data_5JSA # _model_server_result.job_id 0cdhvMT-baGDcluzSFnVcg _model_server_result.datetime_utc '2025-02-26 12:26:12' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 5jsa # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"V","auth_seq_id":615}' # _entry.id 5JSA # _exptl.entry_id 5JSA _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 16 _entity.src_method man _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 5JSA _cell.length_a 266.279 _cell.length_b 266.279 _cell.length_c 266.279 _cell.Z_PDB 24 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 5JSA _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 197 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'I 2 3' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details octadecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 18 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W 1 1 A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W 1 2 A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W 1 3 # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 2 'crystal symmetry operation' 5_555 z,x,y 0 0 1 1 0 0 0 1 0 0 0 0 3 'crystal symmetry operation' 9_555 y,z,x 0 1 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 16 V N N ? 16 W N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 7 oligosaccharide 8 oligosaccharide 9 oligosaccharide 10 oligosaccharide 11 oligosaccharide 12 oligosaccharide 13 oligosaccharide 14 oligosaccharide 15 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 7 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 8 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 8 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 4 ? 8 4 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 5 ? 8 5 4 MAN MAN C1 O1 . O2 HO2 . sing 6 ? 8 6 3 MAN BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing 7 ? 8 7 6 MAN MAN C1 O1 . O3 HO3 . sing 8 ? 8 8 6 MAN MAN C1 O1 . O6 HO6 . sing 9 ? 9 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 10 ? 9 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 11 ? 9 4 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 12 ? 9 5 4 MAN MAN C1 O1 . O2 HO2 . sing 13 ? 9 6 5 MAN MAN C1 O1 . O2 HO2 . sing 14 ? 9 7 3 MAN BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing 15 ? 9 8 7 MAN MAN C1 O1 . O6 HO6 . sing 16 ? 9 9 8 MAN MAN C1 O1 . O2 HO2 . sing 17 ? 9 10 7 MAN MAN C1 O1 . O3 HO3 . sing 18 ? 10 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 19 ? 10 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 20 ? 10 4 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 21 ? 10 5 4 MAN MAN C1 O1 . O2 HO2 . sing 22 ? 10 6 5 MAN MAN C1 O1 . O2 HO2 . sing 23 ? 10 7 3 MAN BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing 24 ? 10 8 7 MAN MAN C1 O1 . O3 HO3 . sing 25 ? 10 9 7 MAN MAN C1 O1 . O6 HO6 . sing 26 ? 11 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 27 ? 11 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 28 ? 11 4 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 29 ? 11 5 4 MAN MAN C1 O1 . O2 HO2 . sing 30 ? 11 6 5 MAN MAN C1 O1 . O2 HO2 . sing 31 ? 11 7 3 MAN BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing 32 ? 12 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 33 ? 12 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 34 ? 12 4 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 35 ? 12 5 4 MAN MAN C1 O1 . O2 HO2 . sing 36 ? 13 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 37 ? 13 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 38 ? 14 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 39 ? 14 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 40 ? 14 4 3 MAN BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing 41 ? 15 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 42 ? 15 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 43 ? 15 4 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 44 ? 15 5 4 MAN MAN C1 O1 . O2 HO2 . sing 45 ? 15 6 5 MAN MAN C1 O1 . O2 HO2 . sing 46 ? 15 7 3 MAN BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing 47 ? 15 8 7 MAN MAN C1 O1 . O3 HO3 . sing 48 ? 15 9 8 MAN MAN C1 O1 . O2 HO2 . sing 49 ? 15 10 7 MAN MAN C1 O1 . O6 HO6 . sing 50 ? 15 11 10 MAN MAN C1 O1 . O2 HO2 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 7 n G NAG 1 G 1 NAG C 602 NAG 7 n G NAG 2 G 2 NAG C 603 NAG 7 n H NAG 1 H 1 NAG C 605 NAG 7 n H NAG 2 H 2 NAG C 606 NAG 7 n I NAG 1 I 1 NAG C 608 NAG 7 n I NAG 2 I 2 NAG C 609 NAG 8 n J NAG 1 J 1 NAG C 612 NAG 8 n J NAG 2 J 2 NAG C 613 NAG 8 n J BMA 3 J 3 BMA C 614 BMA 8 n J MAN 4 J 4 MAN C 615 MAN 8 n J MAN 5 J 5 MAN C 616 MAN 8 n J MAN 6 J 6 MAN C 618 MAN 8 n J MAN 7 J 7 MAN C 620 MAN 8 n J MAN 8 J 8 MAN C 619 MAN 9 n K NAG 1 K 1 NAG C 622 NAG 9 n K NAG 2 K 2 NAG C 623 NAG 9 n K BMA 3 K 3 BMA C 626 BMA 9 n K MAN 4 K 4 MAN C 627 MAN 9 n K MAN 5 K 5 MAN C 630 MAN 9 n K MAN 6 K 6 MAN C 631 MAN 9 n K MAN 7 K 7 MAN C 628 MAN 9 n K MAN 8 K 8 MAN C 624 MAN 9 n K MAN 9 K 9 MAN C 625 MAN 9 n K MAN 10 K 10 MAN C 629 MAN 10 n L NAG 1 L 1 NAG C 632 NAG 10 n L NAG 2 L 2 NAG C 633 NAG 10 n L BMA 3 L 3 BMA C 634 BMA 10 n L MAN 4 L 4 MAN C 638 MAN 10 n L MAN 5 L 5 MAN C 639 MAN 10 n L MAN 6 L 6 MAN C 640 MAN 10 n L MAN 7 L 7 MAN C 635 MAN 10 n L MAN 8 L 8 MAN C 636 MAN 10 n L MAN 9 L 9 MAN C 637 MAN 11 n M NAG 1 M 1 NAG C 641 NAG 11 n M NAG 2 M 2 NAG C 642 NAG 11 n M BMA 3 M 3 BMA C 643 BMA 11 n M MAN 4 M 4 MAN C 645 MAN 11 n M MAN 5 M 5 MAN C 646 MAN 11 n M MAN 6 M 6 MAN C 647 MAN 11 n M MAN 7 M 7 MAN C 644 MAN 12 n N NAG 1 N 1 NAG C 648 NAG 12 n N NAG 2 N 2 NAG C 649 NAG 12 n N BMA 3 N 3 BMA C 650 BMA 12 n N MAN 4 N 4 MAN C 651 MAN 12 n N MAN 5 N 5 MAN C 652 MAN 13 n O NAG 1 O 1 NAG C 653 NAG 13 n O NAG 2 O 2 NAG C 654 NAG 13 n O BMA 3 O 3 BMA C 655 BMA 13 n P NAG 1 P 1 NAG C 657 NAG 13 n P NAG 2 P 2 NAG C 658 NAG 13 n P BMA 3 P 3 BMA C 659 BMA 13 n Q NAG 1 Q 1 NAG C 660 NAG 13 n Q NAG 2 Q 2 NAG C 661 NAG 13 n Q BMA 3 Q 3 BMA C 662 BMA 13 n R NAG 1 R 1 NAG Y 657 NAG 13 n R NAG 2 R 2 NAG Y 658 NAG 13 n R BMA 3 R 3 BMA Y 659 BMA 13 n S NAG 1 S 1 NAG Z 657 NAG 13 n S NAG 2 S 2 NAG Z 658 NAG 13 n S BMA 3 S 3 BMA Z 659 BMA 14 n T NAG 1 T 1 NAG D 701 NAG 14 n T NAG 2 T 2 NAG D 702 NAG 14 n T BMA 3 T 3 BMA D 703 BMA 14 n T MAN 4 T 4 MAN D 704 MAN 15 n U NAG 1 U 1 NAG E 301 NAG 15 n U NAG 2 U 2 NAG E 302 NAG 15 n U BMA 3 U 3 BMA E 303 BMA 15 n U MAN 4 U 4 MAN E 304 MAN 15 n U MAN 5 U 5 MAN E 305 MAN 15 n U MAN 6 U 6 MAN E 306 MAN 15 n U MAN 7 U 7 MAN E 307 MAN 15 n U MAN 8 U 8 MAN E 309 MAN 15 n U MAN 9 U 9 MAN E 311 MAN 15 n U MAN 10 U 10 MAN E 308 MAN 15 n U MAN 11 U 11 MAN E 310 MAN # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 22 A CYS 22 1_555 A SG CYS 103 A CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 32 A CYS 32 1_555 A SG CYS 56 A CYS 52 1_555 ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 162 A CYS 142 1_555 A SG CYS 218 A CYS 208 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf4 B SG CYS 22 B CYS 23 1_555 B SG CYS 85 B CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf5 B SG CYS 133 B CYS 134 1_555 B SG CYS 192 B CYS 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf6 C SG CYS 24 C CYS 54 1_555 C SG CYS 44 C CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf7 C SG CYS 89 C CYS 119 1_555 C SG CYS 174 C CYS 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf8 C SG CYS 96 C CYS 126 1_555 C SG CYS 165 C CYS 195 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf9 C SG CYS 101 C CYS 131 1_555 C SG CYS 118 C CYS 148 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf10 C SG CYS 187 C CYS 217 1_555 C SG CYS 216 C CYS 246 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf11 C SG CYS 197 C CYS 227 1_555 C SG CYS 208 C CYS 238 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf12 C SG CYS 346 C CYS 376 1_555 C SG CYS 412 C CYS 442 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf13 C SG CYS 353 C CYS 383 1_555 C SG CYS 385 C CYS 415 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf14 C SG CYS 468 C CYS 498 1_555 D SG CYS 83 D CYS 594 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf15 D SG CYS 76 D CYS 587 1_555 D SG CYS 82 D CYS 593 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf16 E SG CYS 22 E CYS 22 1_555 E SG CYS 99 E CYS 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf17 E SG CYS 159 E CYS 159 1_555 E SG CYS 215 E CYS 215 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf18 F SG CYS 23 F CYS 23 1_555 F SG CYS 89 F CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf19 F SG CYS 135 F CYS 134 1_555 F SG CYS 195 F CYS 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? covale ? covale1 C ND2 ASN 103 C ASN 133 1_555 V C1 NAG . C NAG 615 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale2 C ND2 ASN 117 C ASN 147 1_555 G C1 NAG . G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale3 C ND2 ASN 121 C ASN 151 1_555 S C1 NAG . S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale4 C ND2 ASN 166 C ASN 196 1_555 H C1 NAG . H NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale5 C ND2 ASN 203 C ASN 233 1_555 U C1 NAG . U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale6 C ND2 ASN 231 C ASN 261 1_555 M C1 NAG . M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale7 C ND2 ASN 245 C ASN 275 1_555 J C1 NAG . J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale8 C ND2 ASN 264 C ASN 294 1_555 N C1 NAG . N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale9 C ND2 ASN 270 C ASN 300 1_555 L C1 NAG . L NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale10 C ND2 ASN 300 C ASN 330 1_555 K C1 NAG . K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale11 C ND2 ASN 307 C ASN 337 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale12 C ND2 ASN 331 C ASN 361 1_555 O C1 NAG . O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale13 C ND2 ASN 354 C ASN 384 1_555 I C1 NAG . I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale14 C ND2 ASN 360 C ASN 390 1_555 P C1 NAG . P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale15 C ND2 ASN 415 C ASN 445 1_555 R C1 NAG . R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale16 D ND2 ASN 89 D ASN 600 1_555 W C1 NAG . D NAG 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale17 D ND2 ASN 115 D ASN 626 1_555 T C1 NAG . T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? covale ? covale18 G O4 NAG . G NAG 1 1_555 G C1 NAG . G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale19 H O4 NAG . H NAG 1 1_555 H C1 NAG . H NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale20 I O4 NAG . I NAG 1 1_555 I C1 NAG . I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale21 J O4 NAG . J NAG 1 1_555 J C1 NAG . J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.427 ? covale ? covale22 J O4 NAG . J NAG 2 1_555 J C1 BMA . J BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale23 J O3 BMA . J BMA 3 1_555 J C1 MAN . J MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale24 J O6 BMA . J BMA 3 1_555 J C1 MAN . J MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale25 J O2 MAN . J MAN 4 1_555 J C1 MAN . J MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale26 J O3 MAN . J MAN 6 1_555 J C1 MAN . J MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale27 J O6 MAN . J MAN 6 1_555 J C1 MAN . J MAN 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.457 ? covale ? covale28 K O4 NAG . K NAG 1 1_555 K C1 NAG . K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale29 K O4 NAG . K NAG 2 1_555 K C1 BMA . K BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale30 K O3 BMA . K BMA 3 1_555 K C1 MAN . K MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale31 K O6 BMA . K BMA 3 1_555 K C1 MAN . K MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale32 K O2 MAN . K MAN 4 1_555 K C1 MAN . K MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale33 K O2 MAN . K MAN 5 1_555 K C1 MAN . K MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale34 K O6 MAN . K MAN 7 1_555 K C1 MAN . K MAN 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale35 K O3 MAN . K MAN 7 1_555 K C1 MAN . K MAN 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale36 K O2 MAN . K MAN 8 1_555 K C1 MAN . K MAN 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale37 L O4 NAG . L NAG 1 1_555 L C1 NAG . L NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.429 ? covale ? covale38 L O4 NAG . L NAG 2 1_555 L C1 BMA . L BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale39 L O3 BMA . L BMA 3 1_555 L C1 MAN . L MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale40 L O6 BMA . L BMA 3 1_555 L C1 MAN . L MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale41 L O2 MAN . L MAN 4 1_555 L C1 MAN . L MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale42 L O2 MAN . L MAN 5 1_555 L C1 MAN . L MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale43 L O3 MAN . L MAN 7 1_555 L C1 MAN . L MAN 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale44 L O6 MAN . L MAN 7 1_555 L C1 MAN . L MAN 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale45 M O4 NAG . M NAG 1 1_555 M C1 NAG . M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale46 M O4 NAG . M NAG 2 1_555 M C1 BMA . M BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale47 M O3 BMA . M BMA 3 1_555 M C1 MAN . M MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale48 M O6 BMA . M BMA 3 1_555 M C1 MAN . M MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale49 M O2 MAN . M MAN 4 1_555 M C1 MAN . M MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale50 M O2 MAN . M MAN 5 1_555 M C1 MAN . M MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale51 N O4 NAG . N NAG 1 1_555 N C1 NAG . N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale52 N O4 NAG . N NAG 2 1_555 N C1 BMA . N BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale53 N O3 BMA . N BMA 3 1_555 N C1 MAN . N MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale54 N O2 MAN . N MAN 4 1_555 N C1 MAN . N MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.457 ? covale ? covale55 O O4 NAG . O NAG 1 1_555 O C1 NAG . O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale56 O O4 NAG . O NAG 2 1_555 O C1 BMA . O BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale57 P O4 NAG . P NAG 1 1_555 P C1 NAG . P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale58 P O4 NAG . P NAG 2 1_555 P C1 BMA . P BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale59 Q O4 NAG . Q NAG 1 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale60 Q O4 NAG . Q NAG 2 1_555 Q C1 BMA . Q BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.417 ? covale ? covale61 R O4 NAG . R NAG 1 1_555 R C1 NAG . R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale62 R O4 NAG . R NAG 2 1_555 R C1 BMA . R BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale63 S O4 NAG . S NAG 1 1_555 S C1 NAG . S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale64 S O4 NAG . S NAG 2 1_555 S C1 BMA . S BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale65 T O4 NAG . T NAG 1 1_555 T C1 NAG . T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale66 T O4 NAG . T NAG 2 1_555 T C1 BMA . T BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale67 T O6 BMA . T BMA 3 1_555 T C1 MAN . T MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? covale ? covale68 U O4 NAG . U NAG 1 1_555 U C1 NAG . U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale69 U O4 NAG . U NAG 2 1_555 U C1 BMA . U BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale70 U O3 BMA . U BMA 3 1_555 U C1 MAN . U MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale71 U O6 BMA . U BMA 3 1_555 U C1 MAN . U MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale72 U O2 MAN . U MAN 4 1_555 U C1 MAN . U MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale73 U O2 MAN . U MAN 5 1_555 U C1 MAN . U MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale74 U O3 MAN . U MAN 7 1_555 U C1 MAN . U MAN 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale75 U O6 MAN . U MAN 7 1_555 U C1 MAN . U MAN 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale76 U O2 MAN . U MAN 8 1_555 U C1 MAN . U MAN 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale77 U O2 MAN . U MAN 10 1_555 U C1 MAN . U MAN 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 283 n n C1 O1 NAG sing 284 n n C1 O5 NAG sing 285 n n C1 H1 NAG sing 286 n n C2 C3 NAG sing 287 n n C2 N2 NAG sing 288 n n C2 H2 NAG sing 289 n n C3 C4 NAG sing 290 n n C3 O3 NAG sing 291 n n C3 H3 NAG sing 292 n n C4 C5 NAG sing 293 n n C4 O4 NAG sing 294 n n C4 H4 NAG sing 295 n n C5 C6 NAG sing 296 n n C5 O5 NAG sing 297 n n C5 H5 NAG sing 298 n n C6 O6 NAG sing 299 n n C6 H61 NAG sing 300 n n C6 H62 NAG sing 301 n n C7 C8 NAG sing 302 n n C7 N2 NAG sing 303 n n C7 O7 NAG doub 304 n n C8 H81 NAG sing 305 n n C8 H82 NAG sing 306 n n C8 H83 NAG sing 307 n n N2 HN2 NAG sing 308 n n O1 HO1 NAG sing 309 n n O3 HO3 NAG sing 310 n n O4 HO4 NAG sing 311 n n O6 HO6 NAG sing 312 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 5JSA _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.003755 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.003755 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.003755 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code V 16 NAG C 1 615 621 NAG NAG . W 16 NAG D 1 705 709 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . V 16 -40.648 -58.996 -86.245 1 349.4 ? C1 NAG 615 C 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . V 16 -40.76 -60.365 -86.925 1 349.4 ? C2 NAG 615 C 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . V 16 -39.917 -61.401 -86.175 1 349.4 ? C3 NAG 615 C 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . V 16 -38.495 -60.896 -85.965 1 349.4 ? C4 NAG 615 C 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . V 16 -38.522 -59.52 -85.312 1 349.4 ? C5 NAG 615 C 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . V 16 -37.152 -58.909 -85.149 1 349.4 ? C6 NAG 615 C 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . V 16 -42.805 -60.976 -88.143 1 349.4 ? C7 NAG 615 C 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . V 16 -44.229 -61.427 -88.021 1 349.4 ? C8 NAG 615 C 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . V 16 -42.146 -60.796 -86.993 1 349.4 ? N2 NAG 615 C 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . V 16 -39.896 -62.619 -86.911 1 349.4 ? O3 NAG 615 C 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . V 16 -37.779 -61.795 -85.126 1 349.4 ? O4 NAG 615 C 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . V 16 -39.279 -58.625 -86.135 1 349.4 ? O5 NAG 615 C 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . V 16 -36.952 -58.426 -83.829 1 349.4 ? O6 NAG 615 C 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . V 16 -42.277 -60.781 -89.232 1 349.4 ? O7 NAG 615 C 1 # _model_server_stats.io_time_ms 65 _model_server_stats.parse_time_ms 18 _model_server_stats.create_model_time_ms 17 _model_server_stats.query_time_ms 712 _model_server_stats.encode_time_ms 23 _model_server_stats.element_count 14 #