data_5LZQ # _model_server_result.job_id Zbfzjl-XYHUGmF87k5sZ5g _model_server_result.datetime_utc '2024-11-04 22:37:33' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 5lzq # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"E","auth_seq_id":803}' # _entry.id 5LZQ # _exptl.entry_id 5LZQ _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 24.305 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MAGNESIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 10 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 5LZQ _cell.length_a 106.421 _cell.length_b 106.763 _cell.length_c 161.913 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 5LZQ _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 C N N ? 2 D N N ? 2 E N N ? 2 F N N ? 2 G N N ? 2 L N N ? 2 M N N ? 2 N N N ? 2 O N N ? 2 P N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OD1 ASP 211 A ASP 202 1_555 C MG MG . A MG 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.37 ? metalc ? metalc2 A OD2 ASP 211 A ASP 202 1_555 C MG MG . A MG 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.767 ? metalc ? metalc3 A OD2 ASP 211 A ASP 202 1_555 E MG MG . A MG 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.249 ? metalc ? metalc4 A OD2 ASP 215 A ASP 206 1_555 C MG MG . A MG 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 ? metalc ? metalc5 A OD1 ASP 241 A ASP 232 1_555 F MG MG . A MG 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.15 ? metalc ? metalc6 A OD2 ASP 241 A ASP 232 1_555 F MG MG . A MG 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.347 ? metalc ? metalc7 A O ASP 252 A ASP 243 1_555 I NA NA . A NA 807 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.827 ? metalc ? metalc8 A OD1 ASP 252 A ASP 243 1_555 I NA NA . A NA 807 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.457 ? metalc ? metalc9 A OE1 GLU 255 A GLU 246 1_555 I NA NA . A NA 807 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.372 ? metalc ? metalc10 A OG SER 256 A SER 247 1_555 I NA NA . A NA 807 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.392 ? metalc ? metalc11 A OD1 ASP 474 A ASP 465 1_555 D MG MG . A MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.223 ? metalc ? metalc12 A OD2 ASP 474 A ASP 465 1_555 D MG MG . A MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.977 ? metalc ? metalc13 A OD2 ASP 474 A ASP 465 1_555 F MG MG . A MG 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.05 ? metalc ? metalc14 A OD1 ASN 501 A ASN 492 1_555 G MG MG . A MG 805 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.144 ? metalc ? metalc15 A OD2 ASP 669 A ASP 660 1_555 G MG MG . A MG 805 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.158 ? metalc ? metalc16 A OD1 ASP 701 A ASP 692 1_555 E MG MG . A MG 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.257 ? metalc ? metalc17 A OD2 ASP 701 A ASP 692 1_555 E MG MG . A MG 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.452 ? metalc ? metalc18 A OD1 ASP 712 A ASP 703 1_555 I NA NA . A NA 807 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.515 ? metalc ? metalc19 C MG MG . A MG 801 1_555 H O5 2PN . A 2PN 806 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? metalc ? metalc20 D MG MG . A MG 802 1_555 H O6 2PN . A 2PN 806 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.588 ? metalc ? metalc21 E MG MG . A MG 803 1_555 H O2 2PN . A 2PN 806 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.394 ? metalc ? metalc22 E MG MG . A MG 803 1_555 H O5 2PN . A 2PN 806 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.496 ? metalc ? metalc23 F MG MG . A MG 804 1_555 H O1 2PN . A 2PN 806 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.131 ? metalc ? metalc24 F MG MG . A MG 804 1_555 H O6 2PN . A 2PN 806 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.59 ? metalc ? metalc25 G MG MG . A MG 805 1_555 H O3 2PN . A 2PN 806 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.58 ? metalc ? metalc26 B OD2 ASP 211 B ASP 202 1_555 L MG MG . B MG 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.209 ? metalc ? metalc27 B OD1 ASP 211 B ASP 202 1_555 P MG MG . B MG 805 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.269 ? metalc ? metalc28 B OD2 ASP 211 B ASP 202 1_555 P MG MG . B MG 805 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.343 ? metalc ? metalc29 B OD2 ASP 215 B ASP 206 1_555 P MG MG . B MG 805 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.315 ? metalc ? metalc30 B OD2 ASP 237 B ASP 228 1_555 M MG MG . B MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.5 ? metalc ? metalc31 B OD1 ASP 237 B ASP 228 1_555 N MG MG . B MG 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.985 ? metalc ? metalc32 B OD1 ASP 241 B ASP 232 1_555 N MG MG . B MG 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.188 ? metalc ? metalc33 B OD2 ASP 241 B ASP 232 1_555 N MG MG . B MG 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.4 ? metalc ? metalc34 B O ASP 252 B ASP 243 1_555 R NA NA . B NA 807 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.789 ? metalc ? metalc35 B OD1 ASP 252 B ASP 243 1_555 R NA NA . B NA 807 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.477 ? metalc ? metalc36 B OE1 GLU 255 B GLU 246 1_555 R NA NA . B NA 807 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.413 ? metalc ? metalc37 B OG SER 256 B SER 247 1_555 R NA NA . B NA 807 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.406 ? metalc ? metalc38 B OD2 ASP 474 B ASP 465 1_555 N MG MG . B MG 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.363 ? metalc ? metalc39 B OD1 ASN 501 B ASN 492 1_555 O MG MG . B MG 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.118 ? metalc ? metalc40 B OD2 ASP 669 B ASP 660 1_555 O MG MG . B MG 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.162 ? metalc ? metalc41 B OD1 ASP 701 B ASP 692 1_555 L MG MG . B MG 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.105 ? metalc ? metalc42 B OD2 ASP 701 B ASP 692 1_555 L MG MG . B MG 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.374 ? metalc ? metalc43 B OD1 ASP 712 B ASP 703 1_555 R NA NA . B NA 807 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.619 ? metalc ? metalc44 L MG MG . B MG 801 1_555 Q O1 2PN . B 2PN 806 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.052 ? metalc ? metalc45 M MG MG . B MG 802 1_555 Q O6 2PN . B 2PN 806 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.429 ? metalc ? metalc46 N MG MG . B MG 803 1_555 Q O6 2PN . B 2PN 806 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.29 ? metalc ? metalc47 N MG MG . B MG 803 1_555 Q O2 2PN . B 2PN 806 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.899 ? metalc ? metalc48 O MG MG . B MG 804 1_555 Q O3 2PN . B 2PN 806 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.224 ? metalc ? metalc49 P MG MG . B MG 805 1_555 Q O5 2PN . B 2PN 806 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.298 ? # _chem_comp.formula 'Mg 2' _chem_comp.formula_weight 24.305 _chem_comp.id MG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MAGNESIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 5LZQ _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.009397 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.009367 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.006176 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 2 MG A 1 801 1767 MG MG . D 2 MG A 1 802 1768 MG MG . E 2 MG A 1 803 1769 MG MG . F 2 MG A 1 804 1770 MG MG . G 2 MG A 1 805 1771 MG MG . H 3 2PN A 1 806 1773 2PN 2PN . I 4 NA A 1 807 1774 NA NA . J 3 2PN A 1 808 2000 2PN 2PN . K 3 2PN A 1 809 2001 2PN 2PN . L 2 MG B 1 801 1767 MG MG . M 2 MG B 1 802 1768 MG MG . N 2 MG B 1 803 1770 MG MG . O 2 MG B 1 804 1771 MG MG . P 2 MG B 1 805 1769 MG MG . Q 3 2PN B 1 806 1773 2PN 2PN . R 4 NA B 1 807 1774 NA NA . S 5 HOH A 1 1001 1001 HOH HOH . S 5 HOH A 2 1002 1000 HOH HOH . T 5 HOH B 1 901 1000 HOH HOH . T 5 HOH B 2 902 1002 HOH HOH . T 5 HOH B 3 903 1001 HOH HOH . T 5 HOH B 4 904 1003 HOH HOH . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MG _atom_site.label_atom_id MG _atom_site.label_comp_id MG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id E _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x 37.819 _atom_site.Cartn_y -4.32 _atom_site.Cartn_z -51.67 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 104.17 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MG _atom_site.auth_comp_id MG _atom_site.auth_seq_id 803 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 61 _model_server_stats.parse_time_ms 12 _model_server_stats.create_model_time_ms 27 _model_server_stats.query_time_ms 307 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 1 #