data_5JHS # _model_server_result.job_id 0K7NhEdMtruLM-SIPXme8g _model_server_result.datetime_utc '2024-11-16 16:44:14' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 5jhs # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"QA","auth_seq_id":302}' # _entry.id 5JHS # _exptl.entry_id 5JHS _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 195.237 _entity.id 18 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description '2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID' _entity.pdbx_number_of_molecules 4 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 113.17 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 5JHS _cell.length_a 135.85 _cell.length_b 300 _cell.length_c 145.32 _cell.Z_PDB 4 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 5JHS _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 4 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1 21 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 28-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 28 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 18 FA N N ? 18 KA N N ? 18 OA N N ? 18 QA N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale ? covale1 H N THR 1 H THR 1 1_555 EA C45 6KG . H 6KG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.506 ? covale ? covale2 H OG1 THR 1 H THR 1 1_555 EA C43 6KG . H 6KG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale3 K N THR 1 K THR 1 1_555 IA C45 6KG . K 6KG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.496 ? covale ? covale4 K OG1 THR 1 K THR 1 1_555 IA C43 6KG . K 6KG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale5 Y N THR 1 Y THR 1 1_555 PA C45 6KG . Y 6KG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.487 ? covale ? covale6 Y OG1 THR 1 Y THR 1 1_555 PA C43 6KG . Y 6KG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.352 ? metalc ? metalc1 G OG1 THR 17 G THR 8 1_555 CA MG MG . G MG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.524 ? metalc ? metalc2 G O TYR 128 G TYR 119 1_555 CA MG MG . G MG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.72 ? metalc ? metalc3 G O ARG 131 G ARG 122 1_555 CA MG MG . G MG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.511 ? metalc ? metalc4 G O MET 134 G MET 125 1_555 CA MG MG . G MG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.294 ? metalc ? metalc5 I O ALA 175 I ALA 174 1_555 GA MG MG . I MG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.891 ? metalc ? metalc6 I O ASP 178 I ASP 177 1_555 GA MG MG . I MG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.497 ? metalc ? metalc7 I O SER 181 I SER 180 1_555 GA MG MG . I MG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.662 ? metalc ? metalc8 I O ASP 205 I ASP 204 1_555 HA MG MG . I MG 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.224 ? metalc ? metalc9 HA MG MG . I MG 302 1_555 Y O ALA 165 Y ALA 165 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.646 ? metalc ? metalc10 HA MG MG . I MG 302 1_555 Y O ASP 168 Y ASP 168 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.169 ? metalc ? metalc11 HA MG MG . I MG 302 1_555 Y O SER 171 Y SER 171 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.958 ? metalc ? metalc12 K O ALA 165 K ALA 165 1_555 JA MG MG . K MG 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.378 ? metalc ? metalc13 K O ASP 168 K ASP 168 1_555 JA MG MG . K MG 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.169 ? metalc ? metalc14 K O SER 171 K SER 171 1_555 JA MG MG . K MG 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.79 ? metalc ? metalc15 JA MG MG . K MG 302 1_555 W O ASP 205 W ASP 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.313 ? metalc ? metalc16 L OXT ASP 222 L ASP 222 1_555 LA MG MG . L MG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.066 ? metalc ? metalc17 LA MG MG . L MG 301 1_555 V O ILE 163 V ILE 163 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.358 ? metalc ? metalc18 LA MG MG . L MG 301 1_555 V O ASP 166 V ASP 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.114 ? metalc ? metalc19 LA MG MG . L MG 301 1_555 V O SER 169 V SER 169 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.901 ? metalc ? metalc20 N O ILE 163 N ILE 163 1_555 MA MG MG . N MG 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.667 ? metalc ? metalc21 N O ASP 166 N ASP 166 1_555 MA MG MG . N MG 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.896 ? metalc ? metalc22 N O SER 169 N SER 169 1_555 MA MG MG . N MG 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.47 ? metalc ? metalc23 Z O THR 192 Z THR 192 1_555 RA MG MG . Z MG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.859 ? metalc ? metalc24 Z O VAL 198 Z VAL 198 1_555 RA MG MG . Z MG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.716 ? # _chem_comp.formula 'C6 H13 N O4 S' _chem_comp.formula_weight 195.237 _chem_comp.id MES _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name '2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag O1 C2 MES sing 322 n n O1 C6 MES sing 323 n n C2 C3 MES sing 324 n n C2 H21 MES sing 325 n n C2 H22 MES sing 326 n n C3 N4 MES sing 327 n n C3 H31 MES sing 328 n n C3 H32 MES sing 329 n n N4 C5 MES sing 330 n n N4 C7 MES sing 331 n n N4 HN4 MES sing 332 n n C5 C6 MES sing 333 n n C5 H51 MES sing 334 n n C5 H52 MES sing 335 n n C6 H61 MES sing 336 n n C6 H62 MES sing 337 n n C7 C8 MES sing 338 n n C7 H71 MES sing 339 n n C7 H72 MES sing 340 n n C8 S MES sing 341 n n C8 H81 MES sing 342 n n C8 H82 MES sing 343 n n S O1S MES doub 344 n n S O2S MES doub 345 n n S O3S MES sing 346 n n # _atom_sites.entry_id 5JHS _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.007361 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.00315 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.003333 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.007485 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code CA 15 MG G 1 301 6 MG MG . DA 16 CL G 1 302 8 CL CL . EA 17 6KG H 1 301 1 6KG LIG . FA 18 MES H 1 302 12 MES MES . GA 15 MG I 1 301 7 MG MG . HA 15 MG I 1 302 4 MG MG . IA 17 6KG K 1 301 1 6KG LIG . JA 15 MG K 1 302 1 MG MG . KA 18 MES K 1 303 13 MES MES . LA 15 MG L 1 301 2 MG MG . MA 15 MG N 1 201 5 MG MG . NA 16 CL U 1 301 9 CL CL . OA 18 MES V 1 301 14 MES MES . PA 17 6KG Y 1 301 1 6KG LIG . QA 18 MES Y 1 302 15 MES MES . RA 15 MG Z 1 301 3 MG MG . SA 19 HOH N 1 301 1 HOH HOH . TA 19 HOH V 1 401 4 HOH HOH . UA 19 HOH W 1 301 3 HOH HOH . UA 19 HOH W 2 302 5 HOH HOH . VA 19 HOH b 1 201 2 HOH HOH . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 O O1 MES . . . QA 18 47.004 -157.801 8.314 1 65.21 ? O1 MES 302 Y 1 HETATM 2 C C2 MES . . . QA 18 47.671 -158.289 9.477 1 57.67 ? C2 MES 302 Y 1 HETATM 3 C C3 MES . . . QA 18 48.503 -157.172 10.088 1 57.92 ? C3 MES 302 Y 1 HETATM 4 N N4 MES . . . QA 18 49.485 -156.664 9.11 1 59.77 ? N4 MES 302 Y 1 HETATM 5 C C5 MES . . . QA 18 48.826 -156.26 7.843 1 58.24 ? C5 MES 302 Y 1 HETATM 6 C C6 MES . . . QA 18 47.921 -157.367 7.307 1 58.18 ? C6 MES 302 Y 1 HETATM 7 C C7 MES . . . QA 18 50.161 -155.505 9.732 1 60.17 ? C7 MES 302 Y 1 HETATM 8 C C8 MES . . . QA 18 51.399 -155.098 8.94 1 62.38 ? C8 MES 302 Y 1 HETATM 9 S S MES . . . QA 18 52.304 -154.016 9.817 1 71.35 ? S MES 302 Y 1 HETATM 10 O O1S MES . . . QA 18 53.389 -153.524 8.938 1 82.25 ? O1S MES 302 Y 1 HETATM 11 O O2S MES . . . QA 18 51.451 -152.876 10.236 1 79.14 ? O2S MES 302 Y 1 HETATM 12 O O3S MES . . . QA 18 52.875 -154.678 11.015 1 70.69 ? O3S MES 302 Y 1 # _model_server_stats.io_time_ms 95 _model_server_stats.parse_time_ms 49 _model_server_stats.create_model_time_ms 91 _model_server_stats.query_time_ms 288 _model_server_stats.encode_time_ms 6 _model_server_stats.element_count 12 #