data_5JW4 # _model_server_result.job_id b9L58Qhfi6GEZlzNlu8TBA _model_server_result.datetime_utc '2024-12-11 21:50:06' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 5jw4 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"WA","auth_seq_id":201}' # _entry.id 5JW4 # _exptl.entry_id 5JW4 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 8 _entity.src_method man _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 20 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90.44 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 5JW4 _cell.length_a 151.26 _cell.length_b 386.36 _cell.length_c 165.86 _cell.Z_PDB 24 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 5JW4 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 5 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'C 1 2 1' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id PISA dodecameric 12 author_and_software_defined_assembly 1 PISA dodecameric 12 author_and_software_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,B,C,D,E,F,M,N,O,P,Q,R,Y,Z,AA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA 1 1 G,H,I,J,K,L,S,T,U,V,W,X,BA,CA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA 2 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 8 DA N N ? 8 EA N N ? 8 FA N N ? 8 GA N N ? 8 HA N N ? 8 IA N N ? 8 JA N N ? 8 KA N N ? 8 LA N N ? 8 MA N N ? 8 NA N N ? 8 OA N N ? 8 PA N N ? 8 QA N N ? 8 RA N N ? 8 SA N N ? 8 TA N N ? 8 UA N N ? 8 VA N N ? 8 WA N N # _pdbx_entity_branch.entity_id 7 _pdbx_entity_branch.type oligosaccharide # _pdbx_entity_branch_link.link_id 1 _pdbx_entity_branch_link.details ? _pdbx_entity_branch_link.entity_id 7 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 2 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 NAG _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 NAG _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 C1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 O1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 . _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 O4 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 HO4 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 . _pdbx_entity_branch_link.value_order sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 7 n Y NAG 1 Y 1 NAG B 1164 NAG 7 n Y NAG 2 Y 2 NAG B 1165 NAG 7 n Z NAG 1 Z 1 NAG E 1322 NAG 7 n Z NAG 2 Z 2 NAG E 1323 NAG 7 n AA NAG 1 a 1 NAG F 1164 NAG 7 n AA NAG 2 a 2 NAG F 1165 NAG 7 n BA NAG 1 b 1 NAG H 1164 NAG 7 n BA NAG 2 b 2 NAG H 1165 NAG 7 n CA NAG 1 c 1 NAG J 1164 NAG 7 n CA NAG 2 c 2 NAG J 1165 NAG # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 4 A CYS 4 1_555 B SG CYS 137 B CYS 137 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 42 A CYS 42 1_555 A SG CYS 274 A CYS 274 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.064 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 55 A CYS 55 1_555 A SG CYS 67 A CYS 67 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 90 A CYS 90 1_555 A SG CYS 135 A CYS 135 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.066 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 278 A CYS 278 1_555 A SG CYS 302 A CYS 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.065 ? disulf ? disulf6 B SG CYS 144 B CYS 144 1_555 B SG CYS 148 B CYS 148 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.068 ? disulf ? disulf7 C SG CYS 4 C CYS 4 1_555 D SG CYS 137 D CYS 137 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.084 ? disulf ? disulf8 C SG CYS 42 C CYS 42 1_555 C SG CYS 274 C CYS 274 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.051 ? disulf ? disulf9 C SG CYS 55 C CYS 55 1_555 C SG CYS 67 C CYS 67 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf10 C SG CYS 90 C CYS 90 1_555 C SG CYS 135 C CYS 135 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.067 ? disulf ? disulf11 C SG CYS 278 C CYS 278 1_555 C SG CYS 302 C CYS 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.075 ? disulf ? disulf12 D SG CYS 144 D CYS 144 1_555 D SG CYS 148 D CYS 148 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.056 ? disulf ? disulf13 E SG CYS 4 E CYS 4 1_555 F SG CYS 137 F CYS 137 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.072 ? disulf ? disulf14 E SG CYS 42 E CYS 42 1_555 E SG CYS 274 E CYS 274 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.058 ? disulf ? disulf15 E SG CYS 55 E CYS 55 1_555 E SG CYS 67 E CYS 67 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf16 E SG CYS 90 E CYS 90 1_555 E SG CYS 135 E CYS 135 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.063 ? disulf ? disulf17 E SG CYS 278 E CYS 278 1_555 E SG CYS 302 E CYS 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.065 ? disulf ? disulf18 F SG CYS 144 F CYS 144 1_555 F SG CYS 148 F CYS 148 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.062 ? disulf ? disulf19 G SG CYS 4 G CYS 4 1_555 H SG CYS 137 H CYS 137 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.065 ? disulf ? disulf20 G SG CYS 42 G CYS 42 1_555 G SG CYS 274 G CYS 274 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.05 ? disulf ? disulf21 G SG CYS 55 G CYS 55 1_555 G SG CYS 67 G CYS 67 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf22 G SG CYS 90 G CYS 90 1_555 G SG CYS 135 G CYS 135 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.059 ? disulf ? disulf23 G SG CYS 278 G CYS 278 1_555 G SG CYS 302 G CYS 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.066 ? disulf ? disulf24 H SG CYS 144 H CYS 144 1_555 H SG CYS 148 H CYS 148 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.061 ? disulf ? disulf25 I SG CYS 4 I CYS 4 1_555 J SG CYS 137 J CYS 137 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.057 ? disulf ? disulf26 I SG CYS 42 I CYS 42 1_555 I SG CYS 274 I CYS 274 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.057 ? disulf ? disulf27 I SG CYS 55 I CYS 55 1_555 I SG CYS 67 I CYS 67 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? disulf ? disulf28 I SG CYS 90 I CYS 90 1_555 I SG CYS 135 I CYS 135 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.062 ? disulf ? disulf29 I SG CYS 278 I CYS 278 1_555 I SG CYS 302 I CYS 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.061 ? disulf ? disulf30 J SG CYS 144 J CYS 144 1_555 J SG CYS 148 J CYS 148 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.056 ? disulf ? disulf31 K SG CYS 4 K CYS 4 1_555 L SG CYS 137 L CYS 137 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf32 K SG CYS 42 K CYS 42 1_555 K SG CYS 274 K CYS 274 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.048 ? disulf ? disulf33 K SG CYS 55 K CYS 55 1_555 K SG CYS 67 K CYS 67 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf34 K SG CYS 90 K CYS 90 1_555 K SG CYS 135 K CYS 135 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.06 ? disulf ? disulf35 K SG CYS 278 K CYS 278 1_555 K SG CYS 302 K CYS 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.066 ? disulf ? disulf36 L SG CYS 144 L CYS 144 1_555 L SG CYS 148 L CYS 148 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.054 ? disulf ? disulf37 M SG CYS 22 M CYS 22 1_555 M SG CYS 99 M CYS 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.081 ? disulf ? disulf38 M SG CYS 154 M CYS 155 1_555 M SG CYS 210 M CYS 211 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf39 N SG CYS 20 N CYS 23 1_555 N SG CYS 85 N CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.045 ? disulf ? disulf40 N SG CYS 127 N CYS 130 1_555 N SG CYS 187 N CYS 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf41 O SG CYS 22 O CYS 22 1_555 O SG CYS 99 O CYS 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.073 ? disulf ? disulf42 O SG CYS 154 O CYS 155 1_555 O SG CYS 210 O CYS 211 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf43 P SG CYS 20 P CYS 23 1_555 P SG CYS 85 P CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.05 ? disulf ? disulf44 P SG CYS 127 P CYS 130 1_555 P SG CYS 187 P CYS 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf45 Q SG CYS 22 Q CYS 22 1_555 Q SG CYS 99 Q CYS 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.078 ? disulf ? disulf46 R SG CYS 23 R CYS 23 1_555 R SG CYS 88 R CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.058 ? disulf ? disulf47 R SG CYS 130 R CYS 130 1_555 R SG CYS 190 R CYS 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.066 ? disulf ? disulf48 S SG CYS 22 S CYS 22 1_555 S SG CYS 99 S CYS 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.081 ? disulf ? disulf49 S SG CYS 154 S CYS 155 1_555 S SG CYS 210 S CYS 211 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf50 T SG CYS 20 T CYS 23 1_555 T SG CYS 85 T CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.049 ? disulf ? disulf51 T SG CYS 127 T CYS 130 1_555 T SG CYS 187 T CYS 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf52 U SG CYS 22 U CYS 22 1_555 U SG CYS 99 U CYS 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.081 ? disulf ? disulf53 U SG CYS 154 U CYS 155 1_555 U SG CYS 210 U CYS 211 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf54 V SG CYS 20 V CYS 23 1_555 V SG CYS 85 V CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.051 ? disulf ? disulf55 V SG CYS 127 V CYS 130 1_555 V SG CYS 187 V CYS 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? disulf ? disulf56 W SG CYS 22 W CYS 22 1_555 W SG CYS 99 W CYS 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.078 ? disulf ? disulf57 W SG CYS 154 W CYS 155 1_555 W SG CYS 210 W CYS 211 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf58 X SG CYS 20 X CYS 23 1_555 X SG CYS 85 X CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.048 ? disulf ? disulf59 X SG CYS 127 X CYS 130 1_555 X SG CYS 187 X CYS 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 23 A ASN 23 1_555 EA C1 NAG . A NAG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.455 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 165 A ASN 165 1_555 DA C1 NAG . A NAG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.456 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 286 A ASN 286 1_555 FA C1 NAG . A NAG 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.456 ? covale ? covale4 B ND2 ASN 154 B ASN 154 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale5 C ND2 ASN 23 C ASN 23 1_555 HA C1 NAG . C NAG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale6 C ND2 ASN 165 C ASN 165 1_555 GA C1 NAG . C NAG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.417 ? covale ? covale7 C ND2 ASN 286 C ASN 286 1_555 IA C1 NAG . C NAG 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale8 D ND2 ASN 154 D ASN 154 1_555 JA C1 NAG . D NAG 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.47 ? covale ? covale9 E ND2 ASN 23 E ASN 23 1_555 KA C1 NAG . E NAG 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.429 ? covale ? covale10 E ND2 ASN 165 E ASN 165 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.355 ? covale ? covale11 E ND2 ASN 286 E ASN 286 1_555 LA C1 NAG . E NAG 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.505 ? covale ? covale12 F ND2 ASN 154 F ASN 154 1_555 AA C1 NAG . a NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.419 ? covale ? covale13 G ND2 ASN 23 G ASN 23 1_555 NA C1 NAG . G NAG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale14 G ND2 ASN 165 G ASN 165 1_555 MA C1 NAG . G NAG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.373 ? covale ? covale15 G ND2 ASN 286 G ASN 286 1_555 OA C1 NAG . G NAG 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale16 H ND2 ASN 154 H ASN 154 1_555 BA C1 NAG . b NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale17 I ND2 ASN 23 I ASN 23 1_555 QA C1 NAG . I NAG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale18 I ND2 ASN 165 I ASN 165 1_555 PA C1 NAG . I NAG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.38 ? covale ? covale19 I ND2 ASN 286 I ASN 286 1_555 RA C1 NAG . I NAG 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.461 ? covale ? covale20 J ND2 ASN 154 J ASN 154 1_555 CA C1 NAG . c NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.514 ? covale ? covale21 K ND2 ASN 23 K ASN 23 1_555 UA C1 NAG . K NAG 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.45 ? covale ? covale22 K ND2 ASN 165 K ASN 165 1_555 SA C1 NAG . K NAG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.41 ? covale ? covale23 K ND2 ASN 286 K ASN 286 1_555 VA C1 NAG . K NAG 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.468 ? covale ? covale24 L ND2 ASN 154 L ASN 154 1_555 WA C1 NAG . L NAG 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.456 ? covale ? covale25 Y O4 NAG . Y NAG 1 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale26 Z O4 NAG . Z NAG 1 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.541 ? covale ? covale27 AA O4 NAG . a NAG 1 1_555 AA C1 NAG . a NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale28 BA O4 NAG . b NAG 1 1_555 BA C1 NAG . b NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale29 CA O4 NAG . c NAG 1 1_555 CA C1 NAG . c NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 235 n n C1 O1 NAG sing 236 n n C1 O5 NAG sing 237 n n C1 H1 NAG sing 238 n n C2 C3 NAG sing 239 n n C2 N2 NAG sing 240 n n C2 H2 NAG sing 241 n n C3 C4 NAG sing 242 n n C3 O3 NAG sing 243 n n C3 H3 NAG sing 244 n n C4 C5 NAG sing 245 n n C4 O4 NAG sing 246 n n C4 H4 NAG sing 247 n n C5 C6 NAG sing 248 n n C5 O5 NAG sing 249 n n C5 H5 NAG sing 250 n n C6 O6 NAG sing 251 n n C6 H61 NAG sing 252 n n C6 H62 NAG sing 253 n n C7 C8 NAG sing 254 n n C7 N2 NAG sing 255 n n C7 O7 NAG doub 256 n n C8 H81 NAG sing 257 n n C8 H82 NAG sing 258 n n C8 H83 NAG sing 259 n n N2 HN2 NAG sing 260 n n O1 HO1 NAG sing 261 n n O3 HO3 NAG sing 262 n n O4 HO4 NAG sing 263 n n O6 HO6 NAG sing 264 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 5JW4 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.006611 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000051 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.002588 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.006029 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code DA 8 NAG A 1 401 1322 NAG NAG . EA 8 NAG A 1 402 1324 NAG NAG . FA 8 NAG A 1 403 1325 NAG NAG . GA 8 NAG C 1 401 1322 NAG NAG . HA 8 NAG C 1 402 1324 NAG NAG . IA 8 NAG C 1 403 1325 NAG NAG . JA 8 NAG D 1 201 1164 NAG NAG . KA 8 NAG E 1 403 1324 NAG NAG . LA 8 NAG E 1 404 1325 NAG NAG . MA 8 NAG G 1 401 1322 NAG NAG . NA 8 NAG G 1 402 1324 NAG NAG . OA 8 NAG G 1 403 1325 NAG NAG . PA 8 NAG I 1 401 1322 NAG NAG . QA 8 NAG I 1 402 1324 NAG NAG . RA 8 NAG I 1 403 1325 NAG NAG . SA 8 NAG K 1 401 1322 NAG NAG . TA 8 NAG K 1 402 1323 NAG NAG . UA 8 NAG K 1 403 1324 NAG NAG . VA 8 NAG K 1 404 1325 NAG NAG . WA 8 NAG L 1 201 1164 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . WA 8 125.26 -73.005 11.298 1 190.8 ? C1 NAG 201 L 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . WA 8 124.647 -74.379 11.468 1 192.37 ? C2 NAG 201 L 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . WA 8 125.7 -75.434 11.816 1 194 ? C3 NAG 201 L 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . WA 8 126.898 -75.348 10.88 1 194.74 ? C4 NAG 201 L 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . WA 8 127.366 -73.907 10.704 1 193.05 ? C5 NAG 201 L 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . WA 8 128.411 -73.781 9.606 1 193.98 ? C6 NAG 201 L 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . WA 8 122.362 -73.874 12.285 1 190.81 ? C7 NAG 201 L 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . WA 8 121.836 -73.648 10.893 1 191.14 ? C8 NAG 201 L 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . WA 8 123.639 -74.215 12.494 1 191.42 ? N2 NAG 201 L 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . WA 8 125.179 -76.756 11.68 1 195.92 ? O3 NAG 201 L 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . WA 8 127.958 -76.165 11.39 1 196.1 ? O4 NAG 201 L 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . WA 8 126.276 -73.082 10.31 1 191.79 ? O5 NAG 201 L 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . WA 8 127.77 -73.845 8.326 1 194.61 ? O6 NAG 201 L 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . WA 8 121.616 -73.761 13.238 1 190.14 ? O7 NAG 201 L 1 # _model_server_stats.io_time_ms 84 _model_server_stats.parse_time_ms 233 _model_server_stats.create_model_time_ms 192 _model_server_stats.query_time_ms 299 _model_server_stats.encode_time_ms 6 _model_server_stats.element_count 14 #