ? metalc ? metalc112 B O SER 331 B SER 331 1_555 Y CA CA . B CA 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.402 ? metalc ? metalc113 B OD1 ASP 332 B ASP 332 1_555 GA CA CA . B CA 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.854 ? metalc ? metalc114 B OE1 GLU 333 B GLU 333 1_555 Y CA CA . B CA 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.691 ? metalc ? metalc115 B OE2 GLU 333 B GLU 333 1_555 Y CA CA . B CA 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.746 ? metalc ? metalc116 B OE1 GLU 333 B GLU 333 1_555 Z CA CA . B CA 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.737 ? metalc ? metalc117 B OE2 GLU 333 B GLU 333 1_555 Z CA CA . B CA 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.34 ? metalc ? metalc118 B O GLU 333 B GLU 333 1_555 GA CA CA . B CA 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.534 ? metalc ? metalc119 B OD2 ASP 348 B ASP 348 1_555 AA CA CA . B CA 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.024 ? metalc ? metalc120 B OD2 ASP 348 B ASP 348 1_555 BA CA CA . B CA 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.593 ? metalc ? metalc121 B OD1 ASP 363 B ASP 363 1_555 GA CA CA . B CA 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.954 ? metalc ? metalc122 B OE1 GLU 365 B GLU 365 1_555 GA CA CA . B CA 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.244 ? metalc ? metalc123 B OE2 GLU 365 B GLU 365 1_555 GA CA CA . B CA 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.481 ? metalc ? metalc124 B OD1 ASP 400 B ASP 400 1_555 AA CA CA . B CA 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.311 ? metalc ? metalc125 B OE2 GLU 402 B GLU 402 1_555 AA CA CA . B CA 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.499 ? metalc ? metalc126 B OE1 GLU 402 B GLU 402 1_555 BA CA CA . B CA 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.816 ? metalc ? metalc127 B OE2 GLU 402 B GLU 402 1_555 BA CA CA . B CA 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.814 ? metalc ? metalc128 B OD2 ASP 435 B ASP 435 1_555 BA CA CA . B CA 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.814 ? metalc ? metalc129 B O TYR 436 B TYR 436 1_555 BA CA CA . B CA 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.336 ? metalc ? metalc130 B OD1 ASN 437 B ASN 437 1_555 CA CA CA . B CA 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.471 ? metalc ? metalc131 B OD1 ASP 438 B ASP 438 1_555 AA CA CA . B CA 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.06 ? metalc ? metalc132 B OD2 ASP 438 B ASP 438 1_555 AA CA CA . B CA 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.404 ? metalc ? metalc133 B OD1 ASP 438 B ASP 438 1_555 BA CA CA . B CA 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.711 ? metalc ? metalc134 B OD2 ASP 438 B ASP 438 1_555 BA CA CA . B CA 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.952 ? metalc ? metalc135 B O HIS 439 B HIS 439 1_555 CA CA CA . B CA 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.853 ? metalc ? metalc136 B OD1 ASP 463 B ASP 463 1_555 CA CA CA . B CA 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.612 ? metalc ? metalc137 B OD2 ASP 463 B ASP 463 1_555 CA CA CA . B CA 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.392 ? metalc ? metalc138 B OD1 ASP 465 B ASP 465 1_555 BA CA CA . B CA 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.241 ? metalc ? metalc139 B OD2 ASP 465 B ASP 465 1_555 CA CA CA . B CA 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.433 ? metalc ? metalc140 B O ASN 469 B ASN 469 1_555 CA CA CA . B CA 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.576 ? metalc ? metalc141 B OD2 ASP 516 B ASP 516 1_555 CA CA CA . B CA 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.512 ? # _chem_comp.formula 'Ca 2' _chem_comp.formula_weight 40.078 _chem_comp.id CA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CALCIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 5IRY _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.004677 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.003543 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.015112 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.008858 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code D 3 NAG A 1 604 643 NAG NAG . E 4 CA A 1 605 10 CA CA . F 4 CA A 1 606 12 CA CA . G 4 CA A 1 607 16 CA CA . H 4 CA A 1 608 17 CA CA . I 4 CA A 1 609 18 CA CA . J 4 CA A 1 610 19 CA CA . K 4 CA A 1 611 20 CA CA . L 4 CA A 1 612 24 CA CA . M 4 CA A 1 613 25 CA CA . N 4 CA A 1 614 31 CA CA . O 4 CA A 1 615 32 CA CA . P 4 CA A 1 616 33 CA CA . Q 5 MAN A 1 617 5 MAN MAN . R 5 MAN A 1 618 9 MAN MAN . S 5 MAN A 1 619 14 MAN MAN . T 5 MAN A 1 620 15 MAN MAN . U 6 EDO A 1 621 2 EDO EDO . V 4 CA B 1 601 1 CA CA . W 4 CA B 1 602 3 CA CA . X 4 CA B 1 603 6 CA CA . Y 4 CA B 1 604 7 CA CA . Z 4 CA B 1 605 8 CA CA . AA 4 CA B 1 606 13 CA CA . BA 4 CA B 1 607 23 CA CA . CA 4 CA B 1 608 26 CA CA . DA 4 CA B 1 609 27 CA CA . EA 4 CA B 1 610 28 CA CA . FA 4 CA B 1 611 29 CA CA . GA 4 CA B 1 612 30 CA CA . HA 5 MAN B 1 613 1 MAN MAN . IA 5 MAN B 1 614 3 MAN MAN . JA 5 MAN B 1 615 4 MAN MAN . KA 5 MAN B 1 616 12 MAN MAN . LA 5 MAN B 1 617 13 MAN MAN . MA 7 HOH A 1 701 10 HOH HOH . MA 7 HOH A 2 702 13 HOH HOH . MA 7 HOH A 3 703 11 HOH HOH . MA 7 HOH A 4 704 17 HOH HOH . MA 7 HOH A 5 705 12 HOH HOH . MA 7 HOH A 6 706 14 HOH HOH . MA 7 HOH A 7 707 8 HOH HOH . MA 7 HOH A 8 708 18 HOH HOH . MA 7 HOH A 9 709 16 HOH HOH . NA 7 HOH B 1 701 19 HOH HOH . NA 7 HOH B 2 702 3 HOH HOH . NA 7 HOH B 3 703 15 HOH HOH . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CA _atom_site.label_atom_id CA _atom_site.label_comp_id CA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id AA _atom_site.label_entity_id 4 _atom_site.Cartn_x 272.65 _atom_site.Cartn_y 21.394 _atom_site.Cartn_z 192.779 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 236.95 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CA _atom_site.auth_comp_id CA _atom_site.auth_seq_id 606 _atom_site.auth_asym_id B _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 13 _model_server_stats.parse_time_ms 12 _model_server_stats.create_model_time_ms 18 _model_server_stats.query_time_ms 272 _model_server_stats.encode_time_ms 21 _model_server_stats.element_count 1 #