data_5NDH # _model_server_result.job_id YxCLZuB2AokGGdC07uR3Kg _model_server_result.datetime_utc '2024-11-12 20:50:07' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 5ndh # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"K","auth_seq_id":101}' # _entry.id 5NDH # _exptl.entry_id 5NDH _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 59.07 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description GUANIDINE _entity.pdbx_number_of_molecules 4 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 5NDH _cell.length_a 48.727 _cell.length_b 57.825 _cell.length_c 100.862 _cell.Z_PDB 16 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 5NDH _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id ? dimeric 2 author_defined_assembly 1 ? dimeric 2 author_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,C,E,F,G,K,L,P,R 1 1 B,D,H,I,J,M,N,O,Q,S 2 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 E N N ? 2 H N N ? 2 K N N ? 2 M N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale ? covale1 A O3' G 1 A G 1 1_555 A P CBV 2 A CBV 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.624 ? covale ? covale2 A O3' CBV 2 A CBV 2 1_555 A P G 3 A G 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.609 ? covale ? covale3 B O3' G 1 B G 1 1_555 B P CBV 2 B CBV 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.626 ? covale ? covale4 B O3' CBV 2 B CBV 2 1_555 B P G 3 B G 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.611 ? covale ? covale5 C O3' G 1 C G 1 1_555 C P CBV 2 C CBV 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.614 ? covale ? covale6 C O3' CBV 2 C CBV 2 1_555 C P G 3 C G 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.609 ? covale ? covale7 D O3' G 1 D G 1 1_555 D P CBV 2 D CBV 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.612 ? covale ? covale8 D O3' CBV 2 D CBV 2 1_555 D P G 3 D G 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.597 ? metalc ? metalc1 A O2' G 15 A G 15 1_555 G MG MG . A MG 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.704 ? metalc ? metalc2 F NA NA . A NA 102 1_555 R O HOH . C HOH 220 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.568 ? metalc ? metalc3 G MG MG . A MG 103 1_555 P O HOH . A HOH 216 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.058 ? metalc ? metalc4 G MG MG . A MG 103 1_555 P O HOH . A HOH 218 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.469 ? metalc ? metalc5 G MG MG . A MG 103 1_545 B O2' G 4 B G 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.993 ? metalc ? metalc6 B O6 G 3 B G 3 1_555 I NA NA . B NA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.857 ? metalc ? metalc7 C O2' C 8 C C 8 1_555 L NA NA . C NA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.052 ? metalc ? metalc8 C O2 C 8 C C 8 1_555 L NA NA . C NA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.144 ? hydrog WATSON-CRICK hydrog1 A N1 G 1 A G 1 1_555 A N3 C 16 A C 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog2 A N2 G 1 A G 1 1_555 A O2 C 16 A C 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 A O6 G 1 A G 1 1_555 A N4 C 16 A C 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 A N3 CBV 2 A CBV 2 1_555 A N1 G 15 A G 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 A N4 CBV 2 A CBV 2 1_555 A O6 G 15 A G 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 A O2 CBV 2 A CBV 2 1_555 A N2 G 15 A G 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 A N1 G 3 A G 3 1_555 A N3 C 14 A C 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 A N2 G 3 A G 3 1_555 A O2 C 14 A C 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 A O6 G 3 A G 3 1_555 A N4 C 14 A C 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 A N1 G 4 A G 4 1_555 A N3 C 13 A C 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 A N2 G 4 A G 4 1_555 A O2 C 13 A C 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 A O6 G 4 A G 4 1_555 A N4 C 13 A C 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog13 A N1 G 5 A G 5 1_555 A N3 C 12 A C 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog14 A N2 G 5 A G 5 1_555 A O2 C 12 A C 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 A O6 G 5 A G 5 1_555 A N4 C 12 A C 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 A N1 G 6 A G 6 1_555 A N3 C 11 A C 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 A N2 G 6 A G 6 1_555 A O2 C 11 A C 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 A O6 G 6 A G 6 1_555 A N4 C 11 A C 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'A-C MISPAIR' hydrog19 A N6 A 7 A A 7 1_555 C O2 C 11 C C 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog20 A N3 C 8 A C 8 1_555 C N1 G 9 C G 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog21 A N4 C 8 A C 8 1_555 C O6 G 9 C G 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog22 A O2 C 8 A C 8 1_555 C N2 G 9 C G 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog23 A N1 G 9 A G 9 1_555 C N3 C 8 C C 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 A N2 G 9 A G 9 1_555 C O2 C 8 C C 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog25 A O6 G 9 A G 9 1_555 C N4 C 8 C C 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'C-A MISPAIR' hydrog26 A O2 C 11 A C 11 1_555 C N6 A 7 C A 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog27 B N1 G 1 B G 1 1_555 B N3 C 16 B C 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog28 B N2 G 1 B G 1 1_555 B O2 C 16 B C 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog29 B O6 G 1 B G 1 1_555 B N4 C 16 B C 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog30 B N3 CBV 2 B CBV 2 1_555 B N1 G 15 B G 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog31 B N4 CBV 2 B CBV 2 1_555 B O6 G 15 B G 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog32 B O2 CBV 2 B CBV 2 1_555 B N2 G 15 B G 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog33 B N1 G 3 B G 3 1_555 B N3 C 14 B C 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog34 B N2 G 3 B G 3 1_555 B O2 C 14 B C 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog35 B O6 G 3 B G 3 1_555 B N4 C 14 B C 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog36 B N1 G 4 B G 4 1_555 B N3 C 13 B C 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog37 B N2 G 4 B G 4 1_555 B O2 C 13 B C 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog38 B O6 G 4 B G 4 1_555 B N4 C 13 B C 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog39 B N1 G 5 B G 5 1_555 B N3 C 12 B C 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog40 B N2 G 5 B G 5 1_555 B O2 C 12 B C 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog41 B O6 G 5 B G 5 1_555 B N4 C 12 B C 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog42 B N1 G 6 B G 6 1_555 B N3 C 11 B C 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog43 B N2 G 6 B G 6 1_555 B O2 C 11 B C 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog44 B O6 G 6 B G 6 1_555 B N4 C 11 B C 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'A-C MISPAIR' hydrog45 B N6 A 7 B A 7 1_555 D O2 C 11 D C 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog46 B N3 C 8 B C 8 1_555 D N1 G 9 D G 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog47 B N4 C 8 B C 8 1_555 D O6 G 9 D G 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog48 B O2 C 8 B C 8 1_555 D N2 G 9 D G 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog49 B N1 G 9 B G 9 1_555 D N3 C 8 D C 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog50 B N2 G 9 B G 9 1_555 D O2 C 8 D C 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog51 B O6 G 9 B G 9 1_555 D N4 C 8 D C 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'C-A MISPAIR' hydrog52 B O2 C 11 B C 11 1_555 D N6 A 7 D A 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog53 C N1 G 1 C G 1 1_555 C N3 C 16 C C 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog54 C N2 G 1 C G 1 1_555 C O2 C 16 C C 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog55 C O6 G 1 C G 1 1_555 C N4 C 16 C C 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog56 C N3 CBV 2 C CBV 2 1_555 C N1 G 15 C G 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog57 C N4 CBV 2 C CBV 2 1_555 C O6 G 15 C G 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog58 C O2 CBV 2 C CBV 2 1_555 C N2 G 15 C G 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog59 C N1 G 3 C G 3 1_555 C N3 C 14 C C 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog60 C N2 G 3 C G 3 1_555 C O2 C 14 C C 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog61 C O6 G 3 C G 3 1_555 C N4 C 14 C C 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog62 C N1 G 4 C G 4 1_555 C N3 C 13 C C 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog63 C N2 G 4 C G 4 1_555 C O2 C 13 C C 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog64 C O6 G 4 C G 4 1_555 C N4 C 13 C C 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog65 C N1 G 5 C G 5 1_555 C N3 C 12 C C 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog66 C N2 G 5 C G 5 1_555 C O2 C 12 C C 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog67 C O6 G 5 C G 5 1_555 C N4 C 12 C C 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog68 C N1 G 6 C G 6 1_555 C N3 C 11 C C 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog69 C N2 G 6 C G 6 1_555 C O2 C 11 C C 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog70 C O6 G 6 C G 6 1_555 C N4 C 11 C C 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog71 D N1 G 1 D G 1 1_555 D N3 C 16 D C 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog72 D N2 G 1 D G 1 1_555 D O2 C 16 D C 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog73 D O6 G 1 D G 1 1_555 D N4 C 16 D C 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog74 D N3 CBV 2 D CBV 2 1_555 D N1 G 15 D G 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog75 D N4 CBV 2 D CBV 2 1_555 D O6 G 15 D G 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog76 D O2 CBV 2 D CBV 2 1_555 D N2 G 15 D G 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog77 D N1 G 3 D G 3 1_555 D N3 C 14 D C 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog78 D N2 G 3 D G 3 1_555 D O2 C 14 D C 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog79 D O6 G 3 D G 3 1_555 D N4 C 14 D C 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog80 D N1 G 4 D G 4 1_555 D N3 C 13 D C 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog81 D N2 G 4 D G 4 1_555 D O2 C 13 D C 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog82 D O6 G 4 D G 4 1_555 D N4 C 13 D C 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog83 D N1 G 5 D G 5 1_555 D N3 C 12 D C 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog84 D N2 G 5 D G 5 1_555 D O2 C 12 D C 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog85 D O6 G 5 D G 5 1_555 D N4 C 12 D C 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog86 D N1 G 6 D G 6 1_555 D N3 C 11 D C 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog87 D N2 G 6 D G 6 1_555 D O2 C 11 D C 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog88 D O6 G 6 D G 6 1_555 D N4 C 11 D C 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'C H5 N3' _chem_comp.formula_weight 59.07 _chem_comp.id GAI _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name GUANIDINE _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C N1 GAI doub 152 n n C N2 GAI sing 153 n n C N3 GAI sing 154 n n N1 HN1 GAI sing 155 n n N2 HN21 GAI sing 156 n n N2 HN22 GAI sing 157 n n N3 HN31 GAI sing 158 n n N3 HN32 GAI sing 159 n n # _atom_sites.entry_id 5NDH _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.020523 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.017293 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.009915 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code E 2 GAI A 1 101 1 GAI GAI . F 3 NA A 1 102 3 NA NA . G 4 MG A 1 103 1 MG MG . H 2 GAI B 1 101 2 GAI GAI . I 3 NA B 1 102 2 NA NA . J 3 NA B 1 103 4 NA NA . K 2 GAI C 1 101 4 GAI GAI . L 3 NA C 1 102 1 NA NA . M 2 GAI D 1 101 3 GAI GAI . N 5 SO4 D 1 102 1 SO4 SO4 . O 5 SO4 D 1 103 2 SO4 SO4 . P 6 HOH A 1 201 37 HOH HOH . P 6 HOH A 2 202 76 HOH HOH . P 6 HOH A 3 203 12 HOH HOH . P 6 HOH A 4 204 24 HOH HOH . P 6 HOH A 5 205 2 HOH HOH . P 6 HOH A 6 206 36 HOH HOH . P 6 HOH A 7 207 9 HOH HOH . P 6 HOH A 8 208 31 HOH HOH . P 6 HOH A 9 209 63 HOH HOH . P 6 HOH A 10 210 61 HOH HOH . P 6 HOH A 11 211 74 HOH HOH . P 6 HOH A 12 212 26 HOH HOH . P 6 HOH A 13 213 14 HOH HOH . P 6 HOH A 14 214 73 HOH HOH . P 6 HOH A 15 215 51 HOH HOH . P 6 HOH A 16 216 55 HOH HOH . P 6 HOH A 17 217 56 HOH HOH . P 6 HOH A 18 218 1 HOH HOH . Q 6 HOH B 1 201 10 HOH HOH . Q 6 HOH B 2 202 21 HOH HOH . Q 6 HOH B 3 203 42 HOH HOH . Q 6 HOH B 4 204 19 HOH HOH . Q 6 HOH B 5 205 52 HOH HOH . Q 6 HOH B 6 206 5 HOH HOH . Q 6 HOH B 7 207 11 HOH HOH . Q 6 HOH B 8 208 3 HOH HOH . Q 6 HOH B 9 209 17 HOH HOH . Q 6 HOH B 10 210 8 HOH HOH . Q 6 HOH B 11 211 39 HOH HOH . Q 6 HOH B 12 212 47 HOH HOH . Q 6 HOH B 13 213 81 HOH HOH . Q 6 HOH B 14 214 46 HOH HOH . Q 6 HOH B 15 215 53 HOH HOH . Q 6 HOH B 16 216 57 HOH HOH . R 6 HOH C 1 201 59 HOH HOH . R 6 HOH C 2 202 29 HOH HOH . R 6 HOH C 3 203 45 HOH HOH . R 6 HOH C 4 204 38 HOH HOH . R 6 HOH C 5 205 54 HOH HOH . R 6 HOH C 6 206 75 HOH HOH . R 6 HOH C 7 207 35 HOH HOH . R 6 HOH C 8 208 15 HOH HOH . R 6 HOH C 9 209 22 HOH HOH . R 6 HOH C 10 210 16 HOH HOH . R 6 HOH C 11 211 66 HOH HOH . R 6 HOH C 12 212 79 HOH HOH . R 6 HOH C 13 213 67 HOH HOH . R 6 HOH C 14 214 60 HOH HOH . R 6 HOH C 15 215 58 HOH HOH . R 6 HOH C 16 216 68 HOH HOH . R 6 HOH C 17 217 48 HOH HOH . R 6 HOH C 18 218 44 HOH HOH . R 6 HOH C 19 219 33 HOH HOH . R 6 HOH C 20 220 65 HOH HOH . R 6 HOH C 21 221 41 HOH HOH . S 6 HOH D 1 201 25 HOH HOH . S 6 HOH D 2 202 80 HOH HOH . S 6 HOH D 3 203 23 HOH HOH . S 6 HOH D 4 204 6 HOH HOH . S 6 HOH D 5 205 4 HOH HOH . S 6 HOH D 6 206 18 HOH HOH . S 6 HOH D 7 207 13 HOH HOH . S 6 HOH D 8 208 27 HOH HOH . S 6 HOH D 9 209 71 HOH HOH . S 6 HOH D 10 210 30 HOH HOH . S 6 HOH D 11 211 50 HOH HOH . S 6 HOH D 12 212 70 HOH HOH . S 6 HOH D 13 213 7 HOH HOH . S 6 HOH D 14 214 49 HOH HOH . S 6 HOH D 15 215 34 HOH HOH . S 6 HOH D 16 216 40 HOH HOH . S 6 HOH D 17 217 69 HOH HOH . S 6 HOH D 18 218 43 HOH HOH . S 6 HOH D 19 219 64 HOH HOH . S 6 HOH D 20 220 78 HOH HOH . S 6 HOH D 21 221 20 HOH HOH . S 6 HOH D 22 222 32 HOH HOH . S 6 HOH D 23 223 28 HOH HOH . S 6 HOH D 24 224 77 HOH HOH . S 6 HOH D 25 225 62 HOH HOH . S 6 HOH D 26 226 72 HOH HOH . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C GAI . . . K 2 16.764 33.828 4.167 1 77.44 ? C GAI 101 C 1 HETATM 2 N N1 GAI . . . K 2 15.975 34.091 5.1 1 56.27 ? N1 GAI 101 C 1 HETATM 3 N N2 GAI . . . K 2 17.885 32.931 4.379 1 95.01 ? N2 GAI 101 C 1 HETATM 4 N N3 GAI . . . K 2 16.561 34.428 2.864 1 68.23 ? N3 GAI 101 C 1 HETATM 5 H HN1 GAI . . . K 2 15.29 34.642 4.962 1 67.52 ? HN1 GAI 101 C 1 HETATM 6 H HN21 GAI . . . K 2 18.009 32.573 5.151 1 114.01 ? HN21 GAI 101 C 1 HETATM 7 H HN22 GAI . . . K 2 18.424 32.756 3.732 1 114.01 ? HN22 GAI 101 C 1 HETATM 8 H HN31 GAI . . . K 2 15.898 34.961 2.735 1 81.87 ? HN31 GAI 101 C 1 HETATM 9 H HN32 GAI . . . K 2 17.102 34.251 2.22 1 81.87 ? HN32 GAI 101 C 1 # _model_server_stats.io_time_ms 28 _model_server_stats.parse_time_ms 11 _model_server_stats.create_model_time_ms 3 _model_server_stats.query_time_ms 314 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 9 #