data_5L5X
#
_model_server_result.job_id            zsyl8B1M0TkaXvQAO_dFkA 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-14 06:48:03' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          5l5x 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"TA","auth_seq_id":201}' 
#
_entry.id    5L5X 
#
_exptl.entry_id    5L5X 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              195.237 
_entity.id                          18 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            '2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    4 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          112.97 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            5L5X 
_cell.length_a            136.02 
_cell.length_b            300.51 
_cell.length_c            145.45 
_cell.Z_PDB               4 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 5L5X 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        4 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1 21 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    28-meric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      28 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 18 GA N N 
? 18 MA N N 
? 18 SA N N 
? 18 TA N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
covale ? covale1 H N THR 1 H THR 1 1_555 FA C10 04C . H 04C 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.511 ? 
covale ? covale2 H OG1 THR 1 H THR 1 1_555 FA C9 04C . H 04C 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? 
covale ? covale3 K N THR 1 K THR 1 1_555 KA C10 04C . K 04C 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.504 ? 
covale ? covale4 K OG1 THR 1 K THR 1 1_555 KA C9 04C . K 04C 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.425 ? 
covale ? covale5 N N THR 1 N THR 1 1_555 OA C10 04C . N 04C 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.517 ? 
covale ? covale6 N OG1 THR 1 N THR 1 1_555 OA C9 04C . N 04C 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.426 ? 
covale ? covale7 V N THR 1 V THR 1 1_555 RA C10 04C . V 04C 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.51 ? 
covale ? covale8 V OG1 THR 1 V THR 1 1_555 RA C9 04C . V 04C 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? 
covale ? covale9 Y N THR 1 Y THR 1 1_555 UA C10 04C . Y 04C 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.503 ? 
covale ? covale10 Y OG1 THR 1 Y THR 1 1_555 UA C9 04C . Y 04C 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.42 ? 
covale ? covale11 BA N THR 1 b THR 1 1_555 WA C10 04C . b 04C 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.519 ? 
covale ? covale12 BA OG1 THR 1 b THR 1 1_555 WA C9 04C . b 04C 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? 
metalc ? metalc1 A O MET 118 A MET 118 1_555 CA MG MG . A MG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.626 ? 
metalc ? metalc2 A O PRO 152 A PRO 152 1_555 CA MG MG . A MG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.47 ? 
metalc ? metalc3 G OG1 THR 17 G THR 8 1_555 DA MG MG . G MG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.498 ? 
metalc ? metalc4 G O TYR 128 G TYR 119 1_555 DA MG MG . G MG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.985 ? 
metalc ? metalc5 G O ARG 131 G ARG 122 1_555 DA MG MG . G MG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.606 ? 
metalc ? metalc6 G O MET 134 G MET 125 1_555 DA MG MG . G MG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.418 ? 
metalc ? metalc7 I O ALA 175 I ALA 174 1_555 HA MG MG . I MG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.994 ? 
metalc ? metalc8 I O ASP 178 I ASP 177 1_555 HA MG MG . I MG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.45 ? 
metalc ? metalc9 I O SER 181 I SER 180 1_555 HA MG MG . I MG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.647 ? 
metalc ? metalc10 I O ASP 205 I ASP 204 1_555 IA MG MG . I MG 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.152 ? 
metalc ? metalc11 IA MG MG . I MG 302 1_555 Y O ALA 164 Y ALA 164 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.256 ? 
metalc ? metalc12 IA MG MG . I MG 302 1_555 Y O ASP 167 Y ASP 167 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.171 ? 
metalc ? metalc13 IA MG MG . I MG 302 1_555 Y O SER 170 Y SER 170 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.578 ? 
metalc ? metalc14 K O ALA 164 K ALA 164 1_555 LA MG MG . K MG 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.301 ? 
metalc ? metalc15 K O ASP 167 K ASP 167 1_555 LA MG MG . K MG 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.099 ? 
metalc ? metalc16 K O SER 170 K SER 170 1_555 LA MG MG . K MG 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.962 ? 
metalc ? metalc17 LA MG MG . K MG 302 1_555 W O ASP 205 W ASP 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.349 ? 
metalc ? metalc18 L OXT ASP 222 L ASP 222 1_555 NA MG MG . L MG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.94 ? 
metalc ? metalc19 NA MG MG . L MG 301 1_555 V O ILE 163 V ILE 163 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.242 ? 
metalc ? metalc20 NA MG MG . L MG 301 1_555 V O ASP 166 V ASP 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.1 ? 
metalc ? metalc21 NA MG MG . L MG 301 1_555 V O SER 169 V SER 169 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.285 ? 
metalc ? metalc22 N O ILE 163 N ILE 163 1_555 PA MG MG . N MG 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.654 ? 
metalc ? metalc23 N O ASP 166 N ASP 166 1_555 PA MG MG . N MG 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.914 ? 
metalc ? metalc24 N O SER 169 N SER 169 1_555 PA MG MG . N MG 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.601 ? 
metalc ? metalc25 Z O THR 192 Z THR 192 1_555 VA MG MG . Z MG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.753 ? 
metalc ? metalc26 Z O HIS 195 Z HIS 195 1_555 VA MG MG . Z MG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.94 ? 
metalc ? metalc27 Z O VAL 198 Z VAL 198 1_555 VA MG MG . Z MG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.494 ? 
#
_chem_comp.formula           'C6 H13 N O4 S' 
_chem_comp.formula_weight    195.237 
_chem_comp.id                MES 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              '2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
O1 C2 MES sing 306 n n 
O1 C6 MES sing 307 n n 
C2 C3 MES sing 308 n n 
C2 H21 MES sing 309 n n 
C2 H22 MES sing 310 n n 
C3 N4 MES sing 311 n n 
C3 H31 MES sing 312 n n 
C3 H32 MES sing 313 n n 
N4 C5 MES sing 314 n n 
N4 C7 MES sing 315 n n 
N4 HN4 MES sing 316 n n 
C5 C6 MES sing 317 n n 
C5 H51 MES sing 318 n n 
C5 H52 MES sing 319 n n 
C6 H61 MES sing 320 n n 
C6 H62 MES sing 321 n n 
C7 C8 MES sing 322 n n 
C7 H71 MES sing 323 n n 
C7 H72 MES sing 324 n n 
C8 S MES sing 325 n n 
C8 H81 MES sing 326 n n 
C8 H82 MES sing 327 n n 
S O1S MES doub 328 n n 
S O2S MES doub 329 n n 
S O3S MES sing 330 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     5L5X 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.007352 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.003116 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.003328 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.007467 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
CA 15 MG A 1 301 11 MG MG . 
DA 15 MG G 1 301 7 MG MG . 
EA 16 CL G 1 302 12 CL CL . 
FA 17 04C H 1 301 1 04C LIG . 
GA 18 MES H 1 302 14 MES MES . 
HA 15 MG I 1 301 8 MG MG . 
IA 15 MG I 1 302 4 MG MG . 
JA 15 MG J 1 201 9 MG MG . 
KA 17 04C K 1 301 1 04C LIG . 
LA 15 MG K 1 302 1 MG MG . 
MA 18 MES K 1 303 15 MES MES . 
NA 15 MG L 1 301 2 MG MG . 
OA 17 04C N 1 201 1 04C LIG . 
PA 15 MG N 1 202 5 MG MG . 
QA 16 CL U 1 301 13 CL CL . 
RA 17 04C V 1 301 1 04C LIG . 
SA 18 MES V 1 302 16 MES MES . 
TA 18 MES X 1 201 17 MES MES . 
UA 17 04C Y 1 301 1 04C LIG . 
VA 15 MG Z 1 301 3 MG MG . 
WA 17 04C b 1 201 1 04C LIG . 
XA 19 HOH A 1 401 36 HOH HOH . 
XA 19 HOH A 2 402 23 HOH HOH . 
XA 19 HOH A 3 403 47 HOH HOH . 
XA 19 HOH A 4 404 32 HOH HOH . 
XA 19 HOH A 5 405 125 HOH HOH . 
YA 19 HOH B 1 301 1 HOH HOH . 
YA 19 HOH B 2 302 65 HOH HOH . 
YA 19 HOH B 3 303 58 HOH HOH . 
YA 19 HOH B 4 304 78 HOH HOH . 
YA 19 HOH B 5 305 40 HOH HOH . 
YA 19 HOH B 6 306 153 HOH HOH . 
YA 19 HOH B 7 307 146 HOH HOH . 
YA 19 HOH B 8 308 139 HOH HOH . 
YA 19 HOH B 9 309 165 HOH HOH . 
ZA 19 HOH C 1 301 160 HOH HOH . 
ZA 19 HOH C 2 302 144 HOH HOH . 
AB 19 HOH D 1 301 3 HOH HOH . 
AB 19 HOH D 2 302 57 HOH HOH . 
AB 19 HOH D 3 303 126 HOH HOH . 
AB 19 HOH D 4 304 76 HOH HOH . 
AB 19 HOH D 5 305 141 HOH HOH . 
AB 19 HOH D 6 306 27 HOH HOH . 
AB 19 HOH D 7 307 145 HOH HOH . 
AB 19 HOH D 8 308 164 HOH HOH . 
BB 19 HOH E 1 301 12 HOH HOH . 
CB 19 HOH F 1 301 136 HOH HOH . 
CB 19 HOH F 2 302 60 HOH HOH . 
CB 19 HOH F 3 303 80 HOH HOH . 
CB 19 HOH F 4 304 107 HOH HOH . 
CB 19 HOH F 5 305 81 HOH HOH . 
CB 19 HOH F 6 306 21 HOH HOH . 
DB 19 HOH G 1 401 34 HOH HOH . 
DB 19 HOH G 2 402 46 HOH HOH . 
DB 19 HOH G 3 403 92 HOH HOH . 
DB 19 HOH G 4 404 24 HOH HOH . 
DB 19 HOH G 5 405 43 HOH HOH . 
DB 19 HOH G 6 406 163 HOH HOH . 
EB 19 HOH H 1 401 109 HOH HOH . 
EB 19 HOH H 2 402 95 HOH HOH . 
EB 19 HOH H 3 403 104 HOH HOH . 
EB 19 HOH H 4 404 156 HOH HOH . 
EB 19 HOH H 5 405 53 HOH HOH . 
EB 19 HOH H 6 406 137 HOH HOH . 
EB 19 HOH H 7 407 114 HOH HOH . 
EB 19 HOH H 8 408 84 HOH HOH . 
FB 19 HOH I 1 401 140 HOH HOH . 
FB 19 HOH I 2 402 168 HOH HOH . 
FB 19 HOH I 3 403 72 HOH HOH . 
FB 19 HOH I 4 404 93 HOH HOH . 
FB 19 HOH I 5 405 74 HOH HOH . 
FB 19 HOH I 6 406 132 HOH HOH . 
FB 19 HOH I 7 407 97 HOH HOH . 
FB 19 HOH I 8 408 105 HOH HOH . 
GB 19 HOH J 1 301 11 HOH HOH . 
GB 19 HOH J 2 302 115 HOH HOH . 
GB 19 HOH J 3 303 123 HOH HOH . 
GB 19 HOH J 4 304 68 HOH HOH . 
HB 19 HOH K 1 401 157 HOH HOH . 
HB 19 HOH K 2 402 124 HOH HOH . 
HB 19 HOH K 3 403 131 HOH HOH . 
IB 19 HOH L 1 401 44 HOH HOH . 
IB 19 HOH L 2 402 134 HOH HOH . 
IB 19 HOH L 3 403 89 HOH HOH . 
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